More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG1938 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG1938  50S ribosomal protein L3  100 
 
 		 205 aa  414  9.999999999999999e-116  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0602  ribosomal protein L3  67.8 
 
 		 205 aa  296  1e-79  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3162  50S ribosomal protein L3  68.45 
 
 		 206 aa  295  3e-79  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.596382 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5787  50S ribosomal protein L3  67.48 
 
 		 220 aa  292  3e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0786499 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05715  50S ribosomal protein L3  67.32 
 
 		 205 aa  291  5e-78  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.499117  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4343  50S ribosomal protein L3  65.53 
 
 		 206 aa  291  7e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0239943  normal  0.123527 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0397  50S ribosomal protein L3  67.32 
 
 		 205 aa  290  1e-77  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1147  50S ribosomal protein L3  65.37 
 
 		 205 aa  286  1e-76  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000530687  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1615  ribosomal protein L3  59.02 
 
 		 205 aa  259  2e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0197  50S ribosomal protein L3  57.14 
 
 		 210 aa  257  7e-68  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.555383 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1185  50S ribosomal protein L3  58.74 
 
 		 210 aa  248  6e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0842  ribosomal protein L3  58.94 
 
 		 210 aa  247  1e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4026  50S ribosomal protein L3  57.77 
 
 		 210 aa  243  9.999999999999999e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000729954 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3024  50S ribosomal protein L3  55.88 
 
 		 210 aa  229  2e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.371217  hitchhiker  0.00790921 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4915  50S ribosomal protein L3  54.37 
 
 		 212 aa  228  6e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0274485  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0180  50S ribosomal protein L3  55.12 
 
 		 209 aa  227  8e-59  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00021825  normal  0.996112 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0289  50S ribosomal protein L3  55.12 
 
 		 209 aa  227  1e-58  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0562  50S ribosomal protein L3  52.68 
 
 		 218 aa  226  2e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2229  50S ribosomal protein L3  54.15 
 
 		 209 aa  226  2e-58  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000790762  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2296  50S ribosomal protein L3  55.61 
 
 		 209 aa  221  6e-57  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00600066  hitchhiker  0.00331239 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4321  ribosomal protein L3  51.72 
 
 		 216 aa  220  9.999999999999999e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3758  50S ribosomal protein L3  52.22 
 
 		 219 aa  219  1.9999999999999999e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.33789  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0306  50S ribosomal protein L3P  51.72 
 
 		 222 aa  218  3.9999999999999997e-56  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00207169 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1086  LSU ribosomal protein L3P  50.73 
 
 		 217 aa  218  6e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.10406 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2423  50S ribosomal protein L3  52.68 
 
 		 209 aa  218  7e-56  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00498434  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2064  50S ribosomal protein L3  50.24 
 
 		 209 aa  214  5e-55  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000717701  normal  0.401636 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2907  50S ribosomal protein L3  53.66 
 
 		 212 aa  215  5e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6614  ribosomal protein L3  51.72 
 
 		 216 aa  214  9e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1161  ribosomal protein L3  52.48 
 
 		 206 aa  213  9.999999999999999e-55  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000266904  hitchhiker  0.000000567921 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1851  50S ribosomal protein L3  53.17 
 
 		 209 aa  213  1.9999999999999998e-54  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.132189  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1184  ribosomal protein L3  52.94 
 
 		 209 aa  212  2.9999999999999995e-54  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000270125  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0058  50S ribosomal protein L3  54.95 
 
 		 208 aa  211  4.9999999999999996e-54  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00491271  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20870  LSU ribosomal protein L3P  48.78 
 
 		 219 aa  211  4.9999999999999996e-54  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.235842  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03980  LSU ribosomal protein L3P  50.73 
 
 		 213 aa  211  5.999999999999999e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1745  50S ribosomal protein L3  53.69 
 
 		 210 aa  209  2e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000981122  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10715  50S ribosomal protein L3  49.51 
 
 		 217 aa  209  3e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.249834 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0701  50S ribosomal protein L3  53.88 
 
 		 210 aa  209  3e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000481863  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23810  LSU ribosomal protein L3P  50.73 
 
 		 226 aa  209  3e-53  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0867  50S ribosomal protein L3  55.39 
 
 		 210 aa  208  4e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000729631  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29740  LSU ribosomal protein L3P  51.98 
 
 		 219 aa  208  4e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.378005 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0708  50S ribosomal protein L3  50.98 
 
 		 208 aa  208  5e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00455924  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1907  50S ribosomal protein L3  52.97 
 
 		 208 aa  208  5e-53  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000032853  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5079  50S ribosomal protein L3  51.74 
 
 		 211 aa  207  1e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000374535  normal  0.27561 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0688  ribosomal protein L3  49.75 
 
 		 219 aa  207  1e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.409644 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5049  50S ribosomal protein L3  48.31 
 
 		 218 aa  207  1e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.399218 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17160  50S ribosomal protein L3  50.24 
 
 		 216 aa  206  1e-52  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.283771  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03171  50S ribosomal protein L3  54.63 
 
 		 209 aa  206  2e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00105587  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0393  ribosomal protein L3  54.63 
 
 		 209 aa  206  2e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000156822  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03122  hypothetical protein  54.63 
 
 		 209 aa  206  2e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000891003  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4643  50S ribosomal protein L3  54.63 
 
 		 209 aa  206  2e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000124545  normal  0.0362623 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0393  50S ribosomal protein L3  54.63 
 
 		 209 aa  206  2e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000309233  hitchhiker  0.00746366 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3803  50S ribosomal protein L3  54.63 
 
 		 209 aa  206  2e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000338592  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3514  50S ribosomal protein L3  54.63 
 
 		 209 aa  206  2e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000214725  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3705  50S ribosomal protein L3  54.63 
 
 		 209 aa  206  2e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000030519  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3615  50S ribosomal protein L3  54.63 
 
 		 209 aa  206  2e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000666979  hitchhiker  0.00609107 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1305  50S ribosomal protein L3  48.06 
 
 		 218 aa  206  2e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.207115  normal  0.106977 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0405  ribosomal protein L3  54.15 
 
 		 209 aa  206  3e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00399178  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0626  ribosomal protein L3  51.74 
 
 		 211 aa  205  4e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00000165351  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0323  ribosomal protein L3  54.15 
 
 		 209 aa  205  5e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000222247  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4001  50S ribosomal protein L3  53.66 
 
 		 209 aa  204  6e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000133554  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0715  ribosomal protein L3  55.39 
 
 		 204 aa  204  6e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3435  50S ribosomal protein L3  47.32 
 
 		 218 aa  204  7e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3923  50S ribosomal protein L3  48.77 
 
 		 219 aa  204  7e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0931  ribosomal protein L3  48.78 
 
 		 215 aa  204  8e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.15696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4548  50S ribosomal protein L3  51.24 
 
 		 211 aa  204  8e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00256892  normal  0.0637159 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1867  50S ribosomal protein L3  50.74 
 
 		 207 aa  204  8e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0222976  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3822  50S ribosomal protein L3  53.66 
 
 		 209 aa  204  9e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000994751  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4507  50S ribosomal protein L3  51.23 
 
 		 221 aa  203  1e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.787031  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2857  50S ribosomal protein L3  47.78 
 
 		 210 aa  203  1e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.918611  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1340  50S ribosomal protein L3  49.75 
 
 		 205 aa  204  1e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2646  50S ribosomal protein L3  49.26 
 
 		 216 aa  203  1e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.334348  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3751  50S ribosomal protein L3  54.15 
 
 		 209 aa  203  1e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000000163503  hitchhiker  0.0040389 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1836  50S ribosomal protein L3  49.01 
 
 		 217 aa  204  1e-51  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00718997  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3636  50S ribosomal protein L3  54.15 
 
 		 209 aa  202  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000330914  normal  0.241535 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2324  ribosomal protein L3  53.66 
 
 		 214 aa  202  2e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00000658885  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4315  50S ribosomal protein L3  48.28 
 
 		 219 aa  203  2e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00341518 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3807  50S ribosomal protein L3  54.15 
 
 		 209 aa  202  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000142393  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01170  50S ribosomal protein L3  49.75 
 
 		 211 aa  202  2e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000794381  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1040  50S ribosomal protein L3  47.57 
 
 		 217 aa  202  2e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3636  50S ribosomal protein L3  54.15 
 
 		 209 aa  202  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000145749  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1013  50S ribosomal protein L3  47.57 
 
 		 217 aa  202  2e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2174  50S ribosomal protein L3  52.2 
 
 		 209 aa  202  2e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000029924  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3744  50S ribosomal protein L3  54.15 
 
 		 209 aa  202  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00311101  normal  0.0177476 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3709  50S ribosomal protein L3  54.15 
 
 		 209 aa  202  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000323926  normal  0.640658 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1030  50S ribosomal protein L3  47.57 
 
 		 217 aa  202  2e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2687  50S ribosomal protein L3  49.26 
 
 		 216 aa  202  4e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.740328 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0587  ribosomal protein L3  49.01 
 
 		 219 aa  201  5e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.295272  normal  0.46094 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6049  50S ribosomal protein L3  49.26 
 
 		 236 aa  201  6e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.185718  normal  0.220559 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2975  50S ribosomal protein L3  49.75 
 
 		 216 aa  201  7e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.454423  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3909  50S ribosomal protein L3  49.75 
 
 		 209 aa  200  9.999999999999999e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.031884  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0626  50S ribosomal protein L3  47.29 
 
 		 210 aa  200  9.999999999999999e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000331463  hitchhiker  0.000000000000331617 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3143  ribosomal protein L3  50.5 
 
 		 220 aa  200  9.999999999999999e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0896196  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0790  50S ribosomal protein L3  49.28 
 
 		 213 aa  200  9.999999999999999e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001742  LSU ribosomal protein L3p (L3e)  51.71 
 
 		 209 aa  199  1.9999999999999998e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000145621  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3905  50S ribosomal protein L3  48.29 
 
 		 223 aa  199  1.9999999999999998e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0627  ribosomal protein L3  50 
 
 		 217 aa  199  3e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0111  50S ribosomal protein L3  50.49 
 
 		 211 aa  199  3e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000151121  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0582  50S ribosomal protein L3  50.25 
 
 		 235 aa  199  3e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3915  50S ribosomal protein L3  53.17 
 
 		 209 aa  198  3.9999999999999996e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  5.44377e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0283  50S ribosomal protein L3  53.17 
 
 		 209 aa  198  3.9999999999999996e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000156273  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>