More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_3995 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_3995  ribosomal protein L3  100 
 
 
208 aa  413  1e-114  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0192  ribosomal protein L3  83.65 
 
 
208 aa  358  5e-98  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4321  ribosomal protein L3  53.4 
 
 
216 aa  218  7e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03980  LSU ribosomal protein L3P  51.94 
 
 
213 aa  210  1e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2659  50S ribosomal protein L3  52.91 
 
 
219 aa  210  1e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0790  50S ribosomal protein L3  54.15 
 
 
213 aa  209  3e-53  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0953  50S ribosomal protein L3  51.96 
 
 
205 aa  207  6e-53  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000000660439  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6614  ribosomal protein L3  50.97 
 
 
216 aa  207  9e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0931  ribosomal protein L3  52.66 
 
 
215 aa  207  1e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.15696  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0141  50S ribosomal protein L3  53.88 
 
 
210 aa  206  2e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000551418  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0110  50S ribosomal protein L3  53.88 
 
 
210 aa  206  2e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000528056  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3758  50S ribosomal protein L3  50.49 
 
 
219 aa  206  2e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.33789  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0110  50S ribosomal protein L3  53.88 
 
 
210 aa  206  2e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000986131  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0106  50S ribosomal protein L3  53.88 
 
 
210 aa  206  2e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.6707699999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0104  50S ribosomal protein L3  53.88 
 
 
210 aa  206  2e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000168091  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0110  50S ribosomal protein L3  53.88 
 
 
210 aa  206  2e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000246604  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0131  50S ribosomal protein L3  53.88 
 
 
210 aa  206  2e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000141135  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1394  50S ribosomal protein L3  54.41 
 
 
207 aa  206  2e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000462367  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1292  50S ribosomal protein L3  54.41 
 
 
207 aa  206  2e-52  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000263563  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0122  50S ribosomal protein L3  53.88 
 
 
210 aa  206  2e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.0599700000000001e-61 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0111  50S ribosomal protein L3  51.94 
 
 
211 aa  205  3e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000151121  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2333  50S ribosomal protein L3  54.59 
 
 
212 aa  205  3e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000241734  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0627  ribosomal protein L3  51.46 
 
 
217 aa  205  3e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0105  50S ribosomal protein L3  53.4 
 
 
210 aa  205  4e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000775669  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5195  50S ribosomal protein L3  53.4 
 
 
210 aa  205  4e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000842867  unclonable  2.19314e-25 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4507  50S ribosomal protein L3  51.94 
 
 
221 aa  203  1e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.787031  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0701  50S ribosomal protein L3  53.62 
 
 
210 aa  203  1e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000481863  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23810  LSU ribosomal protein L3P  51.46 
 
 
226 aa  203  1e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0286  50S ribosomal protein L3  56.31 
 
 
209 aa  204  1e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0410836  hitchhiker  0.00603059 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0104  50S ribosomal protein L3  51.94 
 
 
210 aa  202  2e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000119433  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1745  50S ribosomal protein L3  55.34 
 
 
210 aa  202  3e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000981122  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1138  50S ribosomal protein L3  47.34 
 
 
207 aa  202  3e-51  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000858376  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0981  ribosomal protein L3  50.72 
 
 
215 aa  201  5e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.843676  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0562  50S ribosomal protein L3  50.24 
 
 
218 aa  201  5e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0215  50S ribosomal protein L3  53.88 
 
 
209 aa  201  6e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000370606  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0867  50S ribosomal protein L3  54.81 
 
 
210 aa  201  6e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000729631  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1184  ribosomal protein L3  51.47 
 
 
209 aa  200  9.999999999999999e-51  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000270125  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3905  50S ribosomal protein L3  49.51 
 
 
223 aa  200  9.999999999999999e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0422  50S ribosomal protein L3  50.97 
 
 
209 aa  199  1.9999999999999998e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000195061  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2711  50S ribosomal protein L3  50.24 
 
 
211 aa  199  3e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000399657  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2460  50S ribosomal protein L3  53.4 
 
 
209 aa  198  3.9999999999999996e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0891685 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1123  ribosomal protein L3  49.76 
 
 
220 aa  197  7e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2903  50S ribosomal protein L3  54.07 
 
 
212 aa  197  7e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000477342  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3143  ribosomal protein L3  48.31 
 
 
220 aa  197  7e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0896196  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3435  50S ribosomal protein L3  49.03 
 
 
218 aa  197  7e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1086  LSU ribosomal protein L3P  47.34 
 
 
217 aa  197  1.0000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.10406 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1831  50S ribosomal protein L3  51.16 
 
 
220 aa  196  2.0000000000000003e-49  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000207996  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01170  50S ribosomal protein L3  53.14 
 
 
211 aa  196  2.0000000000000003e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000794381  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10715  50S ribosomal protein L3  47.14 
 
 
217 aa  196  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.249834 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3667  50S ribosomal protein L3  52.91 
 
 
211 aa  196  3e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000330884  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5049  50S ribosomal protein L3  48.82 
 
 
218 aa  195  3e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.399218 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0587  ribosomal protein L3  49.03 
 
 
219 aa  196  3e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.295272  normal  0.46094 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0107  50S ribosomal protein L3  52 
 
 
213 aa  195  4.0000000000000005e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17160  50S ribosomal protein L3  49.51 
 
 
216 aa  195  4.0000000000000005e-49  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.283771  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2975  50S ribosomal protein L3  50 
 
 
216 aa  195  4.0000000000000005e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.454423  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4315  50S ribosomal protein L3  48.76 
 
 
219 aa  194  5.000000000000001e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00341518 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0180  50S ribosomal protein L3  50.96 
 
 
209 aa  194  5.000000000000001e-49  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00021825  normal  0.996112 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1524  50S ribosomal protein L3  52.66 
 
 
209 aa  194  7e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.593746  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20870  LSU ribosomal protein L3P  46.6 
 
 
219 aa  193  1e-48  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.235842  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1867  50S ribosomal protein L3  50.73 
 
 
207 aa  193  1e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0222976  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1305  50S ribosomal protein L3  47.62 
 
 
218 aa  193  1e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.207115  normal  0.106977 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29740  LSU ribosomal protein L3P  48.06 
 
 
219 aa  192  2e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.378005 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0194  50S ribosomal protein L3  52.91 
 
 
210 aa  192  2e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000719285  normal  0.0489845 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0306  50S ribosomal protein L3P  48.54 
 
 
222 aa  192  2e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00207169 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3923  50S ribosomal protein L3  48.76 
 
 
219 aa  193  2e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2857  50S ribosomal protein L3  50.49 
 
 
210 aa  192  3e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.918611  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0758  50S ribosomal protein L3  51.69 
 
 
212 aa  192  3e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000233446  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1836  50S ribosomal protein L3  51.02 
 
 
217 aa  191  5e-48  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00718997  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2399  50S ribosomal protein L3  51.94 
 
 
209 aa  191  5e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000824684  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1938  50S ribosomal protein L3  54.85 
 
 
205 aa  191  6e-48  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2687  50S ribosomal protein L3  49.51 
 
 
216 aa  191  6e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.740328 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6721  50S ribosomal protein L3  49.76 
 
 
243 aa  191  6e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1707  50S ribosomal protein L3  49.03 
 
 
213 aa  191  7e-48  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00287886  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1067  50S ribosomal protein L3  51.94 
 
 
211 aa  191  8e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000374639  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2318  50S ribosomal protein L3  50.23 
 
 
220 aa  190  1e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000223614  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2714  50S ribosomal protein L3  51.94 
 
 
209 aa  190  1e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000231855  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0626  50S ribosomal protein L3  50.49 
 
 
210 aa  189  2e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000331463  hitchhiker  0.000000000000331617 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1147  50S ribosomal protein L3  53.92 
 
 
205 aa  189  2e-47  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000530687  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0397  50S ribosomal protein L3  55.39 
 
 
205 aa  189  2.9999999999999997e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0688  ribosomal protein L3  46.6 
 
 
219 aa  189  2.9999999999999997e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.409644 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2646  50S ribosomal protein L3  49.03 
 
 
216 aa  189  4e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.334348  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6049  50S ribosomal protein L3  48.51 
 
 
236 aa  188  4e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.185718  normal  0.220559 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1013  50S ribosomal protein L3  46.67 
 
 
217 aa  189  4e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1040  50S ribosomal protein L3  46.67 
 
 
217 aa  189  4e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1030  50S ribosomal protein L3  46.67 
 
 
217 aa  189  4e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0323  ribosomal protein L3  51.94 
 
 
209 aa  187  5.999999999999999e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000222247  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0933  50S ribosomal protein L3  51.94 
 
 
211 aa  187  5.999999999999999e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00137042  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0582  50S ribosomal protein L3  47.34 
 
 
235 aa  187  8e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0583  50S ribosomal protein L3  50.48 
 
 
290 aa  187  9e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4915  50S ribosomal protein L3  49.51 
 
 
212 aa  187  1e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0274485  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3024  50S ribosomal protein L3  48.54 
 
 
210 aa  187  1e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.371217  hitchhiker  0.00790921 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05715  50S ribosomal protein L3  53.43 
 
 
205 aa  187  1e-46  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.499117  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3328  50S ribosomal protein L3  51.94 
 
 
211 aa  186  2e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000332976 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2277  50S ribosomal protein L3  48.37 
 
 
220 aa  186  2e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000105261  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0847  50S ribosomal protein L3P  45.89 
 
 
214 aa  186  2e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000479377  decreased coverage  0.0000116579 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5124  50S ribosomal protein L3  47.57 
 
 
216 aa  185  3e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2229  50S ribosomal protein L3  50.48 
 
 
209 aa  185  4e-46  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000790762  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0289  50S ribosomal protein L3  50.5 
 
 
209 aa  184  6e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1185  50S ribosomal protein L3  48.06 
 
 
210 aa  184  7e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0715  ribosomal protein L3  50.98 
 
 
204 aa  184  7e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>