More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_4665 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_4665  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 241 aa  489  1e-137  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.145034  normal  0.467542 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0872  two component transcriptional regulator  77.92 
 
 		 265 aa  390  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.574761 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4558  two component transcriptional regulator, winged helix family  78.3 
 
 		 246 aa  385  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0438  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.51 
 
 		 246 aa  259  2e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.173423  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0424  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.08 
 
 		 246 aa  256  2e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.116445  hitchhiker  0.0000956185 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0543  response regulator transcription regulator protein  50.41 
 
 		 246 aa  236  2e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0623013  normal  0.919777 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0060  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  43.5 
 
 		 235 aa  180  2e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.475352  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0028  two component transcriptional regulator  39.82 
 
 		 268 aa  173  1.9999999999999998e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5416  two component transcriptional regulator  38.84 
 
 		 237 aa  173  1.9999999999999998e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0390  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.39 
 
 		 237 aa  167  9e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.708283  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4943  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  40 
 
 		 236 aa  167  1e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1664  DNA-binding response regulator  39.56 
 
 		 242 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.922311  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0922  DNA-binding response regulator  39.56 
 
 		 234 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1841  DNA-binding response regulator  39.56 
 
 		 242 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2638  DNA-binding response regulator  39.56 
 
 		 242 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.55029  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0427  DNA-binding response regulator  39.56 
 
 		 234 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0835186  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1455  DNA-binding response regulator  39.56 
 
 		 242 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0736  DNA-binding response regulator  39.56 
 
 		 242 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.632099  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1686  DNA-binding response regulator  39.56 
 
 		 242 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0151733  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0432  two component transcriptional regulator  38.22 
 
 		 237 aa  163  3e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000322009  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3520  two component transcriptional regulator  37.95 
 
 		 259 aa  161  8.000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.235883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4276  two component transcriptional regulator  37.95 
 
 		 236 aa  161  1e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.886118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4162  OmpR-family response regulator  38.67 
 
 		 232 aa  160  1e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.789041  normal  0.397671 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1355  two component transcriptional regulator  38.67 
 
 		 234 aa  160  2e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.454645  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1879  two component transcriptional regulator  38.67 
 
 		 234 aa  160  2e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0517303 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1316  two component transcriptional regulator  38.67 
 
 		 234 aa  160  2e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1661  two component transcriptional regulator  38.84 
 
 		 245 aa  159  5e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0475888 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1436  two component transcriptional regulator  38.22 
 
 		 234 aa  158  6e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4580  two component transcriptional regulator  38.22 
 
 		 234 aa  158  6e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.144701  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1414  two component transcriptional regulator  38.22 
 
 		 234 aa  158  6e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0954  two component transcriptional regulator  37.5 
 
 		 296 aa  157  1e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.605306  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5235  two component transcriptional regulator  37.78 
 
 		 228 aa  157  1e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1004  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.94 
 
 		 237 aa  156  2e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4991  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.71 
 
 		 245 aa  157  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0655006 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2530  two component transcriptional regulator  35.27 
 
 		 242 aa  155  5.0000000000000005e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.279936  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1073  two-component system response regulator transcription regulator protein  38.36 
 
 		 237 aa  155  6e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0139958  normal  0.232974 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0939  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.78 
 
 		 237 aa  155  6e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.155156 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1892  two-component system response regulator transcription regulator protein  37.95 
 
 		 240 aa  154  1e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00502317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4704  two component transcriptional regulator  37.33 
 
 		 228 aa  154  1e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0100205  normal  0.152582 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6247  two component transcriptional regulator  34.38 
 
 		 245 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4742  two component transcriptional regulator  34.05 
 
 		 271 aa  145  8.000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.683328  normal  0.766945 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1060  two component transcriptional regulator  36 
 
 		 230 aa  143  3e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6592  two component transcriptional regulator  36.44 
 
 		 227 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.2732  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0575  two component transcriptional regulator  33.93 
 
 		 227 aa  137  2e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00284025  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3159  two component transcriptional regulator  36.73 
 
 		 228 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0059  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  34.8 
 
 		 242 aa  131  7.999999999999999e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1442  two component transcriptional regulator  31.7 
 
 		 227 aa  128  7.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0208535  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0005  two component transcriptional regulator  34.31 
 
 		 238 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000487758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1073  DNA-binding response regulator  35.37 
 
 		 238 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2053  DNA-binding response regulator  33.76 
 
 		 237 aa  125  7e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2192  DNA-binding response regulator  33.62 
 
 		 237 aa  124  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.602573  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11680  two-component regulator  36.04 
 
 		 238 aa  124  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0438  two component transcriptional regulator  35.24 
 
 		 236 aa  119  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.316903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0027  two component transcriptional regulator  35.44 
 
 		 255 aa  119  3e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6791  two component transcriptional regulator  35.11 
 
 		 198 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0454459  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2719  two component transcriptional regulator  33.48 
 
 		 248 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3520  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.8 
 
 		 236 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0476809  normal  0.130253 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0416  two component transcriptional regulator  33.48 
 
 		 253 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3599  two component transcriptional regulator  33.04 
 
 		 253 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0512  two component transcriptional regulator  34.07 
 
 		 254 aa  113  3e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0632255  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2592  two component transcriptional regulator  34.07 
 
 		 254 aa  113  3e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.884841  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0442  two component transcriptional regulator  32.6 
 
 		 253 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.248748 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1588  DNA-binding response regulator  31.11 
 
 		 230 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0641  DNA-binding response regulator  30.94 
 
 		 231 aa  111  9e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.381849  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0838  DNA-binding response regulator  30.94 
 
 		 231 aa  111  9e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1359  DNA-binding response regulator  30.94 
 
 		 231 aa  111  9e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0515  DNA-binding response regulator  30.94 
 
 		 231 aa  111  9e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1563  DNA-binding response regulator  30.94 
 
 		 231 aa  111  9e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1748  DNA-binding response regulator  30.94 
 
 		 389 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0583  response regulator receiver domain-containing protein  29.74 
 
 		 231 aa  110  1.0000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000000029507  normal  0.0148942 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1865  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.31 
 
 		 226 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0484  two component transcriptional regulator  33.63 
 
 		 254 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.81925 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5345  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.39 
 
 		 230 aa  108  5e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.264155 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5920  two component transcriptional regulator  33.48 
 
 		 249 aa  108  6e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0444029 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5261  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.22 
 
 		 237 aa  108  8.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.909356  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4725  putative two component transcriptional regulator, winged helix family  29.6 
 
 		 261 aa  108  8.000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.144117  normal  0.884231 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5286  two component transcriptional regulator  30.8 
 
 		 240 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.498861 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0640  two component transcriptional regulator  37.1 
 
 		 233 aa  107  1e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.772339  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0082  two component transcriptional regulator  34.29 
 
 		 228 aa  107  1e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2910  response regulator receiver  30.26 
 
 		 230 aa  107  2e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0511  phosphate regulon transcriptional regulatory protein phoB  37.78 
 
 		 234 aa  107  2e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.473137 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1991  two component transcriptional regulator  36.67 
 
 		 235 aa  107  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0781  two component transcriptional regulator  36.67 
 
 		 233 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.174075 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4602  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.7 
 
 		 226 aa  106  3e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0724  two component transcriptional regulator  31.7 
 
 		 226 aa  106  4e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0893  winged helix family two component transcriptional regulator  36.67 
 
 		 233 aa  106  4e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0852  response regulator transcription regulator protein  29.63 
 
 		 246 aa  105  5e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.650808  normal  0.373572 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4918  two component transcriptional regulator  36.67 
 
 		 234 aa  105  5e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.134814 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0831  two component transcriptional regulator  33.82 
 
 		 228 aa  105  7e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.310785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2693  two component transcriptional regulator  32.18 
 
 		 226 aa  105  8e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.575064 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2886  two component transcriptional regulator  31.72 
 
 		 253 aa  105  9e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.541925  normal  0.0968864 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1924  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.05 
 
 		 225 aa  104  1e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0200  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.41 
 
 		 242 aa  104  1e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0955644  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1487  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.15 
 
 		 232 aa  104  1e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.487145  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03750  PhoP-like protein  30.8 
 
 		 226 aa  103  2e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.181369  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8215  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.8 
 
 		 226 aa  103  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6145  two component transcriptional regulator  31.7 
 
 		 228 aa  103  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.788201 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004385  phosphate regulon transcriptional regulatory protein PhoB  31.25 
 
 		 229 aa  103  3e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0098  two component transcriptional regulator  30.67 
 
 		 229 aa  103  3e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.761303  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4046  response regulator receiver  29.6 
 
 		 225 aa  103  3e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>