More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSp0852 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RSp0852  response regulator transcription regulator protein  100 
 
 		 246 aa  505  9.999999999999999e-143  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.650808  normal  0.373572 
 
 
-
 
NC_003296  RS02360  response regulator transcription regulator protein  72.03 
 
 		 293 aa  340  1e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.253683 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01951  HrpG  41.5 
 
 		 263 aa  149  3e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0390  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.6 
 
 		 237 aa  119  3.9999999999999996e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.708283  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0060  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  33.04 
 
 		 235 aa  118  9e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.475352  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0543  response regulator transcription regulator protein  33.78 
 
 		 246 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0623013  normal  0.919777 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1004  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.3 
 
 		 237 aa  116  3e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0028  two component transcriptional regulator  30.53 
 
 		 268 aa  116  3e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0939  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.3 
 
 		 237 aa  116  3.9999999999999997e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.155156 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1073  two-component system response regulator transcription regulator protein  32.74 
 
 		 237 aa  115  6e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0139958  normal  0.232974 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0432  two component transcriptional regulator  29.65 
 
 		 237 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000322009  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4943  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  30.67 
 
 		 236 aa  113  3e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6247  two component transcriptional regulator  32.6 
 
 		 245 aa  112  6e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0438  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.9 
 
 		 246 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.173423  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0424  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.56 
 
 		 246 aa  110  3e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.116445  hitchhiker  0.0000956185 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4742  two component transcriptional regulator  29.69 
 
 		 271 aa  109  4.0000000000000004e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.683328  normal  0.766945 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4725  putative two component transcriptional regulator, winged helix family  29.82 
 
 		 261 aa  108  6e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.144117  normal  0.884231 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3520  two component transcriptional regulator  30.64 
 
 		 259 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.235883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0943  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.04 
 
 		 235 aa  107  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.715333  normal  0.0777529 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2530  two component transcriptional regulator  29.31 
 
 		 242 aa  106  3e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.279936  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4665  two component transcriptional regulator  29.63 
 
 		 241 aa  105  5e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.145034  normal  0.467542 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4056  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  30.34 
 
 		 275 aa  105  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1008  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.6 
 
 		 235 aa  103  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5416  two component transcriptional regulator  28.63 
 
 		 237 aa  104  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4276  two component transcriptional regulator  29.07 
 
 		 236 aa  103  4e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.886118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1355  two component transcriptional regulator  30.09 
 
 		 234 aa  102  7e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.454645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1316  two component transcriptional regulator  30.09 
 
 		 234 aa  102  7e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4162  OmpR-family response regulator  29.74 
 
 		 232 aa  102  7e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.789041  normal  0.397671 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0872  two component transcriptional regulator  29.78 
 
 		 265 aa  101  9e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.574761 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0922  DNA-binding response regulator  30.09 
 
 		 234 aa  101  1e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0427  DNA-binding response regulator  30.09 
 
 		 234 aa  101  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0835186  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1060  two component transcriptional regulator  29.07 
 
 		 230 aa  101  1e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1879  two component transcriptional regulator  30.09 
 
 		 234 aa  101  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0517303 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1455  DNA-binding response regulator  30.09 
 
 		 242 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1664  DNA-binding response regulator  30.09 
 
 		 242 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.922311  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0736  DNA-binding response regulator  30.09 
 
 		 242 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.632099  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1414  two component transcriptional regulator  30.09 
 
 		 234 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1841  DNA-binding response regulator  30.09 
 
 		 242 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1686  DNA-binding response regulator  30.09 
 
 		 242 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0151733  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4580  two component transcriptional regulator  30.09 
 
 		 234 aa  100  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.144701  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1436  two component transcriptional regulator  30.09 
 
 		 234 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1073  DNA-binding response regulator  32.99 
 
 		 238 aa  100  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2638  DNA-binding response regulator  30.09 
 
 		 242 aa  100  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.55029  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0954  two component transcriptional regulator  30.09 
 
 		 296 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.605306  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5235  two component transcriptional regulator  33.89 
 
 		 228 aa  99.8  4e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11680  two-component regulator  30.74 
 
 		 238 aa  99.4  5e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0005  two component transcriptional regulator  30.74 
 
 		 238 aa  99.4  5e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000487758  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4558  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.78 
 
 		 246 aa  98.2  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4704  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 228 aa  97.1  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0100205  normal  0.152582 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0059  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  28.44 
 
 		 242 aa  96.3  4e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3159  two component transcriptional regulator  31.56 
 
 		 228 aa  95.5  7e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1076  two-component system response regulator transcription regulator protein  30.4 
 
 		 251 aa  95.1  9e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5345  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.16 
 
 		 230 aa  93.2  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.264155 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3703  two component transcriptional regulator  30.14 
 
 		 232 aa  92  9e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.230236  normal  0.0884672 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1442  two component transcriptional regulator  30.09 
 
 		 227 aa  90.5  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0208535  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2264  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.93 
 
 		 231 aa  90.5  2e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00910741  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0824  two component transcriptional regulator, winged helix family  28.63 
 
 		 229 aa  89.7  3e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0575  two component transcriptional regulator  28.57 
 
 		 227 aa  89.7  4e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00284025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2735  two component transcriptional regulator  27.39 
 
 		 226 aa  88.6  8e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.089268  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0027  two component transcriptional regulator  27.84 
 
 		 255 aa  88.6  8e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0818  two component transcriptional regulator, winged helix family  28.63 
 
 		 236 aa  87.8  1e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.501115  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3287  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.87 
 
 		 237 aa  88.2  1e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000200523  normal  0.324308 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1002  two component transcriptional regulator  34.87 
 
 		 237 aa  88.2  1e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000471824  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1104  two component transcriptional regulator  34.87 
 
 		 237 aa  88.2  1e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00308001  normal  0.0226787 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1071  two component transcriptional regulator  34.87 
 
 		 237 aa  88.2  1e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000676378  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2424  two component transcriptional regulator  29.52 
 
 		 221 aa  87  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0245011  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02492  phosphate regulon transcriptional regulatory protein PhoB  28.19 
 
 		 229 aa  87.4  2e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.506678  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2563  transcriptional regulatory protein ResD  29.05 
 
 		 221 aa  87  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00803163 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0607  two component transcriptional regulator  28.88 
 
 		 248 aa  85.9  6e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0815  two component transcriptional regulator  33.55 
 
 		 248 aa  85.9  6e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.348891 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1397  two component transcriptional regulator  33.77 
 
 		 261 aa  85.5  7e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0231814  hitchhiker  0.000111966 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1554  two component transcriptional regulator, winged helix family  23.66 
 
 		 229 aa  85.5  8e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00709514 
 
 
-
 
NC_003296  RS03101  two-component response regulator transcription regulator protein  35.76 
 
 		 226 aa  85.1  9e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.473925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1661  two component transcriptional regulator  26.92 
 
 		 245 aa  85.1  9e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0475888 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3305  DNA-binding response regulator BaeR  29.69 
 
 		 232 aa  85.1  0.000000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.304306  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5456  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.21 
 
 		 251 aa  84.7  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.228477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1563  DNA-binding response regulator  30.61 
 
 		 231 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0838  DNA-binding response regulator  30.61 
 
 		 231 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0785  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.33 
 
 		 235 aa  84.3  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1359  DNA-binding response regulator  30.61 
 
 		 231 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1748  DNA-binding response regulator  30.61 
 
 		 389 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6592  two component transcriptional regulator  26.22 
 
 		 227 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.2732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0641  DNA-binding response regulator  30.61 
 
 		 231 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.381849  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0766  DNA-binding response regulator  29.46 
 
 		 249 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.692099  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0515  DNA-binding response regulator  30.61 
 
 		 231 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3419  two component transcriptional regulator  32.65 
 
 		 242 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5426  two component transcriptional regulator  35.37 
 
 		 251 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1588  DNA-binding response regulator  30.61 
 
 		 230 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2749  transcription response regulator-like protein  28.57 
 
 		 221 aa  84  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00061025  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3680  two component heavy metal response transcriptional regulator  30.22 
 
 		 228 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.224842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3184  two component transcriptional regulator  32.89 
 
 		 237 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0220819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2306  two component transcriptional regulator  34.67 
 
 		 225 aa  84  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1010  two component transcriptional regulator  32.89 
 
 		 237 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000199702  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4991  two component transcriptional regulator, winged helix family  27.11 
 
 		 245 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0655006 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3842  two component heavy metal response transcriptional regulator  30.22 
 
 		 227 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.67414 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4683  two component heavy metal response transcriptional regulator  30.22 
 
 		 228 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.222547  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1658  two component transcriptional regulator, winged helix family  26.6 
 
 		 230 aa  84  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.515101  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5598  two component transcriptional regulator  29.63 
 
 		 249 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.122257  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3006  two component transcriptional regulator  32.89 
 
 		 237 aa  83.6  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000324706  normal  0.0671955 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3087  two component transcriptional regulator  32.89 
 
 		 237 aa  83.6  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000126315  normal  0.467683 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>