More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0940 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_0940  transcriptional regulator domain protein  100 
 
 		 296 aa  599  1e-170  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000423424 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3144  putative two component transcriptional regulator, winged helix family  68.04 
 
 		 317 aa  404  1.0000000000000001e-112  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10143  two-component system response regulator  36.47 
 
 		 289 aa  156  4e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.304444  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4900  putative two component transcriptional regulator, winged helix family  30.48 
 
 		 296 aa  136  5e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000353912  normal  0.0339956 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2355  putative two component transcriptional regulator, winged helix family  28.96 
 
 		 313 aa  120  3e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0846804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5352  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.05 
 
 		 224 aa  79.3  0.00000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3651  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.78 
 
 		 228 aa  74.7  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0435949 
 
 
-
 
NC_002950  PG1089  DNA-binding response regulator RprY  37 
 
 		 245 aa  72.8  0.000000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.414682 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3566  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.66 
 
 		 228 aa  72  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.720677 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0203  response regulator receiver  35.35 
 
 		 231 aa  70.9  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.359659 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0856  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.5 
 
 		 233 aa  70.9  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0693  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.89 
 
 		 229 aa  69.7  0.00000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4089  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.68 
 
 		 230 aa  67  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00519658 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1246  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.36 
 
 		 233 aa  66.6  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.877806  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5456  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.77 
 
 		 251 aa  63.5  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.228477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2788  two component transcriptional regulator  36.46 
 
 		 232 aa  62  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.471427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2742  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.3 
 
 		 230 aa  60.8  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.142828  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0093  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.78 
 
 		 232 aa  61.2  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02297  response regulator in two-component regulatory system with PhoQ  29.7 
 
 		 224 aa  60.1  0.00000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2643  two component transcriptional regulator  31.43 
 
 		 236 aa  60.1  0.00000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5387  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.14 
 
 		 236 aa  60.1  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1917  two component transcriptional regulator  36.08 
 
 		 238 aa  59.7  0.00000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.332821 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4970  two component transcriptional regulator  32.98 
 
 		 228 aa  58.5  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.375881  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1374  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.48 
 
 		 231 aa  58.2  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.750209  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4521  two component transcriptional regulator  28.07 
 
 		 230 aa  57.8  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1233  DNA-binding response regulator  33.94 
 
 		 222 aa  57  0.0000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0842153  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09498  two-component system, transcriptional regulatory protein  32.29 
 
 		 236 aa  57  0.0000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2990  two component transcriptional regulator  27.27 
 
 		 230 aa  57  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.140246 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1151  two component transcriptional regulator, winged helix family  33 
 
 		 225 aa  56.2  0.0000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1138  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 232 aa  56.2  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.564511  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2924  two component transcriptional regulator  29.09 
 
 		 234 aa  56.2  0.0000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.470238 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2799  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 232 aa  56.2  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2868  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  38.04 
 
 		 227 aa  56.2  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0808147  normal  0.133304 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0165  two component transcriptional regulator  33.64 
 
 		 243 aa  56.2  0.0000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0174  two component transcriptional regulator  33.64 
 
 		 243 aa  56.2  0.0000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.947413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0155  two component transcriptional regulator  33.64 
 
 		 243 aa  55.8  0.0000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0636837 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11290  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  30.63 
 
 		 234 aa  55.1  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1231  DNA-binding response regulator  28.43 
 
 		 225 aa  55.1  0.000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0366189  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6059  two component transcriptional regulator, winged helix family  27.27 
 
 		 246 aa  55.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_7369  two component transcriptional regulator  29 
 
 		 219 aa  55.1  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.175011  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3856  two component transcriptional regulator  31.68 
 
 		 227 aa  55.1  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.199978  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0543  two component transcriptional regulator  32.35 
 
 		 241 aa  55.1  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3997  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.67 
 
 		 227 aa  55.5  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2983  two component transcriptional regulator  34.31 
 
 		 228 aa  55.5  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1046  two component transcriptional regulator, winged helix family  28.18 
 
 		 230 aa  55.1  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0213528  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2151  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.33 
 
 		 217 aa  55.1  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000920449  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3105  DNA-binding response regulator PhoB  30.85 
 
 		 232 aa  54.7  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2755  two component transcriptional regulator  28.16 
 
 		 221 aa  54.3  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.795661  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1373  two component transcriptional regulator  28.72 
 
 		 265 aa  54.7  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0511  phosphate regulon transcriptional regulatory protein phoB  30.84 
 
 		 234 aa  54.7  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.473137 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2095  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.85 
 
 		 229 aa  55.1  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1527  two component transcriptional regulator  29.52 
 
 		 230 aa  54.7  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.255733  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3299  DNA-binding response regulator PetR  32.04 
 
 		 237 aa  54.7  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1546  two component transcriptional regulator, winged helix family  33 
 
 		 237 aa  54.7  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000115937  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01951  HrpG  29.41 
 
 		 263 aa  54.7  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03275  two-component system, transcriptional regulatory protein  31.96 
 
 		 234 aa  55.1  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1242  two component transcriptional regulator, winged helix family  28.87 
 
 		 234 aa  54.3  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1012  DNA-binding response regulator  31.25 
 
 		 222 aa  53.9  0.000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2317  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  31.36 
 
 		 240 aa  53.9  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.539006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1991  two component transcriptional regulator  32.73 
 
 		 235 aa  53.9  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0556  two component transcriptional regulator  35.23 
 
 		 237 aa  53.9  0.000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.451756  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0781  two component transcriptional regulator  34.55 
 
 		 233 aa  53.9  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.174075 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0893  winged helix family two component transcriptional regulator  34.55 
 
 		 233 aa  54.3  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2507  winged helix family two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 233 aa  53.9  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0209  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.71 
 
 		 251 aa  54.3  0.000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4891  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.63 
 
 		 249 aa  53.9  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2368  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  31.36 
 
 		 240 aa  53.5  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.531777  normal  0.413146 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2261  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  31.36 
 
 		 240 aa  53.5  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.806239  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2306  two component transcriptional regulator  29.7 
 
 		 225 aa  53.5  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4918  two component transcriptional regulator  33.64 
 
 		 234 aa  53.5  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.134814 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2361  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  31.36 
 
 		 240 aa  53.5  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2477  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  31.36 
 
 		 240 aa  53.5  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3146  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.3 
 
 		 218 aa  53.5  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.149495  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3118  DNA-binding response regulator  33.33 
 
 		 227 aa  53.1  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0588  two component transcriptional regulator  25 
 
 		 227 aa  53.1  0.000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000451147  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1433  two component transcriptional regulator  35.44 
 
 		 229 aa  53.1  0.000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4914  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 238 aa  53.1  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.095278 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1434  DNA-binding response regulator PhoB  29 
 
 		 243 aa  53.1  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1045  two component transcriptional regulator  30.69 
 
 		 223 aa  53.1  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0254823  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1060  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 230 aa  53.1  0.000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1151  two component transcriptional regulator, winged helix family  29 
 
 		 243 aa  53.1  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2485  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.65 
 
 		 243 aa  53.1  0.000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2840  two component transcriptional regulator  26 
 
 		 226 aa  53.1  0.000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3280  two component transcriptional regulator  30.58 
 
 		 241 aa  53.1  0.000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.536951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1824  two component transcriptional regulator  38.96 
 
 		 222 aa  53.1  0.000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2216  two component transcriptional regulator  28.72 
 
 		 234 aa  52.8  0.000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.357864  normal  0.270863 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2505  two component transcriptional regulator  26.92 
 
 		 226 aa  53.1  0.000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.457878  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2707  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  35.8 
 
 		 243 aa  53.1  0.000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.33731  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4168  DNA-binding response regulator  26.32 
 
 		 234 aa  53.1  0.000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0461  two component transcriptional regulator  31.53 
 
 		 248 aa  52.8  0.000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.735267  normal  0.697364 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3460  two component transcriptional regulator  32.43 
 
 		 238 aa  52.8  0.000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0108229  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3155  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 228 aa  52.8  0.000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4508  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.29 
 
 		 231 aa  52.8  0.000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1842  response regulator receiver protein  29.9 
 
 		 227 aa  52.4  0.000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1773  two component transcriptional regulator  29.9 
 
 		 227 aa  52.4  0.000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.894508  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1393  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.33 
 
 		 223 aa  52.4  0.000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0533398  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3019  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  31.36 
 
 		 240 aa  52.4  0.000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0767733 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3494  two component transcriptional regulator  29.7 
 
 		 256 aa  52.4  0.000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2193  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.53 
 
 		 237 aa  52.4  0.000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0620475  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4054  two component transcriptional regulator  28.04 
 
 		 226 aa  52.4  0.000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.271916 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>