More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_2907 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_2907  50S ribosomal protein L3  100 
 
 		 212 aa  424  1e-118  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2619  50S ribosomal protein L3  79.52 
 
 		 214 aa  345  3e-94  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0132285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1867  50S ribosomal protein L3  74.26 
 
 		 207 aa  310  1e-83  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0222976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0306  50S ribosomal protein L3P  59.72 
 
 		 222 aa  239  2.9999999999999997e-62  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00207169 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0079  50S ribosomal protein L3  60.1 
 
 		 209 aa  232  3e-60  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.145283 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4321  ribosomal protein L3  58.29 
 
 		 216 aa  231  5e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3024  50S ribosomal protein L3  56.73 
 
 		 210 aa  231  7.000000000000001e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.371217  hitchhiker  0.00790921 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0790  50S ribosomal protein L3  56.52 
 
 		 213 aa  228  4e-59  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1394  50S ribosomal protein L3  56.4 
 
 		 207 aa  226  2e-58  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000462367  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3758  50S ribosomal protein L3  57.35 
 
 		 219 aa  226  2e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.33789  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1292  50S ribosomal protein L3  56.4 
 
 		 207 aa  226  2e-58  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000263563  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1184  ribosomal protein L3  57.56 
 
 		 209 aa  225  5.0000000000000005e-58  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000270125  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0701  50S ribosomal protein L3  55.83 
 
 		 210 aa  224  8e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000481863  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03980  LSU ribosomal protein L3P  57.69 
 
 		 213 aa  224  1e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2711  50S ribosomal protein L3  57.75 
 
 		 211 aa  223  1e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000399657  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0931  ribosomal protein L3  57.82 
 
 		 215 aa  223  2e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.15696  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23810  LSU ribosomal protein L3P  54.93 
 
 		 226 aa  223  2e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01170  50S ribosomal protein L3  53.88 
 
 		 211 aa  221  4.9999999999999996e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000794381  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3905  50S ribosomal protein L3  55.61 
 
 		 223 aa  221  6e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1745  50S ribosomal protein L3  54.81 
 
 		 210 aa  220  1.9999999999999999e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000981122  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5049  50S ribosomal protein L3  55.45 
 
 		 218 aa  219  3e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.399218 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0562  50S ribosomal protein L3  54.98 
 
 		 218 aa  219  3e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3923  50S ribosomal protein L3  57.14 
 
 		 219 aa  219  3e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1305  50S ribosomal protein L3  55.45 
 
 		 218 aa  218  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.207115  normal  0.106977 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1086  LSU ribosomal protein L3P  55.3 
 
 		 217 aa  218  7e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.10406 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1138  50S ribosomal protein L3  51.69 
 
 		 207 aa  218  7e-56  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000858376  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1765  50S ribosomal protein L3  57.14 
 
 		 209 aa  218  7e-56  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.0000837732  normal  0.643205 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4915  50S ribosomal protein L3  56.13 
 
 		 212 aa  216  1e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0274485  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17160  50S ribosomal protein L3  54.33 
 
 		 216 aa  216  2e-55  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.283771  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0953  50S ribosomal protein L3  54.59 
 
 		 205 aa  216  2e-55  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000000660439  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20870  LSU ribosomal protein L3P  55.29 
 
 		 219 aa  216  2.9999999999999998e-55  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.235842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2257  50S ribosomal protein L3  57.14 
 
 		 209 aa  215  4e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000117498  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1938  50S ribosomal protein L3  53.66 
 
 		 205 aa  215  5e-55  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1161  ribosomal protein L3  57.21 
 
 		 206 aa  215  5e-55  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000266904  hitchhiker  0.000000567921 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1524  50S ribosomal protein L3  55.45 
 
 		 209 aa  214  5e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.593746  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10715  50S ribosomal protein L3  55.24 
 
 		 217 aa  214  5e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.249834 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1067  50S ribosomal protein L3  50.72 
 
 		 211 aa  214  5.9999999999999996e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000374639  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4315  50S ribosomal protein L3  56.16 
 
 		 219 aa  214  7e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00341518 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10020  LSU ribosomal protein L3P  55.39 
 
 		 206 aa  214  7e-55  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.000000402835  hitchhiker  0.00000000318342 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3435  50S ribosomal protein L3  53.77 
 
 		 218 aa  213  1.9999999999999998e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2333  50S ribosomal protein L3  52.17 
 
 		 212 aa  213  1.9999999999999998e-54  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000241734  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1185  50S ribosomal protein L3  57.01 
 
 		 220 aa  213  1.9999999999999998e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.108943 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0225  ribosomal protein L3  55.56 
 
 		 213 aa  213  2.9999999999999995e-54  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0847  50S ribosomal protein L3P  51.94 
 
 		 214 aa  212  2.9999999999999995e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000479377  decreased coverage  0.0000116579 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6049  50S ribosomal protein L3  55.39 
 
 		 236 aa  212  3.9999999999999995e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.185718  normal  0.220559 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1040  50S ribosomal protein L3  53.55 
 
 		 217 aa  211  4.9999999999999996e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1013  50S ribosomal protein L3  53.55 
 
 		 217 aa  211  4.9999999999999996e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0286  50S ribosomal protein L3  55.94 
 
 		 209 aa  211  4.9999999999999996e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0410836  hitchhiker  0.00603059 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1030  50S ribosomal protein L3  53.55 
 
 		 217 aa  211  4.9999999999999996e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0405  ribosomal protein L3  55.29 
 
 		 209 aa  211  5.999999999999999e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00399178  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2687  50S ribosomal protein L3  53.85 
 
 		 216 aa  211  7e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.740328 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2975  50S ribosomal protein L3  53.85 
 
 		 216 aa  211  7e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.454423  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4026  50S ribosomal protein L3  54.33 
 
 		 210 aa  211  9e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000729954 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3667  50S ribosomal protein L3  55.02 
 
 		 211 aa  210  1e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000330884  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0582  50S ribosomal protein L3  54.59 
 
 		 235 aa  209  3e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2714  50S ribosomal protein L3  51.69 
 
 		 209 aa  208  4e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000231855  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0215  50S ribosomal protein L3  54.81 
 
 		 209 aa  208  5e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000370606  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0323  ribosomal protein L3  54.33 
 
 		 209 aa  208  5e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000222247  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6614  ribosomal protein L3  54.33 
 
 		 216 aa  207  6e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1185  50S ribosomal protein L3  53.37 
 
 		 210 aa  208  6e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0587  ribosomal protein L3  55.29 
 
 		 219 aa  207  8e-53  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.295272  normal  0.46094 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2065  50S ribosomal protein L3  51.23 
 
 		 209 aa  207  9e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.00000000000562685  normal  0.223373 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2399  50S ribosomal protein L3  50.72 
 
 		 209 aa  207  9e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000824684  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2774  ribosomal protein L3  52.74 
 
 		 210 aa  207  1e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.039291  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5195  50S ribosomal protein L3  55.07 
 
 		 210 aa  206  1e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000842867  unclonable  2.19314e-25 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0105  50S ribosomal protein L3  55.07 
 
 		 210 aa  206  1e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000775669  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0602  ribosomal protein L3  53.69 
 
 		 205 aa  207  1e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1123  ribosomal protein L3  53.02 
 
 		 220 aa  206  2e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4001  50S ribosomal protein L3  54.33 
 
 		 209 aa  206  2e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000133554  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3822  50S ribosomal protein L3  54.33 
 
 		 209 aa  206  2e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000994751  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00445  50S ribosomal protein L3  53.37 
 
 		 212 aa  206  2e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.000559916  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3143  ribosomal protein L3  55.45 
 
 		 220 aa  206  3e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0896196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0184  50S ribosomal protein L3  56.65 
 
 		 212 aa  205  3e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000726152  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05715  50S ribosomal protein L3  52.68 
 
 		 205 aa  205  4e-52  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.499117  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5787  50S ribosomal protein L3  53.4 
 
 		 220 aa  204  6e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0786499 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2857  50S ribosomal protein L3  48.31 
 
 		 210 aa  204  7e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.918611  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4507  50S ribosomal protein L3  53.85 
 
 		 221 aa  204  7e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.787031  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1346  50S ribosomal protein L3  51.44 
 
 		 211 aa  204  7e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.700686  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2174  50S ribosomal protein L3  54.81 
 
 		 209 aa  204  7e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000029924  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0104  50S ribosomal protein L3  53.62 
 
 		 210 aa  204  7e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000119433  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3524  ribosomal protein L3  54.33 
 
 		 212 aa  204  7e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.0000015584  hitchhiker  0.00000758128 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0960  50S ribosomal protein L3  54.59 
 
 		 214 aa  204  9e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000067151  hitchhiker  0.000000166028 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0708  50S ribosomal protein L3  52.2 
 
 		 208 aa  204  9e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00455924  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0110  50S ribosomal protein L3  54.11 
 
 		 210 aa  204  1e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000528056  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0131  50S ribosomal protein L3  54.11 
 
 		 210 aa  204  1e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000141135  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0110  50S ribosomal protein L3  54.11 
 
 		 210 aa  204  1e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000986131  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0106  50S ribosomal protein L3  54.11 
 
 		 210 aa  204  1e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.6707699999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0104  50S ribosomal protein L3  54.11 
 
 		 210 aa  204  1e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000168091  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2324  ribosomal protein L3  55.77 
 
 		 214 aa  203  1e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00000658885  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001742  LSU ribosomal protein L3p (L3e)  54.33 
 
 		 209 aa  203  1e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000145621  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5124  50S ribosomal protein L3  53.85 
 
 		 216 aa  203  1e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0110  50S ribosomal protein L3  54.11 
 
 		 210 aa  204  1e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000246604  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00730  50S ribosomal protein L3  54.33 
 
 		 209 aa  203  1e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0141  50S ribosomal protein L3  54.11 
 
 		 210 aa  204  1e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000551418  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0122  50S ribosomal protein L3  54.11 
 
 		 210 aa  204  1e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.0599700000000001e-61 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0393  ribosomal protein L3  53.85 
 
 		 209 aa  203  2e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000156822  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3705  50S ribosomal protein L3  53.85 
 
 		 209 aa  203  2e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000030519  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3803  50S ribosomal protein L3  53.85 
 
 		 209 aa  203  2e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000338592  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0393  50S ribosomal protein L3  53.85 
 
 		 209 aa  203  2e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000309233  hitchhiker  0.00746366 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3751  50S ribosomal protein L3  54.33 
 
 		 209 aa  203  2e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000000163503  hitchhiker  0.0040389 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>