More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH1_2318 on replicon NC_009632
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009632  SaurJH1_2318  50S ribosomal protein L3  100 
 
 
220 aa  441  1e-123  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000223614  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2277  50S ribosomal protein L3  99.09 
 
 
220 aa  436  9.999999999999999e-123  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000105261  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1831  50S ribosomal protein L3  91.82 
 
 
220 aa  410  1e-114  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000207996  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0104  50S ribosomal protein L3  68.06 
 
 
210 aa  301  7.000000000000001e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000119433  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0111  50S ribosomal protein L3  67.13 
 
 
211 aa  298  5e-80  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000151121  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0110  50S ribosomal protein L3  67.59 
 
 
210 aa  297  7e-80  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000528056  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0110  50S ribosomal protein L3  67.59 
 
 
210 aa  297  7e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000986131  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0106  50S ribosomal protein L3  67.59 
 
 
210 aa  297  7e-80  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.6707699999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0104  50S ribosomal protein L3  67.59 
 
 
210 aa  297  7e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000168091  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0131  50S ribosomal protein L3  67.59 
 
 
210 aa  297  7e-80  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000141135  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0122  50S ribosomal protein L3  67.59 
 
 
210 aa  297  7e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.0599700000000001e-61 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0110  50S ribosomal protein L3  67.59 
 
 
210 aa  297  7e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000246604  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0141  50S ribosomal protein L3  67.59 
 
 
210 aa  297  7e-80  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000551418  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5195  50S ribosomal protein L3  67.59 
 
 
210 aa  297  9e-80  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000842867  unclonable  2.19314e-25 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0105  50S ribosomal protein L3  67.59 
 
 
210 aa  297  9e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000775669  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0107  50S ribosomal protein L3  66.99 
 
 
213 aa  286  1e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0058  50S ribosomal protein L3  63.43 
 
 
208 aa  276  2e-73  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00491271  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1907  50S ribosomal protein L3  62.96 
 
 
208 aa  275  3e-73  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000032853  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0196  50S ribosomal protein L3  58.33 
 
 
228 aa  260  1e-68  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0113604  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2711  50S ribosomal protein L3  60.09 
 
 
211 aa  259  3e-68  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000399657  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0422  50S ribosomal protein L3  60.19 
 
 
209 aa  255  4e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000195061  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1745  50S ribosomal protein L3  61.11 
 
 
210 aa  255  5e-67  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000981122  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2714  50S ribosomal protein L3  59.26 
 
 
209 aa  251  6e-66  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000231855  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2399  50S ribosomal protein L3  58.8 
 
 
209 aa  250  9.000000000000001e-66  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000824684  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1483  50S ribosomal protein L3  55.45 
 
 
219 aa  249  2e-65  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000163613  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01170  50S ribosomal protein L3  57.08 
 
 
211 aa  249  2e-65  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000794381  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0291  50S ribosomal protein L3  57.87 
 
 
209 aa  247  1e-64  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000100637  unclonable  1.4129e-28 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0194  50S ribosomal protein L3  58.8 
 
 
210 aa  245  3e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000719285  normal  0.0489845 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0867  50S ribosomal protein L3  58.8 
 
 
210 aa  244  6.999999999999999e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000729631  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0595  50S ribosomal protein L3P  57.87 
 
 
247 aa  244  6.999999999999999e-64  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.000000158145  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3667  50S ribosomal protein L3  57.8 
 
 
211 aa  243  9.999999999999999e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000330884  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0286  50S ribosomal protein L3  55.56 
 
 
209 aa  236  2e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0410836  hitchhiker  0.00603059 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2333  50S ribosomal protein L3  54.88 
 
 
212 aa  236  3e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000241734  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1524  50S ribosomal protein L3  56.07 
 
 
209 aa  233  2.0000000000000002e-60  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.593746  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2460  50S ribosomal protein L3  54.13 
 
 
209 aa  228  7e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0891685 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0696  50S ribosomal protein L3  52.09 
 
 
223 aa  227  1e-58  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.372092  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0758  50S ribosomal protein L3  54.34 
 
 
212 aa  226  3e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000233446  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0701  50S ribosomal protein L3  56.22 
 
 
210 aa  223  2e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000481863  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0626  50S ribosomal protein L3  51.85 
 
 
210 aa  222  3e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000331463  hitchhiker  0.000000000000331617 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0215  50S ribosomal protein L3  52.78 
 
 
209 aa  222  3e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000370606  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1067  50S ribosomal protein L3  51.85 
 
 
211 aa  219  3.9999999999999997e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000374639  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0225  ribosomal protein L3  50 
 
 
213 aa  218  6e-56  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2857  50S ribosomal protein L3  52.78 
 
 
210 aa  217  8.999999999999998e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.918611  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2903  50S ribosomal protein L3  53.92 
 
 
212 aa  215  4e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000477342  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0790  50S ribosomal protein L3  53.27 
 
 
213 aa  214  5.9999999999999996e-55  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl123  50S ribosomal protein L3  52.56 
 
 
238 aa  212  2.9999999999999995e-54  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  9.499549999999999e-37  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1346  50S ribosomal protein L3  52.31 
 
 
211 aa  212  3.9999999999999995e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.700686  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1394  50S ribosomal protein L3  52.83 
 
 
207 aa  210  1e-53  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000462367  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1292  50S ribosomal protein L3  52.83 
 
 
207 aa  210  1e-53  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000263563  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0953  50S ribosomal protein L3  51.89 
 
 
205 aa  210  2e-53  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000000660439  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3905  50S ribosomal protein L3  52.09 
 
 
223 aa  209  2e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3435  50S ribosomal protein L3  49.77 
 
 
218 aa  207  1e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4915  50S ribosomal protein L3  52.04 
 
 
212 aa  206  2e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0274485  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03980  LSU ribosomal protein L3P  50.23 
 
 
213 aa  206  2e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0708  50S ribosomal protein L3  48.58 
 
 
208 aa  205  4e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00455924  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10020  LSU ribosomal protein L3P  48.13 
 
 
206 aa  204  7e-52  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.000000402835  hitchhiker  0.00000000318342 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0981  ribosomal protein L3  52.75 
 
 
215 aa  204  8e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.843676  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3758  50S ribosomal protein L3  48.18 
 
 
219 aa  203  1e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.33789  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0933  50S ribosomal protein L3  50.46 
 
 
211 aa  202  2e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00137042  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2774  ribosomal protein L3  48.8 
 
 
210 aa  202  4e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.039291  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3024  50S ribosomal protein L3  47.93 
 
 
210 aa  201  5e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.371217  hitchhiker  0.00790921 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23810  LSU ribosomal protein L3P  49.53 
 
 
226 aa  200  9.999999999999999e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2687  50S ribosomal protein L3  50.23 
 
 
216 aa  200  9.999999999999999e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.740328 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3328  50S ribosomal protein L3  50 
 
 
211 aa  200  9.999999999999999e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000332976 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1184  ribosomal protein L3  50.7 
 
 
209 aa  200  9.999999999999999e-51  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000270125  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0306  50S ribosomal protein L3P  49.77 
 
 
222 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00207169 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1161  ribosomal protein L3  49.53 
 
 
206 aa  199  1.9999999999999998e-50  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000266904  hitchhiker  0.000000567921 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6614  ribosomal protein L3  48.39 
 
 
216 aa  199  1.9999999999999998e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1138  50S ribosomal protein L3  47.91 
 
 
207 aa  199  3e-50  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000858376  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0962  ribosomal protein L3  50 
 
 
206 aa  198  5e-50  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000608869  hitchhiker  0.0000000000269964 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2975  50S ribosomal protein L3  49.77 
 
 
216 aa  198  6e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.454423  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0562  50S ribosomal protein L3  49.31 
 
 
218 aa  196  2.0000000000000003e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10715  50S ribosomal protein L3  48.65 
 
 
217 aa  196  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.249834 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0931  ribosomal protein L3  47.47 
 
 
215 aa  196  3e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.15696  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0489  50S ribosomal protein L3  48.6 
 
 
206 aa  196  3e-49  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.525282  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5049  50S ribosomal protein L3  48.88 
 
 
218 aa  195  3e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.399218 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17160  50S ribosomal protein L3  47.91 
 
 
216 aa  196  3e-49  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.283771  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0587  ribosomal protein L3  48.84 
 
 
219 aa  195  4.0000000000000005e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.295272  normal  0.46094 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0715  ribosomal protein L3  48.84 
 
 
204 aa  195  4.0000000000000005e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3995  ribosomal protein L3  50.7 
 
 
208 aa  195  4.0000000000000005e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1305  50S ribosomal protein L3  48.65 
 
 
218 aa  194  6e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.207115  normal  0.106977 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2155  50S ribosomal protein L3P  48.58 
 
 
205 aa  194  1e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00587716  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0680  50S ribosomal protein L3  46.34 
 
 
209 aa  193  1e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.620206  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0627  ribosomal protein L3  48.36 
 
 
217 aa  193  2e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1707  50S ribosomal protein L3  46.98 
 
 
213 aa  192  2e-48  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00287886  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20870  LSU ribosomal protein L3P  45.79 
 
 
219 aa  192  2e-48  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.235842  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1086  LSU ribosomal protein L3P  48.39 
 
 
217 aa  192  3e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.10406 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1836  50S ribosomal protein L3  46.63 
 
 
217 aa  192  3e-48  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00718997  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29740  LSU ribosomal protein L3P  47.42 
 
 
219 aa  192  5e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.378005 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2232  50S ribosomal protein L3  46.45 
 
 
213 aa  191  5e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.422626 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3012  50S ribosomal protein L3  45.87 
 
 
227 aa  191  7e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00913494 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0688  ribosomal protein L3  44.65 
 
 
219 aa  190  1e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.409644 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4315  50S ribosomal protein L3  49.53 
 
 
219 aa  191  1e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00341518 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1147  50S ribosomal protein L3  49.05 
 
 
205 aa  190  1e-47  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000530687  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1867  50S ribosomal protein L3  50.68 
 
 
207 aa  190  1e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0222976  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1013  50S ribosomal protein L3  47.75 
 
 
217 aa  191  1e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1040  50S ribosomal protein L3  47.75 
 
 
217 aa  191  1e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3923  50S ribosomal protein L3  50 
 
 
219 aa  191  1e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1030  50S ribosomal protein L3  47.75 
 
 
217 aa  191  1e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4321  ribosomal protein L3  46.12 
 
 
216 aa  190  2e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>