More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_2257 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_2257  50S ribosomal protein L3  100 
 
 		 209 aa  422  1e-117  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000117498  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0079  50S ribosomal protein L3  75.6 
 
 		 209 aa  320  7e-87  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.145283 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1765  50S ribosomal protein L3  71.77 
 
 		 209 aa  305  3e-82  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.0000837732  normal  0.643205 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2774  ribosomal protein L3  56.73 
 
 		 210 aa  255  3e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.039291  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2065  50S ribosomal protein L3  55.12 
 
 		 209 aa  251  6e-66  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.00000000000562685  normal  0.223373 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1555  ribosomal protein L3  54.95 
 
 		 210 aa  231  4.0000000000000004e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00791107  normal  0.982603 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1346  50S ribosomal protein L3  55.94 
 
 		 211 aa  230  1e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.700686  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0701  50S ribosomal protein L3  53.66 
 
 		 210 aa  227  9e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000481863  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0680  50S ribosomal protein L3  54.87 
 
 		 209 aa  223  1e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.620206  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1867  50S ribosomal protein L3  57.14 
 
 		 207 aa  221  6e-57  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0222976  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2857  50S ribosomal protein L3  50.98 
 
 		 210 aa  220  9.999999999999999e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.918611  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1067  50S ribosomal protein L3  52.48 
 
 		 211 aa  220  9.999999999999999e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000374639  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1185  50S ribosomal protein L3  53.69 
 
 		 210 aa  219  1.9999999999999999e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4026  50S ribosomal protein L3  53.2 
 
 		 210 aa  218  3.9999999999999997e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000729954 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3024  50S ribosomal protein L3  50.74 
 
 		 210 aa  218  3.9999999999999997e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.371217  hitchhiker  0.00790921 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4915  50S ribosomal protein L3  54.19 
 
 		 212 aa  216  2e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0274485  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2907  50S ribosomal protein L3  57.14 
 
 		 212 aa  215  4e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0626  50S ribosomal protein L3  48.04 
 
 		 210 aa  213  9.999999999999999e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000331463  hitchhiker  0.000000000000331617 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0847  50S ribosomal protein L3P  51.47 
 
 		 214 aa  212  2.9999999999999995e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000479377  decreased coverage  0.0000116579 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0306  50S ribosomal protein L3P  52.48 
 
 		 222 aa  211  7e-54  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00207169 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2399  50S ribosomal protein L3  49.51 
 
 		 209 aa  210  9e-54  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000824684  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1161  ribosomal protein L3  54.23 
 
 		 206 aa  210  1e-53  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000266904  hitchhiker  0.000000567921 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0933  50S ribosomal protein L3  50 
 
 		 211 aa  209  2e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00137042  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2714  50S ribosomal protein L3  49.51 
 
 		 209 aa  209  2e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000231855  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1184  ribosomal protein L3  50.98 
 
 		 209 aa  207  1e-52  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000270125  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03980  LSU ribosomal protein L3P  52.97 
 
 		 213 aa  206  2e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1394  50S ribosomal protein L3  53.23 
 
 		 207 aa  206  3e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000462367  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1292  50S ribosomal protein L3  53.23 
 
 		 207 aa  206  3e-52  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000263563  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3328  50S ribosomal protein L3  49.01 
 
 		 211 aa  205  4e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000332976 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2619  50S ribosomal protein L3  54.19 
 
 		 214 aa  203  1e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0132285  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_417  ribosomal protein L3  48.28 
 
 		 205 aa  203  1e-51  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000036263  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0451  50S ribosomal protein L3  48.28 
 
 		 205 aa  203  1e-51  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000154888  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0474  50S ribosomal protein L3  48.28 
 
 		 205 aa  203  2e-51  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00148542  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4321  ribosomal protein L3  50.73 
 
 		 216 aa  203  2e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1524  50S ribosomal protein L3  51.23 
 
 		 209 aa  203  2e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.593746  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2460  50S ribosomal protein L3  50.49 
 
 		 209 aa  202  3e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0891685 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01170  50S ribosomal protein L3  49.26 
 
 		 211 aa  202  4e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000794381  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20031  50S ribosomal protein L3  48.28 
 
 		 218 aa  200  9.999999999999999e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1745  50S ribosomal protein L3  51.98 
 
 		 210 aa  199  1.9999999999999998e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000981122  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1129  50S ribosomal protein L3  47.78 
 
 		 218 aa  199  1.9999999999999998e-50  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3703  50S ribosomal protein L3  49.75 
 
 		 212 aa  199  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1836  50S ribosomal protein L3  46 
 
 		 217 aa  199  3e-50  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00718997  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0790  50S ribosomal protein L3  49.26 
 
 		 213 aa  199  3e-50  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0376  50S ribosomal protein L3  47.29 
 
 		 218 aa  198  6e-50  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0867  50S ribosomal protein L3  50.49 
 
 		 210 aa  197  7e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000729631  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0286  50S ribosomal protein L3  51.24 
 
 		 209 aa  197  7.999999999999999e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0410836  hitchhiker  0.00603059 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3435  50S ribosomal protein L3  50 
 
 		 218 aa  196  2.0000000000000003e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4276  ribosomal protein L3  52.48 
 
 		 212 aa  194  8.000000000000001e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000028687  unclonable  0.00000000000491767 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3909  50S ribosomal protein L3  49.26 
 
 		 209 aa  193  1e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.031884  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1938  50S ribosomal protein L3  49.02 
 
 		 205 aa  192  2e-48  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3822  50S ribosomal protein L3  50.74 
 
 		 209 aa  193  2e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000994751  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2174  50S ribosomal protein L3  50.25 
 
 		 209 aa  192  2e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000029924  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4001  50S ribosomal protein L3  50.25 
 
 		 209 aa  192  2e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000133554  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3751  50S ribosomal protein L3  51.72 
 
 		 209 aa  193  2e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000000163503  hitchhiker  0.0040389 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3667  50S ribosomal protein L3  48.78 
 
 		 211 aa  192  2e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000330884  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0562  50S ribosomal protein L3  47.12 
 
 		 218 aa  192  3e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0691  50S ribosomal protein L3  47.52 
 
 		 211 aa  192  3e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00208666  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0962  ribosomal protein L3  54.73 
 
 		 206 aa  192  3e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000608869  hitchhiker  0.0000000000269964 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00730  50S ribosomal protein L3  50.25 
 
 		 209 aa  192  3e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4749  50S ribosomal protein L3  50.25 
 
 		 211 aa  192  4e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000212363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001742  LSU ribosomal protein L3p (L3e)  49.75 
 
 		 209 aa  192  4e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000145621  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1650  50S ribosomal protein L3  44.33 
 
 		 217 aa  192  4e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0931  ribosomal protein L3  50 
 
 		 215 aa  191  5e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.15696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0837  50S ribosomal protein L3  50.25 
 
 		 211 aa  191  5e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0361687  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08850  50S ribosomal protein L3  50.25 
 
 		 211 aa  191  5e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000230335  normal  0.0234155 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0320  50S ribosomal protein L3  49.26 
 
 		 209 aa  191  6e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0285067  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0265  50S ribosomal protein L3  43.9 
 
 		 232 aa  191  6e-48  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000658657  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2966  50S ribosomal protein L3  48.53 
 
 		 227 aa  191  6e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0816974  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1086  LSU ribosomal protein L3P  48.56 
 
 		 217 aa  191  7e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.10406 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4507  50S ribosomal protein L3  51.49 
 
 		 221 aa  191  8e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.787031  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0953  50S ribosomal protein L3  49.75 
 
 		 205 aa  191  8e-48  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000000660439  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10020  LSU ribosomal protein L3P  49.75 
 
 		 206 aa  191  9e-48  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.000000402835  hitchhiker  0.00000000318342 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17651  50S ribosomal protein L3  44.33 
 
 		 217 aa  191  9e-48  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.884364  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17401  50S ribosomal protein L3  43.35 
 
 		 217 aa  191  9e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1249  50S ribosomal protein L3  47.55 
 
 		 251 aa  190  1e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0323  ribosomal protein L3  50.25 
 
 		 209 aa  190  1e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000222247  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3636  50S ribosomal protein L3  51.23 
 
 		 209 aa  189  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000145749  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0626  ribosomal protein L3  48.28 
 
 		 211 aa  189  2e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00000165351  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3758  50S ribosomal protein L3  50 
 
 		 219 aa  189  2e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.33789  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3807  50S ribosomal protein L3  51.23 
 
 		 209 aa  189  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000142393  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3636  50S ribosomal protein L3  51.23 
 
 		 209 aa  189  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000330914  normal  0.241535 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0960  50S ribosomal protein L3  49.26 
 
 		 214 aa  189  2e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000067151  hitchhiker  0.000000166028 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17491  50S ribosomal protein L3  43.35 
 
 		 217 aa  189  2e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0421  50S ribosomal protein L3P  50.24 
 
 		 212 aa  189  2e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00399818  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00445  50S ribosomal protein L3  47.8 
 
 		 212 aa  190  2e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.000559916  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0469  50S ribosomal protein L3  48.78 
 
 		 212 aa  189  2e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000509154  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16781  50S ribosomal protein L3  45.32 
 
 		 219 aa  190  2e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3744  50S ribosomal protein L3  51.23 
 
 		 209 aa  189  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00311101  normal  0.0177476 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3524  ribosomal protein L3  49.27 
 
 		 212 aa  189  2e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.0000015584  hitchhiker  0.00000758128 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1305  50S ribosomal protein L3  48.57 
 
 		 218 aa  189  2e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.207115  normal  0.106977 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3709  50S ribosomal protein L3  51.23 
 
 		 209 aa  189  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000323926  normal  0.640658 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03171  50S ribosomal protein L3  50.74 
 
 		 209 aa  189  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00105587  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0454  50S ribosomal protein L3  49.26 
 
 		 211 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00952841  unclonable  0.000000209689 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2559  50S ribosomal protein L3  48.02 
 
 		 211 aa  189  2.9999999999999997e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.101168  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4544  50S ribosomal protein L3  50.25 
 
 		 209 aa  189  2.9999999999999997e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000354089  hitchhiker  0.00195748 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3803  50S ribosomal protein L3  50.74 
 
 		 209 aa  189  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000338592  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0405  ribosomal protein L3  49.75 
 
 		 209 aa  189  2.9999999999999997e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00399178  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3615  50S ribosomal protein L3  50.74 
 
 		 209 aa  189  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000666979  hitchhiker  0.00609107 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4643  50S ribosomal protein L3  50.74 
 
 		 209 aa  189  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000124545  normal  0.0362623 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0289  50S ribosomal protein L3  50.75 
 
 		 209 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>