More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_1907 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008532  STER_1907  50S ribosomal protein L3  100 
 
 		 208 aa  415  9.999999999999999e-116  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000032853  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0058  50S ribosomal protein L3  94.71 
 
 		 208 aa  400  1e-111  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00491271  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0104  50S ribosomal protein L3  75.24 
 
 		 210 aa  331  4e-90  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000119433  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0141  50S ribosomal protein L3  74.29 
 
 		 210 aa  327  7e-89  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000551418  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0110  50S ribosomal protein L3  74.29 
 
 		 210 aa  327  7e-89  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000528056  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0122  50S ribosomal protein L3  74.29 
 
 		 210 aa  327  7e-89  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.0599700000000001e-61 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0110  50S ribosomal protein L3  74.29 
 
 		 210 aa  327  7e-89  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000986131  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0106  50S ribosomal protein L3  74.29 
 
 		 210 aa  327  7e-89  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.6707699999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0104  50S ribosomal protein L3  74.29 
 
 		 210 aa  327  7e-89  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000168091  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0110  50S ribosomal protein L3  74.29 
 
 		 210 aa  327  7e-89  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000246604  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0131  50S ribosomal protein L3  74.29 
 
 		 210 aa  327  7e-89  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000141135  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0105  50S ribosomal protein L3  74.29 
 
 		 210 aa  327  8e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000775669  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5195  50S ribosomal protein L3  74.29 
 
 		 210 aa  327  8e-89  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000842867  unclonable  2.19314e-25 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0111  50S ribosomal protein L3  74.04 
 
 		 211 aa  317  1e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000151121  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0107  50S ribosomal protein L3  74 
 
 		 213 aa  303  1.0000000000000001e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0291  50S ribosomal protein L3  72.38 
 
 		 209 aa  295  2e-79  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000100637  unclonable  1.4129e-28 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0196  50S ribosomal protein L3  68.45 
 
 		 228 aa  291  7e-78  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0113604  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1483  50S ribosomal protein L3  66.67 
 
 		 219 aa  283  1.0000000000000001e-75  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000163613  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2711  50S ribosomal protein L3  64.88 
 
 		 211 aa  274  6e-73  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000399657  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1831  50S ribosomal protein L3  62.96 
 
 		 220 aa  274  7e-73  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000207996  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0422  50S ribosomal protein L3  63.46 
 
 		 209 aa  271  4.0000000000000004e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000195061  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2318  50S ribosomal protein L3  62.96 
 
 		 220 aa  268  2.9999999999999997e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000223614  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0595  50S ribosomal protein L3P  64.11 
 
 		 247 aa  268  5.9999999999999995e-71  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.000000158145  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2277  50S ribosomal protein L3  62.04 
 
 		 220 aa  264  5.999999999999999e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000105261  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1745  50S ribosomal protein L3  63.16 
 
 		 210 aa  260  8.999999999999999e-69  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000981122  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3667  50S ribosomal protein L3  60.19 
 
 		 211 aa  249  2e-65  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000330884  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2333  50S ribosomal protein L3  57.56 
 
 		 212 aa  249  2e-65  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000241734  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0867  50S ribosomal protein L3  62.68 
 
 		 210 aa  248  5e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000729631  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01170  50S ribosomal protein L3  60.58 
 
 		 211 aa  246  1e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000794381  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2714  50S ribosomal protein L3  59.13 
 
 		 209 aa  246  1e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000231855  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2399  50S ribosomal protein L3  59.13 
 
 		 209 aa  246  2e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000824684  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1524  50S ribosomal protein L3  59.62 
 
 		 209 aa  245  3e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.593746  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0286  50S ribosomal protein L3  59.62 
 
 		 209 aa  243  1.9999999999999999e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0410836  hitchhiker  0.00603059 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0215  50S ribosomal protein L3  58.94 
 
 		 209 aa  241  7.999999999999999e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000370606  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0696  50S ribosomal protein L3  58.82 
 
 		 223 aa  240  1e-62  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.372092  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl123  50S ribosomal protein L3  58.82 
 
 		 238 aa  239  2.9999999999999997e-62  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  9.499549999999999e-37  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0194  50S ribosomal protein L3  57.97 
 
 		 210 aa  236  1e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000719285  normal  0.0489845 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0225  ribosomal protein L3  55.07 
 
 		 213 aa  234  6e-61  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2460  50S ribosomal protein L3  57 
 
 		 209 aa  231  7.000000000000001e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0891685 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0701  50S ribosomal protein L3  56.46 
 
 		 210 aa  219  3e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000481863  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1346  50S ribosomal protein L3  54.03 
 
 		 211 aa  218  3e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.700686  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0758  50S ribosomal protein L3  54.25 
 
 		 212 aa  216  1e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000233446  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1955  50S ribosomal protein L3  49.52 
 
 		 218 aa  214  8e-55  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2903  50S ribosomal protein L3  56.13 
 
 		 212 aa  213  1.9999999999999998e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000477342  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4915  50S ribosomal protein L3  54.25 
 
 		 212 aa  212  2.9999999999999995e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0274485  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1129  50S ribosomal protein L3  50.49 
 
 		 218 aa  210  1e-53  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0376  50S ribosomal protein L3  50 
 
 		 218 aa  210  1e-53  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20031  50S ribosomal protein L3  50.97 
 
 		 218 aa  210  1e-53  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1938  50S ribosomal protein L3  52.97 
 
 		 205 aa  208  5e-53  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3024  50S ribosomal protein L3  50.24 
 
 		 210 aa  207  6e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.371217  hitchhiker  0.00790921 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0626  50S ribosomal protein L3  51.92 
 
 		 210 aa  208  6e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000331463  hitchhiker  0.000000000000331617 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1067  50S ribosomal protein L3  50.71 
 
 		 211 aa  207  7e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000374639  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23021  50S ribosomal protein L3  50 
 
 		 218 aa  207  7e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf444  50S ribosomal protein L3  50.24 
 
 		 272 aa  206  2e-52  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0469  50S ribosomal protein L3  54.98 
 
 		 212 aa  205  3e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000509154  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2857  50S ribosomal protein L3  51.44 
 
 		 210 aa  205  4e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.918611  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0562  50S ribosomal protein L3  53.59 
 
 		 218 aa  205  4e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1867  50S ribosomal protein L3  52.38 
 
 		 207 aa  204  8e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0222976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2232  50S ribosomal protein L3  49.28 
 
 		 213 aa  203  2e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.422626 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3162  50S ribosomal protein L3  52.22 
 
 		 206 aa  203  2e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.596382 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0602  ribosomal protein L3  53.73 
 
 		 205 aa  202  3e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1292  50S ribosomal protein L3  50 
 
 		 212 aa  202  3e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.0000167398  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0715  ribosomal protein L3  52.17 
 
 		 204 aa  201  4e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1161  ribosomal protein L3  51.94 
 
 		 206 aa  201  5e-51  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000266904  hitchhiker  0.000000567921 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4026  50S ribosomal protein L3  49.76 
 
 		 210 aa  201  6e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000729954 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3012  50S ribosomal protein L3  48.87 
 
 		 227 aa  201  6e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00913494 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5787  50S ribosomal protein L3  51.23 
 
 		 220 aa  201  7e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0786499 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0691  50S ribosomal protein L3  49.76 
 
 		 211 aa  201  8e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00208666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1185  50S ribosomal protein L3  49.28 
 
 		 210 aa  200  9.999999999999999e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2907  50S ribosomal protein L3  51.94 
 
 		 212 aa  200  9.999999999999999e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1184  ribosomal protein L3  49.76 
 
 		 209 aa  199  1.9999999999999998e-50  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000270125  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03980  LSU ribosomal protein L3P  52.63 
 
 		 213 aa  198  5e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1147  50S ribosomal protein L3  51.24 
 
 		 205 aa  197  6e-50  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000530687  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4321  ribosomal protein L3  50.72 
 
 		 216 aa  198  6e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0306  50S ribosomal protein L3P  50.72 
 
 		 222 aa  197  6e-50  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00207169 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6614  ribosomal protein L3  51.67 
 
 		 216 aa  198  6e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05715  50S ribosomal protein L3  50.99 
 
 		 205 aa  197  7.999999999999999e-50  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.499117  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16781  50S ribosomal protein L3  47.09 
 
 		 219 aa  197  9e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0587  ribosomal protein L3  50.71 
 
 		 219 aa  197  9e-50  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.295272  normal  0.46094 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001742  LSU ribosomal protein L3p (L3e)  54.37 
 
 		 209 aa  196  1.0000000000000001e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000145621  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23810  LSU ribosomal protein L3P  49.28 
 
 		 226 aa  197  1.0000000000000001e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0981  ribosomal protein L3  51.46 
 
 		 215 aa  197  1.0000000000000001e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.843676  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0960  50S ribosomal protein L3  53.33 
 
 		 214 aa  196  1.0000000000000001e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000067151  hitchhiker  0.000000166028 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0489  50S ribosomal protein L3  50 
 
 		 206 aa  196  1.0000000000000001e-49  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.525282  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0397  50S ribosomal protein L3  52.48 
 
 		 205 aa  196  2.0000000000000003e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0421  50S ribosomal protein L3P  52.86 
 
 		 212 aa  196  2.0000000000000003e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00399818  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0680  50S ribosomal protein L3  51.27 
 
 		 209 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.620206  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0790  50S ribosomal protein L3  49.76 
 
 		 213 aa  196  3e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2324  ribosomal protein L3  51.89 
 
 		 214 aa  195  4.0000000000000005e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00000658885  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4276  ribosomal protein L3  52.38 
 
 		 212 aa  195  4.0000000000000005e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000028687  unclonable  0.00000000000491767 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3758  50S ribosomal protein L3  49.52 
 
 		 219 aa  194  5.000000000000001e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.33789  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2559  50S ribosomal protein L3  50.74 
 
 		 211 aa  194  5.000000000000001e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.101168  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20870  LSU ribosomal protein L3P  48.56 
 
 		 219 aa  194  6e-49  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.235842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3524  ribosomal protein L3  52.61 
 
 		 212 aa  194  6e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.0000015584  hitchhiker  0.00000758128 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1836  50S ribosomal protein L3  47 
 
 		 217 aa  194  7e-49  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00718997  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3435  50S ribosomal protein L3  50.24 
 
 		 218 aa  194  7e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0197  50S ribosomal protein L3  50.96 
 
 		 210 aa  193  1e-48  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.555383 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2174  50S ribosomal protein L3  53.88 
 
 		 209 aa  193  1e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000029924  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0933  50S ribosomal protein L3  48.82 
 
 		 211 aa  193  2e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00137042  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4343  50S ribosomal protein L3  49.26 
 
 		 206 aa  192  2e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0239943  normal  0.123527 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>