More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_3789 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_3789  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 
245 aa  482  1e-135  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0841995  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0588  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.41 
 
 
226 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.944339  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1572  two component transcriptional regulator  39.04 
 
 
225 aa  156  3e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000784208  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1397  two component transcriptional regulator  40.69 
 
 
261 aa  154  1e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0231814  hitchhiker  0.000111966 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1956  DNA-binding response regulator  33.47 
 
 
232 aa  152  4e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.387323  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1985  DNA-binding response regulator  33.89 
 
 
232 aa  152  7e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2693  two component transcriptional regulator  37.72 
 
 
226 aa  151  8.999999999999999e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.575064 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1102  DNA-binding response regulator  38.6 
 
 
225 aa  151  1e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1739  DNA-binding response regulator  33.47 
 
 
232 aa  150  1e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1877  DNA-binding response regulator  33.47 
 
 
232 aa  150  1e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1689  response regulator  33.47 
 
 
232 aa  150  2e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1869  DNA-binding response regulator  33.47 
 
 
232 aa  150  2e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0644  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.69 
 
 
236 aa  150  2e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3473  DNA-binding response regulator  33.05 
 
 
232 aa  150  2e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000348992 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2526  DNA-binding response regulator  34.75 
 
 
231 aa  149  3e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1715  response regulator  33.05 
 
 
232 aa  149  3e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0124001  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1028  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.39 
 
 
237 aa  149  3e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2796  DNA-binding response regulator  34.75 
 
 
231 aa  149  3e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.512352  hitchhiker  0.00000533196 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1912  DNA-binding response regulator  33.05 
 
 
232 aa  148  6e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0928779 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2564  DNA-binding response regulator  34.32 
 
 
231 aa  148  6e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0589521  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0707  two component transcriptional regulator  38.53 
 
 
232 aa  148  6e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2385  DNA-binding response regulator  34.32 
 
 
231 aa  148  7e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.534853  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2341  DNA-binding response regulator  34.32 
 
 
231 aa  148  7e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000166477  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2302  DNA-binding response regulator  34.32 
 
 
231 aa  148  7e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2561  DNA-binding response regulator  34.32 
 
 
231 aa  148  7e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.630654  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2617  DNA-binding response regulator  34.32 
 
 
231 aa  148  7e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.993672  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2574  DNA-binding response regulator  34.32 
 
 
231 aa  148  7e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000040017 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0987  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.74 
 
 
233 aa  148  9e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.195539  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2351  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.91 
 
 
231 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.274912  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0470  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.3 
 
 
239 aa  147  1.0000000000000001e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0260801  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1215  two component transcriptional regulator  34.65 
 
 
223 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.533573  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2513  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.96 
 
 
225 aa  146  3e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1903  two component transcriptional regulator  35.5 
 
 
230 aa  146  3e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2952  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.91 
 
 
225 aa  145  5e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1846  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.24 
 
 
226 aa  145  8.000000000000001e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1413  DNA-binding response regulator  34.67 
 
 
223 aa  144  1e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1815  two component transcriptional regulator  33.47 
 
 
232 aa  144  1e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.101184  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4959  DNA-binding response regulator  35.96 
 
 
223 aa  144  1e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000160223  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1351  DNA-binding response regulator  34.91 
 
 
223 aa  144  1e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1453  DNA-binding response regulator  34.67 
 
 
223 aa  144  1e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5353  DNA-binding response regulator  35.96 
 
 
223 aa  144  1e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1208  phosphate regulon response regulator PhoB  35.22 
 
 
233 aa  143  2e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1897  two component transcriptional regulator  38.7 
 
 
227 aa  143  2e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.151466  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4944  DNA-binding response regulator  35.96 
 
 
223 aa  143  2e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0109954  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4029  two component transcriptional regulator  40.08 
 
 
241 aa  143  2e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.871415 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0489  two component transcriptional regulator  38.43 
 
 
228 aa  144  2e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0234  response regulator receiver  34.78 
 
 
221 aa  143  2e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1271  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.47 
 
 
225 aa  144  2e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5433  DNA-binding response regulator  36.4 
 
 
223 aa  143  3e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3993  DNA-binding response regulator  34.91 
 
 
223 aa  142  3e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.910988 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5379  DNA-binding response regulator  35.96 
 
 
223 aa  143  3e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1213  DNA-binding response regulator  35.11 
 
 
223 aa  143  3e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.203275  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1193  response regulator  34.67 
 
 
223 aa  143  3e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1312  DNA-binding response regulator  35.11 
 
 
223 aa  143  3e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1389  DNA-binding response regulator  34.67 
 
 
223 aa  143  3e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0818  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.41 
 
 
236 aa  143  3e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.501115  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1487  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.77 
 
 
232 aa  142  4e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.487145  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1191  response regulator  34.67 
 
 
223 aa  142  4e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2556  two component transcriptional regulator  39.04 
 
 
225 aa  142  4e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000044969  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2159  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.34 
 
 
227 aa  142  4e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00177162  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1600  two component transcriptional regulator  35.11 
 
 
224 aa  142  4e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000237714  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2802  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.41 
 
 
219 aa  142  5e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.204502 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1865  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.09 
 
 
226 aa  142  5e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1892  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.78 
 
 
228 aa  142  5e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000392  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4009  two component transcriptional regulator  40 
 
 
230 aa  142  5e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00751412  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3794  two component transcriptional regulator  36.84 
 
 
223 aa  142  6e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0280755  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4125  two component transcriptional regulator, winged helix family  40 
 
 
230 aa  142  7e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.125271  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0815  two component transcriptional regulator  36.55 
 
 
248 aa  142  7e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.348891 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4151  two component transcriptional regulator, winged helix family  40 
 
 
230 aa  141  7e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1021  two component transcriptional regulator  33.77 
 
 
223 aa  141  8e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14770  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  38.2 
 
 
226 aa  141  8e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.383411  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5426  two component transcriptional regulator  35.68 
 
 
251 aa  141  8e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5905  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.66 
 
 
237 aa  141  9e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4006  two component transcriptional regulator  35.47 
 
 
235 aa  141  9e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.010356  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1587  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.56 
 
 
231 aa  140  9.999999999999999e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4285  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.45 
 
 
238 aa  140  9.999999999999999e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.83647  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5569  DNA-binding response regulator  35.96 
 
 
223 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4496  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.13 
 
 
245 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3482  two component transcriptional regulator  38.46 
 
 
231 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1508  two component transcriptional regulator  36.75 
 
 
237 aa  140  1.9999999999999998e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1174  two component transcriptional regulator  36.71 
 
 
239 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0181894  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1461  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.29 
 
 
225 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.616357  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2443  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.68 
 
 
224 aa  140  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00121019 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5589  DNA-binding response regulator YycF  35.47 
 
 
235 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0469644  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1136  two component transcriptional regulator  36.71 
 
 
239 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000652217  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1728  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.17 
 
 
233 aa  140  1.9999999999999998e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5346  DNA-binding response regulator YycF  35.04 
 
 
235 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000234523  hitchhiker  0.00000000000323141 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2712  two component transcriptional regulator  37.12 
 
 
224 aa  140  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00552555  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13280  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.53 
 
 
227 aa  140  1.9999999999999998e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000536961  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5385  DNA-binding response regulator  35.96 
 
 
223 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_143  DNA-binding response regulator, two-component system, OmpR family  38.96 
 
 
256 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3815  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.3 
 
 
225 aa  140  1.9999999999999998e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0278114  normal  0.0118387 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1924  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.22 
 
 
225 aa  139  3e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2286  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.09 
 
 
231 aa  139  3e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000188753  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5113  DNA-binding response regulator  35.09 
 
 
223 aa  140  3e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00211772  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5504  DNA-binding response regulator  35.09 
 
 
223 aa  140  3e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43340  two-component response regulator KdpE  38.4 
 
 
230 aa  139  3e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.807414  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3636  two-component response regulator KdpE  38.82 
 
 
230 aa  140  3e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.9171  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5055  two component transcriptional regulator  35.96 
 
 
223 aa  139  3e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5147  response regulator  35.47 
 
 
235 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00168683  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>