More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_0105 on replicon NC_010184
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010184  BcerKBAB4_0105  50S ribosomal protein L3  100 
 
 
210 aa  421  1e-117  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000775669  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5195  50S ribosomal protein L3  100 
 
 
210 aa  421  1e-117  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000842867  unclonable  2.19314e-25 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0110  50S ribosomal protein L3  99.05 
 
 
210 aa  417  1e-116  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000528056  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0110  50S ribosomal protein L3  99.05 
 
 
210 aa  417  1e-116  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000986131  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0106  50S ribosomal protein L3  99.05 
 
 
210 aa  417  1e-116  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.6707699999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0104  50S ribosomal protein L3  99.05 
 
 
210 aa  417  1e-116  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000168091  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0141  50S ribosomal protein L3  99.05 
 
 
210 aa  417  1e-116  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000551418  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0110  50S ribosomal protein L3  99.05 
 
 
210 aa  417  1e-116  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000246604  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0131  50S ribosomal protein L3  99.05 
 
 
210 aa  417  1e-116  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000141135  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0122  50S ribosomal protein L3  99.05 
 
 
210 aa  417  1e-116  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.0599700000000001e-61 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0104  50S ribosomal protein L3  94.76 
 
 
210 aa  403  1e-111  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000119433  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0111  50S ribosomal protein L3  79.23 
 
 
211 aa  335  1.9999999999999998e-91  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000151121  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0107  50S ribosomal protein L3  79.1 
 
 
213 aa  328  5.0000000000000004e-89  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1907  50S ribosomal protein L3  74.29 
 
 
208 aa  327  8e-89  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000032853  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0058  50S ribosomal protein L3  73.81 
 
 
208 aa  326  2.0000000000000001e-88  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00491271  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0196  50S ribosomal protein L3  69.38 
 
 
228 aa  296  2e-79  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0113604  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1483  50S ribosomal protein L3  66.99 
 
 
219 aa  293  1e-78  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000163613  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2318  50S ribosomal protein L3  67.59 
 
 
220 aa  290  8e-78  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000223614  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1831  50S ribosomal protein L3  66.2 
 
 
220 aa  290  1e-77  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000207996  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2277  50S ribosomal protein L3  66.67 
 
 
220 aa  286  1e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000105261  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0422  50S ribosomal protein L3  65.22 
 
 
209 aa  286  1e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000195061  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2711  50S ribosomal protein L3  62.93 
 
 
211 aa  277  7e-74  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000399657  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1745  50S ribosomal protein L3  65.87 
 
 
210 aa  276  2e-73  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000981122  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0291  50S ribosomal protein L3  64.76 
 
 
209 aa  276  2e-73  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000100637  unclonable  1.4129e-28 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0595  50S ribosomal protein L3P  68.12 
 
 
247 aa  275  3e-73  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.000000158145  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0286  50S ribosomal protein L3  61.88 
 
 
209 aa  263  2e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0410836  hitchhiker  0.00603059 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0867  50S ribosomal protein L3  62.98 
 
 
210 aa  257  7e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000729631  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1524  50S ribosomal protein L3  61.06 
 
 
209 aa  257  7e-68  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.593746  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0225  ribosomal protein L3  59.9 
 
 
213 aa  253  1.0000000000000001e-66  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01170  50S ribosomal protein L3  59.42 
 
 
211 aa  251  5.000000000000001e-66  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000794381  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0215  50S ribosomal protein L3  59.13 
 
 
209 aa  251  6e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000370606  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2460  50S ribosomal protein L3  59.9 
 
 
209 aa  249  2e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0891685 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0194  50S ribosomal protein L3  57.49 
 
 
210 aa  244  6.999999999999999e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000719285  normal  0.0489845 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2714  50S ribosomal protein L3  55.77 
 
 
209 aa  243  1.9999999999999999e-63  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000231855  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2333  50S ribosomal protein L3  54.15 
 
 
212 aa  243  1.9999999999999999e-63  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000241734  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3667  50S ribosomal protein L3  56.4 
 
 
211 aa  242  3e-63  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000330884  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2399  50S ribosomal protein L3  55.29 
 
 
209 aa  242  3e-63  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000824684  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2903  50S ribosomal protein L3  60.85 
 
 
212 aa  241  7.999999999999999e-63  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000477342  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0696  50S ribosomal protein L3  57.77 
 
 
223 aa  237  8e-62  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.372092  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0758  50S ribosomal protein L3  55.19 
 
 
212 aa  234  5.0000000000000005e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000233446  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl123  50S ribosomal protein L3  56.8 
 
 
238 aa  230  9e-60  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  9.499549999999999e-37  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0701  50S ribosomal protein L3  54.76 
 
 
210 aa  223  1e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000481863  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3758  50S ribosomal protein L3  56.73 
 
 
219 aa  221  6e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.33789  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4915  50S ribosomal protein L3  54.25 
 
 
212 aa  219  1.9999999999999999e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0274485  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3905  50S ribosomal protein L3  55.5 
 
 
223 aa  219  1.9999999999999999e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3435  50S ribosomal protein L3  55.56 
 
 
218 aa  219  3e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1346  50S ribosomal protein L3  50.71 
 
 
211 aa  218  6e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.700686  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2232  50S ribosomal protein L3  53.08 
 
 
213 aa  218  7e-56  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.422626 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03980  LSU ribosomal protein L3P  54.59 
 
 
213 aa  217  1e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0626  50S ribosomal protein L3  51.92 
 
 
210 aa  217  1e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000331463  hitchhiker  0.000000000000331617 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0981  ribosomal protein L3  53.4 
 
 
215 aa  216  2e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.843676  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1955  50S ribosomal protein L3  49.76 
 
 
218 aa  215  4e-55  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1067  50S ribosomal protein L3  50.71 
 
 
211 aa  214  5.9999999999999996e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000374639  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1161  ribosomal protein L3  53.88 
 
 
206 aa  214  8e-55  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000266904  hitchhiker  0.000000567921 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2857  50S ribosomal protein L3  52.4 
 
 
210 aa  213  9.999999999999999e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.918611  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0790  50S ribosomal protein L3  52.15 
 
 
213 aa  213  1.9999999999999998e-54  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1867  50S ribosomal protein L3  53.77 
 
 
207 aa  212  3.9999999999999995e-54  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0222976  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3024  50S ribosomal protein L3  52.63 
 
 
210 aa  211  5.999999999999999e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.371217  hitchhiker  0.00790921 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1184  ribosomal protein L3  50.72 
 
 
209 aa  211  9e-54  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000270125  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf444  50S ribosomal protein L3  52.13 
 
 
272 aa  210  1e-53  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6614  ribosomal protein L3  53.62 
 
 
216 aa  210  1e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0376  50S ribosomal protein L3  50.24 
 
 
218 aa  210  1e-53  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20031  50S ribosomal protein L3  50.24 
 
 
218 aa  210  1e-53  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1129  50S ribosomal protein L3  49.76 
 
 
218 aa  209  2e-53  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5049  50S ribosomal protein L3  52.61 
 
 
218 aa  209  3e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.399218 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0306  50S ribosomal protein L3P  53.14 
 
 
222 aa  209  3e-53  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00207169 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23021  50S ribosomal protein L3  49.76 
 
 
218 aa  208  4e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4321  ribosomal protein L3  52.66 
 
 
216 aa  208  4e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0691  50S ribosomal protein L3  50.71 
 
 
211 aa  208  4e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00208666  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20870  LSU ribosomal protein L3P  51.94 
 
 
219 aa  208  4e-53  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.235842  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1292  50S ribosomal protein L3  50.24 
 
 
212 aa  207  6e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.0000167398  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10020  LSU ribosomal protein L3P  50.49 
 
 
206 aa  207  9e-53  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.000000402835  hitchhiker  0.00000000318342 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0953  50S ribosomal protein L3  51.96 
 
 
205 aa  207  9e-53  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000000660439  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1394  50S ribosomal protein L3  53.43 
 
 
207 aa  207  1e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000462367  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1292  50S ribosomal protein L3  53.43 
 
 
207 aa  207  1e-52  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000263563  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2907  50S ribosomal protein L3  55.07 
 
 
212 aa  206  1e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3012  50S ribosomal protein L3  49.55 
 
 
227 aa  206  2e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00913494 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0562  50S ribosomal protein L3  52.17 
 
 
218 aa  205  3e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3703  50S ribosomal protein L3  50 
 
 
212 aa  205  4e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3995  ribosomal protein L3  53.4 
 
 
208 aa  205  4e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1305  50S ribosomal protein L3  51.9 
 
 
218 aa  205  4e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.207115  normal  0.106977 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0715  ribosomal protein L3  52.66 
 
 
204 aa  205  5e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23810  LSU ribosomal protein L3P  51.46 
 
 
226 aa  204  6e-52  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2687  50S ribosomal protein L3  51.69 
 
 
216 aa  204  8e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.740328 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2324  ribosomal protein L3  54.03 
 
 
214 aa  203  1e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00000658885  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0582  50S ribosomal protein L3  52.66 
 
 
235 aa  203  1e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1615  ribosomal protein L3  52.94 
 
 
205 aa  204  1e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0587  ribosomal protein L3  51.21 
 
 
219 aa  202  2e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.295272  normal  0.46094 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0627  ribosomal protein L3  52.2 
 
 
217 aa  203  2e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0962  ribosomal protein L3  52.91 
 
 
206 aa  202  2e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000608869  hitchhiker  0.0000000000269964 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2559  50S ribosomal protein L3  50.24 
 
 
211 aa  202  3e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.101168  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3524  ribosomal protein L3  54.5 
 
 
212 aa  202  3e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.0000015584  hitchhiker  0.00000758128 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10715  50S ribosomal protein L3  50.95 
 
 
217 aa  202  4e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.249834 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1123  ribosomal protein L3  52.88 
 
 
220 aa  202  4e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0469  50S ribosomal protein L3  52.61 
 
 
212 aa  202  4e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000509154  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2975  50S ribosomal protein L3  51.21 
 
 
216 aa  202  4e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.454423  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6049  50S ribosomal protein L3  52.22 
 
 
236 aa  201  5e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.185718  normal  0.220559 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17160  50S ribosomal protein L3  50.72 
 
 
216 aa  201  6e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.283771  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1138  50S ribosomal protein L3  49.03 
 
 
207 aa  201  6e-51  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000858376  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2774  ribosomal protein L3  51.23 
 
 
210 aa  201  9e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.039291  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>