More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_6791 on replicon NC_010512
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010512  Bcenmc03_6791  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 198 aa  408  1e-113  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0454459  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1879  two component transcriptional regulator  72.11 
 
 		 234 aa  289  2e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0517303 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4580  two component transcriptional regulator  72.11 
 
 		 234 aa  289  2e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.144701  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1414  two component transcriptional regulator  72.11 
 
 		 234 aa  289  2e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1355  two component transcriptional regulator  72.63 
 
 		 234 aa  289  2e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.454645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0954  two component transcriptional regulator  72.11 
 
 		 296 aa  289  2e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.605306  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1316  two component transcriptional regulator  72.63 
 
 		 234 aa  289  2e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1436  two component transcriptional regulator  72.11 
 
 		 234 aa  289  2e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1664  DNA-binding response regulator  71.43 
 
 		 242 aa  284  5e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.922311  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1686  DNA-binding response regulator  71.43 
 
 		 242 aa  284  5e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0151733  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1841  DNA-binding response regulator  71.43 
 
 		 242 aa  284  5e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2638  DNA-binding response regulator  71.43 
 
 		 242 aa  284  5e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.55029  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0736  DNA-binding response regulator  71.43 
 
 		 242 aa  284  5e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.632099  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1455  DNA-binding response regulator  71.43 
 
 		 242 aa  284  5e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0922  DNA-binding response regulator  71.43 
 
 		 234 aa  284  5.999999999999999e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0427  DNA-binding response regulator  71.43 
 
 		 234 aa  284  5.999999999999999e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0835186  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1661  two component transcriptional regulator  63.54 
 
 		 245 aa  256  2e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0475888 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4991  two component transcriptional regulator, winged helix family  63.02 
 
 		 245 aa  254  7e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0655006 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3159  two component transcriptional regulator  50.52 
 
 		 228 aa  190  1e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6592  two component transcriptional regulator  45.36 
 
 		 227 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.2732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4742  two component transcriptional regulator  40.72 
 
 		 271 aa  168  6e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.683328  normal  0.766945 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0432  two component transcriptional regulator  44.04 
 
 		 237 aa  168  6e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000322009  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4162  OmpR-family response regulator  45.41 
 
 		 232 aa  166  1e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.789041  normal  0.397671 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5235  two component transcriptional regulator  42.49 
 
 		 228 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5416  two component transcriptional regulator  44.92 
 
 		 237 aa  165  5e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4704  two component transcriptional regulator  42.49 
 
 		 228 aa  164  5.9999999999999996e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0100205  normal  0.152582 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4276  two component transcriptional regulator  43.68 
 
 		 236 aa  162  3e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.886118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0028  two component transcriptional regulator  44.85 
 
 		 268 aa  162  4.0000000000000004e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0060  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  44.44 
 
 		 235 aa  160  1e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.475352  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0390  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.26 
 
 		 237 aa  159  2e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.708283  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4943  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  44.1 
 
 		 236 aa  159  2e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1073  DNA-binding response regulator  43.3 
 
 		 238 aa  154  1e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2719  two component transcriptional regulator  43.46 
 
 		 248 aa  153  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2530  two component transcriptional regulator  40.86 
 
 		 242 aa  152  2e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.279936  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11680  two-component regulator  42.78 
 
 		 238 aa  152  4e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0059  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  41.15 
 
 		 242 aa  150  1e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0005  two component transcriptional regulator  41.84 
 
 		 238 aa  149  4e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000487758  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0939  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.93 
 
 		 237 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.155156 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1073  two-component system response regulator transcription regulator protein  43.46 
 
 		 237 aa  146  2.0000000000000003e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0139958  normal  0.232974 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1004  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.93 
 
 		 237 aa  146  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0438  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.58 
 
 		 246 aa  145  3e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.173423  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0424  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.58 
 
 		 246 aa  145  4.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.116445  hitchhiker  0.0000956185 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0575  two component transcriptional regulator  41.15 
 
 		 227 aa  145  5e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00284025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1442  two component transcriptional regulator  39.27 
 
 		 227 aa  144  7.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0208535  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0543  response regulator transcription regulator protein  38.89 
 
 		 246 aa  139  1.9999999999999998e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0623013  normal  0.919777 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0438  two component transcriptional regulator  43.85 
 
 		 236 aa  139  3e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.316903  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3520  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.01 
 
 		 236 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0476809  normal  0.130253 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3520  two component transcriptional regulator  37.89 
 
 		 259 aa  134  8e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.235883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0416  two component transcriptional regulator  42.19 
 
 		 253 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3599  two component transcriptional regulator  41.67 
 
 		 253 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0484  two component transcriptional regulator  42.02 
 
 		 254 aa  132  3e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.81925 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0442  two component transcriptional regulator  41.67 
 
 		 253 aa  132  3e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.248748 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2592  two component transcriptional regulator  42.02 
 
 		 254 aa  132  3e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.884841  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0512  two component transcriptional regulator  42.02 
 
 		 254 aa  132  3e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0632255  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2886  two component transcriptional regulator  41.27 
 
 		 253 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.541925  normal  0.0968864 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0583  response regulator receiver domain-containing protein  35.64 
 
 		 231 aa  130  1.0000000000000001e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000000029507  normal  0.0148942 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6247  two component transcriptional regulator  38.54 
 
 		 245 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5007  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.63 
 
 		 238 aa  124  7e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2053  DNA-binding response regulator  37.11 
 
 		 237 aa  123  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2192  DNA-binding response regulator  37.11 
 
 		 237 aa  123  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.602573  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0872  two component transcriptional regulator  37.23 
 
 		 265 aa  124  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.574761 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0202  two component transcriptional regulator  36.79 
 
 		 233 aa  122  5e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.382528  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4558  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.23 
 
 		 246 aa  122  5e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1021  two component transcriptional regulator  37.97 
 
 		 223 aa  121  7e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1413  DNA-binding response regulator  36.84 
 
 		 223 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0827  two component transcriptional regulator  40.96 
 
 		 256 aa  120  9.999999999999999e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00211389  normal  0.244563 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1453  DNA-binding response regulator  36.84 
 
 		 223 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1191  response regulator  36.32 
 
 		 223 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4652  two component transcriptional regulator  39.58 
 
 		 247 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.490614 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1351  DNA-binding response regulator  36.32 
 
 		 223 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1193  response regulator  36.32 
 
 		 223 aa  119  3e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1389  DNA-binding response regulator  36.32 
 
 		 223 aa  119  3e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3993  DNA-binding response regulator  36.32 
 
 		 223 aa  119  3e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.910988 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0173  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  37.43 
 
 		 227 aa  118  4.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.505642  normal  0.985195 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1060  two component transcriptional regulator  35.6 
 
 		 230 aa  118  6e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1213  DNA-binding response regulator  35.79 
 
 		 223 aa  118  7e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.203275  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1312  DNA-binding response regulator  35.79 
 
 		 223 aa  118  7e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4125  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.36 
 
 		 230 aa  118  7e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.125271  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4665  two component transcriptional regulator  35.11 
 
 		 241 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.145034  normal  0.467542 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0183  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  37.43 
 
 		 227 aa  117  7.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.635675 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7423  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  37.5 
 
 		 234 aa  117  7.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1155  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.23 
 
 		 230 aa  117  9e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.560017  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5185  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  36.51 
 
 		 234 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.809056 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4718  phosphate regulon transcriptional regulatory protein PhoB  37.5 
 
 		 239 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.220817 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1215  two component transcriptional regulator  36.32 
 
 		 223 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.533573  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6685  two component transcriptional regulator  36.96 
 
 		 234 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.599421  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5257  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.5 
 
 		 234 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.025536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1728  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.64 
 
 		 233 aa  116  1.9999999999999998e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0415  two component transcriptional regulator  36.17 
 
 		 231 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.777838 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2401  phosphate regulon transcriptional regulatory protein phoB  36.46 
 
 		 229 aa  116  1.9999999999999998e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2643  two component transcriptional regulator  36.41 
 
 		 236 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0124  two component transcriptional regulator  37.97 
 
 		 227 aa  116  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.352403 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4151  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.83 
 
 		 230 aa  115  3e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1606  two component transcriptional regulator  37.04 
 
 		 230 aa  115  3e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.307098  normal  0.688459 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0485  phosphate regulon transcriptional regulatory protein PhoB  37.43 
 
 		 227 aa  115  3.9999999999999997e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.537934  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1893  two component transcriptional regulator  36.7 
 
 		 235 aa  115  5e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203788 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4009  two component transcriptional regulator  35.29 
 
 		 230 aa  115  6e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00751412  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0834  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  38.2 
 
 		 265 aa  114  6.9999999999999995e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0108417 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0640  two component transcriptional regulator  37.82 
 
 		 233 aa  114  7.999999999999999e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.772339  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0511  phosphate regulon transcriptional regulatory protein phoB  37.44 
 
 		 234 aa  114  8.999999999999998e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.473137 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>