More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_2711 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013205  Aaci_2711  50S ribosomal protein L3  100 
 
 
211 aa  426  1e-118  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000399657  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0111  50S ribosomal protein L3  71.29 
 
 
211 aa  317  1e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000151121  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0107  50S ribosomal protein L3  70.71 
 
 
213 aa  301  6.000000000000001e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0104  50S ribosomal protein L3  64.39 
 
 
210 aa  282  3.0000000000000004e-75  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000119433  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0131  50S ribosomal protein L3  63.41 
 
 
210 aa  279  2e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000141135  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0110  50S ribosomal protein L3  63.41 
 
 
210 aa  279  2e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000528056  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0110  50S ribosomal protein L3  63.41 
 
 
210 aa  279  2e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000986131  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0106  50S ribosomal protein L3  63.41 
 
 
210 aa  279  2e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.6707699999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0104  50S ribosomal protein L3  63.41 
 
 
210 aa  279  2e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000168091  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0141  50S ribosomal protein L3  63.41 
 
 
210 aa  279  2e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000551418  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0110  50S ribosomal protein L3  63.41 
 
 
210 aa  279  2e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000246604  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0122  50S ribosomal protein L3  63.41 
 
 
210 aa  279  2e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.0599700000000001e-61 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0105  50S ribosomal protein L3  62.93 
 
 
210 aa  277  7e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000775669  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5195  50S ribosomal protein L3  62.93 
 
 
210 aa  277  7e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000842867  unclonable  2.19314e-25 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1907  50S ribosomal protein L3  64.88 
 
 
208 aa  274  6e-73  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000032853  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1745  50S ribosomal protein L3  63.59 
 
 
210 aa  272  2.0000000000000002e-72  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000981122  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0058  50S ribosomal protein L3  64.39 
 
 
208 aa  271  5.000000000000001e-72  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00491271  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0867  50S ribosomal protein L3  63.77 
 
 
210 aa  271  8.000000000000001e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000729631  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0286  50S ribosomal protein L3  60.98 
 
 
209 aa  263  1e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0410836  hitchhiker  0.00603059 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0422  50S ribosomal protein L3  60.98 
 
 
209 aa  262  3e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000195061  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1831  50S ribosomal protein L3  60.09 
 
 
220 aa  259  2e-68  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000207996  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0225  ribosomal protein L3  60 
 
 
213 aa  258  5.0000000000000005e-68  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1524  50S ribosomal protein L3  61.65 
 
 
209 aa  258  7e-68  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.593746  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0215  50S ribosomal protein L3  60.49 
 
 
209 aa  257  1e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000370606  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2460  50S ribosomal protein L3  60.49 
 
 
209 aa  256  2e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0891685 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2333  50S ribosomal protein L3  59.71 
 
 
212 aa  256  3e-67  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000241734  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0696  50S ribosomal protein L3  57.55 
 
 
223 aa  252  3e-66  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.372092  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01170  50S ribosomal protein L3  56.73 
 
 
211 aa  251  7e-66  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000794381  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1483  50S ribosomal protein L3  58.57 
 
 
219 aa  251  8.000000000000001e-66  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000163613  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2318  50S ribosomal protein L3  60.09 
 
 
220 aa  249  3e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000223614  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2277  50S ribosomal protein L3  59.17 
 
 
220 aa  244  4.9999999999999997e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000105261  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0196  50S ribosomal protein L3  56.46 
 
 
228 aa  241  5e-63  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0113604  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2714  50S ribosomal protein L3  56.31 
 
 
209 aa  239  2e-62  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000231855  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2399  50S ribosomal protein L3  55.83 
 
 
209 aa  239  2e-62  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000824684  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0291  50S ribosomal protein L3  58.05 
 
 
209 aa  239  2e-62  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000100637  unclonable  1.4129e-28 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3667  50S ribosomal protein L3  54.37 
 
 
211 aa  238  4e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000330884  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0194  50S ribosomal protein L3  55.12 
 
 
210 aa  238  5.999999999999999e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000719285  normal  0.0489845 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl123  50S ribosomal protein L3  57.97 
 
 
238 aa  236  1e-61  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  9.499549999999999e-37  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0595  50S ribosomal protein L3P  59.51 
 
 
247 aa  236  2e-61  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.000000158145  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0981  ribosomal protein L3  55.34 
 
 
215 aa  230  1e-59  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.843676  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0306  50S ribosomal protein L3P  54.93 
 
 
222 aa  228  5e-59  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00207169 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0701  50S ribosomal protein L3  55.07 
 
 
210 aa  227  1e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000481863  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2903  50S ribosomal protein L3  55.56 
 
 
212 aa  224  5.0000000000000005e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000477342  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4915  50S ribosomal protein L3  54.72 
 
 
212 aa  223  1e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0274485  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1067  50S ribosomal protein L3  51.46 
 
 
211 aa  224  1e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000374639  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2907  50S ribosomal protein L3  57.75 
 
 
212 aa  223  1e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf444  50S ribosomal protein L3  51.63 
 
 
272 aa  223  1e-57  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1346  50S ribosomal protein L3  52.43 
 
 
211 aa  221  4.9999999999999996e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.700686  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0790  50S ribosomal protein L3  52.66 
 
 
213 aa  221  8e-57  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0931  ribosomal protein L3  53.55 
 
 
215 aa  220  9.999999999999999e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.15696  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0626  50S ribosomal protein L3  50.97 
 
 
210 aa  218  3.9999999999999997e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000331463  hitchhiker  0.000000000000331617 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0758  50S ribosomal protein L3  49.76 
 
 
212 aa  218  3.9999999999999997e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000233446  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1836  50S ribosomal protein L3  51.98 
 
 
217 aa  218  3.9999999999999997e-56  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00718997  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1138  50S ribosomal protein L3  51.92 
 
 
207 aa  218  6e-56  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000858376  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1394  50S ribosomal protein L3  54.03 
 
 
207 aa  216  2e-55  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000462367  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1292  50S ribosomal protein L3  54.03 
 
 
207 aa  216  2e-55  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000263563  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3758  50S ribosomal protein L3  54.5 
 
 
219 aa  216  2e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.33789  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0562  50S ribosomal protein L3  54.98 
 
 
218 aa  216  2e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1292  50S ribosomal protein L3  51.72 
 
 
212 aa  215  2.9999999999999998e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.0000167398  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3024  50S ribosomal protein L3  51.44 
 
 
210 aa  214  5e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.371217  hitchhiker  0.00790921 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03980  LSU ribosomal protein L3P  53.85 
 
 
213 aa  214  9e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2857  50S ribosomal protein L3  51.46 
 
 
210 aa  213  9.999999999999999e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.918611  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4321  ribosomal protein L3  51.66 
 
 
216 aa  213  9.999999999999999e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0933  50S ribosomal protein L3  51.46 
 
 
211 aa  213  1.9999999999999998e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00137042  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3328  50S ribosomal protein L3  51.46 
 
 
211 aa  211  5.999999999999999e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000332976 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3435  50S ribosomal protein L3  52.83 
 
 
218 aa  210  1e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1184  ribosomal protein L3  53.92 
 
 
209 aa  209  2e-53  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000270125  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3905  50S ribosomal protein L3  53.11 
 
 
223 aa  208  5e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2774  ribosomal protein L3  50.75 
 
 
210 aa  208  6e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.039291  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0953  50S ribosomal protein L3  52.2 
 
 
205 aa  207  9e-53  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000000660439  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2065  50S ribosomal protein L3  51.74 
 
 
209 aa  206  1e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.00000000000562685  normal  0.223373 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0691  50S ribosomal protein L3  49.52 
 
 
211 aa  206  2e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00208666  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4026  50S ribosomal protein L3  51.44 
 
 
210 aa  204  5e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000729954 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2619  50S ribosomal protein L3  53.52 
 
 
214 aa  205  5e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0132285  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1147  50S ribosomal protein L3  51.22 
 
 
205 aa  204  6e-52  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000530687  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5049  50S ribosomal protein L3  52.09 
 
 
218 aa  204  6e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.399218 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1161  ribosomal protein L3  51.49 
 
 
206 aa  204  6e-52  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000266904  hitchhiker  0.000000567921 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1185  50S ribosomal protein L3  50.48 
 
 
210 aa  204  7e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3012  50S ribosomal protein L3  49.54 
 
 
227 aa  204  8e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00913494 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1086  LSU ribosomal protein L3P  52.11 
 
 
217 aa  204  8e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.10406 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23810  LSU ribosomal protein L3P  49.77 
 
 
226 aa  204  1e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1305  50S ribosomal protein L3  52.34 
 
 
218 aa  203  1e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.207115  normal  0.106977 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0680  50S ribosomal protein L3  50.25 
 
 
209 aa  203  2e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.620206  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2324  ribosomal protein L3  54.81 
 
 
214 aa  202  3e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00000658885  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2174  50S ribosomal protein L3  52.88 
 
 
209 aa  202  4e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000029924  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0962  ribosomal protein L3  52.68 
 
 
206 aa  201  5e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000608869  hitchhiker  0.0000000000269964 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4690  50S ribosomal protein L3  53.85 
 
 
212 aa  201  6e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000266431  unclonable  0.0000000247869 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6614  ribosomal protein L3  50.48 
 
 
216 aa  201  7e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10715  50S ribosomal protein L3  52.8 
 
 
217 aa  201  7e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.249834 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1867  50S ribosomal protein L3  52.66 
 
 
207 aa  200  9.999999999999999e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0222976  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1185  50S ribosomal protein L3  51.42 
 
 
220 aa  200  9.999999999999999e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.108943 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3923  50S ribosomal protein L3  51.71 
 
 
219 aa  199  1.9999999999999998e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4507  50S ribosomal protein L3  50.96 
 
 
221 aa  199  1.9999999999999998e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.787031  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0249  50S ribosomal protein L3  50 
 
 
212 aa  199  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.587373  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0489  50S ribosomal protein L3  48.56 
 
 
206 aa  200  1.9999999999999998e-50  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.525282  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4315  50S ribosomal protein L3  51.22 
 
 
219 aa  199  1.9999999999999998e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00341518 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0252  50S ribosomal protein L3  50 
 
 
212 aa  199  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3995  ribosomal protein L3  50.24 
 
 
208 aa  199  3e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001742  LSU ribosomal protein L3p (L3e)  51.92 
 
 
209 aa  199  3e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000145621  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2646  50S ribosomal protein L3  51.44 
 
 
216 aa  198  3.9999999999999996e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.334348  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>