More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_1184 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013522  Taci_1184  ribosomal protein L3  100 
 
 		 209 aa  419  1e-116  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000270125  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1745  50S ribosomal protein L3  56.25 
 
 		 210 aa  252  3e-66  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000981122  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0562  50S ribosomal protein L3  59.31 
 
 		 218 aa  247  1e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4321  ribosomal protein L3  59.31 
 
 		 216 aa  246  2e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1086  LSU ribosomal protein L3P  59.02 
 
 		 217 aa  244  9e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.10406 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0286  50S ribosomal protein L3  58.33 
 
 		 209 aa  242  1.9999999999999999e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0410836  hitchhiker  0.00603059 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0306  50S ribosomal protein L3P  58.54 
 
 		 222 aa  243  1.9999999999999999e-63  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00207169 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0422  50S ribosomal protein L3  56.1 
 
 		 209 aa  239  2e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000195061  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0867  50S ribosomal protein L3  55.29 
 
 		 210 aa  234  5.0000000000000005e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000729631  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03980  LSU ribosomal protein L3P  56.1 
 
 		 213 aa  233  1.0000000000000001e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0215  50S ribosomal protein L3  55.56 
 
 		 209 aa  233  2.0000000000000002e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000370606  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0225  ribosomal protein L3  56.52 
 
 		 213 aa  232  3e-60  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3667  50S ribosomal protein L3  51.21 
 
 		 211 aa  231  6e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000330884  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3435  50S ribosomal protein L3  55.88 
 
 		 218 aa  231  8.000000000000001e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1292  50S ribosomal protein L3  58.62 
 
 		 207 aa  230  9e-60  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000263563  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1394  50S ribosomal protein L3  58.62 
 
 		 207 aa  230  9e-60  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000462367  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4915  50S ribosomal protein L3  51.92 
 
 		 212 aa  230  1e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0274485  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3024  50S ribosomal protein L3  52.66 
 
 		 210 aa  230  1e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.371217  hitchhiker  0.00790921 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2903  50S ribosomal protein L3  54.85 
 
 		 212 aa  229  2e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000477342  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1305  50S ribosomal protein L3  54.59 
 
 		 218 aa  228  4e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.207115  normal  0.106977 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6614  ribosomal protein L3  55.61 
 
 		 216 aa  228  5e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1524  50S ribosomal protein L3  54.41 
 
 		 209 aa  227  9e-59  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.593746  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5049  50S ribosomal protein L3  54.81 
 
 		 218 aa  227  1e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.399218 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0790  50S ribosomal protein L3  53.66 
 
 		 213 aa  226  2e-58  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10715  50S ribosomal protein L3  53.14 
 
 		 217 aa  226  2e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.249834 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0953  50S ribosomal protein L3  56.65 
 
 		 205 aa  226  2e-58  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000000660439  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1867  50S ribosomal protein L3  57.21 
 
 		 207 aa  225  3e-58  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0222976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1185  50S ribosomal protein L3  53.14 
 
 		 210 aa  225  3e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23810  LSU ribosomal protein L3P  54.41 
 
 		 226 aa  225  4e-58  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2646  50S ribosomal protein L3  54.41 
 
 		 216 aa  224  5.0000000000000005e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.334348  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20870  LSU ribosomal protein L3P  51.71 
 
 		 219 aa  224  5.0000000000000005e-58  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.235842  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2907  50S ribosomal protein L3  57.56 
 
 		 212 aa  225  5.0000000000000005e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3758  50S ribosomal protein L3  51.94 
 
 		 219 aa  224  6e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.33789  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1040  50S ribosomal protein L3  53.62 
 
 		 217 aa  224  7e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1013  50S ribosomal protein L3  53.62 
 
 		 217 aa  224  7e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1030  50S ribosomal protein L3  53.62 
 
 		 217 aa  224  7e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1836  50S ribosomal protein L3  52.5 
 
 		 217 aa  223  1e-57  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00718997  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17160  50S ribosomal protein L3  51.96 
 
 		 216 aa  223  2e-57  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.283771  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1123  ribosomal protein L3  57.07 
 
 		 220 aa  223  2e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4507  50S ribosomal protein L3  55.88 
 
 		 221 aa  222  3e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.787031  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3923  50S ribosomal protein L3  56.93 
 
 		 219 aa  222  3e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10020  LSU ribosomal protein L3P  51.69 
 
 		 206 aa  222  3e-57  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.000000402835  hitchhiker  0.00000000318342 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1161  ribosomal protein L3  54.11 
 
 		 206 aa  221  6e-57  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000266904  hitchhiker  0.000000567921 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0691  50S ribosomal protein L3  51.96 
 
 		 211 aa  221  8e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00208666  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5124  50S ribosomal protein L3  53.43 
 
 		 216 aa  221  9e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2714  50S ribosomal protein L3  53.62 
 
 		 209 aa  220  9.999999999999999e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000231855  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1555  ribosomal protein L3  49.76 
 
 		 210 aa  220  9.999999999999999e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00791107  normal  0.982603 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0931  ribosomal protein L3  53.43 
 
 		 215 aa  220  9.999999999999999e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.15696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4315  50S ribosomal protein L3  55.94 
 
 		 219 aa  219  1.9999999999999999e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00341518 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0079  50S ribosomal protein L3  52.94 
 
 		 209 aa  219  1.9999999999999999e-56  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.145283 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2559  50S ribosomal protein L3  52.45 
 
 		 211 aa  219  1.9999999999999999e-56  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.101168  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01170  50S ribosomal protein L3  50.72 
 
 		 211 aa  219  1.9999999999999999e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000794381  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2460  50S ribosomal protein L3  52.66 
 
 		 209 aa  219  1.9999999999999999e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0891685 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0111  50S ribosomal protein L3  52.17 
 
 		 211 aa  219  1.9999999999999999e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000151121  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2399  50S ribosomal protein L3  52.66 
 
 		 209 aa  219  3e-56  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000824684  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1185  50S ribosomal protein L3  57.35 
 
 		 220 aa  219  3e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.108943 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0582  50S ribosomal protein L3  53.66 
 
 		 235 aa  218  3.9999999999999997e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4026  50S ribosomal protein L3  50.72 
 
 		 210 aa  218  5e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000729954 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3143  ribosomal protein L3  53.43 
 
 		 220 aa  218  6e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0896196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1067  50S ribosomal protein L3  51.21 
 
 		 211 aa  218  7e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000374639  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6049  50S ribosomal protein L3  52.48 
 
 		 236 aa  216  1e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.185718  normal  0.220559 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0708  50S ribosomal protein L3  50.97 
 
 		 208 aa  216  2e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00455924  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3905  50S ribosomal protein L3  52.2 
 
 		 223 aa  216  2e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0587  ribosomal protein L3  51.72 
 
 		 219 aa  215  2.9999999999999998e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.295272  normal  0.46094 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29740  LSU ribosomal protein L3P  52.45 
 
 		 219 aa  215  4e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.378005 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0104  50S ribosomal protein L3  51.21 
 
 		 210 aa  215  4e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000119433  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0715  ribosomal protein L3  54.11 
 
 		 204 aa  214  5.9999999999999996e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0458  50S ribosomal protein L3P  51.67 
 
 		 218 aa  214  5.9999999999999996e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.310193  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2324  ribosomal protein L3  51.69 
 
 		 214 aa  214  9.999999999999999e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00000658885  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0107  50S ribosomal protein L3  52.43 
 
 		 213 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0110  50S ribosomal protein L3  51.21 
 
 		 210 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000528056  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0131  50S ribosomal protein L3  51.21 
 
 		 210 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000141135  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0141  50S ribosomal protein L3  51.21 
 
 		 210 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000551418  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0122  50S ribosomal protein L3  51.21 
 
 		 210 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.0599700000000001e-61 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0110  50S ribosomal protein L3  51.21 
 
 		 210 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000986131  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0106  50S ribosomal protein L3  51.21 
 
 		 210 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.6707699999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0104  50S ribosomal protein L3  51.21 
 
 		 210 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000168091  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0110  50S ribosomal protein L3  51.21 
 
 		 210 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000246604  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20031  50S ribosomal protein L3  47.83 
 
 		 218 aa  212  2.9999999999999995e-54  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0469  50S ribosomal protein L3  51.2 
 
 		 212 aa  212  2.9999999999999995e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000509154  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1938  50S ribosomal protein L3  52.94 
 
 		 205 aa  212  3.9999999999999995e-54  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1129  50S ribosomal protein L3  47.34 
 
 		 218 aa  212  3.9999999999999995e-54  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1138  50S ribosomal protein L3  50.74 
 
 		 207 aa  212  3.9999999999999995e-54  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000858376  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0701  50S ribosomal protein L3  50.96 
 
 		 210 aa  211  5.999999999999999e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000481863  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5195  50S ribosomal protein L3  50.72 
 
 		 210 aa  211  9e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000842867  unclonable  2.19314e-25 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0105  50S ribosomal protein L3  50.72 
 
 		 210 aa  211  9e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000775669  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2333  50S ribosomal protein L3  49.26 
 
 		 212 aa  210  1e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000241734  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2975  50S ribosomal protein L3  50 
 
 		 216 aa  210  1e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.454423  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2065  50S ribosomal protein L3  47.34 
 
 		 209 aa  210  1e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.00000000000562685  normal  0.223373 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2687  50S ribosomal protein L3  49.51 
 
 		 216 aa  210  2e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.740328 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2711  50S ribosomal protein L3  53.92 
 
 		 211 aa  209  2e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000399657  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2619  50S ribosomal protein L3  53.88 
 
 		 214 aa  209  3e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0132285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1946  50S ribosomal protein L3  51.69 
 
 		 227 aa  209  3e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1292  50S ribosomal protein L3  47.83 
 
 		 212 aa  208  5e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.0000167398  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0627  ribosomal protein L3  51.47 
 
 		 217 aa  208  5e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2857  50S ribosomal protein L3  48.29 
 
 		 210 aa  207  7e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.918611  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2324  ribosomal protein L3  49.76 
 
 		 215 aa  207  7e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000235705  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1955  50S ribosomal protein L3  47.34 
 
 		 218 aa  207  7e-53  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0497  50S ribosomal protein L3  47.83 
 
 		 210 aa  207  8e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.443535  hitchhiker  0.00000000471094 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0327  50S ribosomal protein L3  47.83 
 
 		 210 aa  207  8e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.322183  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>