More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_4221 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_4221  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 270 aa  552  1e-156  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.41661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1661  two component transcriptional regulator  32.85 
 
 		 245 aa  112  5e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0475888 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3159  two component transcriptional regulator  31.13 
 
 		 228 aa  108  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4991  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.11 
 
 		 245 aa  107  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0655006 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2530  two component transcriptional regulator  30.59 
 
 		 242 aa  107  3e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.279936  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1355  two component transcriptional regulator  32.45 
 
 		 234 aa  102  6e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.454645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1316  two component transcriptional regulator  32.45 
 
 		 234 aa  102  6e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1414  two component transcriptional regulator  31.91 
 
 		 234 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4580  two component transcriptional regulator  31.91 
 
 		 234 aa  101  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.144701  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1436  two component transcriptional regulator  31.91 
 
 		 234 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1879  two component transcriptional regulator  31.91 
 
 		 234 aa  101  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0517303 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0954  two component transcriptional regulator  31.91 
 
 		 296 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.605306  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1455  DNA-binding response regulator  31.91 
 
 		 242 aa  101  2e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0922  DNA-binding response regulator  31.91 
 
 		 234 aa  101  2e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1664  DNA-binding response regulator  31.91 
 
 		 242 aa  101  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.922311  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1686  DNA-binding response regulator  31.91 
 
 		 242 aa  101  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0151733  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1841  DNA-binding response regulator  31.91 
 
 		 242 aa  101  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0736  DNA-binding response regulator  31.91 
 
 		 242 aa  101  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.632099  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0427  DNA-binding response regulator  31.91 
 
 		 234 aa  101  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0835186  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2638  DNA-binding response regulator  31.91 
 
 		 242 aa  101  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.55029  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1073  DNA-binding response regulator  30.88 
 
 		 238 aa  100  3e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11680  two-component regulator  30.96 
 
 		 238 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0390  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.47 
 
 		 237 aa  97.8  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.708283  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0060  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  28.97 
 
 		 235 aa  97.8  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.475352  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4276  two component transcriptional regulator  30.54 
 
 		 236 aa  96.7  4e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.886118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0005  two component transcriptional regulator  30.05 
 
 		 238 aa  95.5  9e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000487758  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0442  two component transcriptional regulator  35 
 
 		 253 aa  94.7  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.248748 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4162  OmpR-family response regulator  29.86 
 
 		 232 aa  94.4  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.789041  normal  0.397671 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4943  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  28.11 
 
 		 236 aa  92.8  5e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0416  two component transcriptional regulator  35 
 
 		 253 aa  92.4  6e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4742  two component transcriptional regulator  27.81 
 
 		 271 aa  92.4  7e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.683328  normal  0.766945 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0939  two component transcriptional regulator, winged helix family  28.57 
 
 		 237 aa  92  8e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.155156 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1073  two-component system response regulator transcription regulator protein  28.91 
 
 		 237 aa  91.7  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0139958  normal  0.232974 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1004  two component transcriptional regulator, winged helix family  28.91 
 
 		 237 aa  91.7  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6791  two component transcriptional regulator  30.94 
 
 		 198 aa  90.1  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0454459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0575  two component transcriptional regulator  28.16 
 
 		 227 aa  89.7  5e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00284025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0028  two component transcriptional regulator  28.77 
 
 		 268 aa  89.4  5e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0059  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  29.05 
 
 		 242 aa  89  8e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6247  two component transcriptional regulator  27.78 
 
 		 245 aa  89  8e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0424  two component transcriptional regulator, winged helix family  25.46 
 
 		 246 aa  87.4  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.116445  hitchhiker  0.0000956185 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0543  response regulator transcription regulator protein  28.44 
 
 		 246 aa  86.7  3e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0623013  normal  0.919777 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1892  two-component system response regulator transcription regulator protein  26.32 
 
 		 240 aa  87  3e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00502317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0512  two component transcriptional regulator  35 
 
 		 254 aa  87  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0632255  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0484  two component transcriptional regulator  35 
 
 		 254 aa  87  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.81925 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2592  two component transcriptional regulator  35 
 
 		 254 aa  87  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.884841  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8578  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.78 
 
 		 231 aa  86.7  4e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0565107  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0583  response regulator receiver domain-containing protein  29.06 
 
 		 231 aa  86.7  4e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000000029507  normal  0.0148942 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2313  two component transcriptional regulator  24.88 
 
 		 228 aa  86.3  5e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0313786  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1008  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.33 
 
 		 235 aa  86.3  5e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0438  two component transcriptional regulator, winged helix family  25 
 
 		 246 aa  86.3  5e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.173423  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0943  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.33 
 
 		 235 aa  86.3  6e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.715333  normal  0.0777529 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3599  two component transcriptional regulator  33.75 
 
 		 253 aa  85.9  7e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3789  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.39 
 
 		 245 aa  85.5  9e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0841995  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5235  two component transcriptional regulator  26.67 
 
 		 228 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0438  two component transcriptional regulator  30.65 
 
 		 236 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.316903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4704  two component transcriptional regulator  27.14 
 
 		 228 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0100205  normal  0.152582 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3564  two component transcriptional regulator  33.11 
 
 		 230 aa  84.7  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.153344  normal  0.125376 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3520  two component transcriptional regulator  28.88 
 
 		 259 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.235883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1572  two component transcriptional regulator  29.13 
 
 		 225 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000784208  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4670  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.24 
 
 		 234 aa  84  0.000000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0872  two component transcriptional regulator  24.9 
 
 		 265 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.574761 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2914  two component transcriptional regulator  33.69 
 
 		 245 aa  83.2  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.634998  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3106  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.69 
 
 		 234 aa  83.2  0.000000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3000  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.69 
 
 		 234 aa  83.2  0.000000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2556  two component transcriptional regulator  29.13 
 
 		 225 aa  82.8  0.000000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000044969  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1076  two-component system response regulator transcription regulator protein  28.16 
 
 		 251 aa  82.4  0.000000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2021  regulatory protein VanR  23.44 
 
 		 228 aa  82.4  0.000000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4046  response regulator receiver  25.73 
 
 		 225 aa  81.6  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4558  two component transcriptional regulator, winged helix family  24.66 
 
 		 246 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6592  two component transcriptional regulator  28.29 
 
 		 227 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.2732  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1028  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.11 
 
 		 237 aa  80.9  0.00000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3520  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.23 
 
 		 236 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0476809  normal  0.130253 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0818  two component transcriptional regulator, winged helix family  28.11 
 
 		 236 aa  79.3  0.00000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.501115  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1060  two component transcriptional regulator  27.86 
 
 		 230 aa  79.3  0.00000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0208  two component transcriptional regulator  25.46 
 
 		 240 aa  79  0.00000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5345  two component transcriptional regulator, winged helix family  27.62 
 
 		 230 aa  78.6  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.264155 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3288  two component transcriptional regulator  31.25 
 
 		 225 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0366247  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2886  two component transcriptional regulator  31.25 
 
 		 253 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.541925  normal  0.0968864 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3620  DNA-binding response regulator  30.63 
 
 		 225 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0597824  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3627  DNA-binding response regulator  30.63 
 
 		 225 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000456124  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3396  DNA-binding response regulator  30.63 
 
 		 225 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000765328  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3612  DNA-binding response regulator  30.63 
 
 		 225 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.20142e-22 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3358  transcriptional regulatory protein  30.63 
 
 		 225 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000200566  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1606  DNA-binding response regulator  30.63 
 
 		 225 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00543423  hitchhiker  0.0000000112462 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3308  transcriptional regulatory protein  30.63 
 
 		 225 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000872353  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3709  DNA-binding response regulator  30.63 
 
 		 225 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000227696  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1197  response regulator receiver  30.61 
 
 		 230 aa  77.4  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0151  two component transcriptional regulator  25.35 
 
 		 241 aa  77.8  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3661  DNA-binding response regulator  30.63 
 
 		 225 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000222084  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4900  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.76 
 
 		 221 aa  77.8  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.196174  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0432  two component transcriptional regulator  25.13 
 
 		 237 aa  77.8  0.0000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000322009  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1442  two component transcriptional regulator  23.9 
 
 		 227 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0208535  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0461  two component transcriptional regulator  30.73 
 
 		 248 aa  77.4  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.735267  normal  0.697364 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2719  two component transcriptional regulator  27.15 
 
 		 248 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0674  two component transcriptional regulator  25.36 
 
 		 228 aa  77.4  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.850641 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1374  two component transcriptional regulator, winged helix family  25.48 
 
 		 219 aa  77.4  0.0000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000555295  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0654  two component transcriptional regulator  25.36 
 
 		 228 aa  77.4  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.682961 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0661  two component transcriptional regulator  25.36 
 
 		 228 aa  77.4  0.0000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10499  two component system sensor transduction protein regX3  25.48 
 
 		 227 aa  76.6  0.0000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  2.46064e-66  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0378  two component transcriptional regulator  26.67 
 
 		 234 aa  76.6  0.0000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>