More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A0059 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A0059  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  100 
 
 		 242 aa  486  1e-136  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0027  two component transcriptional regulator  50.83 
 
 		 255 aa  223  2e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0028  two component transcriptional regulator  46.29 
 
 		 268 aa  196  3e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0060  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  45.09 
 
 		 235 aa  189  4e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.475352  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1879  two component transcriptional regulator  41.67 
 
 		 234 aa  181  1e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0517303 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4162  OmpR-family response regulator  42.92 
 
 		 232 aa  180  2e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.789041  normal  0.397671 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4580  two component transcriptional regulator  41.67 
 
 		 234 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.144701  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1414  two component transcriptional regulator  41.67 
 
 		 234 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1436  two component transcriptional regulator  41.67 
 
 		 234 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1355  two component transcriptional regulator  41.23 
 
 		 234 aa  179  4e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.454645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0954  two component transcriptional regulator  41.56 
 
 		 296 aa  179  4e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.605306  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1316  two component transcriptional regulator  41.23 
 
 		 234 aa  179  4e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0427  DNA-binding response regulator  39.91 
 
 		 234 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0835186  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0922  DNA-binding response regulator  39.91 
 
 		 234 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1841  DNA-binding response regulator  39.91 
 
 		 242 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1664  DNA-binding response regulator  39.91 
 
 		 242 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.922311  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2638  DNA-binding response regulator  39.91 
 
 		 242 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.55029  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1455  DNA-binding response regulator  39.91 
 
 		 242 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1686  DNA-binding response regulator  39.91 
 
 		 242 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0151733  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0736  DNA-binding response regulator  39.91 
 
 		 242 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.632099  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4943  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  39.65 
 
 		 236 aa  172  3.9999999999999995e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1661  two component transcriptional regulator  41.41 
 
 		 245 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0475888 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0438  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.73 
 
 		 246 aa  171  6.999999999999999e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.173423  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0432  two component transcriptional regulator  38.5 
 
 		 237 aa  171  1e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000322009  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4991  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.97 
 
 		 245 aa  171  1e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0655006 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4704  two component transcriptional regulator  41.52 
 
 		 228 aa  171  1e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0100205  normal  0.152582 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1073  two-component system response regulator transcription regulator protein  42.04 
 
 		 237 aa  169  3e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0139958  normal  0.232974 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0424  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.29 
 
 		 246 aa  169  3e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.116445  hitchhiker  0.0000956185 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0939  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.59 
 
 		 237 aa  169  3e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.155156 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1004  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.59 
 
 		 237 aa  169  5e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5235  two component transcriptional regulator  40.62 
 
 		 228 aa  168  6e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0543  response regulator transcription regulator protein  42.29 
 
 		 246 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0623013  normal  0.919777 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4742  two component transcriptional regulator  37.99 
 
 		 271 aa  162  4.0000000000000004e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.683328  normal  0.766945 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0390  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.56 
 
 		 237 aa  160  1e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.708283  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2530  two component transcriptional regulator  36.44 
 
 		 242 aa  155  4e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.279936  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5416  two component transcriptional regulator  37.78 
 
 		 237 aa  154  1e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4276  two component transcriptional regulator  38.67 
 
 		 236 aa  152  2.9999999999999998e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.886118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3159  two component transcriptional regulator  38.77 
 
 		 228 aa  151  1e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6791  two component transcriptional regulator  41.15 
 
 		 198 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0454459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6592  two component transcriptional regulator  39.38 
 
 		 227 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.2732  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0575  two component transcriptional regulator  37.33 
 
 		 227 aa  145  7.0000000000000006e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00284025  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3520  two component transcriptional regulator  35.11 
 
 		 259 aa  143  2e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.235883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6247  two component transcriptional regulator  34.96 
 
 		 245 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2192  DNA-binding response regulator  34.96 
 
 		 237 aa  137  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.602573  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2053  DNA-binding response regulator  34.51 
 
 		 237 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0872  two component transcriptional regulator  34.73 
 
 		 265 aa  135  4e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.574761 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4665  two component transcriptional regulator  34.8 
 
 		 241 aa  131  7.999999999999999e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.145034  normal  0.467542 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4558  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.71 
 
 		 246 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4725  putative two component transcriptional regulator, winged helix family  33.63 
 
 		 261 aa  129  4.0000000000000003e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.144117  normal  0.884231 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1748  DNA-binding response regulator  32.62 
 
 		 389 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1442  two component transcriptional regulator  32.59 
 
 		 227 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0208535  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0838  DNA-binding response regulator  32.89 
 
 		 231 aa  126  3e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0641  DNA-binding response regulator  32.89 
 
 		 231 aa  126  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.381849  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0515  DNA-binding response regulator  32.89 
 
 		 231 aa  126  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1359  DNA-binding response regulator  32.89 
 
 		 231 aa  126  3e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1563  DNA-binding response regulator  32.89 
 
 		 231 aa  126  3e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1588  DNA-binding response regulator  32.74 
 
 		 230 aa  126  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1892  two-component system response regulator transcription regulator protein  32.29 
 
 		 240 aa  123  2e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00502317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4056  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  35.53 
 
 		 275 aa  122  4e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2719  two component transcriptional regulator  34.21 
 
 		 248 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1073  DNA-binding response regulator  32.76 
 
 		 238 aa  119  3e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4652  two component transcriptional regulator  34.36 
 
 		 247 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.490614 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3520  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.56 
 
 		 236 aa  118  6e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0476809  normal  0.130253 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0583  response regulator receiver domain-containing protein  32.89 
 
 		 231 aa  118  7.999999999999999e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000000029507  normal  0.0148942 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2886  two component transcriptional regulator  35.5 
 
 		 253 aa  118  7.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.541925  normal  0.0968864 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11680  two-component regulator  32.76 
 
 		 238 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0438  two component transcriptional regulator  36.52 
 
 		 236 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.316903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0005  two component transcriptional regulator  32.48 
 
 		 238 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000487758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2954  two component transcriptional regulator  35.94 
 
 		 226 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.120358 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1583  DNA-binding response regulator  31.11 
 
 		 260 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0635  DNA-binding response regulator  31.11 
 
 		 260 aa  113  3e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0959742  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1354  DNA-binding response regulator  31.11 
 
 		 260 aa  113  3e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0833  DNA-binding response regulator  31.11 
 
 		 260 aa  113  3e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1744  DNA-binding response regulator  31.11 
 
 		 260 aa  113  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1557  DNA-binding response regulator  31.11 
 
 		 260 aa  113  3e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0520  DNA-binding response regulator  31.11 
 
 		 261 aa  113  3e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.374054  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3599  two component transcriptional regulator  35.83 
 
 		 253 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0442  two component transcriptional regulator  35.42 
 
 		 253 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.248748 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2474  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.24 
 
 		 227 aa  111  1.0000000000000001e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0950849  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0416  two component transcriptional regulator  35.83 
 
 		 253 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3888  two component transcriptional regulator  32.89 
 
 		 223 aa  110  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.130623  normal  0.799765 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2015  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.18 
 
 		 228 aa  110  2.0000000000000002e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1155  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.19 
 
 		 230 aa  110  2.0000000000000002e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.560017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2592  two component transcriptional regulator  36.1 
 
 		 254 aa  109  3e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.884841  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0512  two component transcriptional regulator  36.1 
 
 		 254 aa  109  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0632255  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0484  two component transcriptional regulator  35.68 
 
 		 254 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.81925 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0343  response regulator receiver  35.61 
 
 		 232 aa  107  2e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.86362  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2549  response regulator receiver  32.27 
 
 		 222 aa  105  8e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1060  two component transcriptional regulator  30.97 
 
 		 230 aa  105  8e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1021  two component transcriptional regulator  30.14 
 
 		 223 aa  105  8e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1784  alkaline phosphatase synthesis transcriptional regulatory protein  28.51 
 
 		 234 aa  105  9e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.561076  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1750  two component transcriptional regulator  28.51 
 
 		 234 aa  105  9e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21090  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  30.97 
 
 		 231 aa  105  9e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.664911  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1076  two-component system response regulator transcription regulator protein  28.07 
 
 		 251 aa  104  1e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0552  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.36 
 
 		 226 aa  104  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.496663 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0804  two component transcriptional regulator  32.46 
 
 		 236 aa  104  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.324741  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2106  two component transcriptional regulator, winged helix family  28.91 
 
 		 238 aa  103  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3419  two component transcriptional regulator  32.74 
 
 		 242 aa  104  2e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1838  two component transcriptional regulator  29.61 
 
 		 239 aa  103  3e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000194698  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5089  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.47 
 
 		 242 aa  103  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.160869  normal  0.250223 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>