More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_5920 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_5920  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 249 aa  502  1e-141  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0444029 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0766  DNA-binding response regulator  62.5 
 
 		 249 aa  290  2e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.692099  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0660  DNA-binding response regulator  61.61 
 
 		 249 aa  288  8e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2261  DNA-binding response regulator  61.61 
 
 		 263 aa  287  9e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.338205  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0654  DNA-binding response regulator  61.61 
 
 		 263 aa  287  9e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2178  DNA-binding response regulator  61.61 
 
 		 263 aa  287  9e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.638028  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1614  DNA-binding response regulator  61.61 
 
 		 244 aa  287  9e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0469389  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1975  DNA-binding response regulator  61.61 
 
 		 263 aa  287  9e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0150258  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5652  two component transcriptional regulator  56.79 
 
 		 266 aa  275  6e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0393139 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5869  two component transcriptional regulator  58.33 
 
 		 261 aa  272  3e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4704  two component transcriptional regulator  37.95 
 
 		 228 aa  148  9e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0100205  normal  0.152582 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5235  two component transcriptional regulator  37.67 
 
 		 228 aa  146  3e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3413  two component transcriptional regulator  38.16 
 
 		 252 aa  144  1e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.427436 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0399  two component transcriptional regulator  38.57 
 
 		 272 aa  144  2e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.802217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0939  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.44 
 
 		 237 aa  142  4e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.155156 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1004  two component transcriptional regulator, winged helix family  37 
 
 		 237 aa  141  9e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4546  two component transcriptional regulator  39.11 
 
 		 230 aa  141  9e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.281853 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3116  two component transcriptional regulator  38.29 
 
 		 229 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.202822  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3280  DNA-binding response regulator  35.68 
 
 		 228 aa  138  7e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000001291  hitchhiker  0.0000698043 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1991  two component transcriptional regulator  37.89 
 
 		 235 aa  138  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1073  two-component system response regulator transcription regulator protein  36.28 
 
 		 237 aa  136  3.0000000000000003e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0139958  normal  0.232974 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0575  two component transcriptional regulator  36.65 
 
 		 227 aa  136  3.0000000000000003e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00284025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0511  phosphate regulon transcriptional regulatory protein phoB  39.04 
 
 		 234 aa  136  4e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.473137 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0640  two component transcriptional regulator  37.72 
 
 		 233 aa  135  5e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.772339  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2339  two component transcriptional regulator  38.5 
 
 		 231 aa  135  7.000000000000001e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4918  two component transcriptional regulator  37.89 
 
 		 234 aa  135  8e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.134814 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7423  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  37.78 
 
 		 234 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0583  response regulator receiver domain-containing protein  34.98 
 
 		 231 aa  134  9.999999999999999e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000000029507  normal  0.0148942 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6685  two component transcriptional regulator  38.05 
 
 		 234 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.599421  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4991  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.92 
 
 		 245 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0655006 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5261  two component transcriptional regulator, winged helix family  37 
 
 		 237 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.909356  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0893  winged helix family two component transcriptional regulator  37 
 
 		 233 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5257  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.16 
 
 		 234 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.025536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0124  two component transcriptional regulator  37.33 
 
 		 227 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.352403 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5185  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  37.72 
 
 		 234 aa  133  3e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.809056 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0173  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  37.05 
 
 		 227 aa  133  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.505642  normal  0.985195 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0183  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  37.05 
 
 		 227 aa  133  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.635675 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0834  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  37.55 
 
 		 265 aa  133  3e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0108417 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4718  phosphate regulon transcriptional regulatory protein PhoB  37.72 
 
 		 239 aa  133  3e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.220817 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0202  two component transcriptional regulator  38.57 
 
 		 233 aa  133  3e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.382528  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0485  phosphate regulon transcriptional regulatory protein PhoB  36.89 
 
 		 227 aa  132  3.9999999999999996e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.537934  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0781  two component transcriptional regulator  36.56 
 
 		 233 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.174075 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1661  two component transcriptional regulator  33.2 
 
 		 245 aa  132  6e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0475888 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0483  two component transcriptional regulator  34.8 
 
 		 229 aa  132  6.999999999999999e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.342081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2811  DNA-binding response regulator  31.25 
 
 		 228 aa  131  7.999999999999999e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3923  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.87 
 
 		 224 aa  129  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4943  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  32.89 
 
 		 236 aa  129  4.0000000000000003e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0736  DNA-binding response regulator  35.56 
 
 		 242 aa  129  6e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.632099  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0427  DNA-binding response regulator  35.56 
 
 		 234 aa  129  6e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0835186  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1686  DNA-binding response regulator  35.56 
 
 		 242 aa  129  6e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0151733  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0922  DNA-binding response regulator  35.56 
 
 		 234 aa  129  6e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1841  DNA-binding response regulator  35.56 
 
 		 242 aa  129  6e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1455  DNA-binding response regulator  35.56 
 
 		 242 aa  129  6e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1664  DNA-binding response regulator  35.56 
 
 		 242 aa  129  6e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.922311  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2638  DNA-binding response regulator  35.56 
 
 		 242 aa  129  6e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.55029  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1355  two component transcriptional regulator  34.3 
 
 		 234 aa  128  7.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.454645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2058  phosphate regulon transcriptional regulatory protein PhoB  36.73 
 
 		 228 aa  128  7.000000000000001e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.275433  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0603  two component transcriptional regulator  33.19 
 
 		 233 aa  128  7.000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0519325  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1316  two component transcriptional regulator  34.3 
 
 		 234 aa  128  7.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0644  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.58 
 
 		 236 aa  128  8.000000000000001e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4422  response regulator receiver  36.4 
 
 		 237 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.259959  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2143  phosphate regulon transcriptional regulatory protein Phob  37.55 
 
 		 228 aa  128  1.0000000000000001e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3366  DNA-binding response regulator  28.89 
 
 		 225 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.166078  hitchhiker  0.00000000000000126215 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5187  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.43 
 
 		 228 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000511147 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4460  two component transcriptional regulator  35.75 
 
 		 230 aa  127  1.0000000000000001e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.94443  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1879  two component transcriptional regulator  33.88 
 
 		 234 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0517303 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0954  two component transcriptional regulator  33.88 
 
 		 296 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.605306  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1962  DNA-binding response regulator  28.44 
 
 		 225 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.597164  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0543  response regulator transcription regulator protein  33.48 
 
 		 246 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0623013  normal  0.919777 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3577  two component transcriptional regulator  35.19 
 
 		 232 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.70324 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1028  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.33 
 
 		 237 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4580  two component transcriptional regulator  33.88 
 
 		 234 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.144701  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1257  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 229 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.536699  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2497  DNA-binding response regulator  30.36 
 
 		 228 aa  127  2.0000000000000002e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6247  two component transcriptional regulator  31.42 
 
 		 245 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1436  two component transcriptional regulator  33.88 
 
 		 234 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1414  two component transcriptional regulator  33.88 
 
 		 234 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1288  two component transcriptional regulator  29.26 
 
 		 228 aa  126  3e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000128008  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4162  OmpR-family response regulator  35.24 
 
 		 232 aa  126  4.0000000000000003e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.789041  normal  0.397671 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0438  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.38 
 
 		 246 aa  126  4.0000000000000003e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.173423  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1696  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.25 
 
 		 224 aa  125  5e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0867  transcriptional regulator PhoB  32.14 
 
 		 229 aa  125  6e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.437737  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00347  DNA-binding response regulator in two-component regulatory system with PhoR (or CreC)  32.59 
 
 		 229 aa  125  7e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3210  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  32.59 
 
 		 229 aa  125  7e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.146413  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0467  transcriptional regulator PhoB  32.59 
 
 		 229 aa  125  7e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00351  hypothetical protein  32.59 
 
 		 229 aa  125  7e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0429  transcriptional regulator PhoB  32.59 
 
 		 229 aa  125  7e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.283039  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0475  transcriptional regulator PhoB  32.59 
 
 		 229 aa  125  7e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0427  transcriptional regulator PhoB  32.59 
 
 		 229 aa  125  7e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3234  transcriptional regulator PhoB  32.59 
 
 		 229 aa  125  7e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.456974  unclonable  0.00000000819474 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0318  transcriptional regulator PhoB  32.59 
 
 		 229 aa  125  7e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0435  transcriptional regulator PhoB  32.14 
 
 		 229 aa  125  8.000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0454  transcriptional regulator PhoB  32.14 
 
 		 229 aa  124  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0441  transcriptional regulator PhoB  32.14 
 
 		 229 aa  124  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.244741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0496  transcriptional regulator PhoB  32.14 
 
 		 229 aa  124  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0435  transcriptional regulator PhoB  32.14 
 
 		 229 aa  124  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.464381  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0424  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.93 
 
 		 246 aa  124  1e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.116445  hitchhiker  0.0000956185 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2062  DNA-binding response regulator  28.44 
 
 		 225 aa  124  1e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000169038  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0343  response regulator receiver  34.38 
 
 		 232 aa  123  2e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.86362  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0766  two component transcriptional regulator  36.68 
 
 		 228 aa  124  2e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0291358  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>