More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_3159 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_3159  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 228 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1661  two component transcriptional regulator  70 
 
 		 245 aa  318  5e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0475888 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4991  two component transcriptional regulator, winged helix family  69.57 
 
 		 245 aa  316  2e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0655006 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0922  DNA-binding response regulator  58.37 
 
 		 234 aa  273  1.0000000000000001e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1664  DNA-binding response regulator  58.37 
 
 		 242 aa  273  1.0000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.922311  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0427  DNA-binding response regulator  58.37 
 
 		 234 aa  273  1.0000000000000001e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0835186  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1841  DNA-binding response regulator  58.37 
 
 		 242 aa  273  1.0000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1455  DNA-binding response regulator  58.37 
 
 		 242 aa  273  1.0000000000000001e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2638  DNA-binding response regulator  58.37 
 
 		 242 aa  273  1.0000000000000001e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.55029  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1686  DNA-binding response regulator  58.37 
 
 		 242 aa  273  1.0000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0151733  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0736  DNA-binding response regulator  58.37 
 
 		 242 aa  273  1.0000000000000001e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.632099  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1355  two component transcriptional regulator  57.76 
 
 		 234 aa  266  1e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.454645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1316  two component transcriptional regulator  57.76 
 
 		 234 aa  266  1e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1879  two component transcriptional regulator  57.76 
 
 		 234 aa  266  2e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0517303 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4580  two component transcriptional regulator  57.33 
 
 		 234 aa  265  4e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.144701  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1414  two component transcriptional regulator  57.33 
 
 		 234 aa  265  4e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1436  two component transcriptional regulator  57.33 
 
 		 234 aa  265  4e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0954  two component transcriptional regulator  57.33 
 
 		 296 aa  264  8e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.605306  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4742  two component transcriptional regulator  43.97 
 
 		 271 aa  213  1.9999999999999998e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.683328  normal  0.766945 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6791  two component transcriptional regulator  50.52 
 
 		 198 aa  190  1e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0454459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0432  two component transcriptional regulator  42.04 
 
 		 237 aa  184  9e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000322009  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0390  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.54 
 
 		 237 aa  184  1.0000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.708283  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4943  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  43.35 
 
 		 236 aa  183  2.0000000000000003e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2719  two component transcriptional regulator  43.86 
 
 		 248 aa  174  8e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0028  two component transcriptional regulator  43.61 
 
 		 268 aa  171  6.999999999999999e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4162  OmpR-family response regulator  41.85 
 
 		 232 aa  169  2e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.789041  normal  0.397671 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0939  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.45 
 
 		 237 aa  170  2e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.155156 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1004  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.45 
 
 		 237 aa  169  3e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0575  two component transcriptional regulator  40.17 
 
 		 227 aa  167  1e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00284025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4276  two component transcriptional regulator  40.09 
 
 		 236 aa  167  1e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.886118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2530  two component transcriptional regulator  39.74 
 
 		 242 aa  167  2e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.279936  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6592  two component transcriptional regulator  40.53 
 
 		 227 aa  167  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.2732  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0416  two component transcriptional regulator  43.86 
 
 		 253 aa  166  2e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5416  two component transcriptional regulator  39.11 
 
 		 237 aa  165  4e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0442  two component transcriptional regulator  42.98 
 
 		 253 aa  164  6.9999999999999995e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.248748 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3599  two component transcriptional regulator  42.54 
 
 		 253 aa  162  3e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1073  two-component system response regulator transcription regulator protein  39.83 
 
 		 237 aa  162  4.0000000000000004e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0139958  normal  0.232974 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0438  two component transcriptional regulator  42.98 
 
 		 236 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.316903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0060  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  39.91 
 
 		 235 aa  161  6e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.475352  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0424  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.26 
 
 		 246 aa  161  7e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.116445  hitchhiker  0.0000956185 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5235  two component transcriptional regulator  36.8 
 
 		 228 aa  161  1e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4704  two component transcriptional regulator  36.36 
 
 		 228 aa  160  2e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0100205  normal  0.152582 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0438  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.39 
 
 		 246 aa  158  9e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.173423  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2592  two component transcriptional regulator  42.11 
 
 		 254 aa  157  9e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.884841  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0512  two component transcriptional regulator  42.11 
 
 		 254 aa  157  9e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0632255  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0484  two component transcriptional regulator  41.67 
 
 		 254 aa  156  3e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.81925 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3520  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.23 
 
 		 236 aa  154  9e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0476809  normal  0.130253 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1442  two component transcriptional regulator  36.73 
 
 		 227 aa  153  2e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0208535  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2886  two component transcriptional regulator  41.13 
 
 		 253 aa  153  2e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.541925  normal  0.0968864 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0543  response regulator transcription regulator protein  39.39 
 
 		 246 aa  152  5e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0623013  normal  0.919777 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1073  DNA-binding response regulator  38.33 
 
 		 238 aa  151  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0059  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  38.77 
 
 		 242 aa  151  1e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6247  two component transcriptional regulator  39.38 
 
 		 245 aa  147  9e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0872  two component transcriptional regulator  37.18 
 
 		 265 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.574761 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11680  two-component regulator  37.92 
 
 		 238 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3520  two component transcriptional regulator  36.09 
 
 		 259 aa  146  3e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.235883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0005  two component transcriptional regulator  37.66 
 
 		 238 aa  144  1e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000487758  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4558  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.75 
 
 		 246 aa  144  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4665  two component transcriptional regulator  36.73 
 
 		 241 aa  134  9e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.145034  normal  0.467542 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0027  two component transcriptional regulator  34.68 
 
 		 255 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0583  response regulator receiver domain-containing protein  32.91 
 
 		 231 aa  124  1e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000000029507  normal  0.0148942 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1588  DNA-binding response regulator  34.07 
 
 		 230 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0552  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.27 
 
 		 226 aa  119  3.9999999999999996e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.496663 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0838  DNA-binding response regulator  33.93 
 
 		 231 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0515  DNA-binding response regulator  33.93 
 
 		 231 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0641  DNA-binding response regulator  33.93 
 
 		 231 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.381849  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1359  DNA-binding response regulator  33.93 
 
 		 231 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1563  DNA-binding response regulator  33.93 
 
 		 231 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1748  DNA-binding response regulator  33.93 
 
 		 389 aa  119  6e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2053  DNA-binding response regulator  32.74 
 
 		 237 aa  118  7e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2192  DNA-binding response regulator  32.74 
 
 		 237 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.602573  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4652  two component transcriptional regulator  33.48 
 
 		 247 aa  115  5e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.490614 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1892  two-component system response regulator transcription regulator protein  30.67 
 
 		 240 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00502317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1060  two component transcriptional regulator  34.06 
 
 		 230 aa  113  2.0000000000000002e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1413  DNA-binding response regulator  29.46 
 
 		 223 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1197  response regulator receiver  34.22 
 
 		 230 aa  110  1.0000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1453  DNA-binding response regulator  29.46 
 
 		 223 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5920  two component transcriptional regulator  32.89 
 
 		 249 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0444029 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1351  DNA-binding response regulator  29.46 
 
 		 223 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3993  DNA-binding response regulator  29.46 
 
 		 223 aa  109  3e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.910988 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2990  two component transcriptional regulator  31.25 
 
 		 230 aa  109  3e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.140246 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1215  two component transcriptional regulator  29.91 
 
 		 223 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.533573  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1191  response regulator  29.02 
 
 		 223 aa  108  5e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1193  response regulator  29.02 
 
 		 223 aa  108  5e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1389  DNA-binding response regulator  29.02 
 
 		 223 aa  108  5e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2474  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.48 
 
 		 227 aa  108  6e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0950849  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1213  DNA-binding response regulator  29.02 
 
 		 223 aa  108  7.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.203275  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1312  DNA-binding response regulator  29.02 
 
 		 223 aa  108  7.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03700  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  30.67 
 
 		 226 aa  108  8.000000000000001e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.132847 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1256  alkaline phosphatase synthesis transcriptional regulatory protein PhoP  28.14 
 
 		 236 aa  108  9.000000000000001e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.577358  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4221  two component transcriptional regulator  31.13 
 
 		 270 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.41661  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1961  phosphate regulon response regulator PhoB  31.25 
 
 		 225 aa  107  1e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.411469  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4549  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.12 
 
 		 221 aa  107  1e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.703481  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2324  two component transcriptional regulator, winged helix family  28 
 
 		 226 aa  107  1e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2367  two component transcriptional regulator  33.48 
 
 		 235 aa  107  2e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1491  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  33.48 
 
 		 235 aa  106  2e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1102  DNA-binding response regulator  33.04 
 
 		 225 aa  106  3e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0818  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.74 
 
 		 236 aa  106  3e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.501115  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0769  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.56 
 
 		 236 aa  105  6e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1090  two component transcriptional regulator  34.22 
 
 		 230 aa  105  6e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0839689 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>