More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1851 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_1851  50S ribosomal protein L3  100 
 
 		 209 aa  419  1e-116  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.132189  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0289  50S ribosomal protein L3  82.78 
 
 		 209 aa  360  1e-98  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2423  50S ribosomal protein L3  75.12 
 
 		 209 aa  335  2.9999999999999997e-91  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00498434  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2229  50S ribosomal protein L3  75.12 
 
 		 209 aa  334  5e-91  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000790762  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0180  50S ribosomal protein L3  75.12 
 
 		 209 aa  328  5.0000000000000004e-89  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00021825  normal  0.996112 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2064  50S ribosomal protein L3  67.94 
 
 		 209 aa  303  9.000000000000001e-82  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000717701  normal  0.401636 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2296  50S ribosomal protein L3  67.46 
 
 		 209 aa  292  3e-78  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00600066  hitchhiker  0.00331239 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5787  50S ribosomal protein L3  53.88 
 
 		 220 aa  220  9.999999999999999e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0786499 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4343  50S ribosomal protein L3  52.91 
 
 		 206 aa  218  7.999999999999999e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0239943  normal  0.123527 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1147  50S ribosomal protein L3  52.68 
 
 		 205 aa  216  2e-55  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000530687  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4915  50S ribosomal protein L3  51.67 
 
 		 212 aa  214  5.9999999999999996e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0274485  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1938  50S ribosomal protein L3  53.17 
 
 		 205 aa  213  1.9999999999999998e-54  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0602  ribosomal protein L3  52.71 
 
 		 205 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0397  50S ribosomal protein L3  53.66 
 
 		 205 aa  212  3.9999999999999995e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05715  50S ribosomal protein L3  49.76 
 
 		 205 aa  210  1e-53  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.499117  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3162  50S ribosomal protein L3  51.94 
 
 		 206 aa  210  1e-53  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.596382 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0197  50S ribosomal protein L3  50.49 
 
 		 210 aa  206  2e-52  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.555383 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2714  50S ribosomal protein L3  50.72 
 
 		 209 aa  206  2e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000231855  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4026  50S ribosomal protein L3  48.76 
 
 		 210 aa  205  3e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000729954 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2399  50S ribosomal protein L3  50.24 
 
 		 209 aa  205  3e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000824684  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1185  50S ribosomal protein L3  49.75 
 
 		 210 aa  205  4e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0306  50S ribosomal protein L3P  46.6 
 
 		 222 aa  201  6e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00207169 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0842  ribosomal protein L3  49.28 
 
 		 210 aa  201  8e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3024  50S ribosomal protein L3  50.25 
 
 		 210 aa  200  9.999999999999999e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.371217  hitchhiker  0.00790921 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1615  ribosomal protein L3  50.73 
 
 		 205 aa  198  6e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4321  ribosomal protein L3  47.57 
 
 		 216 aa  197  6e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0931  ribosomal protein L3  48.06 
 
 		 215 aa  195  3e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.15696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0708  50S ribosomal protein L3  49.25 
 
 		 208 aa  194  7e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00455924  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0194  50S ribosomal protein L3  47.34 
 
 		 210 aa  191  8e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000719285  normal  0.0489845 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0867  50S ribosomal protein L3  49.51 
 
 		 210 aa  189  2e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000729631  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2907  50S ribosomal protein L3  49.51 
 
 		 212 aa  189  2e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0286  50S ribosomal protein L3  48.54 
 
 		 209 aa  188  4e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0410836  hitchhiker  0.00603059 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3317  50S ribosomal protein L3  46.38 
 
 		 214 aa  188  5e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000449005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3179  50S ribosomal protein L3  45.89 
 
 		 216 aa  187  9e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00000128128  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0715  ribosomal protein L3  49.76 
 
 		 204 aa  187  1e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01170  50S ribosomal protein L3  45.27 
 
 		 211 aa  186  3e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000794381  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2975  50S ribosomal protein L3  44.17 
 
 		 216 aa  186  3e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.454423  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29740  LSU ribosomal protein L3P  44.44 
 
 		 219 aa  186  3e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.378005 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6614  ribosomal protein L3  43.69 
 
 		 216 aa  185  4e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3758  50S ribosomal protein L3  48.19 
 
 		 219 aa  185  4e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.33789  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3905  50S ribosomal protein L3  44.98 
 
 		 223 aa  185  4e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23810  LSU ribosomal protein L3P  45.15 
 
 		 226 aa  185  4e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0562  50S ribosomal protein L3  46.12 
 
 		 218 aa  184  7e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2324  ribosomal protein L3  45.36 
 
 		 215 aa  184  8e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000235705  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3435  50S ribosomal protein L3  45.15 
 
 		 218 aa  184  8e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3447  50S ribosomal protein L3  47.94 
 
 		 217 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  unclonable  0.0000000000108395  normal  0.0130308 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3297  50S ribosomal protein L3  44.93 
 
 		 217 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.000000538385  hitchhiker  0.0000807722 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2687  50S ribosomal protein L3  43.69 
 
 		 216 aa  184  1.0000000000000001e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.740328 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2950  50S ribosomal protein L3  44.93 
 
 		 217 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  unclonable  0.000000276942  decreased coverage  0.000000134206 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17160  50S ribosomal protein L3  44.17 
 
 		 216 aa  184  1.0000000000000001e-45  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.283771  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4507  50S ribosomal protein L3  46.12 
 
 		 221 aa  183  2.0000000000000003e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.787031  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03980  LSU ribosomal protein L3P  44.02 
 
 		 213 aa  183  2.0000000000000003e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2174  50S ribosomal protein L3  47.96 
 
 		 209 aa  182  2.0000000000000003e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000029924  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0405  ribosomal protein L3  48 
 
 		 209 aa  183  2.0000000000000003e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00399178  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0327  50S ribosomal protein L3  47.42 
 
 		 216 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000900525  normal  0.0194513 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2759  50S ribosomal protein L3  47.42 
 
 		 217 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0000332087  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0323  ribosomal protein L3  47.5 
 
 		 209 aa  183  2.0000000000000003e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000222247  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0348  50S ribosomal protein L3  47.42 
 
 		 217 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000116037  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0587  ribosomal protein L3  44.44 
 
 		 219 aa  183  2.0000000000000003e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.295272  normal  0.46094 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0276  50S ribosomal protein L3  47.42 
 
 		 216 aa  182  3e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000762346  normal  0.121842 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1524  50S ribosomal protein L3  47.55 
 
 		 209 aa  182  3e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.593746  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0249  50S ribosomal protein L3  47.42 
 
 		 216 aa  182  3e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000000000158016  normal  0.145495 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0267  50S ribosomal protein L3  47.42 
 
 		 217 aa  182  3e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000416166  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0079  50S ribosomal protein L3  46.27 
 
 		 209 aa  181  6e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.145283 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0627  ribosomal protein L3  43.96 
 
 		 217 aa  181  6e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0320  50S ribosomal protein L3  47.45 
 
 		 209 aa  181  7e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0285067  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3524  ribosomal protein L3  46.53 
 
 		 212 aa  181  7e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.0000015584  hitchhiker  0.00000758128 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2632  50S ribosomal protein L3  45.88 
 
 		 219 aa  181  8.000000000000001e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  unclonable  0.000000000488611  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3776  50S ribosomal protein L3  45.88 
 
 		 219 aa  181  8.000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.000000000325408  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3068  50S ribosomal protein L3  45.88 
 
 		 219 aa  181  8.000000000000001e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000718216  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3478  50S ribosomal protein L3  45.88 
 
 		 219 aa  181  8.000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  unclonable  0.00000000879138  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1924  50S ribosomal protein L3  45.88 
 
 		 219 aa  181  8.000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000132844  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3169  50S ribosomal protein L3  45.88 
 
 		 219 aa  181  8.000000000000001e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000263976  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3804  50S ribosomal protein L3  45.88 
 
 		 223 aa  181  8.000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.000896818  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3746  50S ribosomal protein L3  45.88 
 
 		 219 aa  181  8.000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  unclonable  0.0000000000021686  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03171  50S ribosomal protein L3  47.5 
 
 		 209 aa  180  1e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00105587  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0393  ribosomal protein L3  47.5 
 
 		 209 aa  180  1e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000156822  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3514  50S ribosomal protein L3  47.5 
 
 		 209 aa  180  1e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000214725  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4643  50S ribosomal protein L3  47.5 
 
 		 209 aa  180  1e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000124545  normal  0.0362623 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3705  50S ribosomal protein L3  47.5 
 
 		 209 aa  180  1e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000030519  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4315  50S ribosomal protein L3  45.77 
 
 		 219 aa  180  1e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00341518 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03122  hypothetical protein  47.5 
 
 		 209 aa  180  1e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000891003  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3615  50S ribosomal protein L3  47.5 
 
 		 209 aa  180  1e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000666979  hitchhiker  0.00609107 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2257  50S ribosomal protein L3  47.76 
 
 		 209 aa  180  1e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000117498  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0960  50S ribosomal protein L3  47.67 
 
 		 214 aa  181  1e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000067151  hitchhiker  0.000000166028 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3803  50S ribosomal protein L3  47.5 
 
 		 209 aa  180  1e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000338592  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0393  50S ribosomal protein L3  47.5 
 
 		 209 aa  180  1e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000309233  hitchhiker  0.00746366 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3751  50S ribosomal protein L3  47.5 
 
 		 209 aa  180  1e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000000163503  hitchhiker  0.0040389 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0458  50S ribosomal protein L3P  47 
 
 		 218 aa  180  1e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.310193  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3822  50S ribosomal protein L3  47.5 
 
 		 209 aa  180  1e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000994751  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4001  50S ribosomal protein L3  47 
 
 		 209 aa  180  1e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000133554  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3019  50S ribosomal protein L3  43.07 
 
 		 220 aa  179  2e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0000216849  hitchhiker  0.0059333 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5124  50S ribosomal protein L3  44.17 
 
 		 216 aa  180  2e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0701  50S ribosomal protein L3  44.93 
 
 		 210 aa  179  2e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000481863  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2840  50S ribosomal protein L3  45.36 
 
 		 219 aa  179  2e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000111519  normal  0.199419 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2460  50S ribosomal protein L3  48.06 
 
 		 209 aa  179  2e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0891685 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3923  50S ribosomal protein L3  45.77 
 
 		 219 aa  179  2e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1226  50S ribosomal protein L3  47.2 
 
 		 244 aa  180  2e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0600156  unclonable  0.00000985108 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00730  50S ribosomal protein L3  46.94 
 
 		 209 aa  179  2.9999999999999997e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2333  50S ribosomal protein L3  46.38 
 
 		 212 aa  179  2.9999999999999997e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000241734  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>