More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS02360 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS02360  response regulator transcription regulator protein  100 
 
 		 293 aa  602  1.0000000000000001e-171  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.253683 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0852  response regulator transcription regulator protein  72.03 
 
 		 246 aa  357  9.999999999999999e-98  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.650808  normal  0.373572 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01951  HrpG  40.89 
 
 		 263 aa  157  3e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0390  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.89 
 
 		 237 aa  119  6e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.708283  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0028  two component transcriptional regulator  32.02 
 
 		 268 aa  118  9.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6247  two component transcriptional regulator  32.77 
 
 		 245 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5416  two component transcriptional regulator  32.31 
 
 		 237 aa  115  8.999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0543  response regulator transcription regulator protein  33.77 
 
 		 246 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0623013  normal  0.919777 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1073  two-component system response regulator transcription regulator protein  33.18 
 
 		 237 aa  114  3e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0139958  normal  0.232974 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0438  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.4 
 
 		 246 aa  113  3e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.173423  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0060  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  30.74 
 
 		 235 aa  112  7.000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.475352  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0424  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.78 
 
 		 246 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.116445  hitchhiker  0.0000956185 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1004  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.87 
 
 		 237 aa  110  3e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0939  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.87 
 
 		 237 aa  110  3e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.155156 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0432  two component transcriptional regulator  29.96 
 
 		 237 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000322009  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4943  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  31.11 
 
 		 236 aa  108  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4056  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  31.35 
 
 		 275 aa  107  3e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3520  two component transcriptional regulator  29.05 
 
 		 259 aa  106  5e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.235883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2530  two component transcriptional regulator  29.82 
 
 		 242 aa  104  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.279936  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4742  two component transcriptional regulator  28.44 
 
 		 271 aa  103  3e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.683328  normal  0.766945 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1060  two component transcriptional regulator  28.57 
 
 		 230 aa  102  8e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0872  two component transcriptional regulator  29.63 
 
 		 265 aa  100  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.574761 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11680  two-component regulator  32.49 
 
 		 238 aa  100  3e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1073  DNA-binding response regulator  31.98 
 
 		 238 aa  99.8  5e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4725  putative two component transcriptional regulator, winged helix family  29.39 
 
 		 261 aa  98.2  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.144117  normal  0.884231 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4665  two component transcriptional regulator  28.45 
 
 		 241 aa  97.4  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.145034  normal  0.467542 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0059  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  29.78 
 
 		 242 aa  97.1  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4558  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.67 
 
 		 246 aa  97.1  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6592  two component transcriptional regulator  29.82 
 
 		 227 aa  95.9  6e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.2732  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2264  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.16 
 
 		 231 aa  95.9  8e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00910741  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0766  DNA-binding response regulator  30.51 
 
 		 249 aa  94.7  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.692099  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0943  two component transcriptional regulator, winged helix family  28.81 
 
 		 235 aa  93.6  3e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.715333  normal  0.0777529 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4162  OmpR-family response regulator  28.89 
 
 		 232 aa  93.6  3e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.789041  normal  0.397671 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1355  two component transcriptional regulator  30.57 
 
 		 234 aa  94  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.454645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1316  two component transcriptional regulator  30.57 
 
 		 234 aa  94  3e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4704  two component transcriptional regulator  32.14 
 
 		 228 aa  93.6  3e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0100205  normal  0.152582 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1879  two component transcriptional regulator  31.17 
 
 		 234 aa  93.6  4e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0517303 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0660  DNA-binding response regulator  30.57 
 
 		 249 aa  93.6  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1008  two component transcriptional regulator, winged helix family  28.81 
 
 		 235 aa  93.6  4e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1414  two component transcriptional regulator  31.17 
 
 		 234 aa  93.2  5e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4276  two component transcriptional regulator  29.07 
 
 		 236 aa  93.2  5e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.886118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1975  DNA-binding response regulator  30.57 
 
 		 263 aa  93.2  5e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0150258  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1614  DNA-binding response regulator  30.57 
 
 		 244 aa  93.2  5e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0469389  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0654  DNA-binding response regulator  30.57 
 
 		 263 aa  93.2  5e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4580  two component transcriptional regulator  31.17 
 
 		 234 aa  93.2  5e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.144701  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2178  DNA-binding response regulator  30.57 
 
 		 263 aa  93.2  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.638028  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2261  DNA-binding response regulator  30.57 
 
 		 263 aa  93.2  5e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.338205  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1436  two component transcriptional regulator  31.17 
 
 		 234 aa  93.2  5e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0922  DNA-binding response regulator  29.69 
 
 		 234 aa  92.8  6e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0427  DNA-binding response regulator  29.69 
 
 		 234 aa  92.8  6e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0835186  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1686  DNA-binding response regulator  29.69 
 
 		 242 aa  92.4  8e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0151733  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0736  DNA-binding response regulator  29.69 
 
 		 242 aa  92.4  8e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.632099  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1841  DNA-binding response regulator  29.69 
 
 		 242 aa  92.4  8e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1664  DNA-binding response regulator  29.69 
 
 		 242 aa  92.4  8e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.922311  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2638  DNA-binding response regulator  29.69 
 
 		 242 aa  92.4  8e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.55029  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1455  DNA-binding response regulator  29.69 
 
 		 242 aa  92.4  8e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0954  two component transcriptional regulator  31.17 
 
 		 296 aa  92  9e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.605306  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3159  two component transcriptional regulator  31.56 
 
 		 228 aa  91.7  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5235  two component transcriptional regulator  31.55 
 
 		 228 aa  91.3  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1658  two component transcriptional regulator, winged helix family  27.6 
 
 		 230 aa  90.1  4e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.515101  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4991  two component transcriptional regulator, winged helix family  28.44 
 
 		 245 aa  90.1  4e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0655006 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1661  two component transcriptional regulator  28.44 
 
 		 245 aa  89.7  5e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0475888 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4546  two component transcriptional regulator  36.36 
 
 		 230 aa  89.4  6e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.281853 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0575  two component transcriptional regulator  28.51 
 
 		 227 aa  87  3e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00284025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0583  response regulator receiver domain-containing protein  25.86 
 
 		 231 aa  87  3e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000000029507  normal  0.0148942 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5707  winged helix family two component transcriptional regulator  28.95 
 
 		 277 aa  87  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0005  two component transcriptional regulator  27.71 
 
 		 238 aa  86.7  4e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000487758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1104  two component transcriptional regulator  35.57 
 
 		 237 aa  86.3  6e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00308001  normal  0.0226787 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3287  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.57 
 
 		 237 aa  86.3  6e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000200523  normal  0.324308 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1002  two component transcriptional regulator  35.57 
 
 		 237 aa  86.3  6e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000471824  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1071  two component transcriptional regulator  35.57 
 
 		 237 aa  86.3  6e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000676378  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3594  transcriptional regulatory protein RstA, putative  34.9 
 
 		 237 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0644  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.85 
 
 		 236 aa  85.1  0.000000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3184  two component transcriptional regulator  34.9 
 
 		 237 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0220819  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3006  two component transcriptional regulator  34.9 
 
 		 237 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000324706  normal  0.0671955 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3087  two component transcriptional regulator  34.9 
 
 		 237 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000126315  normal  0.467683 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1076  two-component system response regulator transcription regulator protein  27.88 
 
 		 251 aa  83.6  0.000000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0124  two component transcriptional regulator  31.58 
 
 		 227 aa  83.6  0.000000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.352403 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1010  two component transcriptional regulator  34.9 
 
 		 237 aa  84  0.000000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000199702  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5185  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  34.64 
 
 		 234 aa  83.2  0.000000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.809056 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4718  phosphate regulon transcriptional regulatory protein PhoB  34.64 
 
 		 239 aa  83.2  0.000000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.220817 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0483  two component transcriptional regulator  31.17 
 
 		 229 aa  83.2  0.000000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.342081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3429  two component transcriptional regulator  26.32 
 
 		 233 aa  82.4  0.000000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0608192  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0027  two component transcriptional regulator  26.34 
 
 		 255 aa  82.8  0.000000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0098  two component transcriptional regulator  26.84 
 
 		 229 aa  82.4  0.000000000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.761303  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2563  two component transcriptional regulator, winged helix family  28.91 
 
 		 230 aa  82  0.00000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0173  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  30.7 
 
 		 227 aa  81.6  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.505642  normal  0.985195 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3419  two component transcriptional regulator  30.81 
 
 		 242 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5456  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.08 
 
 		 251 aa  81.6  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.228477  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6791  two component transcriptional regulator  32.12 
 
 		 198 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0454459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1773  DNA-binding response regulator  27.23 
 
 		 224 aa  82  0.00000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2735  two component transcriptional regulator  27.71 
 
 		 226 aa  81.3  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.089268  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1917  two component transcriptional regulator  31.85 
 
 		 238 aa  81.3  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.332821 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1407  two component transcriptional regulator  33.51 
 
 		 265 aa  80.9  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0183  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  30.7 
 
 		 227 aa  81.3  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.635675 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1897  two component transcriptional regulator, winged helix family  28.89 
 
 		 229 aa  81.3  0.00000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3739  two component transcriptional regulator, winged helix family  26.51 
 
 		 230 aa  80.9  0.00000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000466515  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5257  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.42 
 
 		 234 aa  80.5  0.00000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.025536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0274  two component transcriptional regulator, winged helix family  26.07 
 
 		 232 aa  80.5  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.701823  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1756  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.35 
 
 		 230 aa  80.5  0.00000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.769657  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>