More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_0442 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_0442  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 253 aa  513  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.248748 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0416  two component transcriptional regulator  98.02 
 
 		 253 aa  501  1e-141  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3599  two component transcriptional regulator  94.07 
 
 		 253 aa  486  1e-136  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0484  two component transcriptional regulator  90.55 
 
 		 254 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.81925 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2592  two component transcriptional regulator  90.55 
 
 		 254 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.884841  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0512  two component transcriptional regulator  90.55 
 
 		 254 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0632255  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2886  two component transcriptional regulator  83.79 
 
 		 253 aa  433  1e-120  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.541925  normal  0.0968864 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3520  two component transcriptional regulator, winged helix family  67.39 
 
 		 236 aa  319  3e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0476809  normal  0.130253 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0438  two component transcriptional regulator  66.96 
 
 		 236 aa  317  1e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.316903  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2719  two component transcriptional regulator  59.68 
 
 		 248 aa  308  4e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1661  two component transcriptional regulator  45.2 
 
 		 245 aa  195  5.000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0475888 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4991  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.95 
 
 		 245 aa  190  2e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0655006 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0427  DNA-binding response regulator  44.98 
 
 		 234 aa  186  3e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0835186  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0922  DNA-binding response regulator  44.98 
 
 		 234 aa  186  3e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1686  DNA-binding response regulator  44.98 
 
 		 242 aa  186  4e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0151733  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0736  DNA-binding response regulator  44.98 
 
 		 242 aa  186  4e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.632099  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1841  DNA-binding response regulator  44.98 
 
 		 242 aa  186  4e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2638  DNA-binding response regulator  44.98 
 
 		 242 aa  186  4e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.55029  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1664  DNA-binding response regulator  44.98 
 
 		 242 aa  186  4e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.922311  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1455  DNA-binding response regulator  44.98 
 
 		 242 aa  186  4e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1355  two component transcriptional regulator  44.54 
 
 		 234 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.454645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1316  two component transcriptional regulator  44.54 
 
 		 234 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1879  two component transcriptional regulator  44.1 
 
 		 234 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0517303 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4580  two component transcriptional regulator  44.1 
 
 		 234 aa  181  1e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.144701  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1436  two component transcriptional regulator  44.1 
 
 		 234 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1414  two component transcriptional regulator  44.1 
 
 		 234 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0954  two component transcriptional regulator  44.1 
 
 		 296 aa  180  2e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.605306  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3159  two component transcriptional regulator  42.98 
 
 		 228 aa  164  9e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4742  two component transcriptional regulator  38.1 
 
 		 271 aa  161  1e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.683328  normal  0.766945 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6592  two component transcriptional regulator  41.48 
 
 		 227 aa  150  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.2732  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2530  two component transcriptional regulator  35.5 
 
 		 242 aa  144  2e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.279936  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4276  two component transcriptional regulator  35.4 
 
 		 236 aa  137  2e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.886118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0432  two component transcriptional regulator  34.58 
 
 		 237 aa  136  4e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000322009  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6791  two component transcriptional regulator  41.67 
 
 		 198 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0454459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1073  DNA-binding response regulator  35.04 
 
 		 238 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0390  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.99 
 
 		 237 aa  130  1.0000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.708283  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11680  two-component regulator  35.04 
 
 		 238 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0939  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.96 
 
 		 237 aa  129  5.0000000000000004e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.155156 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0028  two component transcriptional regulator  37 
 
 		 268 aa  128  8.000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1004  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.96 
 
 		 237 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1073  two-component system response regulator transcription regulator protein  35.4 
 
 		 237 aa  126  4.0000000000000003e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0139958  normal  0.232974 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0060  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  36.96 
 
 		 235 aa  124  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.475352  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0943  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.96 
 
 		 235 aa  124  1e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.715333  normal  0.0777529 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4162  OmpR-family response regulator  34.96 
 
 		 232 aa  124  1e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.789041  normal  0.397671 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5416  two component transcriptional regulator  33.92 
 
 		 237 aa  124  1e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4943  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  32.17 
 
 		 236 aa  123  3e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0005  two component transcriptional regulator  36.02 
 
 		 238 aa  122  7e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000487758  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0543  response regulator transcription regulator protein  36.48 
 
 		 246 aa  121  9.999999999999999e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0623013  normal  0.919777 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0872  two component transcriptional regulator  34.65 
 
 		 265 aa  120  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.574761 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1008  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.09 
 
 		 235 aa  119  3.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5235  two component transcriptional regulator  33.48 
 
 		 228 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4558  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.19 
 
 		 246 aa  115  5e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4704  two component transcriptional regulator  33.48 
 
 		 228 aa  115  5e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0100205  normal  0.152582 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1076  two-component system response regulator transcription regulator protein  33.33 
 
 		 251 aa  115  6e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0438  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.27 
 
 		 246 aa  115  6.9999999999999995e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.173423  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0575  two component transcriptional regulator  33.19 
 
 		 227 aa  112  4.0000000000000004e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00284025  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4665  two component transcriptional regulator  32.6 
 
 		 241 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.145034  normal  0.467542 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0424  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.4 
 
 		 246 aa  112  7.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.116445  hitchhiker  0.0000956185 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0059  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  35.42 
 
 		 242 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0027  two component transcriptional regulator  34.9 
 
 		 255 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6247  two component transcriptional regulator  41.45 
 
 		 245 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0583  response regulator receiver domain-containing protein  29.49 
 
 		 231 aa  107  2e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000000029507  normal  0.0148942 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3520  two component transcriptional regulator  30.17 
 
 		 259 aa  103  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.235883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1442  two component transcriptional regulator  30.43 
 
 		 227 aa  102  7e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0208535  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1487  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.33 
 
 		 232 aa  99.4  5e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.487145  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2474  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.43 
 
 		 227 aa  99  7e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0950849  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1060  two component transcriptional regulator  29.96 
 
 		 230 aa  98.6  7e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2053  DNA-binding response regulator  30.87 
 
 		 237 aa  98.2  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2192  DNA-binding response regulator  30.87 
 
 		 237 aa  97.4  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.602573  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0902  two component transcriptional regulator  30.24 
 
 		 224 aa  95.5  6e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.375579  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4725  putative two component transcriptional regulator, winged helix family  31.28 
 
 		 261 aa  95.5  8e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.144117  normal  0.884231 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4221  two component transcriptional regulator  35 
 
 		 270 aa  94.7  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.41661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2522  two component transcriptional regulator, winged helix family  28.89 
 
 		 226 aa  94  2e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0274  two component transcriptional regulator, winged helix family  27.31 
 
 		 232 aa  92.4  7e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.701823  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1588  DNA-binding response regulator  28.76 
 
 		 230 aa  92  9e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1892  two-component system response regulator transcription regulator protein  29.96 
 
 		 240 aa  91.3  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00502317  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0838  DNA-binding response regulator  28.57 
 
 		 231 aa  90.9  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1359  DNA-binding response regulator  28.57 
 
 		 231 aa  90.9  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0515  DNA-binding response regulator  28.57 
 
 		 231 aa  90.9  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1563  DNA-binding response regulator  28.57 
 
 		 231 aa  90.9  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0641  DNA-binding response regulator  28.57 
 
 		 231 aa  90.9  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.381849  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1748  DNA-binding response regulator  28.57 
 
 		 389 aa  90.1  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4652  two component transcriptional regulator  31.09 
 
 		 247 aa  90.1  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.490614 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1961  phosphate regulon response regulator PhoB  28.51 
 
 		 225 aa  89.7  4e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.411469  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2106  two component transcriptional regulator, winged helix family  27.35 
 
 		 238 aa  89.7  4e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0415  two component transcriptional regulator  32 
 
 		 231 aa  89.4  5e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.777838 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3888  two component transcriptional regulator  28.95 
 
 		 223 aa  89.4  6e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.130623  normal  0.799765 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2913  two component transcriptional regulator  31.55 
 
 		 227 aa  89  7e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0379396  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1089  DNA-binding response regulator RprY  26.55 
 
 		 245 aa  88.6  8e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.414682 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1220  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.13 
 
 		 233 aa  88.6  8e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00991602 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03750  PhoP-like protein  26.75 
 
 		 226 aa  88.2  1e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.181369  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20650  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  28.38 
 
 		 231 aa  87.8  2e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0260682  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2641  two component transcriptional regulator  33.75 
 
 		 239 aa  87.4  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1074  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.1 
 
 		 248 aa  87.8  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.798214 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3739  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.64 
 
 		 230 aa  87  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000466515  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0435  DNA-binding response regulator  27.05 
 
 		 228 aa  87  3e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3539  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.06 
 
 		 268 aa  86.7  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.224989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1263  two component transcriptional regulator  34.36 
 
 		 256 aa  86.7  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0638  two component transcriptional regulator  30.92 
 
 		 233 aa  86.7  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.403787  normal  0.96994 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4151  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.83 
 
 		 230 aa  86.7  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>