More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc1073 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc1073  two-component system response regulator transcription regulator protein  100 
 
 		 237 aa  476  1e-133  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0139958  normal  0.232974 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1004  two component transcriptional regulator, winged helix family  94.49 
 
 		 237 aa  448  1e-125  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0939  two component transcriptional regulator, winged helix family  94.07 
 
 		 237 aa  447  1e-125  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.155156 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4943  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  56.17 
 
 		 236 aa  282  2.0000000000000002e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4162  OmpR-family response regulator  59.21 
 
 		 232 aa  280  2e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.789041  normal  0.397671 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0028  two component transcriptional regulator  49.34 
 
 		 268 aa  233  3e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0060  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  47.86 
 
 		 235 aa  229  4e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.475352  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0432  two component transcriptional regulator  45.61 
 
 		 237 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000322009  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2530  two component transcriptional regulator  42.79 
 
 		 242 aa  209  4e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.279936  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3520  two component transcriptional regulator  43.83 
 
 		 259 aa  206  2e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.235883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4704  two component transcriptional regulator  43.36 
 
 		 228 aa  204  1e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0100205  normal  0.152582 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5416  two component transcriptional regulator  44.25 
 
 		 237 aa  201  7e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5235  two component transcriptional regulator  42.04 
 
 		 228 aa  199  3e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0575  two component transcriptional regulator  43.91 
 
 		 227 aa  198  6e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00284025  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0390  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.02 
 
 		 237 aa  193  2e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.708283  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6247  two component transcriptional regulator  42.55 
 
 		 245 aa  191  7e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4742  two component transcriptional regulator  39.57 
 
 		 271 aa  191  1e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.683328  normal  0.766945 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0424  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.13 
 
 		 246 aa  188  8e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.116445  hitchhiker  0.0000956185 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0543  response regulator transcription regulator protein  45.09 
 
 		 246 aa  187  2e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0623013  normal  0.919777 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0438  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.09 
 
 		 246 aa  185  5e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.173423  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4276  two component transcriptional regulator  42.04 
 
 		 236 aa  185  5e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.886118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1442  two component transcriptional regulator  42.04 
 
 		 227 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0208535  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1661  two component transcriptional regulator  41.15 
 
 		 245 aa  181  7e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0475888 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0736  DNA-binding response regulator  43.22 
 
 		 242 aa  179  2e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.632099  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1686  DNA-binding response regulator  43.22 
 
 		 242 aa  179  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0151733  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1841  DNA-binding response regulator  43.22 
 
 		 242 aa  179  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2638  DNA-binding response regulator  43.22 
 
 		 242 aa  179  2e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.55029  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1455  DNA-binding response regulator  43.22 
 
 		 242 aa  179  2e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1664  DNA-binding response regulator  43.22 
 
 		 242 aa  179  2e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.922311  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4991  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.15 
 
 		 245 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0655006 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0427  DNA-binding response regulator  42.98 
 
 		 234 aa  178  7e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0835186  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0922  DNA-binding response regulator  42.98 
 
 		 234 aa  178  7e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1879  two component transcriptional regulator  41.41 
 
 		 234 aa  172  5e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0517303 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0954  two component transcriptional regulator  41.67 
 
 		 296 aa  171  5.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.605306  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1355  two component transcriptional regulator  41.41 
 
 		 234 aa  171  1e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.454645  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1414  two component transcriptional regulator  41.41 
 
 		 234 aa  171  1e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4580  two component transcriptional regulator  41.41 
 
 		 234 aa  171  1e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.144701  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1316  two component transcriptional regulator  41.41 
 
 		 234 aa  171  1e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1436  two component transcriptional regulator  41.41 
 
 		 234 aa  171  1e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0838  DNA-binding response regulator  40.36 
 
 		 231 aa  169  3e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0059  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  42.04 
 
 		 242 aa  169  3e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0641  DNA-binding response regulator  40.36 
 
 		 231 aa  169  3e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.381849  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1588  DNA-binding response regulator  40.36 
 
 		 230 aa  169  3e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1563  DNA-binding response regulator  40.36 
 
 		 231 aa  169  3e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0515  DNA-binding response regulator  40.36 
 
 		 231 aa  169  3e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1359  DNA-binding response regulator  40.36 
 
 		 231 aa  169  3e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1748  DNA-binding response regulator  40.36 
 
 		 389 aa  169  4e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2053  DNA-binding response regulator  40.97 
 
 		 237 aa  167  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2192  DNA-binding response regulator  40.97 
 
 		 237 aa  166  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.602573  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0583  response regulator receiver domain-containing protein  35.68 
 
 		 231 aa  163  2.0000000000000002e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000000029507  normal  0.0148942 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3159  two component transcriptional regulator  39.83 
 
 		 228 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4725  putative two component transcriptional regulator, winged helix family  35.5 
 
 		 261 aa  162  4.0000000000000004e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.144117  normal  0.884231 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4558  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.11 
 
 		 246 aa  160  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1073  DNA-binding response regulator  38.2 
 
 		 238 aa  158  8e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6592  two component transcriptional regulator  42.18 
 
 		 227 aa  157  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.2732  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0872  two component transcriptional regulator  38.67 
 
 		 265 aa  156  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.574761 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4665  two component transcriptional regulator  38.36 
 
 		 241 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.145034  normal  0.467542 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4652  two component transcriptional regulator  38.36 
 
 		 247 aa  155  6e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.490614 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11680  two-component regulator  37.34 
 
 		 238 aa  155  8e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0005  two component transcriptional regulator  39.9 
 
 		 238 aa  152  5e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000487758  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1060  two component transcriptional regulator  37.12 
 
 		 230 aa  150  2e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4056  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  35.59 
 
 		 275 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6791  two component transcriptional regulator  43.46 
 
 		 198 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0454459  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0485  phosphate regulon transcriptional regulatory protein PhoB  40.61 
 
 		 227 aa  144  1e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.537934  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0943  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.47 
 
 		 235 aa  144  2e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.715333  normal  0.0777529 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1557  DNA-binding response regulator  33.91 
 
 		 260 aa  142  4e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0833  DNA-binding response regulator  33.91 
 
 		 260 aa  142  4e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1744  DNA-binding response regulator  33.91 
 
 		 260 aa  142  4e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0635  DNA-binding response regulator  33.91 
 
 		 260 aa  142  4e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0959742  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1354  DNA-binding response regulator  33.91 
 
 		 260 aa  142  4e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0124  two component transcriptional regulator  40 
 
 		 227 aa  142  5e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.352403 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0520  DNA-binding response regulator  33.91 
 
 		 261 aa  142  5e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.374054  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1583  DNA-binding response regulator  33.91 
 
 		 260 aa  141  7e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5261  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.43 
 
 		 237 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.909356  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1008  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.04 
 
 		 235 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0027  two component transcriptional regulator  36.93 
 
 		 255 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5652  two component transcriptional regulator  37.82 
 
 		 266 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0393139 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0183  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  38.43 
 
 		 227 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.635675 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0173  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  38.43 
 
 		 227 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.505642  normal  0.985195 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1028  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.79 
 
 		 237 aa  139  4.999999999999999e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5869  two component transcriptional regulator  38.67 
 
 		 261 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1076  two-component system response regulator transcription regulator protein  34.47 
 
 		 251 aa  138  6e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0438  two component transcriptional regulator  36.75 
 
 		 236 aa  138  6e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.316903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0781  two component transcriptional regulator  37.99 
 
 		 233 aa  138  8.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.174075 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2719  two component transcriptional regulator  34.96 
 
 		 248 aa  137  1e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0893  winged helix family two component transcriptional regulator  37.29 
 
 		 233 aa  137  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0202  two component transcriptional regulator  40.09 
 
 		 233 aa  137  1e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.382528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1991  two component transcriptional regulator  37.55 
 
 		 235 aa  137  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5920  two component transcriptional regulator  36.28 
 
 		 249 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0444029 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0640  two component transcriptional regulator  37.55 
 
 		 233 aa  136  3.0000000000000003e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.772339  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1903  two component transcriptional regulator  33.04 
 
 		 230 aa  135  4e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1197  response regulator receiver  36.64 
 
 		 230 aa  135  5e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4918  two component transcriptional regulator  37.12 
 
 		 234 aa  135  8e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.134814 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5185  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  37.18 
 
 		 234 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.809056 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4718  phosphate regulon transcriptional regulatory protein PhoB  37.18 
 
 		 239 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.220817 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4546  two component transcriptional regulator  36.68 
 
 		 230 aa  133  1.9999999999999998e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.281853 
 
 
-
 
NC_004310  BR2143  phosphate regulon transcriptional regulatory protein Phob  39.29 
 
 		 228 aa  132  3e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0511  phosphate regulon transcriptional regulatory protein phoB  39.51 
 
 		 234 aa  133  3e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.473137 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2058  phosphate regulon transcriptional regulatory protein PhoB  39.9 
 
 		 228 aa  132  3e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.275433  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7423  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  36.55 
 
 		 234 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>