More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_C6592 on replicon NC_007509
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007509  Bcep18194_C6592  two component transcriptional regulator  100 
 
 
227 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.2732  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4991  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.7 
 
 
245 aa  218  5e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0655006 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1661  two component transcriptional regulator  47.11 
 
 
245 aa  218  6e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0475888 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4580  two component transcriptional regulator  46.09 
 
 
234 aa  205  4e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.144701  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1436  two component transcriptional regulator  46.09 
 
 
234 aa  205  4e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1414  two component transcriptional regulator  46.09 
 
 
234 aa  205  4e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0954  two component transcriptional regulator  46.09 
 
 
296 aa  205  6e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.605306  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1879  two component transcriptional regulator  45.65 
 
 
234 aa  204  1e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0517303 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1355  two component transcriptional regulator  45.65 
 
 
234 aa  203  2e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.454645  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1316  two component transcriptional regulator  45.65 
 
 
234 aa  203  2e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1686  DNA-binding response regulator  45.65 
 
 
242 aa  202  3e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0151733  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0736  DNA-binding response regulator  45.65 
 
 
242 aa  202  3e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.632099  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0427  DNA-binding response regulator  45.65 
 
 
234 aa  202  3e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0835186  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1664  DNA-binding response regulator  45.65 
 
 
242 aa  202  3e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.922311  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0922  DNA-binding response regulator  45.65 
 
 
234 aa  202  3e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1841  DNA-binding response regulator  45.65 
 
 
242 aa  202  3e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1455  DNA-binding response regulator  45.65 
 
 
242 aa  202  3e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2638  DNA-binding response regulator  45.65 
 
 
242 aa  202  3e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.55029  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4742  two component transcriptional regulator  39.56 
 
 
271 aa  176  4e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.683328  normal  0.766945 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6791  two component transcriptional regulator  45.36 
 
 
198 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0454459  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0028  two component transcriptional regulator  42.17 
 
 
268 aa  173  1.9999999999999998e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3159  two component transcriptional regulator  40.53 
 
 
228 aa  167  2e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0060  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  39.38 
 
 
235 aa  163  2.0000000000000002e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.475352  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0390  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.05 
 
 
237 aa  161  8.000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.708283  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0432  two component transcriptional regulator  35.11 
 
 
237 aa  158  5e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000322009  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5416  two component transcriptional regulator  35.11 
 
 
237 aa  159  5e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0939  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.43 
 
 
237 aa  158  8e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.155156 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2719  two component transcriptional regulator  39.3 
 
 
248 aa  157  1e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1004  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.65 
 
 
237 aa  157  1e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1073  two-component system response regulator transcription regulator protein  42.18 
 
 
237 aa  157  2e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0139958  normal  0.232974 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4276  two component transcriptional regulator  36.44 
 
 
236 aa  157  2e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.886118  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3599  two component transcriptional regulator  41.48 
 
 
253 aa  155  4e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2530  two component transcriptional regulator  38.33 
 
 
242 aa  154  1e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.279936  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0416  two component transcriptional regulator  41.48 
 
 
253 aa  153  2e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2592  two component transcriptional regulator  41.3 
 
 
254 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.884841  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0512  two component transcriptional regulator  41.3 
 
 
254 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0632255  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3520  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.61 
 
 
236 aa  152  4e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0476809  normal  0.130253 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0484  two component transcriptional regulator  40.87 
 
 
254 aa  151  1e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.81925 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0442  two component transcriptional regulator  41.48 
 
 
253 aa  150  1e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.248748 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5235  two component transcriptional regulator  35.96 
 
 
228 aa  150  2e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0438  two component transcriptional regulator  40.61 
 
 
236 aa  150  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.316903  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0872  two component transcriptional regulator  36.4 
 
 
265 aa  150  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.574761 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2886  two component transcriptional regulator  39.74 
 
 
253 aa  149  5e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.541925  normal  0.0968864 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0059  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  39.38 
 
 
242 aa  147  9e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4162  OmpR-family response regulator  35.87 
 
 
232 aa  147  9e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.789041  normal  0.397671 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4704  two component transcriptional regulator  35.53 
 
 
228 aa  146  3e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0100205  normal  0.152582 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3520  two component transcriptional regulator  36.56 
 
 
259 aa  145  5e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.235883  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4943  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  34.53 
 
 
236 aa  143  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4558  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.65 
 
 
246 aa  141  8e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1073  DNA-binding response regulator  34.62 
 
 
238 aa  141  8e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4665  two component transcriptional regulator  36.44 
 
 
241 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.145034  normal  0.467542 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11680  two-component regulator  34.47 
 
 
238 aa  139  3e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0543  response regulator transcription regulator protein  34.67 
 
 
246 aa  139  3.9999999999999997e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0623013  normal  0.919777 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0005  two component transcriptional regulator  34.19 
 
 
238 aa  138  6e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000487758  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6247  two component transcriptional regulator  35.96 
 
 
245 aa  138  7.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0424  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.37 
 
 
246 aa  137  1e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.116445  hitchhiker  0.0000956185 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0438  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.93 
 
 
246 aa  136  2e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.173423  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1060  two component transcriptional regulator  35.09 
 
 
230 aa  132  5e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0027  two component transcriptional regulator  35.71 
 
 
255 aa  132  5e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0575  two component transcriptional regulator  36.71 
 
 
227 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00284025  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1442  two component transcriptional regulator  32.89 
 
 
227 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0208535  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4725  putative two component transcriptional regulator, winged helix family  32.55 
 
 
261 aa  124  9e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.144117  normal  0.884231 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0583  response regulator receiver domain-containing protein  31.6 
 
 
231 aa  120  1.9999999999999998e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000000029507  normal  0.0148942 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1892  two-component system response regulator transcription regulator protein  27.63 
 
 
240 aa  113  3e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00502317  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1588  DNA-binding response regulator  32.16 
 
 
230 aa  111  9e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2053  DNA-binding response regulator  30.53 
 
 
237 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0641  DNA-binding response regulator  32.09 
 
 
231 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.381849  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1563  DNA-binding response regulator  32.09 
 
 
231 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0838  DNA-binding response regulator  32.09 
 
 
231 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1359  DNA-binding response regulator  32.09 
 
 
231 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1748  DNA-binding response regulator  32.09 
 
 
389 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0515  DNA-binding response regulator  32.09 
 
 
231 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2192  DNA-binding response regulator  30.53 
 
 
237 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.602573  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5920  two component transcriptional regulator  34.06 
 
 
249 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0444029 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0704  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.94 
 
 
227 aa  105  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.205827  normal  0.593451 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0943  two component transcriptional regulator  32.29 
 
 
223 aa  104  9e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0172896  normal  0.994999 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1554  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.63 
 
 
229 aa  104  1e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00709514 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0520  DNA-binding response regulator  31.17 
 
 
261 aa  103  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.374054  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0833  DNA-binding response regulator  31.17 
 
 
260 aa  103  2e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0511  phosphate regulon transcriptional regulatory protein phoB  34.16 
 
 
234 aa  103  2e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.473137 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1744  DNA-binding response regulator  31.17 
 
 
260 aa  103  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1354  DNA-binding response regulator  31.17 
 
 
260 aa  103  2e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1557  DNA-binding response regulator  31.17 
 
 
260 aa  103  2e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0635  DNA-binding response regulator  31.17 
 
 
260 aa  103  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0959742  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5869  two component transcriptional regulator  32.16 
 
 
261 aa  103  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1991  two component transcriptional regulator  33.17 
 
 
235 aa  102  4e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5652  two component transcriptional regulator  32.16 
 
 
266 aa  102  4e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0393139 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1539  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.39 
 
 
222 aa  102  5e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000287281  normal  0.103291 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2295  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.78 
 
 
237 aa  102  5e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2913  two component transcriptional regulator  31.7 
 
 
227 aa  102  5e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0379396  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1583  DNA-binding response regulator  29.52 
 
 
260 aa  102  5e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5261  two component transcriptional regulator, winged helix family  33 
 
 
237 aa  102  6e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.909356  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0821  two component transcriptional regulator  32.52 
 
 
232 aa  102  6e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.60557  hitchhiker  0.00503775 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2641  two component transcriptional regulator  29.39 
 
 
239 aa  101  9e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3061  two component transcriptional regulator  33.82 
 
 
227 aa  101  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.799336  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0893  winged helix family two component transcriptional regulator  33 
 
 
233 aa  100  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0640  two component transcriptional regulator  33.66 
 
 
233 aa  101  1e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.772339  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1916  two component transcriptional regulator  27.14 
 
 
228 aa  101  1e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.400732  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0767  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.04 
 
 
229 aa  100  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.870104  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0781  two component transcriptional regulator  33 
 
 
233 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.174075 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>