More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_2886 on replicon NC_010084
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010084  Bmul_2886  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 253 aa  512  1e-144  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.541925  normal  0.0968864 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3599  two component transcriptional regulator  83.79 
 
 		 253 aa  435  1e-121  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0416  two component transcriptional regulator  83.79 
 
 		 253 aa  434  1e-121  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0442  two component transcriptional regulator  83.79 
 
 		 253 aa  433  1e-120  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.248748 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2592  two component transcriptional regulator  81.1 
 
 		 254 aa  420  1e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.884841  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0512  two component transcriptional regulator  81.1 
 
 		 254 aa  420  1e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0632255  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0484  two component transcriptional regulator  81.1 
 
 		 254 aa  419  1e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.81925 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3520  two component transcriptional regulator, winged helix family  63.91 
 
 		 236 aa  298  4e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0476809  normal  0.130253 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0438  two component transcriptional regulator  63.48 
 
 		 236 aa  296  3e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.316903  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2719  two component transcriptional regulator  60.09 
 
 		 248 aa  290  2e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1661  two component transcriptional regulator  42.8 
 
 		 245 aa  185  7e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0475888 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4991  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.34 
 
 		 245 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0655006 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0922  DNA-binding response regulator  43.67 
 
 		 234 aa  176  4e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0427  DNA-binding response regulator  43.67 
 
 		 234 aa  176  4e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0835186  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0736  DNA-binding response regulator  43.67 
 
 		 242 aa  176  5e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.632099  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1664  DNA-binding response regulator  43.67 
 
 		 242 aa  176  5e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.922311  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1841  DNA-binding response regulator  43.67 
 
 		 242 aa  176  5e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2638  DNA-binding response regulator  43.67 
 
 		 242 aa  176  5e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.55029  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1686  DNA-binding response regulator  43.67 
 
 		 242 aa  176  5e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0151733  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1455  DNA-binding response regulator  43.67 
 
 		 242 aa  176  5e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1355  two component transcriptional regulator  42.79 
 
 		 234 aa  175  7e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.454645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1316  two component transcriptional regulator  42.79 
 
 		 234 aa  175  7e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1879  two component transcriptional regulator  42.36 
 
 		 234 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0517303 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4580  two component transcriptional regulator  42.36 
 
 		 234 aa  171  7.999999999999999e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.144701  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1414  two component transcriptional regulator  42.36 
 
 		 234 aa  171  7.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1436  two component transcriptional regulator  42.36 
 
 		 234 aa  171  7.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0954  two component transcriptional regulator  42.36 
 
 		 296 aa  171  1e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.605306  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4742  two component transcriptional regulator  38.1 
 
 		 271 aa  162  3e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.683328  normal  0.766945 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3159  two component transcriptional regulator  41.13 
 
 		 228 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6592  two component transcriptional regulator  39.74 
 
 		 227 aa  149  6e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.2732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1073  DNA-binding response regulator  36.29 
 
 		 238 aa  133  3e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2530  two component transcriptional regulator  33.48 
 
 		 242 aa  130  1.0000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.279936  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11680  two-component regulator  35.86 
 
 		 238 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6791  two component transcriptional regulator  41.27 
 
 		 198 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0454459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0432  two component transcriptional regulator  34.19 
 
 		 237 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000322009  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4943  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  35.06 
 
 		 236 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5416  two component transcriptional regulator  35.96 
 
 		 237 aa  125  7e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4162  OmpR-family response regulator  36.56 
 
 		 232 aa  125  7e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.789041  normal  0.397671 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0939  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.96 
 
 		 237 aa  123  3e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.155156 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4276  two component transcriptional regulator  33.19 
 
 		 236 aa  123  3e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.886118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0028  two component transcriptional regulator  36.12 
 
 		 268 aa  122  6e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1004  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.51 
 
 		 237 aa  120  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0543  response regulator transcription regulator protein  37.29 
 
 		 246 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0623013  normal  0.919777 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0060  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  35.53 
 
 		 235 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.475352  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1073  two-component system response regulator transcription regulator protein  34.96 
 
 		 237 aa  119  3.9999999999999996e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0139958  normal  0.232974 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0059  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  35.5 
 
 		 242 aa  118  9e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0390  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.37 
 
 		 237 aa  118  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.708283  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0005  two component transcriptional regulator  33.62 
 
 		 238 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000487758  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0872  two component transcriptional regulator  34.07 
 
 		 265 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.574761 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0943  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.65 
 
 		 235 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.715333  normal  0.0777529 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0027  two component transcriptional regulator  34.98 
 
 		 255 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0438  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.2 
 
 		 246 aa  108  6e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.173423  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1076  two-component system response regulator transcription regulator protein  33.62 
 
 		 251 aa  108  7.000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4558  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.63 
 
 		 246 aa  108  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6247  two component transcriptional regulator  41.45 
 
 		 245 aa  107  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0424  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.2 
 
 		 246 aa  106  3e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.116445  hitchhiker  0.0000956185 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1008  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.21 
 
 		 235 aa  107  3e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0575  two component transcriptional regulator  32.31 
 
 		 227 aa  106  4e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00284025  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4665  two component transcriptional regulator  31.72 
 
 		 241 aa  105  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.145034  normal  0.467542 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0902  two component transcriptional regulator  31.72 
 
 		 224 aa  104  1e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.375579  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5235  two component transcriptional regulator  29.82 
 
 		 228 aa  103  3e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4704  two component transcriptional regulator  29.82 
 
 		 228 aa  102  7e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0100205  normal  0.152582 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2913  two component transcriptional regulator  34.63 
 
 		 227 aa  101  1e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0379396  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0583  response regulator receiver domain-containing protein  34.18 
 
 		 231 aa  100  2e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000000029507  normal  0.0148942 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2053  DNA-binding response regulator  30.87 
 
 		 237 aa  96.7  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1060  two component transcriptional regulator  29.52 
 
 		 230 aa  96.3  4e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3520  two component transcriptional regulator  29.74 
 
 		 259 aa  96.3  4e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.235883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2192  DNA-binding response regulator  30.87 
 
 		 237 aa  95.5  6e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.602573  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2474  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.29 
 
 		 227 aa  94.7  1e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0950849  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1961  phosphate regulon response regulator PhoB  29.52 
 
 		 225 aa  94.4  2e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.411469  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3888  two component transcriptional regulator  31 
 
 		 223 aa  94  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.130623  normal  0.799765 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4725  putative two component transcriptional regulator, winged helix family  30.7 
 
 		 261 aa  94  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.144117  normal  0.884231 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3539  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.33 
 
 		 268 aa  92.8  5e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.224989  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0943  two component transcriptional regulator  31.22 
 
 		 223 aa  92  7e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0172896  normal  0.994999 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1487  two component transcriptional regulator, winged helix family  28.07 
 
 		 232 aa  91.7  9e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.487145  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1892  two-component system response regulator transcription regulator protein  29.65 
 
 		 240 aa  90.5  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00502317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1442  two component transcriptional regulator  29.07 
 
 		 230 aa  90.5  2e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1074  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.26 
 
 		 248 aa  90.9  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.798214 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1196  two-component transcriptional regulator  30.1 
 
 		 238 aa  90.1  3e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0435  DNA-binding response regulator  27.95 
 
 		 228 aa  89.7  4e-17  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1842  two component transcriptional regulator  30.26 
 
 		 240 aa  89.7  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0925  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.26 
 
 		 248 aa  89.7  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0932454  normal  0.0109566 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1442  two component transcriptional regulator  28.51 
 
 		 227 aa  89.4  5e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0208535  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0638  two component transcriptional regulator  31.22 
 
 		 233 aa  89  7e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.403787  normal  0.96994 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4054  two component transcriptional regulator  30.6 
 
 		 226 aa  89  7e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.271916 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1268  two component transcriptional regulator, winged helix family  25.22 
 
 		 229 aa  88.6  8e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0450  two component transcriptional regulator  32.06 
 
 		 227 aa  88.2  1e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0944  two component transcriptional regulator  28.92 
 
 		 225 aa  87.4  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.091613  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3442  two component transcriptional regulator  28.63 
 
 		 241 aa  87.4  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.297648  normal  0.0871248 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2012  winged helix family two component transcriptional regulator  29.07 
 
 		 241 aa  87.8  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.566736  normal  0.606644 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0415  two component transcriptional regulator  29.78 
 
 		 231 aa  87.4  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.777838 
 
 
-
 
NC_002950  PG1089  DNA-binding response regulator RprY  25.66 
 
 		 245 aa  86.7  3e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.414682 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0704  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.95 
 
 		 227 aa  86.7  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.205827  normal  0.593451 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03750  PhoP-like protein  27.19 
 
 		 226 aa  86.7  4e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.181369  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3078  two component transcriptional regulator  28.63 
 
 		 234 aa  85.9  5e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1370  two component response regulator  30.24 
 
 		 252 aa  86.3  5e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3651  two component transcriptional regulator, winged helix family  27.07 
 
 		 228 aa  85.9  5e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0435949 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2641  two component transcriptional regulator  32.48 
 
 		 239 aa  85.5  7e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2236  two component transcriptional regulator  29 
 
 		 227 aa  85.5  8e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.214459  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0329  two component transcriptional regulator, winged helix family  27.07 
 
 		 231 aa  85.5  8e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>