More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4991 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_4991  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 245 aa  499  1e-140  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0655006 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1661  two component transcriptional regulator  95.92 
 
 		 245 aa  479  1e-134  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0475888 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1355  two component transcriptional regulator  69.1 
 
 		 234 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.454645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1316  two component transcriptional regulator  69.1 
 
 		 234 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1879  two component transcriptional regulator  68.24 
 
 		 234 aa  333  2e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0517303 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1436  two component transcriptional regulator  67.81 
 
 		 234 aa  331  6e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4580  two component transcriptional regulator  67.81 
 
 		 234 aa  331  6e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.144701  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1414  two component transcriptional regulator  67.81 
 
 		 234 aa  331  6e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0954  two component transcriptional regulator  67.81 
 
 		 296 aa  331  8e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.605306  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1664  DNA-binding response regulator  68.86 
 
 		 242 aa  329  2e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.922311  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0922  DNA-binding response regulator  68.86 
 
 		 234 aa  329  2e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1841  DNA-binding response regulator  68.86 
 
 		 242 aa  329  2e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1686  DNA-binding response regulator  68.86 
 
 		 242 aa  329  2e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0151733  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2638  DNA-binding response regulator  68.86 
 
 		 242 aa  329  2e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.55029  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0736  DNA-binding response regulator  68.86 
 
 		 242 aa  329  2e-89  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.632099  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0427  DNA-binding response regulator  68.86 
 
 		 234 aa  329  2e-89  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0835186  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1455  DNA-binding response regulator  68.86 
 
 		 242 aa  329  2e-89  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3159  two component transcriptional regulator  69.57 
 
 		 228 aa  316  2e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6791  two component transcriptional regulator  63.02 
 
 		 198 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0454459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4742  two component transcriptional regulator  47.6 
 
 		 271 aa  243  3e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.683328  normal  0.766945 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0390  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.73 
 
 		 237 aa  220  1.9999999999999999e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.708283  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0432  two component transcriptional regulator  44.68 
 
 		 237 aa  218  5e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000322009  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6592  two component transcriptional regulator  46.7 
 
 		 227 aa  218  6e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.2732  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4943  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  48.29 
 
 		 236 aa  211  9e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5416  two component transcriptional regulator  44.78 
 
 		 237 aa  208  6e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0028  two component transcriptional regulator  46.7 
 
 		 268 aa  206  2e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4276  two component transcriptional regulator  45.78 
 
 		 236 aa  207  2e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.886118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2719  two component transcriptional regulator  45.49 
 
 		 248 aa  204  9e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1073  DNA-binding response regulator  44.49 
 
 		 238 aa  203  3e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11680  two-component regulator  44.87 
 
 		 238 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4162  OmpR-family response regulator  44.54 
 
 		 232 aa  199  5e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.789041  normal  0.397671 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2530  two component transcriptional regulator  42.08 
 
 		 242 aa  197  1.0000000000000001e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.279936  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0060  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  44.98 
 
 		 235 aa  196  3e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.475352  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4704  two component transcriptional regulator  41.92 
 
 		 228 aa  195  6e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0100205  normal  0.152582 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5235  two component transcriptional regulator  41.92 
 
 		 228 aa  193  2e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3599  two component transcriptional regulator  43.55 
 
 		 253 aa  191  8e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0438  two component transcriptional regulator  45.38 
 
 		 236 aa  191  9e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.316903  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0442  two component transcriptional regulator  43.95 
 
 		 253 aa  190  2e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.248748 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0575  two component transcriptional regulator  42.17 
 
 		 227 aa  190  2e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00284025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0416  two component transcriptional regulator  43.95 
 
 		 253 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0005  two component transcriptional regulator  43.9 
 
 		 238 aa  189  4e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000487758  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3520  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.92 
 
 		 236 aa  187  1e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0476809  normal  0.130253 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1004  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.04 
 
 		 237 aa  187  2e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0939  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.59 
 
 		 237 aa  184  9e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.155156 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0512  two component transcriptional regulator  43.37 
 
 		 254 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0632255  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2592  two component transcriptional regulator  43.37 
 
 		 254 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.884841  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2886  two component transcriptional regulator  42.34 
 
 		 253 aa  182  3e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.541925  normal  0.0968864 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0484  two component transcriptional regulator  44.07 
 
 		 254 aa  181  9.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.81925 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0438  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.76 
 
 		 246 aa  181  1e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.173423  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1073  two-component system response regulator transcription regulator protein  41.15 
 
 		 237 aa  179  2.9999999999999997e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0139958  normal  0.232974 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0424  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.3 
 
 		 246 aa  177  2e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.116445  hitchhiker  0.0000956185 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1442  two component transcriptional regulator  40.71 
 
 		 227 aa  175  8e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0208535  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0583  response regulator receiver domain-containing protein  39.48 
 
 		 231 aa  174  1.9999999999999998e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000000029507  normal  0.0148942 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0543  response regulator transcription regulator protein  40.87 
 
 		 246 aa  172  2.9999999999999996e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0623013  normal  0.919777 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0059  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  40.97 
 
 		 242 aa  171  1e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3520  two component transcriptional regulator  37.83 
 
 		 259 aa  167  1e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.235883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0872  two component transcriptional regulator  40.51 
 
 		 265 aa  167  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.574761 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4558  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.07 
 
 		 246 aa  164  9e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6247  two component transcriptional regulator  39.22 
 
 		 245 aa  159  3e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4665  two component transcriptional regulator  38.71 
 
 		 241 aa  157  2e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.145034  normal  0.467542 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1060  two component transcriptional regulator  37.17 
 
 		 230 aa  149  4e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4652  two component transcriptional regulator  37 
 
 		 247 aa  139  6e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.490614 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0027  two component transcriptional regulator  35.1 
 
 		 255 aa  136  4e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5920  two component transcriptional regulator  33.92 
 
 		 249 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0444029 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1351  DNA-binding response regulator  33.78 
 
 		 223 aa  133  3e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1191  response regulator  34.22 
 
 		 223 aa  132  3e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5257  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.99 
 
 		 234 aa  133  3e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.025536  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1193  response regulator  33.78 
 
 		 223 aa  132  5e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1389  DNA-binding response regulator  33.78 
 
 		 223 aa  132  5e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1215  two component transcriptional regulator  34.22 
 
 		 223 aa  132  6e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.533573  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1213  DNA-binding response regulator  33.78 
 
 		 223 aa  132  6.999999999999999e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.203275  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1312  DNA-binding response regulator  33.78 
 
 		 223 aa  132  6.999999999999999e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3993  DNA-binding response regulator  33.78 
 
 		 223 aa  132  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.910988 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4725  putative two component transcriptional regulator, winged helix family  33.33 
 
 		 261 aa  132  6.999999999999999e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.144117  normal  0.884231 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5185  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  38.16 
 
 		 234 aa  131  9e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.809056 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4718  phosphate regulon transcriptional regulatory protein PhoB  38.16 
 
 		 239 aa  131  9e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.220817 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03700  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  35.24 
 
 		 226 aa  131  1.0000000000000001e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.132847 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6685  two component transcriptional regulator  37.99 
 
 		 234 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.599421  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1413  DNA-binding response regulator  33.04 
 
 		 223 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3564  two component transcriptional regulator  36.65 
 
 		 230 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.153344  normal  0.125376 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1453  DNA-binding response regulator  33.04 
 
 		 223 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0827  two component transcriptional regulator  36.73 
 
 		 256 aa  129  5.0000000000000004e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00211389  normal  0.244563 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2474  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.74 
 
 		 227 aa  128  7.000000000000001e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0950849  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7423  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  37.55 
 
 		 234 aa  128  7.000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1652  DNA-binding response regulator CreB  37.55 
 
 		 232 aa  128  8.000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0202  two component transcriptional regulator  38.57 
 
 		 233 aa  128  9.000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.382528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1768  two component transcriptional regulator  33.78 
 
 		 229 aa  127  1.0000000000000001e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0372211  hitchhiker  0.00235645 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1892  two-component system response regulator transcription regulator protein  32.16 
 
 		 240 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00502317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1588  DNA-binding response regulator  33.63 
 
 		 230 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0132  response regulator receiver protein  37.61 
 
 		 231 aa  127  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0185  DNA-binding response regulator CreB  36.89 
 
 		 226 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0511  phosphate regulon transcriptional regulatory protein phoB  38.16 
 
 		 234 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.473137 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1748  DNA-binding response regulator  33.48 
 
 		 389 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3116  two component transcriptional regulator  37.61 
 
 		 229 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.202822  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0641  DNA-binding response regulator  33.48 
 
 		 231 aa  126  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.381849  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1563  DNA-binding response regulator  33.48 
 
 		 231 aa  126  3e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0838  DNA-binding response regulator  33.48 
 
 		 231 aa  126  3e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2401  phosphate regulon transcriptional regulatory protein phoB  33.33 
 
 		 229 aa  126  3e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0515  DNA-binding response regulator  33.48 
 
 		 231 aa  126  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2990  two component transcriptional regulator  33.93 
 
 		 230 aa  126  3e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.140246 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>