More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MARTH_orf444 on replicon NC_011025
Organism: Mycoplasma arthritidis 158L3-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011025  MARTH_orf444  50S ribosomal protein L3  100 
 
 
272 aa  549  1e-155  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0696  50S ribosomal protein L3  56.56 
 
 
223 aa  241  7.999999999999999e-63  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.372092  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2711  50S ribosomal protein L3  51.63 
 
 
211 aa  226  4e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000399657  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl123  50S ribosomal protein L3  51.82 
 
 
238 aa  216  2.9999999999999998e-55  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  9.499549999999999e-37  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0111  50S ribosomal protein L3  51.17 
 
 
211 aa  216  4e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000151121  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0105  50S ribosomal protein L3  52.13 
 
 
210 aa  212  4.9999999999999996e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000775669  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5195  50S ribosomal protein L3  52.13 
 
 
210 aa  212  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000842867  unclonable  2.19314e-25 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0104  50S ribosomal protein L3  51.66 
 
 
210 aa  211  1e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000119433  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0110  50S ribosomal protein L3  51.66 
 
 
210 aa  210  2e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000528056  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0110  50S ribosomal protein L3  51.66 
 
 
210 aa  210  2e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000986131  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0106  50S ribosomal protein L3  51.66 
 
 
210 aa  210  2e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.6707699999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0104  50S ribosomal protein L3  51.66 
 
 
210 aa  210  2e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000168091  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0141  50S ribosomal protein L3  51.66 
 
 
210 aa  210  2e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000551418  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0131  50S ribosomal protein L3  51.66 
 
 
210 aa  210  2e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000141135  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0110  50S ribosomal protein L3  51.66 
 
 
210 aa  210  2e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000246604  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0122  50S ribosomal protein L3  51.66 
 
 
210 aa  210  2e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.0599700000000001e-61 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1907  50S ribosomal protein L3  50.24 
 
 
208 aa  208  6e-53  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000032853  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0107  50S ribosomal protein L3  51.72 
 
 
213 aa  207  2e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0196  50S ribosomal protein L3  48.03 
 
 
228 aa  204  2e-51  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0113604  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0058  50S ribosomal protein L3  48.33 
 
 
208 aa  203  3e-51  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00491271  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1483  50S ribosomal protein L3  49.53 
 
 
219 aa  203  3e-51  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000163613  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0867  50S ribosomal protein L3  48.34 
 
 
210 aa  199  3.9999999999999996e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000729631  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0595  50S ribosomal protein L3P  50 
 
 
247 aa  197  1.0000000000000001e-49  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.000000158145  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0225  ribosomal protein L3  46.89 
 
 
213 aa  196  4.0000000000000005e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0286  50S ribosomal protein L3  50 
 
 
209 aa  195  8.000000000000001e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0410836  hitchhiker  0.00603059 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3909  50S ribosomal protein L3  47.12 
 
 
209 aa  194  2e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.031884  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01170  50S ribosomal protein L3  46.67 
 
 
211 aa  193  2e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000794381  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0837  50S ribosomal protein L3  48.56 
 
 
211 aa  192  7e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0361687  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08850  50S ribosomal protein L3  48.56 
 
 
211 aa  192  7e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000230335  normal  0.0234155 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0291  50S ribosomal protein L3  47.39 
 
 
209 aa  191  8e-48  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000100637  unclonable  1.4129e-28 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4749  50S ribosomal protein L3  47.6 
 
 
211 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000212363  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0454  50S ribosomal protein L3  48.08 
 
 
211 aa  190  2e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00952841  unclonable  0.000000209689 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0487  50S ribosomal protein L3  48.08 
 
 
211 aa  190  2e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000838631  normal  0.0709669 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1745  50S ribosomal protein L3  47.39 
 
 
210 aa  190  2e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000981122  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1524  50S ribosomal protein L3  45.75 
 
 
209 aa  190  2e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.593746  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0484  50S ribosomal protein L3  48.08 
 
 
211 aa  190  2e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000200613  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0960  50S ribosomal protein L3  46.19 
 
 
214 aa  189  5e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000067151  hitchhiker  0.000000166028 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0626  ribosomal protein L3  46.63 
 
 
211 aa  187  1e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00000165351  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4548  50S ribosomal protein L3  46.63 
 
 
211 aa  187  1e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00256892  normal  0.0637159 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2460  50S ribosomal protein L3  46.41 
 
 
209 aa  187  1e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0891685 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5079  50S ribosomal protein L3  46.63 
 
 
211 aa  187  2e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000374535  normal  0.27561 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1836  50S ribosomal protein L3  47.06 
 
 
217 aa  185  6e-46  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00718997  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0215  50S ribosomal protein L3  44.76 
 
 
209 aa  185  7e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000370606  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0328  ribosomal protein L3  46.05 
 
 
212 aa  185  8e-46  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1138  50S ribosomal protein L3  44.55 
 
 
207 aa  182  4.0000000000000006e-45  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000858376  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1831  50S ribosomal protein L3  45.5 
 
 
220 aa  182  6e-45  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000207996  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1938  50S ribosomal protein L3  44.86 
 
 
205 aa  182  7e-45  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2318  50S ribosomal protein L3  47.3 
 
 
220 aa  181  1e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000223614  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2174  50S ribosomal protein L3  46.45 
 
 
209 aa  181  1e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000029924  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0422  50S ribosomal protein L3  44.76 
 
 
209 aa  181  1e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000195061  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001742  LSU ribosomal protein L3p (L3e)  45.97 
 
 
209 aa  178  1e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000145621  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0320  50S ribosomal protein L3  45.97 
 
 
209 aa  177  1e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0285067  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0981  ribosomal protein L3  45.45 
 
 
215 aa  177  2e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.843676  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1292  50S ribosomal protein L3  44.98 
 
 
207 aa  177  2e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000263563  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0758  50S ribosomal protein L3  41.98 
 
 
212 aa  177  2e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000233446  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1394  50S ribosomal protein L3  44.98 
 
 
207 aa  177  2e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000462367  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1184  ribosomal protein L3  46.86 
 
 
209 aa  176  3e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000270125  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0405  ribosomal protein L3  43.6 
 
 
209 aa  176  3e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00399178  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0226  50S ribosomal protein L3  42.22 
 
 
233 aa  176  4e-43  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  hitchhiker  0.00275796  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06250  50S ribosomal protein L3  46 
 
 
200 aa  176  4e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00608659  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00730  50S ribosomal protein L3  45.02 
 
 
209 aa  176  5e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2277  50S ribosomal protein L3  46.4 
 
 
220 aa  176  5e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000105261  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4915  50S ribosomal protein L3  43.26 
 
 
212 aa  175  7e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0274485  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0323  ribosomal protein L3  43.13 
 
 
209 aa  175  9e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000222247  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0194  50S ribosomal protein L3  42.11 
 
 
210 aa  174  9.999999999999999e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000719285  normal  0.0489845 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3667  50S ribosomal protein L3  42.65 
 
 
211 aa  174  1.9999999999999998e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000330884  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2903  50S ribosomal protein L3  42.92 
 
 
212 aa  174  1.9999999999999998e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000477342  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3024  50S ribosomal protein L3  42.65 
 
 
210 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.371217  hitchhiker  0.00790921 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4001  50S ribosomal protein L3  42.65 
 
 
209 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000133554  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5049  50S ribosomal protein L3  44.75 
 
 
218 aa  173  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.399218 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0562  50S ribosomal protein L3  44.34 
 
 
218 aa  172  3.9999999999999995e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1040  50S ribosomal protein L3  44.5 
 
 
217 aa  172  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3822  50S ribosomal protein L3  42.65 
 
 
209 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000994751  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1013  50S ribosomal protein L3  44.5 
 
 
217 aa  172  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0059  50S ribosomal protein L3  45.24 
 
 
208 aa  172  3.9999999999999995e-42  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000158228  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1030  50S ribosomal protein L3  44.5 
 
 
217 aa  172  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2907  50S ribosomal protein L3  43.46 
 
 
212 aa  172  5e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2714  50S ribosomal protein L3  44.29 
 
 
209 aa  172  5e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000231855  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0421  50S ribosomal protein L3P  43.33 
 
 
212 aa  172  5.999999999999999e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00399818  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0790  50S ribosomal protein L3  42.59 
 
 
213 aa  172  5.999999999999999e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3751  50S ribosomal protein L3  43.6 
 
 
209 aa  172  6.999999999999999e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000000163503  hitchhiker  0.0040389 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2399  50S ribosomal protein L3  43.81 
 
 
209 aa  172  6.999999999999999e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000824684  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0584  50S ribosomal protein L3  43.13 
 
 
209 aa  171  7.999999999999999e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000000183333  normal  0.0735815 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0283  50S ribosomal protein L3  43.13 
 
 
209 aa  171  7.999999999999999e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000156273  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3915  50S ribosomal protein L3  43.13 
 
 
209 aa  171  7.999999999999999e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  5.44377e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2155  50S ribosomal protein L3P  42.16 
 
 
205 aa  171  7.999999999999999e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00587716  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4544  50S ribosomal protein L3  42.65 
 
 
209 aa  171  7.999999999999999e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000354089  hitchhiker  0.00195748 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3709  50S ribosomal protein L3  43.6 
 
 
209 aa  171  9e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000323926  normal  0.640658 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3807  50S ribosomal protein L3  43.6 
 
 
209 aa  171  9e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000142393  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3636  50S ribosomal protein L3  43.6 
 
 
209 aa  171  9e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000145749  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3744  50S ribosomal protein L3  43.6 
 
 
209 aa  171  9e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00311101  normal  0.0177476 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1305  50S ribosomal protein L3  44.04 
 
 
218 aa  171  9e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.207115  normal  0.106977 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0489  50S ribosomal protein L3  43.33 
 
 
206 aa  171  9e-42  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.525282  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3636  50S ribosomal protein L3  43.6 
 
 
209 aa  171  9e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000330914  normal  0.241535 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4690  50S ribosomal protein L3  44.55 
 
 
212 aa  171  1e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000266431  unclonable  0.0000000247869 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0393  ribosomal protein L3  43.13 
 
 
209 aa  170  2e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000156822  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3615  50S ribosomal protein L3  43.13 
 
 
209 aa  170  2e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000666979  hitchhiker  0.00609107 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3514  50S ribosomal protein L3  43.13 
 
 
209 aa  170  2e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000214725  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03122  hypothetical protein  43.13 
 
 
209 aa  170  2e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000891003  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3803  50S ribosomal protein L3  43.13 
 
 
209 aa  170  2e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000338592  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>