More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_01951 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_01951  HrpG  100 
 
 		 263 aa  543  1e-153  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02360  response regulator transcription regulator protein  40.89 
 
 		 293 aa  150  2e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.253683 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0852  response regulator transcription regulator protein  41.5 
 
 		 246 aa  149  3e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.650808  normal  0.373572 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4704  two component transcriptional regulator  30.49 
 
 		 228 aa  105  9e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0100205  normal  0.152582 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6247  two component transcriptional regulator  30.22 
 
 		 245 aa  103  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3520  two component transcriptional regulator  31.11 
 
 		 259 aa  103  3e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.235883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0028  two component transcriptional regulator  30.4 
 
 		 268 aa  103  4e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5235  two component transcriptional regulator  30.49 
 
 		 228 aa  103  4e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2530  two component transcriptional regulator  30.2 
 
 		 242 aa  102  6e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.279936  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0939  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.88 
 
 		 237 aa  102  7e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.155156 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1073  two-component system response regulator transcription regulator protein  32.52 
 
 		 237 aa  101  1e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0139958  normal  0.232974 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1004  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.4 
 
 		 237 aa  100  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5416  two component transcriptional regulator  31.22 
 
 		 237 aa  100  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4943  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  32 
 
 		 236 aa  99  7e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0060  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  33.82 
 
 		 235 aa  97.8  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.475352  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0543  response regulator transcription regulator protein  32.19 
 
 		 246 aa  97.4  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0623013  normal  0.919777 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2053  DNA-binding response regulator  26.34 
 
 		 237 aa  97.4  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4162  OmpR-family response regulator  32.5 
 
 		 232 aa  97.4  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.789041  normal  0.397671 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0005  two component transcriptional regulator  35 
 
 		 238 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000487758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1073  DNA-binding response regulator  32.52 
 
 		 238 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11680  two-component regulator  31.88 
 
 		 238 aa  95.9  6e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0438  two component transcriptional regulator, winged helix family  28.81 
 
 		 246 aa  94  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.173423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1563  DNA-binding response regulator  30.24 
 
 		 231 aa  94  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0641  DNA-binding response regulator  30.24 
 
 		 231 aa  94  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.381849  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0838  DNA-binding response regulator  30.24 
 
 		 231 aa  94  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1359  DNA-binding response regulator  30.24 
 
 		 231 aa  94  2e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1060  two component transcriptional regulator  28.57 
 
 		 230 aa  94  2e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0515  DNA-binding response regulator  30.24 
 
 		 231 aa  94  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1588  DNA-binding response regulator  30.24 
 
 		 230 aa  94  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1748  DNA-binding response regulator  30.24 
 
 		 389 aa  93.2  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2192  DNA-binding response regulator  25.89 
 
 		 237 aa  93.2  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.602573  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0424  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.04 
 
 		 246 aa  92.8  5e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.116445  hitchhiker  0.0000956185 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1442  two component transcriptional regulator  30.61 
 
 		 227 aa  92.8  5e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0208535  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0872  two component transcriptional regulator  31.16 
 
 		 265 aa  92  8e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.574761 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0432  two component transcriptional regulator  25.94 
 
 		 237 aa  91.3  1e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000322009  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0059  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  29.9 
 
 		 242 aa  90.5  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4558  two component transcriptional regulator, winged helix family  26.89 
 
 		 246 aa  89  8e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1892  two-component system response regulator transcription regulator protein  31.16 
 
 		 240 aa  87.8  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00502317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0630  two component transcriptional regulator  27.59 
 
 		 232 aa  88.2  1e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0027  two component transcriptional regulator  26.07 
 
 		 255 aa  85.9  7e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1693  two component transcriptional regulator  32.28 
 
 		 229 aa  85.5  8e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000234642 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3089  two component transcriptional regulator  27.35 
 
 		 236 aa  85.5  9e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.63756 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3535  two component transcriptional regulator  29.06 
 
 		 234 aa  85.1  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.58717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4742  two component transcriptional regulator  28.29 
 
 		 271 aa  84.3  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.683328  normal  0.766945 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0485  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  28.14 
 
 		 244 aa  83.6  0.000000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.773776  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0922  DNA-binding response regulator  28.71 
 
 		 234 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1664  DNA-binding response regulator  28.71 
 
 		 242 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.922311  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1841  DNA-binding response regulator  28.71 
 
 		 242 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1686  DNA-binding response regulator  28.71 
 
 		 242 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0151733  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2638  DNA-binding response regulator  28.71 
 
 		 242 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.55029  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0736  DNA-binding response regulator  28.71 
 
 		 242 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.632099  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1455  DNA-binding response regulator  28.71 
 
 		 242 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0427  DNA-binding response regulator  28.71 
 
 		 234 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0835186  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4665  two component transcriptional regulator  27.23 
 
 		 241 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.145034  normal  0.467542 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1179  two component transcriptional regulator, winged helix family  27.73 
 
 		 237 aa  82.4  0.000000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.566879  normal  0.163877 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1400  two component transcriptional regulator, winged helix family  27.73 
 
 		 237 aa  82.4  0.000000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0577794  normal  0.435154 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1238  response regulator receiver  27.73 
 
 		 237 aa  82.4  0.000000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0943  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.32 
 
 		 235 aa  82  0.000000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.715333  normal  0.0777529 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0583  response regulator receiver domain-containing protein  28.88 
 
 		 231 aa  82  0.000000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000000029507  normal  0.0148942 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0249  two component transcriptional regulator  29.21 
 
 		 233 aa  82  0.000000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0382139  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31270  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  29.26 
 
 		 221 aa  81.6  0.00000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.014564  normal  0.249814 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1695  response regulator receiver  32.61 
 
 		 218 aa  82  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.747822 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1355  two component transcriptional regulator  28.79 
 
 		 234 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.454645  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3159  two component transcriptional regulator  28.28 
 
 		 228 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3389  two component transcriptional regulator  28.76 
 
 		 234 aa  80.9  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.413911  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0390  two component transcriptional regulator, winged helix family  28.02 
 
 		 237 aa  80.9  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.708283  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1268  two component transcriptional regulator, winged helix family  26.32 
 
 		 229 aa  80.9  0.00000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0224  two component transcriptional regulator  28.57 
 
 		 226 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.175792  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1661  two component transcriptional regulator  27.08 
 
 		 245 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0475888 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1316  two component transcriptional regulator  28.79 
 
 		 234 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4991  two component transcriptional regulator, winged helix family  27.08 
 
 		 245 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0655006 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3422  two component transcriptional regulator  29.57 
 
 		 241 aa  79.7  0.00000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1008  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.38 
 
 		 235 aa  79.3  0.00000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4276  two component transcriptional regulator  25.56 
 
 		 236 aa  79.3  0.00000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.886118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1975  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.06 
 
 		 236 aa  79.3  0.00000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.206633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1414  two component transcriptional regulator  27.88 
 
 		 234 aa  79  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4580  two component transcriptional regulator  27.88 
 
 		 234 aa  79  0.00000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.144701  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1397  two component transcriptional regulator  34.39 
 
 		 261 aa  79  0.00000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0231814  hitchhiker  0.000111966 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0954  two component transcriptional regulator  27.88 
 
 		 296 aa  79  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.605306  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1436  two component transcriptional regulator  27.88 
 
 		 234 aa  79  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1332  transcriptional regulatory protein BvrR  25.74 
 
 		 240 aa  78.6  0.00000000000009  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0828  two component transcriptional regulator  28.57 
 
 		 239 aa  78.6  0.00000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0815733  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1504  two component transcriptional regulator  30.46 
 
 		 231 aa  78.2  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263867  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_004310  BR2090  DNA-binding response regulator BvrR, putative  28.57 
 
 		 239 aa  78.2  0.0000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0306093  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1879  two component transcriptional regulator  29.85 
 
 		 234 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0517303 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3904  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.31 
 
 		 230 aa  78.6  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.144495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2010  putative DNA-binding response regulator BvrR  28.57 
 
 		 239 aa  78.2  0.0000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.112651  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5433  two component transcriptional regulator, winged helix family  27.97 
 
 		 238 aa  78.2  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.177781  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0225  two component transcriptional regulator  27.97 
 
 		 238 aa  78.2  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0106464 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3309  two component transcriptional regulator  28.94 
 
 		 220 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1810  DNA-binding response regulator  25.33 
 
 		 233 aa  78.2  0.0000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0562957  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0654  DNA-binding response regulator  29.3 
 
 		 263 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1975  DNA-binding response regulator  29.3 
 
 		 263 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0150258  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13280  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.21 
 
 		 227 aa  77.4  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000536961  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2261  DNA-binding response regulator  29.3 
 
 		 263 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.338205  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1614  DNA-binding response regulator  29.3 
 
 		 244 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0469389  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0660  DNA-binding response regulator  29.3 
 
 		 249 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1940  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.73 
 
 		 219 aa  77.4  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.359722  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2178  DNA-binding response regulator  29.3 
 
 		 263 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.638028  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3931  two component transcriptional regulator  27.35 
 
 		 221 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>