More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_1382 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_1382  putative two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 277 aa  562  1.0000000000000001e-159  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00248291 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1554  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.92 
 
 		 229 aa  125  9e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00709514 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0630  two component transcriptional regulator  61.7 
 
 		 232 aa  123  3e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1954  two component transcriptional regulator  46.3 
 
 		 229 aa  112  8.000000000000001e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000155813  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1285  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.08 
 
 		 234 aa  107  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.477652  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1897  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.49 
 
 		 229 aa  107  2e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0264  two component transcriptional regulator  53.09 
 
 		 238 aa  105  1e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.392693  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4781  DNA-binding response regulator  53.57 
 
 		 229 aa  103  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0458  DNA-binding response regulator  53.57 
 
 		 229 aa  103  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00396749 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2918  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.38 
 
 		 232 aa  104  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4786  DNA-binding response regulator  52.38 
 
 		 229 aa  103  3e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5511  two component transcriptional regulator  43.65 
 
 		 236 aa  102  5e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  0.567595 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0258  response regulator  45.71 
 
 		 237 aa  102  8e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4663  two component transcriptional regulator  52.38 
 
 		 232 aa  102  8e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0273  DNA-binding response regulator  43.81 
 
 		 237 aa  102  9e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.484752  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0287  DNA-binding response regulator  43.81 
 
 		 237 aa  102  9e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.42222  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0317  DNA-binding response regulator  43.81 
 
 		 237 aa  102  9e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2729  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.21 
 
 		 228 aa  101  1e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.981161  normal  0.424997 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3069  two component transcriptional regulator  47.78 
 
 		 230 aa  100  2e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000467461  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0255  DNA-binding response regulator  43.81 
 
 		 237 aa  100  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4400  DNA-binding response regulator  52.38 
 
 		 233 aa  100  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4417  DNA-binding response regulator  52.38 
 
 		 233 aa  100  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4803  DNA-binding response regulator  52.38 
 
 		 229 aa  100  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1456  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.71 
 
 		 223 aa  100  2e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000183373  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3703  two component transcriptional regulator  40.35 
 
 		 232 aa  100  2e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.230236  normal  0.0884672 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0378  two component transcriptional regulator  43.3 
 
 		 234 aa  100  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3872  two component transcriptional regulator  47.78 
 
 		 229 aa  101  2e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0547348  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4565  DNA-binding response regulator  51.19 
 
 		 233 aa  100  3e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4801  response regulator protein  46.74 
 
 		 234 aa  100  3e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000584394  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4920  DNA-binding response regulator  51.19 
 
 		 229 aa  100  3e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0294  DNA-binding response regulator  50 
 
 		 233 aa  99.8  4e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0296  DNA-binding response regulator  50 
 
 		 233 aa  99.8  4e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0256  DNA-binding response regulator  50 
 
 		 233 aa  99.8  4e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0242  response regulator  50 
 
 		 233 aa  99.8  4e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0245  response regulator  50 
 
 		 233 aa  99.8  4e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0271  DNA-binding response regulator  50 
 
 		 233 aa  99.8  4e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.439326  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0303  DNA-binding response regulator  50 
 
 		 233 aa  99.8  4e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0610099  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0322  DNA-binding response regulator  50 
 
 		 233 aa  99.8  4e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000418869  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4998  DNA-binding response regulator  47.62 
 
 		 237 aa  99.4  6e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.709524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1007  two component transcriptional regulator  48.89 
 
 		 233 aa  99.4  6e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0287  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.09 
 
 		 229 aa  99  7e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00220806  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0987  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.65 
 
 		 233 aa  99  7e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.195539  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5254  regulatory protein VanR  46.74 
 
 		 234 aa  99  7e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0316  DNA-binding response regulator  47.62 
 
 		 237 aa  99  8e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1529  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.89 
 
 		 228 aa  98.6  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1673  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.9 
 
 		 233 aa  98.6  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0266  two component transcriptional regulator  50.62 
 
 		 237 aa  98.2  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.262207  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2674  DNA-binding response regulator  44.79 
 
 		 232 aa  98.2  1e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00069138  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2359  DNA-binding response regulator  44.79 
 
 		 232 aa  98.2  1e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.596616  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5021  DNA-binding response regulator  48.91 
 
 		 233 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0330449  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1728  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.66 
 
 		 233 aa  97.8  2e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0940  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.92 
 
 		 237 aa  97.8  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.324642  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4666  two component transcriptional regulator  47.83 
 
 		 233 aa  97.4  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1157  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.9 
 
 		 233 aa  97.1  3e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3233  two component transcriptional regulator  45.16 
 
 		 230 aa  97.1  3e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0444  DNA-binding response regulator  41.74 
 
 		 233 aa  97.4  3e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4647  DNA-binding response regulator  43.56 
 
 		 230 aa  96.3  4e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2507  winged helix family two component transcriptional regulator  44.44 
 
 		 233 aa  95.9  6e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4650  DNA-binding response regulator  44.44 
 
 		 230 aa  95.9  6e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1658  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.45 
 
 		 230 aa  95.9  6e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.515101  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0588  two component transcriptional regulator  44.44 
 
 		 227 aa  95.9  7e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000451147  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4433  DNA-binding response regulator  44.44 
 
 		 230 aa  95.9  7e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4272  response regulator  44.44 
 
 		 230 aa  95.9  7e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.760233  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4777  DNA-binding response regulator  44.44 
 
 		 230 aa  95.9  7e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4663  DNA-binding response regulator  44.44 
 
 		 230 aa  95.9  7e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1441  two component transcriptional regulator  49.45 
 
 		 247 aa  95.9  7e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.167327  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1193  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.55 
 
 		 240 aa  95.5  8e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4283  response regulator  44.44 
 
 		 230 aa  95.1  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4687  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.05 
 
 		 230 aa  94.7  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000280381  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0283  regulatory protein VanR  45.65 
 
 		 233 aa  94.7  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1040  DNA-binding response regulator  47.25 
 
 		 234 aa  94  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4914  two component transcriptional regulator  43.88 
 
 		 238 aa  94  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.095278 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1119  DNA-binding response regulator  47.25 
 
 		 234 aa  94  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3086  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.98 
 
 		 233 aa  94  2e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.151774  normal  0.916258 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0543  two component transcriptional regulator  46.15 
 
 		 241 aa  94  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1508  two component transcriptional regulator  46.59 
 
 		 237 aa  94.7  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4662  DNA-binding response regulator  42.42 
 
 		 230 aa  93.6  3e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  48.42 
 
 		 229 aa  93.6  3e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0590  DNA-binding response regulator  42.42 
 
 		 230 aa  93.2  4e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0721  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.59 
 
 		 233 aa  93.6  4e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.811558  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0295  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.65 
 
 		 242 aa  93.2  4e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5426  two component transcriptional regulator  47.73 
 
 		 251 aa  93.2  4e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1917  two component transcriptional regulator  42 
 
 		 238 aa  93.2  4e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.332821 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11290  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  39.06 
 
 		 234 aa  93.2  4e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0218  two component transcriptional regulator  45.05 
 
 		 239 aa  93.6  4e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0307  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.65 
 
 		 242 aa  93.2  4e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1136  two component transcriptional regulator  49.48 
 
 		 239 aa  92.8  5e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000652217  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4050  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.56 
 
 		 227 aa  92.8  5e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00552008  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2678  winged helix family two component transcriptional regulator  41.84 
 
 		 240 aa  93.2  5e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1174  two component transcriptional regulator  49.48 
 
 		 239 aa  92.8  5e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0181894  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1838  two component transcriptional regulator  49.48 
 
 		 239 aa  92.8  5e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000194698  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04710  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.72 
 
 		 237 aa  92.8  5e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0249  two component transcriptional regulator  46.74 
 
 		 233 aa  92.8  6e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0382139  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0439  two component transcriptional regulator  51.85 
 
 		 225 aa  92.8  6e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000223011  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0132  response regulator receiver protein  51.81 
 
 		 231 aa  92.4  6e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1490  two component transcriptional regulator  49.48 
 
 		 239 aa  92.4  7e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000120928  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0255  two component transcriptional regulator  45.65 
 
 		 246 aa  92  8e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000922211  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1192  DNA-binding response regulator  45.88 
 
 		 229 aa  92  8e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00982401  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1715  response regulator  44 
 
 		 232 aa  92  9e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0124001  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1689  response regulator  44 
 
 		 232 aa  92  9e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>