More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_2719 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010622  Bphy_2719  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 248 aa  500  1e-140  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0438  two component transcriptional regulator  72.61 
 
 		 236 aa  356  1.9999999999999998e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.316903  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3520  two component transcriptional regulator, winged helix family  71.3 
 
 		 236 aa  351  8e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0476809  normal  0.130253 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0416  two component transcriptional regulator  60.87 
 
 		 253 aa  313  9.999999999999999e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3599  two component transcriptional regulator  60.08 
 
 		 253 aa  309  2e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0442  two component transcriptional regulator  59.68 
 
 		 253 aa  308  4e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.248748 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0484  two component transcriptional regulator  58.27 
 
 		 254 aa  296  2e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.81925 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2592  two component transcriptional regulator  57.87 
 
 		 254 aa  293  2e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.884841  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0512  two component transcriptional regulator  57.87 
 
 		 254 aa  293  2e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0632255  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2886  two component transcriptional regulator  60.09 
 
 		 253 aa  290  2e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.541925  normal  0.0968864 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1661  two component transcriptional regulator  44.86 
 
 		 245 aa  208  8e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0475888 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4991  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.49 
 
 		 245 aa  204  9e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0655006 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1355  two component transcriptional regulator  42.55 
 
 		 234 aa  189  5e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.454645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1316  two component transcriptional regulator  42.55 
 
 		 234 aa  189  5e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0922  DNA-binding response regulator  43.23 
 
 		 234 aa  186  2e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1841  DNA-binding response regulator  43.23 
 
 		 242 aa  187  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1664  DNA-binding response regulator  43.23 
 
 		 242 aa  187  2e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.922311  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1879  two component transcriptional regulator  42.13 
 
 		 234 aa  186  2e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0517303 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2638  DNA-binding response regulator  43.23 
 
 		 242 aa  187  2e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.55029  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0427  DNA-binding response regulator  43.23 
 
 		 234 aa  186  2e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0835186  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0736  DNA-binding response regulator  43.23 
 
 		 242 aa  187  2e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.632099  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1686  DNA-binding response regulator  43.23 
 
 		 242 aa  187  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0151733  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1455  DNA-binding response regulator  43.23 
 
 		 242 aa  187  2e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4580  two component transcriptional regulator  42.13 
 
 		 234 aa  185  5e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.144701  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1414  two component transcriptional regulator  42.13 
 
 		 234 aa  185  5e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1436  two component transcriptional regulator  42.13 
 
 		 234 aa  185  5e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0954  two component transcriptional regulator  42.13 
 
 		 296 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.605306  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3159  two component transcriptional regulator  43.86 
 
 		 228 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4742  two component transcriptional regulator  39.48 
 
 		 271 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.683328  normal  0.766945 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0432  two component transcriptional regulator  37.28 
 
 		 237 aa  159  5e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000322009  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6592  two component transcriptional regulator  39.3 
 
 		 227 aa  157  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.2732  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4162  OmpR-family response regulator  39.82 
 
 		 232 aa  156  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.789041  normal  0.397671 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6791  two component transcriptional regulator  43.46 
 
 		 198 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0454459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4943  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  37.17 
 
 		 236 aa  151  1e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5416  two component transcriptional regulator  39.21 
 
 		 237 aa  151  1e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0060  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  40.09 
 
 		 235 aa  149  4e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.475352  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4276  two component transcriptional regulator  37.61 
 
 		 236 aa  148  6e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.886118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2530  two component transcriptional regulator  34.16 
 
 		 242 aa  148  8e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.279936  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0028  two component transcriptional regulator  39.47 
 
 		 268 aa  144  1e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0438  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.02 
 
 		 246 aa  141  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.173423  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0939  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.68 
 
 		 237 aa  139  4.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.155156 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1073  two-component system response regulator transcription regulator protein  34.96 
 
 		 237 aa  137  1e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0139958  normal  0.232974 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0424  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.23 
 
 		 246 aa  137  1e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.116445  hitchhiker  0.0000956185 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1004  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.68 
 
 		 237 aa  137  1e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0543  response regulator transcription regulator protein  38.59 
 
 		 246 aa  136  4e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0623013  normal  0.919777 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11680  two-component regulator  35.04 
 
 		 238 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0575  two component transcriptional regulator  35.22 
 
 		 227 aa  133  1.9999999999999998e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00284025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1073  DNA-binding response regulator  34.19 
 
 		 238 aa  132  6e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0390  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.18 
 
 		 237 aa  131  1.0000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.708283  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0005  two component transcriptional regulator  36.44 
 
 		 238 aa  128  7.000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000487758  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0583  response regulator receiver domain-containing protein  30.6 
 
 		 231 aa  127  2.0000000000000002e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000000029507  normal  0.0148942 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5235  two component transcriptional regulator  32.89 
 
 		 228 aa  126  3e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4704  two component transcriptional regulator  32.02 
 
 		 228 aa  124  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0100205  normal  0.152582 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0027  two component transcriptional regulator  35.32 
 
 		 255 aa  124  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3520  two component transcriptional regulator  32.46 
 
 		 259 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.235883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4558  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.07 
 
 		 246 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0059  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  34.21 
 
 		 242 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1008  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.33 
 
 		 235 aa  120  3e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6247  two component transcriptional regulator  36.52 
 
 		 245 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0872  two component transcriptional regulator  34.22 
 
 		 265 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.574761 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1076  two-component system response regulator transcription regulator protein  31.69 
 
 		 251 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2192  DNA-binding response regulator  35.78 
 
 		 237 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.602573  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4665  two component transcriptional regulator  33.48 
 
 		 241 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.145034  normal  0.467542 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0943  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.89 
 
 		 235 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.715333  normal  0.0777529 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2053  DNA-binding response regulator  35.78 
 
 		 237 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4725  putative two component transcriptional regulator, winged helix family  35.1 
 
 		 261 aa  110  3e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.144117  normal  0.884231 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1588  DNA-binding response regulator  35.59 
 
 		 230 aa  107  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1442  two component transcriptional regulator  29.07 
 
 		 227 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0208535  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0515  DNA-binding response regulator  35.47 
 
 		 231 aa  106  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0838  DNA-binding response regulator  35.47 
 
 		 231 aa  106  3e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1563  DNA-binding response regulator  35.47 
 
 		 231 aa  106  3e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1359  DNA-binding response regulator  35.47 
 
 		 231 aa  106  3e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0641  DNA-binding response regulator  35.47 
 
 		 231 aa  106  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.381849  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1748  DNA-binding response regulator  34.82 
 
 		 389 aa  106  4e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4056  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  38.1 
 
 		 275 aa  105  6e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1060  two component transcriptional regulator  30.4 
 
 		 230 aa  104  1e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3888  two component transcriptional regulator  31.44 
 
 		 223 aa  103  3e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.130623  normal  0.799765 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1487  two component transcriptional regulator, winged helix family  30 
 
 		 232 aa  101  1e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.487145  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0587  two component transcriptional regulator  31.58 
 
 		 222 aa  100  2e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1892  two-component system response regulator transcription regulator protein  30.7 
 
 		 240 aa  100  3e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00502317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1354  DNA-binding response regulator  31.11 
 
 		 260 aa  100  3e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0833  DNA-binding response regulator  31.11 
 
 		 260 aa  100  3e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1557  DNA-binding response regulator  31.11 
 
 		 260 aa  100  3e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1744  DNA-binding response regulator  31.11 
 
 		 260 aa  100  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0520  DNA-binding response regulator  31.11 
 
 		 261 aa  100  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.374054  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1583  DNA-binding response regulator  31.11 
 
 		 260 aa  100  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0635  DNA-binding response regulator  31.11 
 
 		 260 aa  100  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0959742  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0499  two component transcriptional regulator  26.99 
 
 		 223 aa  99  6e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0329  two component transcriptional regulator, winged helix family  27.07 
 
 		 231 aa  98.6  9e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1268  two component transcriptional regulator, winged helix family  25.66 
 
 		 229 aa  97.4  2e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0554  DNA-binding response regulator  26.22 
 
 		 223 aa  97.1  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0585  DNA-binding response regulator  26.22 
 
 		 223 aa  97.1  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0503  two component transcriptional regulator  25.78 
 
 		 223 aa  97.1  2e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0496  response regulator  26.22 
 
 		 223 aa  96.7  3e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0498  response regulator  26.22 
 
 		 223 aa  96.7  3e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0641  DNA-binding response regulator  26.22 
 
 		 223 aa  96.7  3e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0638  two component transcriptional regulator  30.73 
 
 		 233 aa  96.7  3e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.403787  normal  0.96994 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0650  DNA-binding response regulator  26.22 
 
 		 223 aa  96.3  4e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0711  DNA-binding response regulator  26.22 
 
 		 223 aa  96.3  4e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1708  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.37 
 
 		 228 aa  95.9  5e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.476364 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>