More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_03980 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_03980  LSU ribosomal protein L3P  100 
 
 		 213 aa  424  1e-118  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6614  ribosomal protein L3  80 
 
 		 216 aa  335  1.9999999999999998e-91  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3758  50S ribosomal protein L3  74.64 
 
 		 219 aa  326  1.0000000000000001e-88  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.33789  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3435  50S ribosomal protein L3  76.19 
 
 		 218 aa  323  1e-87  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5049  50S ribosomal protein L3  74.18 
 
 		 218 aa  317  1e-85  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.399218 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4507  50S ribosomal protein L3  75.24 
 
 		 221 aa  316  2e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.787031  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1305  50S ribosomal protein L3  74.53 
 
 		 218 aa  315  2e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.207115  normal  0.106977 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10715  50S ribosomal protein L3  74.06 
 
 		 217 aa  315  3e-85  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.249834 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1040  50S ribosomal protein L3  74.53 
 
 		 217 aa  315  4e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1013  50S ribosomal protein L3  74.53 
 
 		 217 aa  315  4e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1030  50S ribosomal protein L3  74.53 
 
 		 217 aa  315  4e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20870  LSU ribosomal protein L3P  71.98 
 
 		 219 aa  311  6.999999999999999e-84  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.235842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0582  50S ribosomal protein L3  71.98 
 
 		 235 aa  308  4e-83  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4321  ribosomal protein L3  71.15 
 
 		 216 aa  306  2.0000000000000002e-82  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6049  50S ribosomal protein L3  72.06 
 
 		 236 aa  305  2.0000000000000002e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.185718  normal  0.220559 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1123  ribosomal protein L3  74.16 
 
 		 220 aa  305  3e-82  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29740  LSU ribosomal protein L3P  71.84 
 
 		 219 aa  303  1.0000000000000001e-81  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.378005 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0627  ribosomal protein L3  72.33 
 
 		 217 aa  303  1.0000000000000001e-81  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17160  50S ribosomal protein L3  69.86 
 
 		 216 aa  303  2.0000000000000002e-81  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.283771  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0931  ribosomal protein L3  68.1 
 
 		 215 aa  301  4.0000000000000003e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.15696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2646  50S ribosomal protein L3  70.48 
 
 		 216 aa  301  5.000000000000001e-81  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.334348  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0306  50S ribosomal protein L3P  68.9 
 
 		 222 aa  298  3e-80  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00207169 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1086  LSU ribosomal protein L3P  68.08 
 
 		 217 aa  297  7e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.10406 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2659  50S ribosomal protein L3  71.84 
 
 		 219 aa  296  1e-79  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23810  LSU ribosomal protein L3P  70.19 
 
 		 226 aa  296  2e-79  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3905  50S ribosomal protein L3  68.4 
 
 		 223 aa  296  2e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2687  50S ribosomal protein L3  66.99 
 
 		 216 aa  293  1e-78  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.740328 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0688  ribosomal protein L3  67.77 
 
 		 219 aa  291  3e-78  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.409644 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0562  50S ribosomal protein L3  66.67 
 
 		 218 aa  291  5e-78  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2975  50S ribosomal protein L3  66.03 
 
 		 216 aa  289  2e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.454423  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0587  ribosomal protein L3  66.51 
 
 		 219 aa  286  2e-76  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.295272  normal  0.46094 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5124  50S ribosomal protein L3  65.55 
 
 		 216 aa  285  5e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1185  50S ribosomal protein L3  71.15 
 
 		 220 aa  280  1e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.108943 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3143  ribosomal protein L3  66.83 
 
 		 220 aa  278  6e-74  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0896196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3923  50S ribosomal protein L3  66.83 
 
 		 219 aa  277  1e-73  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4315  50S ribosomal protein L3  66.34 
 
 		 219 aa  276  1e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00341518 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1707  50S ribosomal protein L3  61.06 
 
 		 213 aa  262  3e-69  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00287886  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0255  50S ribosomal protein L3  60.19 
 
 		 216 aa  251  4.0000000000000004e-66  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1184  ribosomal protein L3  56.1 
 
 		 209 aa  233  1.0000000000000001e-60  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000270125  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4915  50S ribosomal protein L3  55.29 
 
 		 212 aa  234  1.0000000000000001e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0274485  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0701  50S ribosomal protein L3  58.17 
 
 		 210 aa  232  3e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000481863  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0111  50S ribosomal protein L3  56.04 
 
 		 211 aa  230  1e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000151121  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0286  50S ribosomal protein L3  57.49 
 
 		 209 aa  228  5e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0410836  hitchhiker  0.00603059 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1867  50S ribosomal protein L3  57.42 
 
 		 207 aa  228  6e-59  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0222976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2333  50S ribosomal protein L3  52.17 
 
 		 212 aa  226  1e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000241734  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1524  50S ribosomal protein L3  55.77 
 
 		 209 aa  225  4e-58  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.593746  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2907  50S ribosomal protein L3  57.69 
 
 		 212 aa  224  1e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0691  50S ribosomal protein L3  55.29 
 
 		 211 aa  223  2e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00208666  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2619  50S ribosomal protein L3  57.21 
 
 		 214 aa  223  2e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0132285  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2460  50S ribosomal protein L3  55.98 
 
 		 209 aa  223  2e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0891685 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3024  50S ribosomal protein L3  51.2 
 
 		 210 aa  223  2e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.371217  hitchhiker  0.00790921 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10020  LSU ribosomal protein L3P  52.91 
 
 		 206 aa  223  2e-57  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.000000402835  hitchhiker  0.00000000318342 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0458  50S ribosomal protein L3P  57.28 
 
 		 218 aa  223  2e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.310193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3667  50S ribosomal protein L3  52.63 
 
 		 211 aa  223  2e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000330884  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1745  50S ribosomal protein L3  54.11 
 
 		 210 aa  222  4e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000981122  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001742  LSU ribosomal protein L3p (L3e)  55.29 
 
 		 209 aa  221  4.9999999999999996e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000145621  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0715  ribosomal protein L3  52.91 
 
 		 204 aa  221  6e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0323  ribosomal protein L3  53.85 
 
 		 209 aa  221  7e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000222247  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0405  ribosomal protein L3  53.85 
 
 		 209 aa  220  9.999999999999999e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00399178  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0107  50S ribosomal protein L3  55.22 
 
 		 213 aa  220  9.999999999999999e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00445  50S ribosomal protein L3  52.88 
 
 		 212 aa  220  9.999999999999999e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.000559916  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2324  ribosomal protein L3  55.98 
 
 		 214 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00000658885  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1292  50S ribosomal protein L3  53.43 
 
 		 212 aa  219  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.0000167398  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0295  ribosomal protein L3  54.55 
 
 		 212 aa  219  1.9999999999999999e-56  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000479422  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0960  50S ribosomal protein L3  56.31 
 
 		 214 aa  219  1.9999999999999999e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000067151  hitchhiker  0.000000166028 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0141  50S ribosomal protein L3  55.07 
 
 		 210 aa  219  3e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000551418  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0110  50S ribosomal protein L3  55.07 
 
 		 210 aa  219  3e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000528056  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0110  50S ribosomal protein L3  55.07 
 
 		 210 aa  219  3e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000986131  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0106  50S ribosomal protein L3  55.07 
 
 		 210 aa  219  3e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.6707699999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0104  50S ribosomal protein L3  55.07 
 
 		 210 aa  219  3e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000168091  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2174  50S ribosomal protein L3  54.81 
 
 		 209 aa  219  3e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000029924  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0110  50S ribosomal protein L3  55.07 
 
 		 210 aa  219  3e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000246604  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0131  50S ribosomal protein L3  55.07 
 
 		 210 aa  219  3e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000141135  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0122  50S ribosomal protein L3  55.07 
 
 		 210 aa  219  3e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.0599700000000001e-61 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0320  50S ribosomal protein L3  53.85 
 
 		 209 aa  219  3e-56  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0285067  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00730  50S ribosomal protein L3  54.81 
 
 		 209 aa  219  3e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01170  50S ribosomal protein L3  53.62 
 
 		 211 aa  218  7.999999999999999e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000794381  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0105  50S ribosomal protein L3  54.59 
 
 		 210 aa  217  1e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000775669  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5195  50S ribosomal protein L3  54.59 
 
 		 210 aa  217  1e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000842867  unclonable  2.19314e-25 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0867  50S ribosomal protein L3  53.14 
 
 		 210 aa  217  1e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000729631  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1067  50S ribosomal protein L3  53.14 
 
 		 211 aa  216  1e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000374639  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3822  50S ribosomal protein L3  53.37 
 
 		 209 aa  216  2e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000994751  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3915  50S ribosomal protein L3  53.85 
 
 		 209 aa  216  2e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  5.44377e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0584  50S ribosomal protein L3  53.85 
 
 		 209 aa  216  2e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000000183333  normal  0.0735815 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0283  50S ribosomal protein L3  53.85 
 
 		 209 aa  216  2e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000156273  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4001  50S ribosomal protein L3  52.88 
 
 		 209 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000133554  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0469  50S ribosomal protein L3  52.88 
 
 		 212 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000509154  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4544  50S ribosomal protein L3  52.88 
 
 		 209 aa  214  5e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000354089  hitchhiker  0.00195748 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2559  50S ribosomal protein L3  52.88 
 
 		 211 aa  214  5.9999999999999996e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.101168  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0422  50S ribosomal protein L3  53.14 
 
 		 209 aa  214  8e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000195061  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0847  50S ribosomal protein L3P  52.4 
 
 		 214 aa  214  8e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000479377  decreased coverage  0.0000116579 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2711  50S ribosomal protein L3  53.85 
 
 		 211 aa  214  9e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000399657  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3751  50S ribosomal protein L3  52.4 
 
 		 209 aa  214  9e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000000163503  hitchhiker  0.0040389 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0393  ribosomal protein L3  52.4 
 
 		 209 aa  213  9.999999999999999e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000156822  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3744  50S ribosomal protein L3  52.88 
 
 		 209 aa  213  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00311101  normal  0.0177476 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3705  50S ribosomal protein L3  52.4 
 
 		 209 aa  213  9.999999999999999e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000030519  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3709  50S ribosomal protein L3  52.88 
 
 		 209 aa  213  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000323926  normal  0.640658 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3615  50S ribosomal protein L3  52.4 
 
 		 209 aa  213  9.999999999999999e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000666979  hitchhiker  0.00609107 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0215  50S ribosomal protein L3  53.62 
 
 		 209 aa  214  9.999999999999999e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000370606  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4643  50S ribosomal protein L3  52.4 
 
 		 209 aa  213  9.999999999999999e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000124545  normal  0.0362623 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>