More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10247_0635 on replicon NC_009080
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006348  BMA0833  DNA-binding response regulator  100 
 
 		 260 aa  524  1e-148  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1744  DNA-binding response regulator  100 
 
 		 260 aa  524  1e-148  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1354  DNA-binding response regulator  100 
 
 		 260 aa  524  1e-148  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0520  DNA-binding response regulator  100 
 
 		 261 aa  524  1e-148  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.374054  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1557  DNA-binding response regulator  100 
 
 		 260 aa  524  1e-148  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0635  DNA-binding response regulator  100 
 
 		 260 aa  524  1e-148  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0959742  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1583  DNA-binding response regulator  99.23 
 
 		 260 aa  518  1e-146  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2053  DNA-binding response regulator  44.44 
 
 		 237 aa  207  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0838  DNA-binding response regulator  45.29 
 
 		 231 aa  207  2e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1748  DNA-binding response regulator  45.29 
 
 		 389 aa  207  2e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0641  DNA-binding response regulator  45.29 
 
 		 231 aa  207  2e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.381849  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1588  DNA-binding response regulator  45.29 
 
 		 230 aa  207  2e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0515  DNA-binding response regulator  45.29 
 
 		 231 aa  207  2e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1359  DNA-binding response regulator  45.29 
 
 		 231 aa  207  2e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1563  DNA-binding response regulator  45.29 
 
 		 231 aa  207  2e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2192  DNA-binding response regulator  44.44 
 
 		 237 aa  206  3e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.602573  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5235  two component transcriptional regulator  37.33 
 
 		 228 aa  154  2e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3520  two component transcriptional regulator  37.33 
 
 		 259 aa  151  1e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.235883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4704  two component transcriptional regulator  37.33 
 
 		 228 aa  151  1e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0100205  normal  0.152582 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4162  OmpR-family response regulator  36.28 
 
 		 232 aa  149  5e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.789041  normal  0.397671 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6247  two component transcriptional regulator  36.97 
 
 		 245 aa  148  8e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4943  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  34.96 
 
 		 236 aa  146  4.0000000000000006e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0939  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.21 
 
 		 237 aa  145  9e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.155156 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1073  two-component system response regulator transcription regulator protein  33.91 
 
 		 237 aa  142  5e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0139958  normal  0.232974 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1004  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.77 
 
 		 237 aa  142  5e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1397  two component transcriptional regulator  34.2 
 
 		 261 aa  136  3.0000000000000003e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0231814  hitchhiker  0.000111966 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03750  PhoP-like protein  35.11 
 
 		 226 aa  135  8e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.181369  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3105  DNA-binding response regulator PhoB  36.52 
 
 		 232 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4276  two component transcriptional regulator  38.66 
 
 		 236 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.886118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2811  DNA-binding response regulator  36.16 
 
 		 228 aa  133  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1374  two component transcriptional regulator  34.78 
 
 		 238 aa  133  3e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5319  cell cycle transcriptional regulator CtrA  35.14 
 
 		 233 aa  132  3.9999999999999996e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0983847 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0295  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.19 
 
 		 242 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0307  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.19 
 
 		 242 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0060  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  32.62 
 
 		 235 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.475352  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0583  response regulator receiver domain-containing protein  35.11 
 
 		 231 aa  130  2.0000000000000002e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000000029507  normal  0.0148942 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5358  two component transcriptional regulator  32 
 
 		 272 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.296948 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0841  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.77 
 
 		 223 aa  130  2.0000000000000002e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0644  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.4 
 
 		 236 aa  130  3e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2530  two component transcriptional regulator  31.7 
 
 		 242 aa  129  7.000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.279936  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2497  DNA-binding response regulator  35.27 
 
 		 228 aa  128  7.000000000000001e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1060  two component transcriptional regulator  36.56 
 
 		 230 aa  128  9.000000000000001e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1279  two component transcriptional regulator  33.78 
 
 		 237 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.461363  normal  0.257738 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4602  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.67 
 
 		 226 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8215  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.56 
 
 		 226 aa  128  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2621  two component transcriptional regulator  33.78 
 
 		 237 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.75303  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6809  two component transcriptional regulator  31.9 
 
 		 277 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.867301 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1026  two component transcriptional regulator  33.78 
 
 		 231 aa  128  1.0000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4496  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.47 
 
 		 245 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0850  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.67 
 
 		 226 aa  128  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0470  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.9 
 
 		 239 aa  128  1.0000000000000001e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0260801  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08590  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  35.62 
 
 		 239 aa  128  1.0000000000000001e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.857083 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1173  two component transcriptional regulator  33.19 
 
 		 266 aa  127  1.0000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.761417  normal  0.802826 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1399  two component transcriptional regulator  32.88 
 
 		 239 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.365128 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0724  two component transcriptional regulator  34.22 
 
 		 226 aa  128  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3778  two component transcriptional regulator, winged helix family  36 
 
 		 232 aa  127  2.0000000000000002e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0820994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3815  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.55 
 
 		 225 aa  127  2.0000000000000002e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0278114  normal  0.0118387 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4763  two component transcriptional regulator  36.8 
 
 		 230 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.96205  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0715  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.56 
 
 		 224 aa  127  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1903  two component transcriptional regulator  33.78 
 
 		 237 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3071  two component transcriptional regulator  33.19 
 
 		 238 aa  127  2.0000000000000002e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.000985444  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1155  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.86 
 
 		 230 aa  127  2.0000000000000002e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.560017  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5550  two component transcriptional regulator  31.2 
 
 		 239 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1561  two component transcriptional regulator  31.9 
 
 		 239 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.932075  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5785  two component transcriptional regulator  31.2 
 
 		 239 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.281368 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6757  two component transcriptional regulator  31.9 
 
 		 239 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.250889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6268  two component transcriptional regulator  31.9 
 
 		 239 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.350192  normal  0.482642 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0415  two component transcriptional regulator  36.89 
 
 		 231 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.777838 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1897  two component transcriptional regulator  35.84 
 
 		 227 aa  126  3e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.151466  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2053  two component transcriptional regulator  34.53 
 
 		 232 aa  126  3e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.745879 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4085  two component transcriptional regulator  34.23 
 
 		 225 aa  126  3e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.320847 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2193  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.53 
 
 		 237 aa  126  4.0000000000000003e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0620475  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2443  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.18 
 
 		 224 aa  126  4.0000000000000003e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00121019 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2712  two component transcriptional regulator  33.18 
 
 		 224 aa  126  4.0000000000000003e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00552555  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1288  two component transcriptional regulator  32.31 
 
 		 228 aa  125  6e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000128008  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1508  cell cycle transcriptional regulator ctrA  32.52 
 
 		 237 aa  125  6e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.469708  normal  0.710734 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0543  two component transcriptional regulator  31.9 
 
 		 241 aa  125  7e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21090  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  35.11 
 
 		 231 aa  125  7e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.664911  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20650  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  33.63 
 
 		 231 aa  125  9e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0260682  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2116  two component transcriptional regulator  32.6 
 
 		 231 aa  124  1e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.291778  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0005  two component transcriptional regulator  36.04 
 
 		 238 aa  124  1e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000487758  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2505  two component transcriptional regulator  32.88 
 
 		 238 aa  124  1e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.791438  normal  0.178168 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2154  response regulator receiver  32.6 
 
 		 231 aa  124  1e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0828561  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0028  two component transcriptional regulator  34.8 
 
 		 268 aa  124  1e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0604  two component transcriptional regulator  32.14 
 
 		 227 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00704602  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0575  two component transcriptional regulator  35.59 
 
 		 227 aa  124  2e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00284025  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1046  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.96 
 
 		 230 aa  124  2e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0213528  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0424  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.46 
 
 		 246 aa  124  2e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.116445  hitchhiker  0.0000956185 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1268  two component transcriptional regulator, winged helix family  28.7 
 
 		 229 aa  123  2e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0815  two component transcriptional regulator  31.03 
 
 		 248 aa  124  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.348891 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0632  two component transcriptional regulator  32.14 
 
 		 227 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.157641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6310  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.64 
 
 		 261 aa  124  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.534044  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14770  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  33.64 
 
 		 226 aa  124  2e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.383411  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0997  response regulator receiver  33.63 
 
 		 228 aa  123  3e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1924  two component transcriptional regulator  36.8 
 
 		 230 aa  123  3e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.781724  normal  0.399122 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3391  two component transcriptional regulator  33.03 
 
 		 235 aa  123  3e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3691  two component transcriptional regulator  34.36 
 
 		 230 aa  123  3e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4285  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.73 
 
 		 238 aa  123  3e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.83647  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0719  DNA-binding response regulator  33.18 
 
 		 225 aa  123  4e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11045  transcriptional regulatory protein kdpE  37.33 
 
 		 226 aa  123  4e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>