More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0701 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_0701  50S ribosomal protein L3  100 
 
 		 210 aa  425  1e-118  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000481863  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0626  50S ribosomal protein L3  61.72 
 
 		 210 aa  266  1e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000331463  hitchhiker  0.000000000000331617 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1067  50S ribosomal protein L3  60.77 
 
 		 211 aa  265  2.9999999999999995e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000374639  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2857  50S ribosomal protein L3  60.29 
 
 		 210 aa  261  6e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.918611  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1346  50S ribosomal protein L3  60.77 
 
 		 211 aa  246  2e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.700686  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0933  50S ribosomal protein L3  58.85 
 
 		 211 aa  245  4e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00137042  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1555  ribosomal protein L3  54.55 
 
 		 210 aa  244  6e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00791107  normal  0.982603 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3328  50S ribosomal protein L3  58.37 
 
 		 211 aa  243  9.999999999999999e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000332976 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0286  50S ribosomal protein L3  56.94 
 
 		 209 aa  240  1e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0410836  hitchhiker  0.00603059 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2399  50S ribosomal protein L3  56.46 
 
 		 209 aa  238  4e-62  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000824684  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2714  50S ribosomal protein L3  56.46 
 
 		 209 aa  238  5e-62  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000231855  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0111  50S ribosomal protein L3  56.46 
 
 		 211 aa  235  4e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000151121  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1745  50S ribosomal protein L3  56.94 
 
 		 210 aa  234  7e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000981122  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01170  50S ribosomal protein L3  59.33 
 
 		 211 aa  233  1.0000000000000001e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000794381  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2333  50S ribosomal protein L3  53.62 
 
 		 212 aa  233  1.0000000000000001e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000241734  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0215  50S ribosomal protein L3  56.67 
 
 		 209 aa  233  2.0000000000000002e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000370606  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03980  LSU ribosomal protein L3P  58.17 
 
 		 213 aa  232  3e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0680  50S ribosomal protein L3  57.58 
 
 		 209 aa  231  4.0000000000000004e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.620206  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0708  50S ribosomal protein L3  53.88 
 
 		 208 aa  230  1e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00455924  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1867  50S ribosomal protein L3  57.14 
 
 		 207 aa  229  2e-59  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0222976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2774  ribosomal protein L3  50.96 
 
 		 210 aa  228  6e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.039291  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0867  50S ribosomal protein L3  55.98 
 
 		 210 aa  228  7e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000729631  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1831  50S ribosomal protein L3  55.76 
 
 		 220 aa  227  9e-59  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000207996  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2257  50S ribosomal protein L3  53.66 
 
 		 209 aa  227  9e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000117498  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2711  50S ribosomal protein L3  55.07 
 
 		 211 aa  227  1e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000399657  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0122  50S ribosomal protein L3  55.71 
 
 		 210 aa  227  1e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.0599700000000001e-61 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0110  50S ribosomal protein L3  55.71 
 
 		 210 aa  227  1e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000528056  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0110  50S ribosomal protein L3  55.71 
 
 		 210 aa  227  1e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000986131  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0106  50S ribosomal protein L3  55.71 
 
 		 210 aa  227  1e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.6707699999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0104  50S ribosomal protein L3  55.71 
 
 		 210 aa  227  1e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000168091  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0141  50S ribosomal protein L3  55.71 
 
 		 210 aa  227  1e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000551418  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0110  50S ribosomal protein L3  55.71 
 
 		 210 aa  227  1e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000246604  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0131  50S ribosomal protein L3  55.71 
 
 		 210 aa  227  1e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000141135  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2460  50S ribosomal protein L3  55.02 
 
 		 209 aa  226  2e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0891685 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0790  50S ribosomal protein L3  54.59 
 
 		 213 aa  226  3e-58  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0079  50S ribosomal protein L3  53.66 
 
 		 209 aa  225  4e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.145283 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2907  50S ribosomal protein L3  55.83 
 
 		 212 aa  224  8e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0105  50S ribosomal protein L3  54.76 
 
 		 210 aa  223  1e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000775669  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5195  50S ribosomal protein L3  54.76 
 
 		 210 aa  223  1e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000842867  unclonable  2.19314e-25 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0107  50S ribosomal protein L3  54.68 
 
 		 213 aa  223  2e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0104  50S ribosomal protein L3  55.12 
 
 		 210 aa  222  3e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000119433  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1765  50S ribosomal protein L3  53.43 
 
 		 209 aa  222  3e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.0000837732  normal  0.643205 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2619  50S ribosomal protein L3  56.46 
 
 		 214 aa  220  9.999999999999999e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0132285  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1524  50S ribosomal protein L3  54.11 
 
 		 209 aa  219  1.9999999999999999e-56  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.593746  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4915  50S ribosomal protein L3  52.86 
 
 		 212 aa  219  1.9999999999999999e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0274485  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4321  ribosomal protein L3  54.33 
 
 		 216 aa  219  1.9999999999999999e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2318  50S ribosomal protein L3  56.22 
 
 		 220 aa  219  1.9999999999999999e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000223614  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0422  50S ribosomal protein L3  52.63 
 
 		 209 aa  219  1.9999999999999999e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000195061  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1907  50S ribosomal protein L3  56.46 
 
 		 208 aa  219  3e-56  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000032853  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0981  ribosomal protein L3  53.37 
 
 		 215 aa  218  5e-56  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.843676  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2065  50S ribosomal protein L3  52.71 
 
 		 209 aa  218  6e-56  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.00000000000562685  normal  0.223373 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1185  50S ribosomal protein L3  50.95 
 
 		 210 aa  218  7e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0058  50S ribosomal protein L3  56.46 
 
 		 208 aa  217  1e-55  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00491271  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0194  50S ribosomal protein L3  55.02 
 
 		 210 aa  217  1e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000719285  normal  0.0489845 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4026  50S ribosomal protein L3  51.43 
 
 		 210 aa  217  1e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000729954 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0306  50S ribosomal protein L3P  53.37 
 
 		 222 aa  216  2e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00207169 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3667  50S ribosomal protein L3  52.63 
 
 		 211 aa  216  2.9999999999999998e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000330884  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2277  50S ribosomal protein L3  55.3 
 
 		 220 aa  215  4e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000105261  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1394  50S ribosomal protein L3  53.4 
 
 		 207 aa  215  4e-55  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000462367  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1292  50S ribosomal protein L3  53.4 
 
 		 207 aa  215  4e-55  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000263563  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1161  ribosomal protein L3  53.66 
 
 		 206 aa  215  4e-55  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000266904  hitchhiker  0.000000567921 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1836  50S ribosomal protein L3  52.26 
 
 		 217 aa  214  8e-55  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00718997  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0758  50S ribosomal protein L3  50.72 
 
 		 212 aa  214  9e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000233446  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2903  50S ribosomal protein L3  51.2 
 
 		 212 aa  213  1.9999999999999998e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000477342  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1184  ribosomal protein L3  50.96 
 
 		 209 aa  211  5.999999999999999e-54  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000270125  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10020  LSU ribosomal protein L3P  50.24 
 
 		 206 aa  211  7e-54  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.000000402835  hitchhiker  0.00000000318342 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3024  50S ribosomal protein L3  50.48 
 
 		 210 aa  211  7e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.371217  hitchhiker  0.00790921 
 
 
-
 
NC_002950  PG1938  50S ribosomal protein L3  53.88 
 
 		 205 aa  209  3e-53  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00445  50S ribosomal protein L3  53.77 
 
 		 212 aa  209  3e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.000559916  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1086  LSU ribosomal protein L3P  53.37 
 
 		 217 aa  208  4e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.10406 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0691  50S ribosomal protein L3  50.48 
 
 		 211 aa  207  8e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00208666  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0225  ribosomal protein L3  50.24 
 
 		 213 aa  207  8e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0562  50S ribosomal protein L3  52.4 
 
 		 218 aa  207  1e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0953  50S ribosomal protein L3  52.17 
 
 		 205 aa  207  1e-52  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000000660439  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0291  50S ribosomal protein L3  48.79 
 
 		 226 aa  206  2e-52  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0279726  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0469  50S ribosomal protein L3  53.95 
 
 		 212 aa  206  2e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000509154  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0931  ribosomal protein L3  51.44 
 
 		 215 aa  206  2e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.15696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0451  50S ribosomal protein L3  50.95 
 
 		 205 aa  205  4e-52  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000154888  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3758  50S ribosomal protein L3  50.72 
 
 		 219 aa  204  6e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.33789  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3995  ribosomal protein L3  53.62 
 
 		 208 aa  203  1e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0474  50S ribosomal protein L3  50.48 
 
 		 205 aa  202  2e-51  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00148542  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2324  ribosomal protein L3  53.33 
 
 		 214 aa  203  2e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00000658885  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_417  ribosomal protein L3  50.48 
 
 		 205 aa  203  2e-51  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000036263  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6614  ribosomal protein L3  52.4 
 
 		 216 aa  202  2e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1138  50S ribosomal protein L3  48.31 
 
 		 207 aa  203  2e-51  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000858376  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0405  ribosomal protein L3  52.66 
 
 		 209 aa  202  3e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00399178  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0962  ribosomal protein L3  52.68 
 
 		 206 aa  202  3e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000608869  hitchhiker  0.0000000000269964 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0291  50S ribosomal protein L3  49.76 
 
 		 209 aa  201  5e-51  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000100637  unclonable  1.4129e-28 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1123  ribosomal protein L3  52.4 
 
 		 220 aa  200  9.999999999999999e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10715  50S ribosomal protein L3  50.71 
 
 		 217 aa  199  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.249834 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0323  ribosomal protein L3  51.21 
 
 		 209 aa  199  1.9999999999999998e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000222247  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00730  50S ribosomal protein L3  54.11 
 
 		 209 aa  200  1.9999999999999998e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2174  50S ribosomal protein L3  53.14 
 
 		 209 aa  199  1.9999999999999998e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000029924  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3905  50S ribosomal protein L3  51.92 
 
 		 223 aa  199  3e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2646  50S ribosomal protein L3  51.44 
 
 		 216 aa  197  7e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.334348  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5049  50S ribosomal protein L3  50.94 
 
 		 218 aa  197  7.999999999999999e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.399218 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4548  50S ribosomal protein L3  50.48 
 
 		 211 aa  197  9e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00256892  normal  0.0637159 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5124  50S ribosomal protein L3  51.44 
 
 		 216 aa  197  9e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3703  50S ribosomal protein L3  48.34 
 
 		 212 aa  197  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0842  ribosomal protein L3  50 
 
 		 210 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>