More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_1836 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014150  Bmur_1836  50S ribosomal protein L3  100 
 
 		 217 aa  448  1e-125  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00718997  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0867  50S ribosomal protein L3  53.14 
 
 		 210 aa  240  1e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000729631  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1745  50S ribosomal protein L3  51.21 
 
 		 210 aa  238  4e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000981122  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0422  50S ribosomal protein L3  52.17 
 
 		 209 aa  233  2.0000000000000002e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000195061  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1524  50S ribosomal protein L3  51.21 
 
 		 209 aa  233  2.0000000000000002e-60  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.593746  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0286  50S ribosomal protein L3  51.69 
 
 		 209 aa  232  3e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0410836  hitchhiker  0.00603059 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0562  50S ribosomal protein L3  54.11 
 
 		 218 aa  231  6e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2460  50S ribosomal protein L3  49.76 
 
 		 209 aa  228  5e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0891685 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3667  50S ribosomal protein L3  50.98 
 
 		 211 aa  227  9e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000330884  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1184  ribosomal protein L3  51.94 
 
 		 209 aa  227  1e-58  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000270125  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2333  50S ribosomal protein L3  51.46 
 
 		 212 aa  226  1e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000241734  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0758  50S ribosomal protein L3  54.15 
 
 		 212 aa  226  2e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000233446  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2711  50S ribosomal protein L3  51.89 
 
 		 211 aa  226  2e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000399657  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2714  50S ribosomal protein L3  53.43 
 
 		 209 aa  226  3e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000231855  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2399  50S ribosomal protein L3  52.94 
 
 		 209 aa  225  4e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000824684  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0306  50S ribosomal protein L3P  50 
 
 		 222 aa  224  9e-58  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00207169 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0215  50S ribosomal protein L3  50.73 
 
 		 209 aa  221  9e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000370606  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0249  50S ribosomal protein L3  52.68 
 
 		 212 aa  221  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.587373  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0252  50S ribosomal protein L3  52.68 
 
 		 212 aa  221  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0111  50S ribosomal protein L3  50.72 
 
 		 211 aa  219  1.9999999999999999e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000151121  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1086  LSU ribosomal protein L3P  52.17 
 
 		 217 aa  218  3.9999999999999997e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.10406 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4321  ribosomal protein L3  50.49 
 
 		 216 aa  218  6e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1292  50S ribosomal protein L3  49.02 
 
 		 212 aa  217  7.999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.0000167398  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0691  50S ribosomal protein L3  49.51 
 
 		 211 aa  217  1e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00208666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1138  50S ribosomal protein L3  50.24 
 
 		 207 aa  217  1e-55  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000858376  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1292  50S ribosomal protein L3  51.23 
 
 		 207 aa  216  2e-55  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000263563  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1394  50S ribosomal protein L3  51.23 
 
 		 207 aa  216  2e-55  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000462367  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0701  50S ribosomal protein L3  50.97 
 
 		 210 aa  215  2.9999999999999998e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000481863  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2559  50S ribosomal protein L3  50.49 
 
 		 211 aa  215  5e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.101168  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0933  50S ribosomal protein L3  50.72 
 
 		 211 aa  214  5.9999999999999996e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00137042  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2903  50S ribosomal protein L3  48.79 
 
 		 212 aa  214  9e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000477342  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03980  LSU ribosomal protein L3P  50.96 
 
 		 213 aa  213  9.999999999999999e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3328  50S ribosomal protein L3  51.21 
 
 		 211 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000332976 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3024  50S ribosomal protein L3  48.54 
 
 		 210 aa  213  1.9999999999999998e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.371217  hitchhiker  0.00790921 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3012  50S ribosomal protein L3  47.27 
 
 		 227 aa  213  1.9999999999999998e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00913494 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01170  50S ribosomal protein L3  50 
 
 		 211 aa  213  2.9999999999999995e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000794381  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3703  50S ribosomal protein L3  49.27 
 
 		 212 aa  211  9e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1067  50S ribosomal protein L3  48.79 
 
 		 211 aa  210  1e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000374639  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0291  50S ribosomal protein L3  51.24 
 
 		 226 aa  210  2e-53  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0279726  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1161  ribosomal protein L3  48.51 
 
 		 206 aa  209  3e-53  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000266904  hitchhiker  0.000000567921 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0304  ribosomal protein L3  49.28 
 
 		 211 aa  208  4e-53  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.234109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0107  50S ribosomal protein L3  49.49 
 
 		 213 aa  207  7e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0790  50S ribosomal protein L3  48.11 
 
 		 213 aa  207  9e-53  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0225  ribosomal protein L3  45.85 
 
 		 213 aa  207  1e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2857  50S ribosomal protein L3  47.83 
 
 		 210 aa  206  2e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.918611  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0708  50S ribosomal protein L3  48.5 
 
 		 208 aa  206  2e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00455924  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4026  50S ribosomal protein L3  47.57 
 
 		 210 aa  206  2e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000729954 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0981  ribosomal protein L3  47.83 
 
 		 215 aa  206  2e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.843676  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0931  ribosomal protein L3  48.31 
 
 		 215 aa  206  3e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.15696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4915  50S ribosomal protein L3  47.62 
 
 		 212 aa  206  3e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0274485  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2232  50S ribosomal protein L3  47.06 
 
 		 213 aa  205  4e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.422626 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3435  50S ribosomal protein L3  49.51 
 
 		 218 aa  204  6e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10715  50S ribosomal protein L3  47.42 
 
 		 217 aa  204  7e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.249834 
 
 
-
 
NC_002950  PG1938  50S ribosomal protein L3  49.01 
 
 		 205 aa  204  8e-52  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0265  50S ribosomal protein L3  45.25 
 
 		 232 aa  204  9e-52  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000658657  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1831  50S ribosomal protein L3  46.08 
 
 		 220 aa  204  1e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000207996  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1185  50S ribosomal protein L3  48.06 
 
 		 210 aa  204  1e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1555  ribosomal protein L3  46.7 
 
 		 210 aa  203  1e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00791107  normal  0.982603 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5787  50S ribosomal protein L3  51.23 
 
 		 220 aa  203  2e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0786499 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0953  50S ribosomal protein L3  50.73 
 
 		 205 aa  203  2e-51  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000000660439  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3758  50S ribosomal protein L3  48.54 
 
 		 219 aa  202  3e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.33789  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1123  ribosomal protein L3  49.76 
 
 		 220 aa  202  3e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1346  50S ribosomal protein L3  47.8 
 
 		 211 aa  202  3e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.700686  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3162  50S ribosomal protein L3  51.47 
 
 		 206 aa  202  3e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.596382 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17651  50S ribosomal protein L3  46.27 
 
 		 217 aa  201  7e-51  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.884364  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17401  50S ribosomal protein L3  47.26 
 
 		 217 aa  201  8e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2774  ribosomal protein L3  45.81 
 
 		 210 aa  201  9e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.039291  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0131  50S ribosomal protein L3  47.8 
 
 		 210 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000141135  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0110  50S ribosomal protein L3  47.8 
 
 		 210 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000528056  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1418  ribosomal protein L3  45.19 
 
 		 259 aa  199  1.9999999999999998e-50  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.710723  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0110  50S ribosomal protein L3  47.8 
 
 		 210 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000986131  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0106  50S ribosomal protein L3  47.8 
 
 		 210 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.6707699999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0104  50S ribosomal protein L3  47.8 
 
 		 210 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000168091  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4343  50S ribosomal protein L3  48.28 
 
 		 206 aa  199  1.9999999999999998e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0239943  normal  0.123527 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2646  50S ribosomal protein L3  47.57 
 
 		 216 aa  199  1.9999999999999998e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.334348  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0141  50S ribosomal protein L3  47.8 
 
 		 210 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000551418  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0122  50S ribosomal protein L3  47.8 
 
 		 210 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.0599700000000001e-61 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0226  50S ribosomal protein L3  49.29 
 
 		 233 aa  199  1.9999999999999998e-50  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  hitchhiker  0.00275796  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0626  50S ribosomal protein L3  46.86 
 
 		 210 aa  199  1.9999999999999998e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000331463  hitchhiker  0.000000000000331617 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2257  50S ribosomal protein L3  46 
 
 		 209 aa  200  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000117498  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0110  50S ribosomal protein L3  47.8 
 
 		 210 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000246604  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1650  50S ribosomal protein L3  46.77 
 
 		 217 aa  199  1.9999999999999998e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6614  ribosomal protein L3  48.06 
 
 		 216 aa  199  1.9999999999999998e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10020  LSU ribosomal protein L3P  43.56 
 
 		 206 aa  200  1.9999999999999998e-50  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.000000402835  hitchhiker  0.00000000318342 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1907  50S ribosomal protein L3  47.32 
 
 		 208 aa  199  1.9999999999999998e-50  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000032853  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1305  50S ribosomal protein L3  47.42 
 
 		 218 aa  200  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.207115  normal  0.106977 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5195  50S ribosomal protein L3  47.8 
 
 		 210 aa  199  3e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000842867  unclonable  2.19314e-25 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0104  50S ribosomal protein L3  48.29 
 
 		 210 aa  199  3e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000119433  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5049  50S ribosomal protein L3  47.66 
 
 		 218 aa  199  3e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.399218 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0105  50S ribosomal protein L3  47.8 
 
 		 210 aa  199  3e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000775669  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0696  50S ribosomal protein L3  46.26 
 
 		 223 aa  199  3.9999999999999996e-50  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.372092  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17491  50S ribosomal protein L3  45.27 
 
 		 217 aa  199  3.9999999999999996e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2318  50S ribosomal protein L3  46.54 
 
 		 220 aa  198  5e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000223614  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2065  50S ribosomal protein L3  47 
 
 		 209 aa  198  5e-50  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.00000000000562685  normal  0.223373 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0847  50S ribosomal protein L3P  47.83 
 
 		 214 aa  197  7e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000479377  decreased coverage  0.0000116579 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1040  50S ribosomal protein L3  47.42 
 
 		 217 aa  197  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0079  50S ribosomal protein L3  45.5 
 
 		 209 aa  197  1.0000000000000001e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.145283 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1013  50S ribosomal protein L3  47.42 
 
 		 217 aa  197  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0715  ribosomal protein L3  48.04 
 
 		 204 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1030  50S ribosomal protein L3  47.42 
 
 		 217 aa  197  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.676061 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>