More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_0432 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007947  Mfla_0432  two component transcriptional regulator  100 
 
 
237 aa  493  1e-139  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000322009  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0390  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.11 
 
 
237 aa  241  7e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.708283  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5416  two component transcriptional regulator  49.33 
 
 
237 aa  238  5e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4276  two component transcriptional regulator  50.67 
 
 
236 aa  238  9e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.886118  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4991  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.68 
 
 
245 aa  218  5e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0655006 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0736  DNA-binding response regulator  46.26 
 
 
242 aa  216  2e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.632099  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0427  DNA-binding response regulator  46.26 
 
 
234 aa  216  2e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0835186  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0922  DNA-binding response regulator  46.26 
 
 
234 aa  216  2e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1841  DNA-binding response regulator  46.26 
 
 
242 aa  216  2e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2638  DNA-binding response regulator  46.26 
 
 
242 aa  216  2e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.55029  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1664  DNA-binding response regulator  46.26 
 
 
242 aa  216  2e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.922311  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1455  DNA-binding response regulator  46.26 
 
 
242 aa  216  2e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1686  DNA-binding response regulator  46.26 
 
 
242 aa  216  2e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0151733  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1661  two component transcriptional regulator  45.13 
 
 
245 aa  215  4e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0475888 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4943  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  43.61 
 
 
236 aa  214  8e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0954  two component transcriptional regulator  46.29 
 
 
296 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.605306  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1073  two-component system response regulator transcription regulator protein  45.61 
 
 
237 aa  213  1.9999999999999998e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0139958  normal  0.232974 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4580  two component transcriptional regulator  46.29 
 
 
234 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.144701  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1414  two component transcriptional regulator  46.29 
 
 
234 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1436  two component transcriptional regulator  46.29 
 
 
234 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1879  two component transcriptional regulator  46.29 
 
 
234 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0517303 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1355  two component transcriptional regulator  46.29 
 
 
234 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.454645  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1316  two component transcriptional regulator  46.29 
 
 
234 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2530  two component transcriptional regulator  42.04 
 
 
242 aa  210  2e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.279936  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0028  two component transcriptional regulator  44.74 
 
 
268 aa  210  2e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1004  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.3 
 
 
237 aa  209  4e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0939  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.86 
 
 
237 aa  207  1e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.155156 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4742  two component transcriptional regulator  45.18 
 
 
271 aa  206  2e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.683328  normal  0.766945 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0438  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.02 
 
 
246 aa  205  5e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.173423  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4162  OmpR-family response regulator  42.98 
 
 
232 aa  203  2e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.789041  normal  0.397671 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0424  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.58 
 
 
246 aa  202  3e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.116445  hitchhiker  0.0000956185 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0060  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  42.22 
 
 
235 aa  198  6e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.475352  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0543  response regulator transcription regulator protein  43.81 
 
 
246 aa  194  1e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0623013  normal  0.919777 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4704  two component transcriptional regulator  41.23 
 
 
228 aa  186  2e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0100205  normal  0.152582 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1073  DNA-binding response regulator  42.55 
 
 
238 aa  186  4e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3159  two component transcriptional regulator  42.04 
 
 
228 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11680  two-component regulator  42.13 
 
 
238 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5235  two component transcriptional regulator  40.35 
 
 
228 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0575  two component transcriptional regulator  38.05 
 
 
227 aa  175  7e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00284025  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1442  two component transcriptional regulator  38.77 
 
 
227 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0208535  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0005  two component transcriptional regulator  39.74 
 
 
238 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000487758  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0059  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  38.5 
 
 
242 aa  171  9e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6247  two component transcriptional regulator  37.07 
 
 
245 aa  169  5e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6791  two component transcriptional regulator  44.04 
 
 
198 aa  168  9e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0454459  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3520  two component transcriptional regulator  38.94 
 
 
259 aa  167  2e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.235883  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4665  two component transcriptional regulator  38.22 
 
 
241 aa  163  3e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.145034  normal  0.467542 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1060  two component transcriptional regulator  38.1 
 
 
230 aa  161  6e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4558  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.44 
 
 
246 aa  160  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2719  two component transcriptional regulator  37.28 
 
 
248 aa  159  4e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6592  two component transcriptional regulator  35.11 
 
 
227 aa  158  5e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.2732  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0872  two component transcriptional regulator  36 
 
 
265 aa  157  1e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.574761 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1892  two-component system response regulator transcription regulator protein  34.96 
 
 
240 aa  156  3e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00502317  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0027  two component transcriptional regulator  34.87 
 
 
255 aa  155  8e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0583  response regulator receiver domain-containing protein  35.68 
 
 
231 aa  154  1e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000000029507  normal  0.0148942 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0438  two component transcriptional regulator  38.6 
 
 
236 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.316903  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3520  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.16 
 
 
236 aa  149  4e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0476809  normal  0.130253 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4652  two component transcriptional regulator  36.28 
 
 
247 aa  148  7e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.490614 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0082  two component transcriptional regulator  37.32 
 
 
228 aa  140  9.999999999999999e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1413  DNA-binding response regulator  33.93 
 
 
223 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3993  DNA-binding response regulator  33.93 
 
 
223 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.910988 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2474  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.32 
 
 
227 aa  140  1.9999999999999998e-32  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0950849  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1453  DNA-binding response regulator  33.93 
 
 
223 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1389  DNA-binding response regulator  33.48 
 
 
223 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1193  response regulator  33.48 
 
 
223 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1191  response regulator  33.48 
 
 
223 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1213  DNA-binding response regulator  33.48 
 
 
223 aa  139  6e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.203275  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1312  DNA-binding response regulator  33.48 
 
 
223 aa  139  6e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1750  two component transcriptional regulator  35.09 
 
 
234 aa  138  7e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1784  alkaline phosphatase synthesis transcriptional regulatory protein  35.09 
 
 
234 aa  138  7e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.561076  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2281  two component transcriptional regulator  33.78 
 
 
229 aa  138  7.999999999999999e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.331932  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0654  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.68 
 
 
229 aa  138  7.999999999999999e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.200991  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0831  two component transcriptional regulator  36.23 
 
 
228 aa  137  1e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.310785  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4725  putative two component transcriptional regulator, winged helix family  32 
 
 
261 aa  137  1e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.144117  normal  0.884231 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2192  DNA-binding response regulator  35.84 
 
 
237 aa  137  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.602573  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1351  DNA-binding response regulator  33.48 
 
 
223 aa  137  2e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0838  DNA-binding response regulator  35.96 
 
 
231 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1563  DNA-binding response regulator  35.96 
 
 
231 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1359  DNA-binding response regulator  35.96 
 
 
231 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0515  DNA-binding response regulator  35.96 
 
 
231 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1215  two component transcriptional regulator  33.94 
 
 
223 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.533573  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1046  two component transcriptional regulator, winged helix family  36 
 
 
230 aa  136  3.0000000000000003e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0213528  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  35.11 
 
 
229 aa  136  3.0000000000000003e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03700  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  35.61 
 
 
226 aa  136  3.0000000000000003e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.132847 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0442  two component transcriptional regulator  34.58 
 
 
253 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.248748 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0641  DNA-binding response regulator  35.96 
 
 
231 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.381849  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1588  DNA-binding response regulator  35.96 
 
 
230 aa  136  4e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2053  DNA-binding response regulator  34.75 
 
 
237 aa  136  4e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1748  DNA-binding response regulator  33.48 
 
 
389 aa  135  5e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0674  two component transcriptional regulator  36.23 
 
 
228 aa  135  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.850641 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0661  two component transcriptional regulator  36.23 
 
 
228 aa  135  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0654  two component transcriptional regulator  36.23 
 
 
228 aa  135  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.682961 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0997  response regulator receiver  36.54 
 
 
228 aa  134  9.999999999999999e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4929  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.36 
 
 
226 aa  134  9.999999999999999e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_143  DNA-binding response regulator, two-component system, OmpR family  36.24 
 
 
256 aa  134  9.999999999999999e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10499  two component system sensor transduction protein regX3  35.44 
 
 
227 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  2.46064e-66  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1021  two component transcriptional regulator  35.29 
 
 
223 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3599  two component transcriptional regulator  33.75 
 
 
253 aa  132  3e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0200  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.44 
 
 
242 aa  133  3e-30  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0955644  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03750  PhoP-like protein  35.41 
 
 
226 aa  132  3.9999999999999996e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.181369  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5345  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.92 
 
 
230 aa  132  3.9999999999999996e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.264155 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>