More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfl123 on replicon NC_006055
Organism: Mesoplasma florum L1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006055  Mfl123  50S ribosomal protein L3  100 
 
 		 238 aa  478  1e-134  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  9.499549999999999e-37  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0696  50S ribosomal protein L3  80.09 
 
 		 223 aa  361  7.0000000000000005e-99  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.372092  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0595  50S ribosomal protein L3P  59.8 
 
 		 247 aa  241  7.999999999999999e-63  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.000000158145  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0196  50S ribosomal protein L3  55.9 
 
 		 228 aa  241  9e-63  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0113604  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1907  50S ribosomal protein L3  58.82 
 
 		 208 aa  239  2.9999999999999997e-62  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000032853  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2711  50S ribosomal protein L3  57.97 
 
 		 211 aa  237  1e-61  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000399657  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0058  50S ribosomal protein L3  57.84 
 
 		 208 aa  236  2e-61  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00491271  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0111  50S ribosomal protein L3  58.25 
 
 		 211 aa  236  2e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000151121  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0104  50S ribosomal protein L3  57.28 
 
 		 210 aa  235  5.0000000000000005e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000119433  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0110  50S ribosomal protein L3  57.77 
 
 		 210 aa  234  6e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000528056  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0110  50S ribosomal protein L3  57.77 
 
 		 210 aa  234  6e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000986131  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0106  50S ribosomal protein L3  57.77 
 
 		 210 aa  234  6e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.6707699999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0104  50S ribosomal protein L3  57.77 
 
 		 210 aa  234  6e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000168091  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0131  50S ribosomal protein L3  57.77 
 
 		 210 aa  234  6e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000141135  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0110  50S ribosomal protein L3  57.77 
 
 		 210 aa  234  6e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000246604  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0122  50S ribosomal protein L3  57.77 
 
 		 210 aa  234  6e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.0599700000000001e-61 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0141  50S ribosomal protein L3  57.77 
 
 		 210 aa  234  6e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000551418  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1483  50S ribosomal protein L3  56.34 
 
 		 219 aa  232  3e-60  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000163613  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5195  50S ribosomal protein L3  56.8 
 
 		 210 aa  231  1e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000842867  unclonable  2.19314e-25 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0105  50S ribosomal protein L3  56.8 
 
 		 210 aa  231  1e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000775669  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0107  50S ribosomal protein L3  56.78 
 
 		 213 aa  225  4e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf444  50S ribosomal protein L3  51.82 
 
 		 272 aa  214  9.999999999999999e-55  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0286  50S ribosomal protein L3  55.72 
 
 		 209 aa  213  1.9999999999999998e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0410836  hitchhiker  0.00603059 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1831  50S ribosomal protein L3  53.02 
 
 		 220 aa  212  3.9999999999999995e-54  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000207996  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01170  50S ribosomal protein L3  52.38 
 
 		 211 aa  212  4.9999999999999996e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000794381  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2333  50S ribosomal protein L3  51.94 
 
 		 212 aa  209  4e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000241734  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0867  50S ribosomal protein L3  53.14 
 
 		 210 aa  208  5e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000729631  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3667  50S ribosomal protein L3  54.11 
 
 		 211 aa  208  6e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000330884  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0291  50S ribosomal protein L3  55.12 
 
 		 209 aa  208  7e-53  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000100637  unclonable  1.4129e-28 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2318  50S ribosomal protein L3  52.09 
 
 		 220 aa  206  2e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000223614  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2714  50S ribosomal protein L3  54.11 
 
 		 209 aa  206  4e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000231855  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2399  50S ribosomal protein L3  53.62 
 
 		 209 aa  205  5e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000824684  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2277  50S ribosomal protein L3  51.16 
 
 		 220 aa  202  5e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000105261  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0215  50S ribosomal protein L3  51.94 
 
 		 209 aa  200  9.999999999999999e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000370606  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0758  50S ribosomal protein L3  50.24 
 
 		 212 aa  200  1.9999999999999998e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000233446  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1524  50S ribosomal protein L3  51.21 
 
 		 209 aa  198  6e-50  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.593746  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2460  50S ribosomal protein L3  50.72 
 
 		 209 aa  197  9e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0891685 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0422  50S ribosomal protein L3  50.97 
 
 		 209 aa  196  3e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000195061  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0225  ribosomal protein L3  48.31 
 
 		 213 aa  195  5.000000000000001e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1745  50S ribosomal protein L3  49.76 
 
 		 210 aa  193  2e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000981122  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0960  50S ribosomal protein L3  51.18 
 
 		 214 aa  190  1e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000067151  hitchhiker  0.000000166028 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2903  50S ribosomal protein L3  49.28 
 
 		 212 aa  189  2e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000477342  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0489  50S ribosomal protein L3  47.34 
 
 		 206 aa  188  8e-47  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.525282  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0226  50S ribosomal protein L3  49.76 
 
 		 233 aa  188  8e-47  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  hitchhiker  0.00275796  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0194  50S ribosomal protein L3  47.37 
 
 		 210 aa  186  4e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000719285  normal  0.0489845 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1836  50S ribosomal protein L3  47.18 
 
 		 217 aa  184  9e-46  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00718997  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0701  50S ribosomal protein L3  46.86 
 
 		 210 aa  181  6e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000481863  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0981  ribosomal protein L3  47.37 
 
 		 215 aa  180  2e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.843676  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001742  LSU ribosomal protein L3p (L3e)  49.76 
 
 		 209 aa  180  2e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000145621  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2324  ribosomal protein L3  49.05 
 
 		 215 aa  179  4.999999999999999e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000235705  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2174  50S ribosomal protein L3  49.28 
 
 		 209 aa  178  7e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000029924  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00730  50S ribosomal protein L3  48.8 
 
 		 209 aa  177  1e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1867  50S ribosomal protein L3  48.31 
 
 		 207 aa  177  1e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0222976  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2857  50S ribosomal protein L3  45.89 
 
 		 210 aa  176  4e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.918611  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0320  50S ribosomal protein L3  49.28 
 
 		 209 aa  176  4e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0285067  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0756  50S ribosomal protein L3  46.34 
 
 		 216 aa  176  4e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000385888  normal  0.0180173 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0306  50S ribosomal protein L3P  45.07 
 
 		 222 aa  176  4e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00207169 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2324  ribosomal protein L3  47.37 
 
 		 214 aa  175  5e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00000658885  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3435  50S ribosomal protein L3  47.17 
 
 		 218 aa  174  7e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03980  LSU ribosomal protein L3P  44.76 
 
 		 213 aa  174  8e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0790  50S ribosomal protein L3  45.67 
 
 		 213 aa  174  1.9999999999999998e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1955  50S ribosomal protein L3  45.15 
 
 		 218 aa  173  1.9999999999999998e-42  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2232  50S ribosomal protein L3  47.67 
 
 		 213 aa  173  1.9999999999999998e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.422626 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4321  ribosomal protein L3  45.45 
 
 		 216 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1184  ribosomal protein L3  48.77 
 
 		 209 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000270125  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3909  50S ribosomal protein L3  47.57 
 
 		 209 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.031884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4276  ribosomal protein L3  47.34 
 
 		 212 aa  172  3.9999999999999995e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000028687  unclonable  0.00000000000491767 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0454  50S ribosomal protein L3  47.57 
 
 		 211 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00952841  unclonable  0.000000209689 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0484  50S ribosomal protein L3  47.57 
 
 		 211 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000200613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0487  50S ribosomal protein L3  47.57 
 
 		 211 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000838631  normal  0.0709669 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1292  50S ribosomal protein L3  44.78 
 
 		 212 aa  172  3.9999999999999995e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.0000167398  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4749  50S ribosomal protein L3  48.06 
 
 		 211 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000212363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2646  50S ribosomal protein L3  46.19 
 
 		 216 aa  171  7.999999999999999e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.334348  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1292  50S ribosomal protein L3  47.8 
 
 		 207 aa  171  9e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000263563  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1394  50S ribosomal protein L3  47.8 
 
 		 207 aa  171  9e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000462367  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20031  50S ribosomal protein L3  44.91 
 
 		 218 aa  171  1e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5124  50S ribosomal protein L3  46.92 
 
 		 216 aa  171  1e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0497  50S ribosomal protein L3  43.75 
 
 		 210 aa  170  1e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.443535  hitchhiker  0.00000000471094 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0327  50S ribosomal protein L3  43.75 
 
 		 210 aa  170  1e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.322183  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23021  50S ribosomal protein L3  44.06 
 
 		 218 aa  171  1e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0192  ribosomal protein L3  47.83 
 
 		 208 aa  170  2e-41  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6614  ribosomal protein L3  45.28 
 
 		 216 aa  170  2e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4690  50S ribosomal protein L3  46.89 
 
 		 212 aa  170  2e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000266431  unclonable  0.0000000247869 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1129  50S ribosomal protein L3  45.05 
 
 		 218 aa  169  3e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0469  50S ribosomal protein L3  47.85 
 
 		 212 aa  169  3e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000509154  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1707  50S ribosomal protein L3  46.89 
 
 		 213 aa  169  3e-41  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00287886  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0426  50S ribosomal protein L3  46.41 
 
 		 212 aa  169  4e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000808775  hitchhiker  0.0000319768 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3758  50S ribosomal protein L3  47.39 
 
 		 219 aa  169  4e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.33789  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1123  ribosomal protein L3  46.45 
 
 		 220 aa  169  4e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0158  50S ribosomal protein L3  46.89 
 
 		 212 aa  169  4e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000206645  decreased coverage  0.0000470561 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3995  ribosomal protein L3  48.31 
 
 		 208 aa  169  4e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1161  ribosomal protein L3  47.26 
 
 		 206 aa  169  4e-41  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000266904  hitchhiker  0.000000567921 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0587  ribosomal protein L3  44.81 
 
 		 219 aa  169  5e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.295272  normal  0.46094 
 
 
-
 
NC_002950  PG1938  50S ribosomal protein L3  47.96 
 
 		 205 aa  168  6e-41  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0477  ribosomal protein L3  42.36 
 
 		 245 aa  168  6e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0304  ribosomal protein L3  43.14 
 
 		 211 aa  168  6e-41  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.234109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1086  LSU ribosomal protein L3P  45.45 
 
 		 217 aa  168  7e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.10406 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0931  ribosomal protein L3  45.45 
 
 		 215 aa  168  7e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.15696  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0562  50S ribosomal protein L3  46.89 
 
 		 218 aa  167  9e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4913  50S ribosomal protein L3  44.5 
 
 		 226 aa  167  1e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00251627  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>