More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1483 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_1483  50S ribosomal protein L3  100 
 
 		 219 aa  443  1.0000000000000001e-124  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000163613  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0196  50S ribosomal protein L3  67.12 
 
 		 228 aa  304  5.0000000000000004e-82  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0113604  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0104  50S ribosomal protein L3  67.94 
 
 		 210 aa  301  6.000000000000001e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000119433  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0595  50S ribosomal protein L3P  70.39 
 
 		 247 aa  299  2e-80  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.000000158145  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0110  50S ribosomal protein L3  67.46 
 
 		 210 aa  294  7e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000528056  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0110  50S ribosomal protein L3  67.46 
 
 		 210 aa  294  7e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000986131  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0106  50S ribosomal protein L3  67.46 
 
 		 210 aa  294  7e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.6707699999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0104  50S ribosomal protein L3  67.46 
 
 		 210 aa  294  7e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000168091  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0122  50S ribosomal protein L3  67.46 
 
 		 210 aa  294  7e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.0599700000000001e-61 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0110  50S ribosomal protein L3  67.46 
 
 		 210 aa  294  7e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000246604  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0131  50S ribosomal protein L3  67.46 
 
 		 210 aa  294  7e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000141135  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0141  50S ribosomal protein L3  67.46 
 
 		 210 aa  294  7e-79  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000551418  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5195  50S ribosomal protein L3  66.99 
 
 		 210 aa  293  1e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000842867  unclonable  2.19314e-25 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0105  50S ribosomal protein L3  66.99 
 
 		 210 aa  293  1e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000775669  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0111  50S ribosomal protein L3  66.35 
 
 		 211 aa  291  5e-78  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000151121  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0291  50S ribosomal protein L3  68.12 
 
 		 209 aa  288  4e-77  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000100637  unclonable  1.4129e-28 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1907  50S ribosomal protein L3  66.67 
 
 		 208 aa  283  1.0000000000000001e-75  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000032853  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0058  50S ribosomal protein L3  66.35 
 
 		 208 aa  283  2.0000000000000002e-75  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00491271  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0107  50S ribosomal protein L3  67 
 
 		 213 aa  278  4e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2711  50S ribosomal protein L3  58.57 
 
 		 211 aa  251  8.000000000000001e-66  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000399657  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1831  50S ribosomal protein L3  55 
 
 		 220 aa  246  2e-64  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000207996  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2318  50S ribosomal protein L3  55.45 
 
 		 220 aa  243  1.9999999999999999e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000223614  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0696  50S ribosomal protein L3  54.13 
 
 		 223 aa  239  2e-62  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.372092  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2277  50S ribosomal protein L3  54.55 
 
 		 220 aa  238  5e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000105261  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0422  50S ribosomal protein L3  56.73 
 
 		 209 aa  238  6.999999999999999e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000195061  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0286  50S ribosomal protein L3  56.46 
 
 		 209 aa  234  1.0000000000000001e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0410836  hitchhiker  0.00603059 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1745  50S ribosomal protein L3  55.5 
 
 		 210 aa  233  1.0000000000000001e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000981122  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl123  50S ribosomal protein L3  57.56 
 
 		 238 aa  232  3e-60  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  9.499549999999999e-37  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0215  50S ribosomal protein L3  57.49 
 
 		 209 aa  232  3e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000370606  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3667  50S ribosomal protein L3  53.11 
 
 		 211 aa  230  2e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000330884  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01170  50S ribosomal protein L3  55.07 
 
 		 211 aa  228  4e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000794381  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2714  50S ribosomal protein L3  52.63 
 
 		 209 aa  227  1e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000231855  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2399  50S ribosomal protein L3  52.15 
 
 		 209 aa  227  1e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000824684  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2333  50S ribosomal protein L3  53.66 
 
 		 212 aa  224  6e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000241734  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0194  50S ribosomal protein L3  51.9 
 
 		 210 aa  221  6e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000719285  normal  0.0489845 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0225  ribosomal protein L3  52.15 
 
 		 213 aa  217  8.999999999999998e-56  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1524  50S ribosomal protein L3  54.11 
 
 		 209 aa  217  1e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.593746  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2460  50S ribosomal protein L3  54.33 
 
 		 209 aa  215  2.9999999999999998e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0891685 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0867  50S ribosomal protein L3  50.72 
 
 		 210 aa  207  1e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000729631  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0981  ribosomal protein L3  48.54 
 
 		 215 aa  203  2e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.843676  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf444  50S ribosomal protein L3  49.53 
 
 		 272 aa  201  7e-51  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1346  50S ribosomal protein L3  48.33 
 
 		 211 aa  197  9e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.700686  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0758  50S ribosomal protein L3  46.67 
 
 		 212 aa  191  5e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000233446  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0701  50S ribosomal protein L3  49.28 
 
 		 210 aa  191  8e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000481863  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3758  50S ribosomal protein L3  49.07 
 
 		 219 aa  191  1e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.33789  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6614  ribosomal protein L3  48.8 
 
 		 216 aa  189  2e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1161  ribosomal protein L3  48.53 
 
 		 206 aa  189  2e-47  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000266904  hitchhiker  0.000000567921 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0756  50S ribosomal protein L3  49.07 
 
 		 216 aa  190  2e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000385888  normal  0.0180173 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0691  50S ribosomal protein L3  45.81 
 
 		 211 aa  189  4e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00208666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1067  50S ribosomal protein L3  44.98 
 
 		 211 aa  189  4e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000374639  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3435  50S ribosomal protein L3  49.77 
 
 		 218 aa  188  5e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0626  50S ribosomal protein L3  45.71 
 
 		 210 aa  188  5.999999999999999e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000331463  hitchhiker  0.000000000000331617 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0790  50S ribosomal protein L3  46.23 
 
 		 213 aa  188  5.999999999999999e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1184  ribosomal protein L3  46.86 
 
 		 209 aa  187  7e-47  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000270125  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1867  50S ribosomal protein L3  48.8 
 
 		 207 aa  187  9e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0222976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2903  50S ribosomal protein L3  48.82 
 
 		 212 aa  187  1e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000477342  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1305  50S ribosomal protein L3  47.2 
 
 		 218 aa  187  1e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.207115  normal  0.106977 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0306  50S ribosomal protein L3P  44.86 
 
 		 222 aa  186  2e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00207169 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0931  ribosomal protein L3  45.89 
 
 		 215 aa  186  3e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.15696  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4321  ribosomal protein L3  46.92 
 
 		 216 aa  186  3e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5049  50S ribosomal protein L3  47.44 
 
 		 218 aa  185  4e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.399218 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4915  50S ribosomal protein L3  46.95 
 
 		 212 aa  185  4e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0274485  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2559  50S ribosomal protein L3  44.83 
 
 		 211 aa  185  5e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.101168  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0962  ribosomal protein L3  47.55 
 
 		 206 aa  184  6e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000608869  hitchhiker  0.0000000000269964 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0680  50S ribosomal protein L3  48.99 
 
 		 209 aa  184  7e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.620206  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20031  50S ribosomal protein L3  45.1 
 
 		 218 aa  184  9e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0587  ribosomal protein L3  48.8 
 
 		 219 aa  184  9e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.295272  normal  0.46094 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1040  50S ribosomal protein L3  47.2 
 
 		 217 aa  183  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1129  50S ribosomal protein L3  44.61 
 
 		 218 aa  183  1.0000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1013  50S ribosomal protein L3  47.2 
 
 		 217 aa  183  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1030  50S ribosomal protein L3  47.2 
 
 		 217 aa  183  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0469  50S ribosomal protein L3  49.06 
 
 		 212 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000509154  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3524  ribosomal protein L3  48.58 
 
 		 212 aa  183  2.0000000000000003e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.0000015584  hitchhiker  0.00000758128 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04521  50S ribosomal protein L3  48.79 
 
 		 207 aa  182  3e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000554969  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1292  50S ribosomal protein L3  45.45 
 
 		 212 aa  182  4.0000000000000006e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.0000167398  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03980  LSU ribosomal protein L3P  46.73 
 
 		 213 aa  182  4.0000000000000006e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1707  50S ribosomal protein L3  46.38 
 
 		 213 aa  181  6e-45  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00287886  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10020  LSU ribosomal protein L3P  44.61 
 
 		 206 aa  181  6e-45  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.000000402835  hitchhiker  0.00000000318342 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0255  50S ribosomal protein L3  45.85 
 
 		 216 aa  181  7e-45  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0454  50S ribosomal protein L3  47.14 
 
 		 211 aa  180  1e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00952841  unclonable  0.000000209689 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0487  50S ribosomal protein L3  47.14 
 
 		 211 aa  180  1e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000838631  normal  0.0709669 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4548  50S ribosomal protein L3  46.19 
 
 		 211 aa  180  1e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00256892  normal  0.0637159 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0715  ribosomal protein L3  46.86 
 
 		 204 aa  181  1e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00445  50S ribosomal protein L3  46.7 
 
 		 212 aa  180  1e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.000559916  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0484  50S ribosomal protein L3  47.14 
 
 		 211 aa  180  1e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000200613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3905  50S ribosomal protein L3  45.97 
 
 		 223 aa  180  1e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1086  LSU ribosomal protein L3P  46.26 
 
 		 217 aa  181  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.10406 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2857  50S ribosomal protein L3  45.67 
 
 		 210 aa  180  2e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.918611  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0562  50S ribosomal protein L3  47.14 
 
 		 218 aa  179  2e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0626  ribosomal protein L3  45.71 
 
 		 211 aa  179  4e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00000165351  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4749  50S ribosomal protein L3  46.19 
 
 		 211 aa  179  4e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000212363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001742  LSU ribosomal protein L3p (L3e)  46.86 
 
 		 209 aa  178  5.999999999999999e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000145621  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2907  50S ribosomal protein L3  47.69 
 
 		 212 aa  178  5.999999999999999e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0933  50S ribosomal protein L3  44.98 
 
 		 211 aa  178  7e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00137042  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0405  ribosomal protein L3  47.34 
 
 		 209 aa  177  8e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00399178  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2174  50S ribosomal protein L3  46.86 
 
 		 209 aa  177  9e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000029924  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20870  LSU ribosomal protein L3P  45.63 
 
 		 219 aa  177  9e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.235842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1138  50S ribosomal protein L3  45.15 
 
 		 207 aa  177  1e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000858376  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0719  ribosomal protein L3  45.28 
 
 		 212 aa  177  1e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000525785  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0960  50S ribosomal protein L3  46.67 
 
 		 214 aa  177  2e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000067151  hitchhiker  0.000000166028 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>