More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_0192 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013515  Smon_0192  ribosomal protein L3  100 
 
 
208 aa  410  1e-113  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3995  ribosomal protein L3  83.65 
 
 
208 aa  358  5e-98  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4321  ribosomal protein L3  48.06 
 
 
216 aa  210  1e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3758  50S ribosomal protein L3  50.97 
 
 
219 aa  209  3e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.33789  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3667  50S ribosomal protein L3  51.94 
 
 
211 aa  202  2e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000330884  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3435  50S ribosomal protein L3  48.54 
 
 
218 aa  202  3e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03980  LSU ribosomal protein L3P  48.54 
 
 
213 aa  202  4e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0110  50S ribosomal protein L3  52.91 
 
 
210 aa  200  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000528056  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0110  50S ribosomal protein L3  52.91 
 
 
210 aa  200  9.999999999999999e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000986131  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0106  50S ribosomal protein L3  52.91 
 
 
210 aa  200  9.999999999999999e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.6707699999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0104  50S ribosomal protein L3  52.91 
 
 
210 aa  200  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000168091  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0131  50S ribosomal protein L3  52.91 
 
 
210 aa  200  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000141135  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0141  50S ribosomal protein L3  52.91 
 
 
210 aa  200  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000551418  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0110  50S ribosomal protein L3  52.91 
 
 
210 aa  200  9.999999999999999e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000246604  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0286  50S ribosomal protein L3  53.4 
 
 
209 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0410836  hitchhiker  0.00603059 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0122  50S ribosomal protein L3  52.91 
 
 
210 aa  200  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.0599700000000001e-61 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0981  ribosomal protein L3  49.76 
 
 
215 aa  199  1.9999999999999998e-50  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.843676  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4507  50S ribosomal protein L3  48.54 
 
 
221 aa  199  1.9999999999999998e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.787031  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0215  50S ribosomal protein L3  53.4 
 
 
209 aa  199  3e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000370606  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0105  50S ribosomal protein L3  52.43 
 
 
210 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000775669  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5195  50S ribosomal protein L3  52.43 
 
 
210 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000842867  unclonable  2.19314e-25 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6614  ribosomal protein L3  48.54 
 
 
216 aa  198  6e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0104  50S ribosomal protein L3  51.46 
 
 
210 aa  197  6e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000119433  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2659  50S ribosomal protein L3  49.03 
 
 
219 aa  197  7.999999999999999e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0790  50S ribosomal protein L3  51.22 
 
 
213 aa  197  9e-50  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2333  50S ribosomal protein L3  50.49 
 
 
212 aa  197  1.0000000000000001e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000241734  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23810  LSU ribosomal protein L3P  48.06 
 
 
226 aa  197  1.0000000000000001e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0111  50S ribosomal protein L3  50 
 
 
211 aa  196  2.0000000000000003e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000151121  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1305  50S ribosomal protein L3  46.67 
 
 
218 aa  196  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.207115  normal  0.106977 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0953  50S ribosomal protein L3  49.51 
 
 
205 aa  196  3e-49  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000000660439  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0562  50S ribosomal protein L3  47.34 
 
 
218 aa  196  3e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5049  50S ribosomal protein L3  46.92 
 
 
218 aa  195  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.399218 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1184  ribosomal protein L3  49.02 
 
 
209 aa  195  5.000000000000001e-49  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000270125  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10715  50S ribosomal protein L3  46.19 
 
 
217 aa  194  6e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.249834 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2399  50S ribosomal protein L3  50.97 
 
 
209 aa  194  7e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000824684  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0931  ribosomal protein L3  47.34 
 
 
215 aa  193  1e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.15696  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3143  ribosomal protein L3  46.38 
 
 
220 aa  194  1e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0896196  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0701  50S ribosomal protein L3  51.21 
 
 
210 aa  193  1e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000481863  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2714  50S ribosomal protein L3  50.97 
 
 
209 aa  193  1e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000231855  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1745  50S ribosomal protein L3  50.97 
 
 
210 aa  192  2e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000981122  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1086  LSU ribosomal protein L3P  47.34 
 
 
217 aa  192  3e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.10406 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1123  ribosomal protein L3  48.31 
 
 
220 aa  192  3e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0422  50S ribosomal protein L3  48.54 
 
 
209 aa  191  5e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000195061  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1394  50S ribosomal protein L3  50.98 
 
 
207 aa  191  5e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000462367  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1292  50S ribosomal protein L3  50.98 
 
 
207 aa  191  5e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000263563  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0323  ribosomal protein L3  50.49 
 
 
209 aa  191  6e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000222247  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1138  50S ribosomal protein L3  44.93 
 
 
207 aa  191  7e-48  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000858376  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0627  ribosomal protein L3  47.57 
 
 
217 aa  191  9e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17160  50S ribosomal protein L3  46.6 
 
 
216 aa  190  1e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.283771  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2460  50S ribosomal protein L3  50 
 
 
209 aa  190  1e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0891685 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0867  50S ribosomal protein L3  50 
 
 
210 aa  190  1e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000729631  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01170  50S ribosomal protein L3  49.28 
 
 
211 aa  190  1e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000794381  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4315  50S ribosomal protein L3  46.27 
 
 
219 aa  189  2e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00341518 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1524  50S ribosomal protein L3  50.97 
 
 
209 aa  190  2e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.593746  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1040  50S ribosomal protein L3  45.24 
 
 
217 aa  189  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0587  ribosomal protein L3  46.6 
 
 
219 aa  189  2.9999999999999997e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.295272  normal  0.46094 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1013  50S ribosomal protein L3  45.24 
 
 
217 aa  189  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0306  50S ribosomal protein L3P  45.63 
 
 
222 aa  189  2.9999999999999997e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00207169 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1030  50S ribosomal protein L3  45.24 
 
 
217 aa  189  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0405  ribosomal protein L3  50 
 
 
209 aa  188  4e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00399178  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2711  50S ribosomal protein L3  47.34 
 
 
211 aa  188  4e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000399657  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2903  50S ribosomal protein L3  51.43 
 
 
212 aa  188  4e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000477342  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29740  LSU ribosomal protein L3P  47.09 
 
 
219 aa  188  4e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.378005 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3905  50S ribosomal protein L3  46.6 
 
 
223 aa  188  5.999999999999999e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0107  50S ribosomal protein L3  50.5 
 
 
213 aa  187  7e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0180  50S ribosomal protein L3  48.56 
 
 
209 aa  187  9e-47  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00021825  normal  0.996112 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3923  50S ribosomal protein L3  46.27 
 
 
219 aa  187  1e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2646  50S ribosomal protein L3  47.09 
 
 
216 aa  186  2e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.334348  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0397  50S ribosomal protein L3  52.45 
 
 
205 aa  186  2e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2324  ribosomal protein L3  48.56 
 
 
214 aa  185  4e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00000658885  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1831  50S ribosomal protein L3  49.3 
 
 
220 aa  184  8e-46  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000207996  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1867  50S ribosomal protein L3  48.54 
 
 
207 aa  183  2.0000000000000003e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0222976  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0079  50S ribosomal protein L3  47.78 
 
 
209 aa  182  3e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.145283 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4001  50S ribosomal protein L3  48.54 
 
 
209 aa  182  3e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000133554  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6049  50S ribosomal protein L3  44.83 
 
 
236 aa  182  3e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.185718  normal  0.220559 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3915  50S ribosomal protein L3  48.54 
 
 
209 aa  182  4.0000000000000006e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  5.44377e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3822  50S ribosomal protein L3  48.54 
 
 
209 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000994751  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20870  LSU ribosomal protein L3P  43.2 
 
 
219 aa  182  4.0000000000000006e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.235842  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0283  50S ribosomal protein L3  48.54 
 
 
209 aa  182  4.0000000000000006e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000156273  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0320  50S ribosomal protein L3  48.06 
 
 
209 aa  182  4.0000000000000006e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0285067  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1067  50S ribosomal protein L3  47.09 
 
 
211 aa  182  4.0000000000000006e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000374639  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0584  50S ribosomal protein L3  48.54 
 
 
209 aa  182  4.0000000000000006e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000000183333  normal  0.0735815 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1147  50S ribosomal protein L3  50.98 
 
 
205 aa  181  6e-45  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000530687  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0582  50S ribosomal protein L3  44.44 
 
 
235 aa  181  6e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2229  50S ribosomal protein L3  49.04 
 
 
209 aa  181  6e-45  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000790762  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2975  50S ribosomal protein L3  45.63 
 
 
216 aa  181  6e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.454423  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6721  50S ribosomal protein L3  46.19 
 
 
243 aa  181  6e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0758  50S ribosomal protein L3  48.31 
 
 
212 aa  181  7e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000233446  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1836  50S ribosomal protein L3  46.43 
 
 
217 aa  181  1e-44  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00718997  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1765  50S ribosomal protein L3  48.28 
 
 
209 aa  180  1e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.0000837732  normal  0.643205 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1854  50S ribosomal protein L3  47.37 
 
 
217 aa  179  2e-44  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000292484  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2174  50S ribosomal protein L3  47.09 
 
 
209 aa  180  2e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000029924  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0279  50S ribosomal protein L3  45.19 
 
 
214 aa  179  2e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000003338  unclonable  0.000000102958 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5124  50S ribosomal protein L3  45.15 
 
 
216 aa  179  2e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0059  50S ribosomal protein L3  49.51 
 
 
208 aa  179  2e-44  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000158228  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0304  ribosomal protein L3  46.41 
 
 
211 aa  179  2e-44  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.234109  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3514  50S ribosomal protein L3  48.54 
 
 
209 aa  179  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000214725  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3703  50S ribosomal protein L3  47.52 
 
 
212 aa  179  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0960  50S ribosomal protein L3  47.57 
 
 
214 aa  179  2.9999999999999997e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000067151  hitchhiker  0.000000166028 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4643  50S ribosomal protein L3  48.54 
 
 
209 aa  179  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000124545  normal  0.0362623 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>