More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2355 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_2355  putative two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 313 aa  635    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0846804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4900  putative two component transcriptional regulator, winged helix family  50.92 
 
 		 296 aa  259  3e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000353912  normal  0.0339956 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10143  two-component system response regulator  29.32 
 
 		 289 aa  127  2.0000000000000002e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.304444  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0940  transcriptional regulator domain protein  29.63 
 
 		 296 aa  124  3e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000423424 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3144  putative two component transcriptional regulator, winged helix family  27.62 
 
 		 317 aa  120  3.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3566  two component transcriptional regulator, winged helix family  45 
 
 		 228 aa  99.8  6e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.720677 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4521  two component transcriptional regulator  40.54 
 
 		 230 aa  82  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03275  two-component system, transcriptional regulatory protein  41.24 
 
 		 234 aa  80.9  0.00000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4970  two component transcriptional regulator  37.62 
 
 		 228 aa  80.5  0.00000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.375881  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2742  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.54 
 
 		 230 aa  79  0.00000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.142828  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1089  DNA-binding response regulator RprY  37.78 
 
 		 245 aa  77.4  0.0000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.414682 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1242  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.62 
 
 		 234 aa  76.6  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3651  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.91 
 
 		 228 aa  76.6  0.0000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0435949 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0693  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.63 
 
 		 229 aa  75.1  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0203  response regulator receiver  41.84 
 
 		 231 aa  75.5  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.359659 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5352  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.78 
 
 		 224 aa  72.8  0.000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1246  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.23 
 
 		 233 aa  72  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.877806  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0209  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.51 
 
 		 251 aa  71.2  0.00000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09498  two-component system, transcriptional regulatory protein  41.56 
 
 		 236 aa  70.9  0.00000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0856  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.71 
 
 		 233 aa  70.5  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2990  two component transcriptional regulator  36.27 
 
 		 230 aa  70.1  0.00000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.140246 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1649  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.73 
 
 		 236 aa  70.1  0.00000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5387  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.06 
 
 		 236 aa  68.9  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1848  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.86 
 
 		 236 aa  68.2  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0065624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3460  two component transcriptional regulator  39.24 
 
 		 238 aa  68.2  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0108229  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7053  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.02 
 
 		 248 aa  66.2  0.0000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00262574  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1962  osmolarity response regulator  37.04 
 
 		 244 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.187967  normal  0.0634815 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5249  osmolarity response regulator  37.04 
 
 		 244 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.204246  normal  0.745504 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6141  osmolarity response regulator  37.04 
 
 		 244 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.120853  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1938  osmolarity response regulator  37.04 
 
 		 244 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0280828  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1980  osmolarity response regulator  37.04 
 
 		 244 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0224779  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2352  osmolarity response regulator  37.04 
 
 		 244 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.260389  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4089  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.54 
 
 		 230 aa  65.9  0.0000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00519658 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1485  osmolarity response regulator  37.04 
 
 		 241 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.021777  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1569  osmolarity response regulator  37.04 
 
 		 240 aa  65.9  0.0000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.306137  normal  0.101265 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2507  osmolarity response regulator  37.04 
 
 		 241 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.734124  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1853  osmolarity response regulator  37.04 
 
 		 244 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00101518  hitchhiker  0.0000149756 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2094  osmolarity response regulator  37.04 
 
 		 241 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1898  osmolarity response regulator  37.04 
 
 		 240 aa  65.9  0.0000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.065084  normal  0.515659 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1253  osmolarity response regulator  37.04 
 
 		 244 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.512472  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1333  osmolarity response regulator  37.04 
 
 		 244 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00265076  decreased coverage  0.0000710625 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2395  osmolarity response regulator  37.04 
 
 		 244 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.479905  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1926  osmolarity response regulator  37.04 
 
 		 244 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0250147  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3325  osmolarity response regulator  37.04 
 
 		 244 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000316731  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1648  osmolarity response regulator  37.04 
 
 		 240 aa  65.9  0.0000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.446623 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2629  two component signal transduction response regulator  36.08 
 
 		 238 aa  65.9  0.0000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1368  osmolarity response regulator  36.52 
 
 		 240 aa  65.9  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4240  transcriptional regulator domain-containing protein  38.3 
 
 		 257 aa  65.5  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.466466  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1947  osmolarity response regulator  36.52 
 
 		 240 aa  64.3  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2988  two component transcriptional regulator, winged helix family  43 
 
 		 256 aa  64.7  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1879  osmolarity response regulator  35.19 
 
 		 244 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.276509  normal  0.342548 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2307  osmolarity response regulator  35.19 
 
 		 244 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0713504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2022  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.43 
 
 		 227 aa  63.9  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.203611  normal  0.416027 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0346  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.96 
 
 		 234 aa  64.3  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3821  response regulator receiver  37.37 
 
 		 264 aa  63.9  0.000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.169085  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1003  osmolarity response regulator  38.3 
 
 		 244 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0710839  normal  0.39184 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1614  DNA-binding response regulator  33.98 
 
 		 244 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0469389  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0660  DNA-binding response regulator  34.31 
 
 		 249 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2261  DNA-binding response regulator  34.31 
 
 		 263 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.338205  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1975  DNA-binding response regulator  34.31 
 
 		 263 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0150258  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2178  DNA-binding response regulator  34.31 
 
 		 263 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.638028  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0654  DNA-binding response regulator  34.31 
 
 		 263 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0154  two component transcriptional regulator  41.67 
 
 		 238 aa  63.2  0.000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.644268  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0766  DNA-binding response regulator  34.31 
 
 		 249 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.692099  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6372  putative two component transcriptional regulator, winged helix family  38.54 
 
 		 236 aa  63.2  0.000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0541  two component transcriptional regulator  37.11 
 
 		 230 aa  62  0.00000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1897  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.57 
 
 		 229 aa  61.6  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3090  putative two component transcriptional regulator, winged helix family  29.31 
 
 		 241 aa  61.6  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000121276 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0293  winged helix family two component response transcriptional regulator  38.14 
 
 		 239 aa  61.2  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1382  putative two component transcriptional regulator, winged helix family  38.55 
 
 		 277 aa  60.8  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00248291 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03550  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  43.24 
 
 		 261 aa  60.8  0.00000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.329191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0956  DNA-binding response regulator  31 
 
 		 223 aa  60.8  0.00000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.504019  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0255  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.67 
 
 		 232 aa  60.5  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1456  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.04 
 
 		 223 aa  60.1  0.00000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000183373  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0556  two component transcriptional regulator  30.66 
 
 		 237 aa  60.1  0.00000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.451756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0337  winged helix family two component response transcriptional regulator  38 
 
 		 239 aa  60.1  0.00000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0279779 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0588  two component transcriptional regulator  44.44 
 
 		 227 aa  59.7  0.00000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000451147  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5920  two component transcriptional regulator  36.73 
 
 		 249 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0444029 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04930  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  31.62 
 
 		 249 aa  59.7  0.00000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.793732  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4134  osmolarity response regulator  35.51 
 
 		 241 aa  59.7  0.00000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0359  osmolarity response regulator  38.71 
 
 		 245 aa  59.7  0.00000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4338  osmolarity response regulator  35.51 
 
 		 241 aa  59.7  0.00000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4206  osmolarity response regulator  35.51 
 
 		 241 aa  59.7  0.00000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4983  putative two component transcriptional regulator, winged helix family  34.02 
 
 		 232 aa  59.7  0.00000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1402  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.63 
 
 		 241 aa  59.7  0.00000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.154165 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0218  osmolarity response regulator  34.26 
 
 		 241 aa  59.7  0.00000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4017  osmolarity response regulator  35.51 
 
 		 241 aa  59.7  0.00000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1917  two component transcriptional regulator  41.03 
 
 		 238 aa  59.3  0.00000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.332821 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0578  two component transcriptional regulator  36.08 
 
 		 240 aa  59.3  0.00000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3042  two-component response regulator  34.44 
 
 		 228 aa  59.3  0.00000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.330896  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3811  osmolarity response regulator  35.51 
 
 		 241 aa  59.3  0.00000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0373241 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3902  osmolarity response regulator  35.51 
 
 		 241 aa  59.3  0.00000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.140952 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2546  osmolarity response regulator  36.11 
 
 		 245 aa  59.3  0.00000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.16006 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6462  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 249 aa  58.9  0.00000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.747199 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3538  osmolarity response regulator  36.56 
 
 		 240 aa  59.3  0.00000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000279148  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0879  putative two component transcriptional regulator, winged helix family  34.51 
 
 		 259 aa  58.5  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.249855  hitchhiker  0.00478466 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4159  two component transcriptional regulator  34.69 
 
 		 230 aa  58.5  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.667277  normal  0.0359145 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1433  two component transcriptional regulator  33.02 
 
 		 229 aa  58.9  0.0000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2522  response regulator receiver  32.33 
 
 		 229 aa  58.5  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.661278  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3703  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 232 aa  58.9  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.230236  normal  0.0884672 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>