More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH1_2154 on replicon NC_009632
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009487  SaurJH9_2116  two component transcriptional regulator  100 
 
 
231 aa  476  1e-133  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.291778  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2154  response regulator receiver  100 
 
 
231 aa  476  1e-133  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0828561  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2490  DNA-binding response regulator KdeP  61.23 
 
 
231 aa  290  1e-77  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0057  two component transcriptional regulator  61.23 
 
 
231 aa  290  1e-77  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0059  response regulator receiver  61.23 
 
 
231 aa  290  1e-77  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1214  DNA-binding response regulator KdpE  45.3 
 
 
237 aa  199  3.9999999999999996e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000130813  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1587  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.52 
 
 
231 aa  182  4.0000000000000006e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2842  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.87 
 
 
235 aa  180  2e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1681  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.16 
 
 
247 aa  176  2e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4649  two component transcriptional regulator  39.11 
 
 
230 aa  170  2e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.424735  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1206  two component transcriptional regulator  40.99 
 
 
225 aa  169  4e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00352252 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2274  two component transcriptional regulator  40.36 
 
 
231 aa  167  9e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0891  two component transcriptional regulator  38.91 
 
 
231 aa  167  1e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.391375  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6752  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.91 
 
 
230 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3104  two component transcriptional regulator  39.82 
 
 
233 aa  166  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.317177  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0942  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.09 
 
 
231 aa  165  5e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0532517  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5840  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.81 
 
 
230 aa  165  5e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.99298  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0939  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.09 
 
 
231 aa  165  5.9999999999999996e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.102691  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0763  DNA-binding transcriptional activator KdpE  41.33 
 
 
225 aa  164  9e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1708  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.19 
 
 
228 aa  164  1.0000000000000001e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.476364 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0810  DNA-binding transcriptional activator KdpE  41.33 
 
 
225 aa  164  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0860  DNA-binding transcriptional activator KdpE  41.33 
 
 
225 aa  163  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1222  two component transcriptional regulator  41.7 
 
 
235 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0824  DNA-binding transcriptional activator KdpE  41.33 
 
 
225 aa  163  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0770111 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0750  DNA-binding transcriptional activator KdpE  41.33 
 
 
225 aa  163  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.358042  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3780  two component transcriptional regulator  39.01 
 
 
233 aa  162  3e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3122  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.73 
 
 
235 aa  162  3e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1172  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.18 
 
 
235 aa  162  4.0000000000000004e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0386  two component transcriptional regulator  40.09 
 
 
229 aa  162  4.0000000000000004e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2942  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.29 
 
 
225 aa  160  1e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2051  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  37.05 
 
 
230 aa  161  1e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.191031  normal  0.53595 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0828  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.95 
 
 
232 aa  160  1e-38  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.159677 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2822  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.34 
 
 
230 aa  161  1e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0741  DNA-binding transcriptional activator KdpE  39.29 
 
 
225 aa  160  1e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000675118  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0555  DNA-binding transcriptional activator KdpE  39.29 
 
 
225 aa  160  1e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2931  DNA-binding transcriptional activator KdpE  41.23 
 
 
229 aa  160  1e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0716  DNA-binding transcriptional activator KdpE  39.29 
 
 
225 aa  160  1e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0593355  normal  0.505732 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0720  DNA-binding transcriptional activator KdpE  39.29 
 
 
225 aa  160  1e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0669037  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2990  two component transcriptional regulator  37.5 
 
 
230 aa  160  2e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.839569  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00651  DNA-binding response regulator in two-component regulatory system with KdpD  38.84 
 
 
225 aa  159  3e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5960  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.95 
 
 
226 aa  159  3e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.891848  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00642  hypothetical protein  38.84 
 
 
225 aa  159  3e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0787  DNA-binding transcriptional activator KdpE  39.29 
 
 
225 aa  159  3e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3787  transposase  39.82 
 
 
229 aa  159  4e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1214  DNA-binding transcriptional activator KdpE  40.53 
 
 
226 aa  159  4e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00514307  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2962  DNA-binding transcriptional activator KdpE  38.84 
 
 
225 aa  159  5e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1196  two component transcriptional regulator  36.89 
 
 
240 aa  159  5e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1126  DNA-binding transcriptional activator KdpE  41.23 
 
 
226 aa  158  5e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.296902  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1269  two component transcriptional regulator  37.67 
 
 
228 aa  158  6e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3636  two-component response regulator KdpE  35.11 
 
 
230 aa  157  1e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.9171  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2927  two component transcriptional regulator  37.67 
 
 
228 aa  157  1e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4157  winged helix family two component transcriptional regulator  34.82 
 
 
231 aa  156  2e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.507569  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6070  two component response regulator  39.46 
 
 
228 aa  157  2e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1711  two component transcriptional regulator  35.27 
 
 
231 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43340  two-component response regulator KdpE  34.67 
 
 
230 aa  156  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.807414  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3235  two component transcriptional regulator  37.78 
 
 
228 aa  156  2e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.40462  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3729  two component transcriptional regulator  35.71 
 
 
231 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2246  KDP operon transcriptional regulatory protein kdpE  36.61 
 
 
230 aa  156  3e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.683582  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2289  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  39.8 
 
 
231 aa  156  3e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000420296  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4253  two component transcriptional regulator  37.83 
 
 
228 aa  156  3e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1159  two component transcriptional regulator  38.33 
 
 
230 aa  155  4e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2540  two component transcriptional regulator  37.83 
 
 
228 aa  155  4e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2213  DNA binding response regulator KdpE  37.5 
 
 
231 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4029  two component transcriptional regulator  35.27 
 
 
241 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.871415 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4763  two component transcriptional regulator  38.05 
 
 
230 aa  155  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.96205  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5611  two component transcriptional regulator  37.67 
 
 
232 aa  155  6e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0731674  normal  0.970504 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0994  two component transcriptional regulator  36.89 
 
 
232 aa  155  7e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1464  two component transcriptional regulator  39.38 
 
 
222 aa  155  7e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.286623  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3600  two component transcriptional regulator  37.55 
 
 
235 aa  154  9e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2437  two component transcriptional regulator  39.91 
 
 
233 aa  154  1e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0531  two component transcriptional regulator  38.91 
 
 
229 aa  154  1e-36  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2200  two component transcriptional regulator  37.22 
 
 
232 aa  154  1e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.365248  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2322  two component transcriptional regulator  37.22 
 
 
232 aa  154  1e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.521655  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0299  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.31 
 
 
231 aa  154  1e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.867846 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3482  two component transcriptional regulator  35.27 
 
 
231 aa  153  2e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3023  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.92 
 
 
234 aa  153  2e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0742  two component transcriptional regulator  40.61 
 
 
245 aa  153  2e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4230  two component transcriptional regulator  37.61 
 
 
226 aa  153  2e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.285059  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4296  two component transcriptional regulator  37.61 
 
 
226 aa  153  2e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0135013  normal  0.794825 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3370  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.92 
 
 
234 aa  153  2e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5362  two component transcriptional regulator  37.22 
 
 
230 aa  153  2e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0748621 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4608  two component transcriptional regulator  37.61 
 
 
226 aa  153  2e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3077  two component transcriptional regulator  36 
 
 
227 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0535977  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11045  transcriptional regulatory protein kdpE  36.77 
 
 
226 aa  152  4e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3778  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.96 
 
 
232 aa  152  4e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0820994  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3087  response regulator transcription regulator protein  37.93 
 
 
234 aa  152  5e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.160744  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1884  response regulator receiver protein  34.38 
 
 
244 aa  152  5e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.365735  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1875  response regulator receiver  38.01 
 
 
230 aa  152  5.9999999999999996e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.72432  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2094  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.04 
 
 
231 aa  151  5.9999999999999996e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2307  two component transcriptional regulator  36.32 
 
 
232 aa  151  7e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1510  two component transcriptional regulator  38.84 
 
 
224 aa  151  7e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.963665  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1672  two component transcriptional regulator  36.32 
 
 
232 aa  151  7e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.193412  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2284  two component transcriptional regulator  36.32 
 
 
232 aa  151  7e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.21195  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1397  DNA-binding response regulator KdpE  37.22 
 
 
232 aa  150  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.089264  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1025  DNA-binding response regulator KdpE  37.22 
 
 
234 aa  150  1e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1246  KDP operon transcriptional regulatory protein KdpE  37.22 
 
 
232 aa  150  1e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0465  DNA-binding response regulator  41.52 
 
 
230 aa  150  1e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000321608  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1872  DNA-binding response regulator KdpE  37.22 
 
 
234 aa  150  2e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0800306  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1254  KDP operon transcriptional regulatory protein KdpE  37.22 
 
 
234 aa  150  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00667548  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0371  DNA-binding response regulator KdpE  37.22 
 
 
234 aa  150  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>