More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_0194 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010718  Nther_0194  50S ribosomal protein L3  100 
 
 		 210 aa  420  1e-116  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000719285  normal  0.0489845 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01170  50S ribosomal protein L3  63.81 
 
 		 211 aa  276  2e-73  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000794381  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2714  50S ribosomal protein L3  57.89 
 
 		 209 aa  251  7e-66  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000231855  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2399  50S ribosomal protein L3  57.42 
 
 		 209 aa  250  9.000000000000001e-66  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000824684  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1831  50S ribosomal protein L3  59.26 
 
 		 220 aa  248  5e-65  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000207996  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0422  50S ribosomal protein L3  57.42 
 
 		 209 aa  248  5e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000195061  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5195  50S ribosomal protein L3  57.49 
 
 		 210 aa  244  6.999999999999999e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000842867  unclonable  2.19314e-25 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0105  50S ribosomal protein L3  57.49 
 
 		 210 aa  244  6.999999999999999e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000775669  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0104  50S ribosomal protein L3  56.25 
 
 		 210 aa  244  8e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000119433  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0131  50S ribosomal protein L3  57 
 
 		 210 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000141135  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0141  50S ribosomal protein L3  57 
 
 		 210 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000551418  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0110  50S ribosomal protein L3  57 
 
 		 210 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000528056  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0058  50S ribosomal protein L3  59.62 
 
 		 208 aa  243  1.9999999999999999e-63  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00491271  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0110  50S ribosomal protein L3  57 
 
 		 210 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000986131  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0106  50S ribosomal protein L3  57 
 
 		 210 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.6707699999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0104  50S ribosomal protein L3  57 
 
 		 210 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000168091  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0110  50S ribosomal protein L3  57 
 
 		 210 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000246604  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0122  50S ribosomal protein L3  57 
 
 		 210 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.0599700000000001e-61 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0867  50S ribosomal protein L3  58.1 
 
 		 210 aa  240  9e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000729631  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0286  50S ribosomal protein L3  56.46 
 
 		 209 aa  239  2e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0410836  hitchhiker  0.00603059 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1745  50S ribosomal protein L3  57.62 
 
 		 210 aa  239  2e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000981122  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1524  50S ribosomal protein L3  57.28 
 
 		 209 aa  238  4e-62  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.593746  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2711  50S ribosomal protein L3  55.12 
 
 		 211 aa  238  5.999999999999999e-62  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000399657  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3667  50S ribosomal protein L3  57.42 
 
 		 211 aa  238  5.999999999999999e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000330884  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2318  50S ribosomal protein L3  59.26 
 
 		 220 aa  237  6.999999999999999e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000223614  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0758  50S ribosomal protein L3  57.62 
 
 		 212 aa  237  1e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000233446  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1907  50S ribosomal protein L3  57.97 
 
 		 208 aa  236  1e-61  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000032853  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0111  50S ribosomal protein L3  53.81 
 
 		 211 aa  236  2e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000151121  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2460  50S ribosomal protein L3  55.77 
 
 		 209 aa  234  6e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0891685 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2277  50S ribosomal protein L3  58.33 
 
 		 220 aa  233  2.0000000000000002e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000105261  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1346  50S ribosomal protein L3  56.94 
 
 		 211 aa  230  9e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.700686  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0215  50S ribosomal protein L3  54.55 
 
 		 209 aa  230  1e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000370606  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0107  50S ribosomal protein L3  55 
 
 		 213 aa  229  2e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2333  50S ribosomal protein L3  50.96 
 
 		 212 aa  228  4e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000241734  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2903  50S ribosomal protein L3  54.98 
 
 		 212 aa  228  7e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000477342  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2857  50S ribosomal protein L3  51.9 
 
 		 210 aa  226  3e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.918611  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0225  ribosomal protein L3  51.69 
 
 		 213 aa  224  1e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0626  50S ribosomal protein L3  51.9 
 
 		 210 aa  223  2e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000331463  hitchhiker  0.000000000000331617 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1483  50S ribosomal protein L3  51.9 
 
 		 219 aa  221  4.9999999999999996e-57  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000163613  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0196  50S ribosomal protein L3  50.95 
 
 		 228 aa  221  8e-57  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0113604  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0701  50S ribosomal protein L3  55.02 
 
 		 210 aa  217  1e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000481863  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0790  50S ribosomal protein L3  51.44 
 
 		 213 aa  214  9e-55  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1067  50S ribosomal protein L3  50.48 
 
 		 211 aa  212  2.9999999999999995e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000374639  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0291  50S ribosomal protein L3  51.44 
 
 		 209 aa  210  1e-53  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000100637  unclonable  1.4129e-28 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0680  50S ribosomal protein L3  51.01 
 
 		 209 aa  208  6e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.620206  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10020  LSU ribosomal protein L3P  50.74 
 
 		 206 aa  207  8e-53  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.000000402835  hitchhiker  0.00000000318342 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0953  50S ribosomal protein L3  52.74 
 
 		 205 aa  206  2e-52  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000000660439  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0933  50S ribosomal protein L3  49.52 
 
 		 211 aa  206  3e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00137042  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1138  50S ribosomal protein L3  49.51 
 
 		 207 aa  205  4e-52  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000858376  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1184  ribosomal protein L3  50 
 
 		 209 aa  204  6e-52  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000270125  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1394  50S ribosomal protein L3  51.69 
 
 		 207 aa  203  1e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000462367  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1292  50S ribosomal protein L3  51.69 
 
 		 207 aa  203  1e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000263563  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2774  ribosomal protein L3  49.02 
 
 		 210 aa  204  1e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.039291  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3328  50S ribosomal protein L3  49.05 
 
 		 211 aa  203  2e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000332976 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1161  ribosomal protein L3  51.72 
 
 		 206 aa  203  2e-51  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000266904  hitchhiker  0.000000567921 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0981  ribosomal protein L3  48.78 
 
 		 215 aa  203  2e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.843676  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0595  50S ribosomal protein L3P  48.31 
 
 		 247 aa  202  4e-51  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.000000158145  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0306  50S ribosomal protein L3P  49.05 
 
 		 222 aa  201  5e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00207169 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2232  50S ribosomal protein L3  48.06 
 
 		 213 aa  201  9e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.422626 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0696  50S ribosomal protein L3  47.37 
 
 		 223 aa  200  9.999999999999999e-51  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.372092  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3024  50S ribosomal protein L3  48.1 
 
 		 210 aa  199  3e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.371217  hitchhiker  0.00790921 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0962  ribosomal protein L3  52.22 
 
 		 206 aa  199  3e-50  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000608869  hitchhiker  0.0000000000269964 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4321  ribosomal protein L3  47.85 
 
 		 216 aa  198  6e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2907  50S ribosomal protein L3  50 
 
 		 212 aa  197  9e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2229  50S ribosomal protein L3  49.51 
 
 		 209 aa  197  1.0000000000000001e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000790762  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0079  50S ribosomal protein L3  48.77 
 
 		 209 aa  196  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.145283 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0376  50S ribosomal protein L3  45.67 
 
 		 218 aa  196  2.0000000000000003e-49  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001742  LSU ribosomal protein L3p (L3e)  51.46 
 
 		 209 aa  196  2.0000000000000003e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000145621  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0320  50S ribosomal protein L3  51.94 
 
 		 209 aa  196  2.0000000000000003e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0285067  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3758  50S ribosomal protein L3  49.28 
 
 		 219 aa  196  2.0000000000000003e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.33789  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0715  ribosomal protein L3  51.96 
 
 		 204 aa  196  2.0000000000000003e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1185  50S ribosomal protein L3  47.14 
 
 		 210 aa  196  3e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1555  ribosomal protein L3  46.19 
 
 		 210 aa  195  3e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00791107  normal  0.982603 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1955  50S ribosomal protein L3  44.71 
 
 		 218 aa  195  4.0000000000000005e-49  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20031  50S ribosomal protein L3  46.31 
 
 		 218 aa  195  4.0000000000000005e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1129  50S ribosomal protein L3  45.81 
 
 		 218 aa  194  6e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2174  50S ribosomal protein L3  50.97 
 
 		 209 aa  194  7e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000029924  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0289  50S ribosomal protein L3  48.31 
 
 		 209 aa  193  1e-48  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1836  50S ribosomal protein L3  45.23 
 
 		 217 aa  193  1e-48  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00718997  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4026  50S ribosomal protein L3  46.67 
 
 		 210 aa  193  1e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000729954 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3905  50S ribosomal protein L3  47.6 
 
 		 223 aa  194  1e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3995  ribosomal protein L3  52.91 
 
 		 208 aa  192  2e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2065  50S ribosomal protein L3  46 
 
 		 209 aa  192  2e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.00000000000562685  normal  0.223373 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00730  50S ribosomal protein L3  50.49 
 
 		 209 aa  192  3e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1707  50S ribosomal protein L3  47.12 
 
 		 213 aa  192  4e-48  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00287886  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0180  50S ribosomal protein L3  48.53 
 
 		 209 aa  192  4e-48  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00021825  normal  0.996112 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00445  50S ribosomal protein L3  50 
 
 		 212 aa  192  4e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.000559916  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4915  50S ribosomal protein L3  48.1 
 
 		 212 aa  192  4e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0274485  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1867  50S ribosomal protein L3  49.76 
 
 		 207 aa  192  4e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0222976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0469  50S ribosomal protein L3  49.53 
 
 		 212 aa  192  4e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000509154  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03980  LSU ribosomal protein L3P  48.31 
 
 		 213 aa  191  7e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0931  ribosomal protein L3  48.79 
 
 		 215 aa  191  8e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.15696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1851  50S ribosomal protein L3  47.34 
 
 		 209 aa  191  8e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.132189  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3524  ribosomal protein L3  50.47 
 
 		 212 aa  191  9e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.0000015584  hitchhiker  0.00000758128 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20870  LSU ribosomal protein L3P  47.32 
 
 		 219 aa  190  1e-47  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.235842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17401  50S ribosomal protein L3  45.81 
 
 		 217 aa  190  1e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0691  50S ribosomal protein L3  45.67 
 
 		 211 aa  190  1e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00208666  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1340  50S ribosomal protein L3  51 
 
 		 205 aa  190  1e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23021  50S ribosomal protein L3  46.31 
 
 		 218 aa  190  1e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4507  50S ribosomal protein L3  48.31 
 
 		 221 aa  189  2e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.787031  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>