More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0708 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_0708  50S ribosomal protein L3  100 
 
 		 208 aa  423  1e-118  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00455924  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3024  50S ribosomal protein L3  54.85 
 
 		 210 aa  239  2e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.371217  hitchhiker  0.00790921 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0626  50S ribosomal protein L3  51.47 
 
 		 210 aa  231  6e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000331463  hitchhiker  0.000000000000331617 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0701  50S ribosomal protein L3  53.88 
 
 		 210 aa  230  1e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000481863  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2857  50S ribosomal protein L3  49.51 
 
 		 210 aa  227  1e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.918611  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1292  50S ribosomal protein L3  56.86 
 
 		 207 aa  227  1e-58  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000263563  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1394  50S ribosomal protein L3  56.86 
 
 		 207 aa  227  1e-58  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000462367  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1067  50S ribosomal protein L3  51.47 
 
 		 211 aa  224  6e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000374639  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4915  50S ribosomal protein L3  52.43 
 
 		 212 aa  224  8e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0274485  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0286  50S ribosomal protein L3  54.19 
 
 		 209 aa  224  9e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0410836  hitchhiker  0.00603059 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4321  ribosomal protein L3  55.17 
 
 		 216 aa  224  9e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1745  50S ribosomal protein L3  50.98 
 
 		 210 aa  222  4e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000981122  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1524  50S ribosomal protein L3  52.94 
 
 		 209 aa  220  9e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.593746  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1555  ribosomal protein L3  48.31 
 
 		 210 aa  218  3.9999999999999997e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00791107  normal  0.982603 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0306  50S ribosomal protein L3P  50.25 
 
 		 222 aa  218  5e-56  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00207169 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0225  ribosomal protein L3  51.47 
 
 		 213 aa  217  1e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0790  50S ribosomal protein L3  52.94 
 
 		 213 aa  217  1e-55  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1184  ribosomal protein L3  50.97 
 
 		 209 aa  216  2e-55  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000270125  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0079  50S ribosomal protein L3  51.72 
 
 		 209 aa  215  2.9999999999999998e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.145283 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0933  50S ribosomal protein L3  50.98 
 
 		 211 aa  215  4e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00137042  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1765  50S ribosomal protein L3  50.74 
 
 		 209 aa  214  8e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.0000837732  normal  0.643205 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4026  50S ribosomal protein L3  49.03 
 
 		 210 aa  213  9.999999999999999e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000729954 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3328  50S ribosomal protein L3  50.49 
 
 		 211 aa  213  1.9999999999999998e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000332976 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0215  50S ribosomal protein L3  50.98 
 
 		 209 aa  213  1.9999999999999998e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000370606  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1185  50S ribosomal protein L3  48.54 
 
 		 210 aa  212  2.9999999999999995e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2460  50S ribosomal protein L3  51.47 
 
 		 209 aa  211  3.9999999999999995e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0891685 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0562  50S ribosomal protein L3  51.72 
 
 		 218 aa  211  4.9999999999999996e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10020  LSU ribosomal protein L3P  50.49 
 
 		 206 aa  211  4.9999999999999996e-54  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.000000402835  hitchhiker  0.00000000318342 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0867  50S ribosomal protein L3  50 
 
 		 210 aa  211  5.999999999999999e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000729631  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03980  LSU ribosomal protein L3P  51.47 
 
 		 213 aa  209  3e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1938  50S ribosomal protein L3  50.98 
 
 		 205 aa  208  6e-53  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0422  50S ribosomal protein L3  49.51 
 
 		 209 aa  207  1e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000195061  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0953  50S ribosomal protein L3  52.5 
 
 		 205 aa  207  1e-52  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000000660439  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0715  ribosomal protein L3  52.43 
 
 		 204 aa  206  2e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1836  50S ribosomal protein L3  48.5 
 
 		 217 aa  205  4e-52  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00718997  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1086  LSU ribosomal protein L3P  50.74 
 
 		 217 aa  205  5e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.10406 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01170  50S ribosomal protein L3  49.27 
 
 		 211 aa  204  8e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000794381  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2907  50S ribosomal protein L3  52.2 
 
 		 212 aa  204  9e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17160  50S ribosomal protein L3  48.04 
 
 		 216 aa  203  1e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.283771  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5124  50S ribosomal protein L3  50.25 
 
 		 216 aa  203  1e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1346  50S ribosomal protein L3  47.55 
 
 		 211 aa  203  1e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.700686  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2774  ribosomal protein L3  47.32 
 
 		 210 aa  202  2e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.039291  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1161  ribosomal protein L3  49.51 
 
 		 206 aa  202  2e-51  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000266904  hitchhiker  0.000000567921 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0104  50S ribosomal protein L3  50.49 
 
 		 210 aa  202  2e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000119433  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0680  50S ribosomal protein L3  50.78 
 
 		 209 aa  203  2e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.620206  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2065  50S ribosomal protein L3  47.52 
 
 		 209 aa  202  3e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.00000000000562685  normal  0.223373 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3435  50S ribosomal protein L3  48.77 
 
 		 218 aa  202  3e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2646  50S ribosomal protein L3  50.25 
 
 		 216 aa  201  4e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.334348  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2333  50S ribosomal protein L3  49.5 
 
 		 212 aa  202  4e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000241734  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20031  50S ribosomal protein L3  47.06 
 
 		 218 aa  201  6e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1129  50S ribosomal protein L3  46.57 
 
 		 218 aa  201  9e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0691  50S ribosomal protein L3  47.78 
 
 		 211 aa  201  9e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00208666  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0105  50S ribosomal protein L3  49.51 
 
 		 210 aa  200  9.999999999999999e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000775669  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6614  ribosomal protein L3  50 
 
 		 216 aa  200  9.999999999999999e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5195  50S ribosomal protein L3  49.51 
 
 		 210 aa  200  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000842867  unclonable  2.19314e-25 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1955  50S ribosomal protein L3  47.55 
 
 		 218 aa  200  1.9999999999999998e-50  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0376  50S ribosomal protein L3  48.53 
 
 		 218 aa  199  1.9999999999999998e-50  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2714  50S ribosomal protein L3  47.06 
 
 		 209 aa  199  1.9999999999999998e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000231855  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0111  50S ribosomal protein L3  48.53 
 
 		 211 aa  199  1.9999999999999998e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000151121  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3758  50S ribosomal protein L3  47.55 
 
 		 219 aa  199  3e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.33789  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2903  50S ribosomal protein L3  48.78 
 
 		 212 aa  198  3.9999999999999996e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000477342  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3162  50S ribosomal protein L3  53.17 
 
 		 206 aa  199  3.9999999999999996e-50  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.596382 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2399  50S ribosomal protein L3  46.57 
 
 		 209 aa  199  3.9999999999999996e-50  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000824684  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0107  50S ribosomal protein L3  49.25 
 
 		 213 aa  198  5e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2711  50S ribosomal protein L3  48.77 
 
 		 211 aa  198  5e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000399657  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0289  50S ribosomal protein L3  49.75 
 
 		 209 aa  197  6e-50  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4507  50S ribosomal protein L3  50.25 
 
 		 221 aa  198  6e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.787031  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0397  50S ribosomal protein L3  49.51 
 
 		 205 aa  198  6e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23810  LSU ribosomal protein L3P  48.51 
 
 		 226 aa  197  7e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0110  50S ribosomal protein L3  48.53 
 
 		 210 aa  197  7.999999999999999e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000528056  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0110  50S ribosomal protein L3  48.53 
 
 		 210 aa  197  7.999999999999999e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000986131  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0106  50S ribosomal protein L3  48.53 
 
 		 210 aa  197  7.999999999999999e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.6707699999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0104  50S ribosomal protein L3  48.53 
 
 		 210 aa  197  7.999999999999999e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000168091  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0122  50S ribosomal protein L3  48.53 
 
 		 210 aa  197  7.999999999999999e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.0599700000000001e-61 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0141  50S ribosomal protein L3  48.53 
 
 		 210 aa  197  7.999999999999999e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000551418  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0131  50S ribosomal protein L3  48.53 
 
 		 210 aa  197  7.999999999999999e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000141135  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0110  50S ribosomal protein L3  48.53 
 
 		 210 aa  197  7.999999999999999e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000246604  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1147  50S ribosomal protein L3  48.29 
 
 		 205 aa  197  7.999999999999999e-50  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000530687  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3667  50S ribosomal protein L3  43.41 
 
 		 211 aa  197  9e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000330884  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3012  50S ribosomal protein L3  47.3 
 
 		 227 aa  197  9e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00913494 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0279  50S ribosomal protein L3  48.31 
 
 		 214 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000003338  unclonable  0.000000102958 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0931  ribosomal protein L3  48.77 
 
 		 215 aa  197  1.0000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.15696  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1305  50S ribosomal protein L3  48.54 
 
 		 218 aa  196  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.207115  normal  0.106977 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2318  50S ribosomal protein L3  48.58 
 
 		 220 aa  196  2.0000000000000003e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000223614  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05715  50S ribosomal protein L3  49.03 
 
 		 205 aa  196  2.0000000000000003e-49  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.499117  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1650  50S ribosomal protein L3  45.89 
 
 		 217 aa  196  2.0000000000000003e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2687  50S ribosomal protein L3  47.55 
 
 		 216 aa  196  2.0000000000000003e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.740328 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0587  ribosomal protein L3  47.06 
 
 		 219 aa  196  3e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.295272  normal  0.46094 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2232  50S ribosomal protein L3  46.31 
 
 		 213 aa  195  4.0000000000000005e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.422626 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16781  50S ribosomal protein L3  46.57 
 
 		 219 aa  194  5.000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2229  50S ribosomal protein L3  49.02 
 
 		 209 aa  194  5.000000000000001e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000790762  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10715  50S ribosomal protein L3  49.03 
 
 		 217 aa  195  5.000000000000001e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.249834 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1615  ribosomal protein L3  50.24 
 
 		 205 aa  194  6e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1851  50S ribosomal protein L3  49.25 
 
 		 209 aa  194  7e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.132189  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0627  ribosomal protein L3  48.76 
 
 		 217 aa  194  8.000000000000001e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1831  50S ribosomal protein L3  46.45 
 
 		 220 aa  194  9e-49  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000207996  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0962  ribosomal protein L3  50.49 
 
 		 206 aa  194  9e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000608869  hitchhiker  0.0000000000269964 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1040  50S ribosomal protein L3  48.54 
 
 		 217 aa  193  1e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1013  50S ribosomal protein L3  48.54 
 
 		 217 aa  193  1e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1030  50S ribosomal protein L3  48.54 
 
 		 217 aa  193  1e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.676061 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>