More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2619 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_2619  50S ribosomal protein L3  100 
 
 		 214 aa  427  1e-119  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0132285  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2907  50S ribosomal protein L3  79.52 
 
 		 212 aa  345  3e-94  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1867  50S ribosomal protein L3  70.3 
 
 		 207 aa  290  1e-77  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0222976  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0079  50S ribosomal protein L3  58.13 
 
 		 209 aa  230  1e-59  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.145283 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0790  50S ribosomal protein L3  56.52 
 
 		 213 aa  229  3e-59  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1394  50S ribosomal protein L3  55.98 
 
 		 207 aa  224  6e-58  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000462367  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1292  50S ribosomal protein L3  55.98 
 
 		 207 aa  224  6e-58  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000263563  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03980  LSU ribosomal protein L3P  57.21 
 
 		 213 aa  223  2e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0701  50S ribosomal protein L3  56.46 
 
 		 210 aa  220  9.999999999999999e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000481863  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1138  50S ribosomal protein L3  53.14 
 
 		 207 aa  220  9.999999999999999e-57  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000858376  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1765  50S ribosomal protein L3  55.67 
 
 		 209 aa  218  3.9999999999999997e-56  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.0000837732  normal  0.643205 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0953  50S ribosomal protein L3  55.56 
 
 		 205 aa  216  2e-55  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000000660439  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0306  50S ribosomal protein L3P  53.85 
 
 		 222 aa  212  2.9999999999999995e-54  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00207169 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01170  50S ribosomal protein L3  53.88 
 
 		 211 aa  211  5.999999999999999e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000794381  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2333  50S ribosomal protein L3  52.17 
 
 		 212 aa  210  1e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000241734  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0931  ribosomal protein L3  52.88 
 
 		 215 aa  210  1e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.15696  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0847  50S ribosomal protein L3P  51.46 
 
 		 214 aa  210  1e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000479377  decreased coverage  0.0000116579 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1184  ribosomal protein L3  53.88 
 
 		 209 aa  209  3e-53  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000270125  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4321  ribosomal protein L3  53.62 
 
 		 216 aa  207  7e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10020  LSU ribosomal protein L3P  54.41 
 
 		 206 aa  206  2e-52  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.000000402835  hitchhiker  0.00000000318342 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1745  50S ribosomal protein L3  53.62 
 
 		 210 aa  206  3e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000981122  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2711  50S ribosomal protein L3  53.52 
 
 		 211 aa  205  5e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000399657  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0562  50S ribosomal protein L3  50.68 
 
 		 218 aa  204  1e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2257  50S ribosomal protein L3  54.19 
 
 		 209 aa  203  1e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000117498  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23810  LSU ribosomal protein L3P  50.93 
 
 		 226 aa  203  2e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3024  50S ribosomal protein L3  50.96 
 
 		 210 aa  203  2e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.371217  hitchhiker  0.00790921 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1086  LSU ribosomal protein L3P  51.17 
 
 		 217 aa  202  3e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.10406 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1067  50S ribosomal protein L3  50.72 
 
 		 211 aa  202  3e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000374639  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3758  50S ribosomal protein L3  51.21 
 
 		 219 aa  202  3e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.33789  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5049  50S ribosomal protein L3  52.13 
 
 		 218 aa  201  5e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.399218 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4915  50S ribosomal protein L3  53.59 
 
 		 212 aa  201  7e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0274485  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1524  50S ribosomal protein L3  53.37 
 
 		 209 aa  199  1.9999999999999998e-50  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.593746  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0405  ribosomal protein L3  53.74 
 
 		 209 aa  199  3e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00399178  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0582  50S ribosomal protein L3  51.44 
 
 		 235 aa  199  3e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2857  50S ribosomal protein L3  49.76 
 
 		 210 aa  199  3.9999999999999996e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.918611  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0291  50S ribosomal protein L3  50.73 
 
 		 226 aa  198  6e-50  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0279726  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1305  50S ribosomal protein L3  51.66 
 
 		 218 aa  198  6e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.207115  normal  0.106977 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3923  50S ribosomal protein L3  51.72 
 
 		 219 aa  198  6e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0981  ribosomal protein L3  51.21 
 
 		 215 aa  197  7.999999999999999e-50  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.843676  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6049  50S ribosomal protein L3  50.73 
 
 		 236 aa  197  9e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.185718  normal  0.220559 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0602  ribosomal protein L3  53.2 
 
 		 205 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0323  ribosomal protein L3  52.8 
 
 		 209 aa  197  1.0000000000000001e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000222247  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1938  50S ribosomal protein L3  49.76 
 
 		 205 aa  196  2.0000000000000003e-49  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3435  50S ribosomal protein L3  50.48 
 
 		 218 aa  196  2.0000000000000003e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0225  ribosomal protein L3  52.17 
 
 		 213 aa  196  2.0000000000000003e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20870  LSU ribosomal protein L3P  50.96 
 
 		 219 aa  196  2.0000000000000003e-49  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.235842  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6614  ribosomal protein L3  50.96 
 
 		 216 aa  196  3e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17160  50S ribosomal protein L3  50.48 
 
 		 216 aa  195  4.0000000000000005e-49  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.283771  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1161  ribosomal protein L3  52.74 
 
 		 206 aa  195  5.000000000000001e-49  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000266904  hitchhiker  0.000000567921 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1346  50S ribosomal protein L3  50.96 
 
 		 211 aa  195  5.000000000000001e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.700686  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3667  50S ribosomal protein L3  50.72 
 
 		 211 aa  194  7e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000330884  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10715  50S ribosomal protein L3  50.48 
 
 		 217 aa  194  8.000000000000001e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.249834 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1013  50S ribosomal protein L3  50.24 
 
 		 217 aa  194  8.000000000000001e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1030  50S ribosomal protein L3  50.24 
 
 		 217 aa  194  8.000000000000001e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1040  50S ribosomal protein L3  50.24 
 
 		 217 aa  194  8.000000000000001e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4001  50S ribosomal protein L3  52.34 
 
 		 209 aa  193  1e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000133554  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3822  50S ribosomal protein L3  52.34 
 
 		 209 aa  193  1e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000994751  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4315  50S ribosomal protein L3  50.25 
 
 		 219 aa  193  2e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00341518 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1123  ribosomal protein L3  49.76 
 
 		 220 aa  193  2e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1555  ribosomal protein L3  47.6 
 
 		 210 aa  192  5e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00791107  normal  0.982603 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3905  50S ribosomal protein L3  51.44 
 
 		 223 aa  191  5e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0141  50S ribosomal protein L3  51.44 
 
 		 210 aa  191  6e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000551418  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0110  50S ribosomal protein L3  51.44 
 
 		 210 aa  191  6e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000528056  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0110  50S ribosomal protein L3  51.44 
 
 		 210 aa  191  6e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000986131  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0106  50S ribosomal protein L3  51.44 
 
 		 210 aa  191  6e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.6707699999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0104  50S ribosomal protein L3  51.44 
 
 		 210 aa  191  6e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000168091  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0286  50S ribosomal protein L3  51.69 
 
 		 209 aa  191  6e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0410836  hitchhiker  0.00603059 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0131  50S ribosomal protein L3  51.44 
 
 		 210 aa  191  6e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000141135  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0122  50S ribosomal protein L3  51.44 
 
 		 210 aa  191  6e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.0599700000000001e-61 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0110  50S ribosomal protein L3  51.44 
 
 		 210 aa  191  6e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000246604  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0105  50S ribosomal protein L3  51.44 
 
 		 210 aa  191  7e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000775669  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5195  50S ribosomal protein L3  51.44 
 
 		 210 aa  191  7e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000842867  unclonable  2.19314e-25 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2324  ribosomal protein L3  49.3 
 
 		 215 aa  191  7e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000235705  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0867  50S ribosomal protein L3  54.07 
 
 		 210 aa  191  7e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000729631  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00445  50S ribosomal protein L3  51.4 
 
 		 212 aa  191  9e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.000559916  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0398  ribosomal protein L3  51.92 
 
 		 213 aa  191  9e-48  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1185  50S ribosomal protein L3  51.18 
 
 		 220 aa  190  1e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.108943 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2174  50S ribosomal protein L3  52.34 
 
 		 209 aa  190  1e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000029924  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0421  50S ribosomal protein L3P  51.69 
 
 		 212 aa  190  1e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00399818  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0215  50S ribosomal protein L3  51.44 
 
 		 209 aa  190  1e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000370606  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0587  ribosomal protein L3  49.04 
 
 		 219 aa  190  2e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.295272  normal  0.46094 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2714  50S ribosomal protein L3  48.56 
 
 		 209 aa  190  2e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000231855  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0933  50S ribosomal protein L3  47.83 
 
 		 211 aa  189  2e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00137042  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2774  ribosomal protein L3  48.76 
 
 		 210 aa  190  2e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.039291  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2065  50S ribosomal protein L3  46.34 
 
 		 209 aa  189  2e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.00000000000562685  normal  0.223373 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1185  50S ribosomal protein L3  48.56 
 
 		 210 aa  189  2.9999999999999997e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0708  50S ribosomal protein L3  47.34 
 
 		 208 aa  189  2.9999999999999997e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00455924  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0688  ribosomal protein L3  50 
 
 		 219 aa  189  2.9999999999999997e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.409644 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00730  50S ribosomal protein L3  51.87 
 
 		 209 aa  188  4e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001742  LSU ribosomal protein L3p (L3e)  51.87 
 
 		 209 aa  188  4e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000145621  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2399  50S ribosomal protein L3  47.6 
 
 		 209 aa  189  4e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000824684  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1907  50S ribosomal protein L3  51.22 
 
 		 208 aa  188  4e-47  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000032853  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0719  ribosomal protein L3  50 
 
 		 212 aa  189  4e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000525785  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3143  ribosomal protein L3  49.51 
 
 		 220 aa  187  7e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0896196  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0320  50S ribosomal protein L3  51.87 
 
 		 209 aa  187  7e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0285067  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2659  50S ribosomal protein L3  51.22 
 
 		 219 aa  187  7e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3751  50S ribosomal protein L3  51.87 
 
 		 209 aa  188  7e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000000163503  hitchhiker  0.0040389 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1615  ribosomal protein L3  47.34 
 
 		 205 aa  187  7e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0469  50S ribosomal protein L3  50.96 
 
 		 212 aa  187  8e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000509154  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0422  50S ribosomal protein L3  48.83 
 
 		 209 aa  187  8e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000195061  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>