More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_2802 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_2802  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 
219 aa  434  1e-121  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.204502 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0142  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.73 
 
 
221 aa  217  8.999999999999998e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.709604 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0302  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.45 
 
 
221 aa  217  1e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0841  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.57 
 
 
223 aa  191  6e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1028  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.64 
 
 
237 aa  181  6e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2564  two component transcriptional regulator  47.25 
 
 
244 aa  181  1e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1784  alkaline phosphatase synthesis transcriptional regulatory protein  43.42 
 
 
234 aa  179  2e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.561076  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1750  two component transcriptional regulator  43.42 
 
 
234 aa  179  2e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2675  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.17 
 
 
234 aa  177  1e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.661044  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1256  alkaline phosphatase synthesis transcriptional regulatory protein PhoP  42.42 
 
 
236 aa  174  9.999999999999999e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.577358  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1740  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.44 
 
 
225 aa  172  5e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000204942  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1954  two component transcriptional regulator  41.3 
 
 
229 aa  172  5e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000155813  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1539  two component transcriptional regulator, winged helix family  50 
 
 
222 aa  171  1e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000287281  normal  0.103291 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1696  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.44 
 
 
224 aa  168  5e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13280  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.23 
 
 
227 aa  168  5e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000536961  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1681  response regulator receiver protein  43.36 
 
 
227 aa  168  7e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0956507  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  44.2 
 
 
229 aa  168  8e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3302  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.78 
 
 
231 aa  166  2e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000343135 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0644  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.91 
 
 
236 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1181  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.13 
 
 
234 aa  165  4e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00335068 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1504  two component transcriptional regulator  42.98 
 
 
231 aa  165  4e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263867  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1903  two component transcriptional regulator  41.67 
 
 
230 aa  165  5e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1374  two component transcriptional regulator  41.96 
 
 
238 aa  165  5e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0785  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.67 
 
 
235 aa  165  5.9999999999999996e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0393  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.78 
 
 
227 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.202895 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0543  two component transcriptional regulator  42.92 
 
 
241 aa  164  1.0000000000000001e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0087  two component transcriptional regulator  45.45 
 
 
222 aa  164  1.0000000000000001e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3737  two component transcriptional regulator  43.17 
 
 
231 aa  163  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00273603 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1897  two component transcriptional regulator  43.89 
 
 
227 aa  163  2.0000000000000002e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.151466  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3739  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.18 
 
 
230 aa  162  2.0000000000000002e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000466515  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2981  two component transcriptional regulator  44.14 
 
 
229 aa  163  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000201285  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0353  two component transcriptional regulator  44.54 
 
 
230 aa  162  3e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.683455 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4914  two component transcriptional regulator  40.97 
 
 
238 aa  162  3e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.095278 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1508  two component transcriptional regulator  41.23 
 
 
237 aa  162  4.0000000000000004e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1220  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.04 
 
 
233 aa  162  4.0000000000000004e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00991602 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4549  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.44 
 
 
221 aa  162  4.0000000000000004e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.703481  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2351  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.29 
 
 
231 aa  162  5.0000000000000005e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.274912  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1728  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.04 
 
 
233 aa  162  5.0000000000000005e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2678  winged helix family two component transcriptional regulator  40.71 
 
 
240 aa  161  6e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4198  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.56 
 
 
226 aa  161  6e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1924  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.91 
 
 
225 aa  161  6e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2782  two component transcriptional regulator  43.95 
 
 
231 aa  161  7e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.92379  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0827  two component transcriptional regulator  42.79 
 
 
256 aa  161  8.000000000000001e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00211389  normal  0.244563 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4496  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.79 
 
 
245 aa  161  8.000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3274  two component transcriptional regulator  39.83 
 
 
238 aa  160  1e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1174  two component transcriptional regulator  40.87 
 
 
239 aa  160  1e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0181894  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1136  two component transcriptional regulator  40.87 
 
 
239 aa  160  1e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000652217  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1397  two component transcriptional regulator  39.39 
 
 
261 aa  160  1e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0231814  hitchhiker  0.000111966 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1021  two component transcriptional regulator  40.83 
 
 
223 aa  160  2e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5433  DNA-binding response regulator  40.45 
 
 
223 aa  159  2e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2440  two component transcriptional regulator  41.96 
 
 
222 aa  160  2e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0936231  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3703  two component transcriptional regulator  40 
 
 
232 aa  160  2e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.230236  normal  0.0884672 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0761  two component transcriptional regulator  42.53 
 
 
229 aa  159  2e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.179681 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0951  response regulator receiver protein  41.05 
 
 
239 aa  160  2e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000111905  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1580  response regulator receiver  38.36 
 
 
241 aa  159  3e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4720  DNA-binding response regulator PhoP  39.66 
 
 
239 aa  159  3e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0295  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.59 
 
 
242 aa  159  3e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4959  DNA-binding response regulator  40.45 
 
 
223 aa  159  3e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000160223  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5385  DNA-binding response regulator  40.91 
 
 
223 aa  159  3e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1176  two component transcriptional regulator  41.33 
 
 
229 aa  159  3e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.149936 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5353  DNA-binding response regulator  40.45 
 
 
223 aa  159  3e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1815  two component transcriptional regulator  35.65 
 
 
232 aa  159  3e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.101184  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1549  two component transcriptional regulator  38.36 
 
 
241 aa  159  3e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0805  two component transcriptional regulator  40 
 
 
229 aa  159  3e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0307  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.59 
 
 
242 aa  159  3e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5569  DNA-binding response regulator  40.91 
 
 
223 aa  159  3e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2988  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.04 
 
 
242 aa  159  3e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.410423  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2662  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.97 
 
 
231 aa  159  4e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5379  DNA-binding response regulator  40.45 
 
 
223 aa  159  4e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6757  two component transcriptional regulator  41.23 
 
 
239 aa  159  4e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.250889  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1561  two component transcriptional regulator  41.23 
 
 
239 aa  159  4e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.932075  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1261  DNA-binding response regulator  41.05 
 
 
236 aa  159  4e-38  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000139979  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6268  two component transcriptional regulator  41.23 
 
 
239 aa  159  4e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.350192  normal  0.482642 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5550  two component transcriptional regulator  40.79 
 
 
239 aa  158  5e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0815  two component transcriptional regulator  40.35 
 
 
248 aa  158  5e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.348891 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5785  two component transcriptional regulator  40.79 
 
 
239 aa  158  5e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.281368 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4484  DNA-binding response regulator PhoP  39.22 
 
 
239 aa  158  6e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4704  DNA-binding response regulator PhoP  39.22 
 
 
239 aa  158  6e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000673192 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4319  alkaline phosphatase synthesis response regulator  39.22 
 
 
239 aa  158  6e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4330  alkaline phosphatase synthesis response regulator  39.22 
 
 
239 aa  158  6e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4833  DNA-binding response regulator PhoP  39.22 
 
 
239 aa  158  6e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0982965  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21640  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.89 
 
 
226 aa  158  6e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000176926  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4714  DNA-binding response regulator PhoP  39.22 
 
 
239 aa  158  6e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2216  two component transcriptional regulator  39.55 
 
 
224 aa  158  6e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5113  DNA-binding response regulator  40 
 
 
223 aa  158  7e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00211772  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4944  DNA-binding response regulator  40.45 
 
 
223 aa  158  7e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0109954  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4699  DNA-binding response regulator PhoP  39.22 
 
 
239 aa  158  7e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5504  DNA-binding response regulator  40 
 
 
223 aa  158  7e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0312  response regulator receiver  45.13 
 
 
233 aa  158  7e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0102436  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0539  DNA-binding response regulator PhoP  39.22 
 
 
239 aa  158  7e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000130788 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1055  DNA-binding response regulator SrrA  38.79 
 
 
241 aa  158  8e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1419  two component transcriptional regulator  44.26 
 
 
231 aa  157  8e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0720218  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1007  two component transcriptional regulator  44.59 
 
 
233 aa  157  8e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00149  transcriptional regulator CpxR  41.33 
 
 
229 aa  158  8e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4445  two component transcriptional regulator  41.18 
 
 
229 aa  157  8e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.14031 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5055  two component transcriptional regulator  40.45 
 
 
223 aa  157  8e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2302  DNA-binding response regulator  36.96 
 
 
231 aa  157  9e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0997  two component transcriptional regulator  42.04 
 
 
230 aa  157  9e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.679101  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3782  response regulator receiver  42.79 
 
 
297 aa  157  9e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2180  DNA-binding response regulator  41.18 
 
 
223 aa  157  1e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0299585  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>