More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_0680 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_0680  50S ribosomal protein L3  100 
 
 		 209 aa  428  1e-119  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.620206  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1346  50S ribosomal protein L3  75.12 
 
 		 211 aa  333  7.999999999999999e-91  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.700686  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1067  50S ribosomal protein L3  69.38 
 
 		 211 aa  309  2e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000374639  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2857  50S ribosomal protein L3  68.75 
 
 		 210 aa  306  1.0000000000000001e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.918611  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0626  50S ribosomal protein L3  66.51 
 
 		 210 aa  299  2e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000331463  hitchhiker  0.000000000000331617 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3328  50S ribosomal protein L3  66.03 
 
 		 211 aa  292  3e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000332976 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0933  50S ribosomal protein L3  66.03 
 
 		 211 aa  291  6e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00137042  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0701  50S ribosomal protein L3  58.37 
 
 		 210 aa  247  1e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000481863  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01170  50S ribosomal protein L3  55.77 
 
 		 211 aa  237  8e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000794381  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2257  50S ribosomal protein L3  55.88 
 
 		 209 aa  236  2e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000117498  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2714  50S ribosomal protein L3  54.07 
 
 		 209 aa  235  4e-61  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000231855  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2399  50S ribosomal protein L3  53.59 
 
 		 209 aa  234  5.0000000000000005e-61  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000824684  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3667  50S ribosomal protein L3  53.59 
 
 		 211 aa  234  6e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000330884  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2460  50S ribosomal protein L3  53.59 
 
 		 209 aa  233  2.0000000000000002e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0891685 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0867  50S ribosomal protein L3  52.63 
 
 		 210 aa  227  8e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000729631  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1745  50S ribosomal protein L3  52.63 
 
 		 210 aa  226  1e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000981122  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0790  50S ribosomal protein L3  49.76 
 
 		 213 aa  227  1e-58  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0422  50S ribosomal protein L3  51.67 
 
 		 209 aa  226  1e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000195061  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0286  50S ribosomal protein L3  52.63 
 
 		 209 aa  224  5.0000000000000005e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0410836  hitchhiker  0.00603059 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0194  50S ribosomal protein L3  52.15 
 
 		 210 aa  224  8e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000719285  normal  0.0489845 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1524  50S ribosomal protein L3  52.17 
 
 		 209 aa  223  2e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.593746  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4915  50S ribosomal protein L3  50.48 
 
 		 212 aa  221  4e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0274485  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3024  50S ribosomal protein L3  51.67 
 
 		 210 aa  221  4e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.371217  hitchhiker  0.00790921 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0691  50S ribosomal protein L3  53.2 
 
 		 211 aa  221  7e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00208666  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0111  50S ribosomal protein L3  51.2 
 
 		 211 aa  221  8e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000151121  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0058  50S ribosomal protein L3  53.59 
 
 		 208 aa  219  1.9999999999999999e-56  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00491271  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05715  50S ribosomal protein L3  55.17 
 
 		 205 aa  219  1.9999999999999999e-56  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.499117  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2333  50S ribosomal protein L3  52.17 
 
 		 212 aa  219  1.9999999999999999e-56  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000241734  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1555  ribosomal protein L3  50.72 
 
 		 210 aa  219  1.9999999999999999e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00791107  normal  0.982603 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0225  ribosomal protein L3  49.04 
 
 		 213 aa  219  3e-56  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4321  ribosomal protein L3  54.07 
 
 		 216 aa  219  3e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2774  ribosomal protein L3  51.46 
 
 		 210 aa  218  3.9999999999999997e-56  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.039291  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0215  50S ribosomal protein L3  52.4 
 
 		 209 aa  218  5e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000370606  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0708  50S ribosomal protein L3  51.96 
 
 		 208 aa  218  6e-56  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00455924  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0079  50S ribosomal protein L3  49.51 
 
 		 209 aa  217  8.999999999999998e-56  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.145283 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2559  50S ribosomal protein L3  53.69 
 
 		 211 aa  216  2e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.101168  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0758  50S ribosomal protein L3  50 
 
 		 212 aa  216  2e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000233446  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2711  50S ribosomal protein L3  50.97 
 
 		 211 aa  216  2e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000399657  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3758  50S ribosomal protein L3  53.62 
 
 		 219 aa  214  7e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.33789  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10020  LSU ribosomal protein L3P  51.47 
 
 		 206 aa  214  8e-55  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.000000402835  hitchhiker  0.00000000318342 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0104  50S ribosomal protein L3  50.24 
 
 		 210 aa  213  9.999999999999999e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000119433  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2065  50S ribosomal protein L3  48.02 
 
 		 209 aa  214  9.999999999999999e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.00000000000562685  normal  0.223373 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0847  50S ribosomal protein L3P  48.33 
 
 		 214 aa  213  9.999999999999999e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000479377  decreased coverage  0.0000116579 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0562  50S ribosomal protein L3  52.66 
 
 		 218 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1185  50S ribosomal protein L3  49.52 
 
 		 210 aa  213  1.9999999999999998e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1765  50S ribosomal protein L3  49.02 
 
 		 209 aa  213  1.9999999999999998e-54  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.0000837732  normal  0.643205 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1907  50S ribosomal protein L3  52.4 
 
 		 208 aa  212  2.9999999999999995e-54  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000032853  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0931  ribosomal protein L3  51.69 
 
 		 215 aa  211  4.9999999999999996e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.15696  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1867  50S ribosomal protein L3  52.63 
 
 		 207 aa  211  4.9999999999999996e-54  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0222976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1161  ribosomal protein L3  50.98 
 
 		 206 aa  211  7.999999999999999e-54  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000266904  hitchhiker  0.000000567921 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0397  50S ribosomal protein L3  52.71 
 
 		 205 aa  210  1e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0105  50S ribosomal protein L3  50 
 
 		 210 aa  210  1e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000775669  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5195  50S ribosomal protein L3  50 
 
 		 210 aa  210  1e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000842867  unclonable  2.19314e-25 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0249  50S ribosomal protein L3  50 
 
 		 212 aa  209  2e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.587373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2903  50S ribosomal protein L3  49.52 
 
 		 212 aa  210  2e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000477342  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0252  50S ribosomal protein L3  50 
 
 		 212 aa  209  2e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4026  50S ribosomal protein L3  48.57 
 
 		 210 aa  209  2e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000729954 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00445  50S ribosomal protein L3  50.94 
 
 		 212 aa  209  3e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.000559916  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0319  50S ribosomal protein L3  50.94 
 
 		 212 aa  209  3e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  9.147880000000001e-24  hitchhiker  0.0000384813 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0107  50S ribosomal protein L3  50.5 
 
 		 213 aa  209  3e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1147  50S ribosomal protein L3  52.22 
 
 		 205 aa  208  4e-53  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000530687  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1955  50S ribosomal protein L3  47.12 
 
 		 218 aa  209  4e-53  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2232  50S ribosomal protein L3  52.31 
 
 		 213 aa  208  4e-53  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.422626 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1292  50S ribosomal protein L3  49.02 
 
 		 207 aa  208  4e-53  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000263563  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1394  50S ribosomal protein L3  49.02 
 
 		 207 aa  208  4e-53  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000462367  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1938  50S ribosomal protein L3  52.22 
 
 		 205 aa  208  5e-53  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0421  50S ribosomal protein L3P  53.55 
 
 		 212 aa  208  5e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00399818  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4001  50S ribosomal protein L3  52.17 
 
 		 209 aa  208  5e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000133554  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2324  ribosomal protein L3  52.36 
 
 		 214 aa  207  6e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00000658885  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3703  50S ribosomal protein L3  48.53 
 
 		 212 aa  207  6e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3822  50S ribosomal protein L3  52.17 
 
 		 209 aa  208  6e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000994751  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0960  50S ribosomal protein L3  52.38 
 
 		 214 aa  207  7e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000067151  hitchhiker  0.000000166028 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2907  50S ribosomal protein L3  51.21 
 
 		 212 aa  207  8e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0474  50S ribosomal protein L3  50.72 
 
 		 205 aa  207  9e-53  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00148542  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_417  ribosomal protein L3  50.72 
 
 		 205 aa  207  9e-53  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000036263  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1292  50S ribosomal protein L3  49.76 
 
 		 212 aa  207  9e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.0000167398  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0110  50S ribosomal protein L3  49.04 
 
 		 210 aa  207  1e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000528056  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0110  50S ribosomal protein L3  49.04 
 
 		 210 aa  207  1e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000986131  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0106  50S ribosomal protein L3  49.04 
 
 		 210 aa  207  1e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.6707699999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0104  50S ribosomal protein L3  49.04 
 
 		 210 aa  207  1e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000168091  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0131  50S ribosomal protein L3  49.04 
 
 		 210 aa  207  1e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000141135  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2174  50S ribosomal protein L3  51.69 
 
 		 209 aa  207  1e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000029924  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0323  ribosomal protein L3  52.17 
 
 		 209 aa  207  1e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000222247  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0141  50S ribosomal protein L3  49.04 
 
 		 210 aa  207  1e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000551418  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0110  50S ribosomal protein L3  49.04 
 
 		 210 aa  207  1e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000246604  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17491  50S ribosomal protein L3  46.08 
 
 		 217 aa  206  1e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0122  50S ribosomal protein L3  49.04 
 
 		 210 aa  207  1e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.0599700000000001e-61 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2318  50S ribosomal protein L3  47.69 
 
 		 220 aa  207  1e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000223614  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1184  ribosomal protein L3  47.83 
 
 		 209 aa  207  1e-52  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000270125  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0451  50S ribosomal protein L3  50.72 
 
 		 205 aa  207  1e-52  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000154888  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20031  50S ribosomal protein L3  46.57 
 
 		 218 aa  206  2e-52  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1831  50S ribosomal protein L3  46.76 
 
 		 220 aa  206  2e-52  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000207996  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17401  50S ribosomal protein L3  47.06 
 
 		 217 aa  206  2e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0376  50S ribosomal protein L3  45.67 
 
 		 218 aa  206  2e-52  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0962  ribosomal protein L3  54.9 
 
 		 206 aa  206  2e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000608869  hitchhiker  0.0000000000269964 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1086  LSU ribosomal protein L3P  50.72 
 
 		 217 aa  206  2e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.10406 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3751  50S ribosomal protein L3  51.69 
 
 		 209 aa  206  2e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000000163503  hitchhiker  0.0040389 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0405  ribosomal protein L3  52.17 
 
 		 209 aa  206  2e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00399178  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1129  50S ribosomal protein L3  46.08 
 
 		 218 aa  205  3e-52  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3179  50S ribosomal protein L3  48.58 
 
 		 216 aa  206  3e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00000128128  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>