More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_0111 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012793  GWCH70_0111  50S ribosomal protein L3  100 
 
 		 211 aa  421  1e-117  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000151121  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0107  50S ribosomal protein L3  95.52 
 
 		 213 aa  391  1e-108  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0104  50S ribosomal protein L3  81.25 
 
 		 210 aa  344  7e-94  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000119433  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0110  50S ribosomal protein L3  79.71 
 
 		 210 aa  337  5.9999999999999996e-92  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000528056  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0110  50S ribosomal protein L3  79.71 
 
 		 210 aa  337  5.9999999999999996e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000986131  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0106  50S ribosomal protein L3  79.71 
 
 		 210 aa  337  5.9999999999999996e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.6707699999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0104  50S ribosomal protein L3  79.71 
 
 		 210 aa  337  5.9999999999999996e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000168091  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0122  50S ribosomal protein L3  79.71 
 
 		 210 aa  337  5.9999999999999996e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.0599700000000001e-61 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0110  50S ribosomal protein L3  79.71 
 
 		 210 aa  337  5.9999999999999996e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000246604  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0131  50S ribosomal protein L3  79.71 
 
 		 210 aa  337  5.9999999999999996e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000141135  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0141  50S ribosomal protein L3  79.71 
 
 		 210 aa  337  5.9999999999999996e-92  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000551418  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5195  50S ribosomal protein L3  79.23 
 
 		 210 aa  335  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000842867  unclonable  2.19314e-25 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0105  50S ribosomal protein L3  79.23 
 
 		 210 aa  335  1.9999999999999998e-91  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000775669  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2711  50S ribosomal protein L3  71.29 
 
 		 211 aa  317  1e-85  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000399657  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1907  50S ribosomal protein L3  74.04 
 
 		 208 aa  317  1e-85  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000032853  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0058  50S ribosomal protein L3  72.6 
 
 		 208 aa  312  1.9999999999999998e-84  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00491271  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1831  50S ribosomal protein L3  68.52 
 
 		 220 aa  301  6.000000000000001e-81  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000207996  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2318  50S ribosomal protein L3  67.13 
 
 		 220 aa  295  3e-79  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000223614  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0196  50S ribosomal protein L3  69.67 
 
 		 228 aa  294  8e-79  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0113604  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1483  50S ribosomal protein L3  66.35 
 
 		 219 aa  291  4e-78  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000163613  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2277  50S ribosomal protein L3  66.2 
 
 		 220 aa  291  5e-78  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000105261  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0291  50S ribosomal protein L3  67.79 
 
 		 209 aa  287  8e-77  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000100637  unclonable  1.4129e-28 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1745  50S ribosomal protein L3  66.67 
 
 		 210 aa  287  8e-77  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000981122  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0422  50S ribosomal protein L3  63.64 
 
 		 209 aa  281  4.0000000000000003e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000195061  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1524  50S ribosomal protein L3  65.53 
 
 		 209 aa  276  2e-73  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.593746  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2333  50S ribosomal protein L3  61.35 
 
 		 212 aa  273  9e-73  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000241734  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0867  50S ribosomal protein L3  64.76 
 
 		 210 aa  273  2.0000000000000002e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000729631  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0595  50S ribosomal protein L3P  67.15 
 
 		 247 aa  270  1e-71  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.000000158145  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2460  50S ribosomal protein L3  62.02 
 
 		 209 aa  269  2e-71  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0891685 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0286  50S ribosomal protein L3  61.24 
 
 		 209 aa  266  2e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0410836  hitchhiker  0.00603059 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0215  50S ribosomal protein L3  62.68 
 
 		 209 aa  263  2e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000370606  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0225  ribosomal protein L3  61.35 
 
 		 213 aa  262  4e-69  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3667  50S ribosomal protein L3  59.81 
 
 		 211 aa  260  1e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000330884  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01170  50S ribosomal protein L3  59.9 
 
 		 211 aa  257  1e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000794381  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2714  50S ribosomal protein L3  57.42 
 
 		 209 aa  256  2e-67  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000231855  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2399  50S ribosomal protein L3  56.94 
 
 		 209 aa  256  3e-67  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000824684  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0696  50S ribosomal protein L3  59.33 
 
 		 223 aa  248  5e-65  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.372092  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2903  50S ribosomal protein L3  61.14 
 
 		 212 aa  244  6.999999999999999e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000477342  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0758  50S ribosomal protein L3  54.76 
 
 		 212 aa  243  1.9999999999999999e-63  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000233446  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1067  50S ribosomal protein L3  54.76 
 
 		 211 aa  237  8e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000374639  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl123  50S ribosomal protein L3  58.25 
 
 		 238 aa  236  2e-61  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  9.499549999999999e-37  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0194  50S ribosomal protein L3  53.81 
 
 		 210 aa  236  2e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000719285  normal  0.0489845 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0701  50S ribosomal protein L3  56.46 
 
 		 210 aa  235  4e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000481863  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0981  ribosomal protein L3  55.83 
 
 		 215 aa  232  4.0000000000000004e-60  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.843676  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03980  LSU ribosomal protein L3P  56.04 
 
 		 213 aa  230  1e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1394  50S ribosomal protein L3  55.88 
 
 		 207 aa  226  2e-58  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000462367  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1292  50S ribosomal protein L3  55.88 
 
 		 207 aa  226  2e-58  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000263563  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0790  50S ribosomal protein L3  53.85 
 
 		 213 aa  226  2e-58  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0306  50S ribosomal protein L3P  54.76 
 
 		 222 aa  226  2e-58  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00207169 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1346  50S ribosomal protein L3  51.67 
 
 		 211 aa  224  6e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.700686  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0933  50S ribosomal protein L3  51.9 
 
 		 211 aa  224  6e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00137042  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3758  50S ribosomal protein L3  53.77 
 
 		 219 aa  224  7e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.33789  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0626  50S ribosomal protein L3  50.48 
 
 		 210 aa  224  9e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000331463  hitchhiker  0.000000000000331617 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1138  50S ribosomal protein L3  52.43 
 
 		 207 aa  223  2e-57  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000858376  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3328  50S ribosomal protein L3  51.9 
 
 		 211 aa  222  2e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000332976 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1161  ribosomal protein L3  54.85 
 
 		 206 aa  222  3e-57  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000266904  hitchhiker  0.000000567921 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4321  ribosomal protein L3  52.13 
 
 		 216 aa  221  9e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1184  ribosomal protein L3  52.17 
 
 		 209 aa  219  1.9999999999999999e-56  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000270125  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5049  50S ribosomal protein L3  54.03 
 
 		 218 aa  218  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.399218 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3435  50S ribosomal protein L3  53.08 
 
 		 218 aa  218  5e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6614  ribosomal protein L3  52.86 
 
 		 216 aa  218  6e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1305  50S ribosomal protein L3  54.76 
 
 		 218 aa  218  7.999999999999999e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.207115  normal  0.106977 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4915  50S ribosomal protein L3  53.52 
 
 		 212 aa  217  8.999999999999998e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0274485  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2857  50S ribosomal protein L3  50.95 
 
 		 210 aa  217  1e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.918611  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3905  50S ribosomal protein L3  52.63 
 
 		 223 aa  216  2e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0562  50S ribosomal protein L3  53.33 
 
 		 218 aa  215  4e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1836  50S ribosomal protein L3  51.52 
 
 		 217 aa  214  5.9999999999999996e-55  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00718997  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0953  50S ribosomal protein L3  55.12 
 
 		 205 aa  214  7e-55  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000000660439  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf444  50S ribosomal protein L3  51.17 
 
 		 272 aa  213  9.999999999999999e-55  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1292  50S ribosomal protein L3  51.46 
 
 		 212 aa  212  2.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.0000167398  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0962  ribosomal protein L3  53.88 
 
 		 206 aa  212  2.9999999999999995e-54  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000608869  hitchhiker  0.0000000000269964 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0688  ribosomal protein L3  50.24 
 
 		 219 aa  211  4.9999999999999996e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.409644 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10715  50S ribosomal protein L3  52.86 
 
 		 217 aa  211  4.9999999999999996e-54  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.249834 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2774  ribosomal protein L3  49.26 
 
 		 210 aa  211  5.999999999999999e-54  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.039291  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20870  LSU ribosomal protein L3P  50.97 
 
 		 219 aa  209  3e-53  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.235842  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1185  50S ribosomal protein L3  53.81 
 
 		 220 aa  208  4e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.108943 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0931  ribosomal protein L3  50 
 
 		 215 aa  208  4e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.15696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1040  50S ribosomal protein L3  51.9 
 
 		 217 aa  208  5e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1867  50S ribosomal protein L3  53.81 
 
 		 207 aa  208  5e-53  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0222976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1013  50S ribosomal protein L3  51.9 
 
 		 217 aa  208  5e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1030  50S ribosomal protein L3  51.9 
 
 		 217 aa  208  5e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23810  LSU ribosomal protein L3P  49.52 
 
 		 226 aa  208  6e-53  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4026  50S ribosomal protein L3  51.66 
 
 		 210 aa  207  1e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000729954 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2646  50S ribosomal protein L3  51.44 
 
 		 216 aa  207  1e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.334348  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1185  50S ribosomal protein L3  50.95 
 
 		 210 aa  206  2e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0715  ribosomal protein L3  52.66 
 
 		 204 aa  206  2e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17160  50S ribosomal protein L3  51.21 
 
 		 216 aa  206  2e-52  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.283771  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001742  LSU ribosomal protein L3p (L3e)  55.56 
 
 		 209 aa  206  2e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000145621  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3995  ribosomal protein L3  51.94 
 
 		 208 aa  205  4e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0587  ribosomal protein L3  49.28 
 
 		 219 aa  205  4e-52  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.295272  normal  0.46094 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2324  ribosomal protein L3  54.93 
 
 		 214 aa  205  4e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00000658885  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1707  50S ribosomal protein L3  49.76 
 
 		 213 aa  205  4e-52  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00287886  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0680  50S ribosomal protein L3  50 
 
 		 209 aa  205  4e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.620206  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2174  50S ribosomal protein L3  55.07 
 
 		 209 aa  204  6e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000029924  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3024  50S ribosomal protein L3  50 
 
 		 210 aa  204  6e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.371217  hitchhiker  0.00790921 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0320  50S ribosomal protein L3  55.07 
 
 		 209 aa  204  7e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0285067  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00730  50S ribosomal protein L3  55.07 
 
 		 209 aa  204  7e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0691  50S ribosomal protein L3  51.28 
 
 		 211 aa  204  8e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00208666  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1147  50S ribosomal protein L3  50.5 
 
 		 205 aa  204  1e-51  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000530687  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10020  LSU ribosomal protein L3P  48.06 
 
 		 206 aa  204  1e-51  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.000000402835  hitchhiker  0.00000000318342 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>