More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4507 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_4507  50S ribosomal protein L3  100 
 
 		 221 aa  437  9.999999999999999e-123  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.787031  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4321  ribosomal protein L3  76.06 
 
 		 216 aa  334  7e-91  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1123  ribosomal protein L3  77.93 
 
 		 220 aa  331  4e-90  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6614  ribosomal protein L3  78.95 
 
 		 216 aa  328  3e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0582  50S ribosomal protein L3  74.53 
 
 		 235 aa  325  5e-88  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2646  50S ribosomal protein L3  74.76 
 
 		 216 aa  321  7e-87  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.334348  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1086  LSU ribosomal protein L3P  72.43 
 
 		 217 aa  318  6e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.10406 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03980  LSU ribosomal protein L3P  75.24 
 
 		 213 aa  316  2e-85  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6049  50S ribosomal protein L3  73.21 
 
 		 236 aa  314  8e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.185718  normal  0.220559 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3758  50S ribosomal protein L3  73.11 
 
 		 219 aa  313  9.999999999999999e-85  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.33789  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0931  ribosomal protein L3  70.09 
 
 		 215 aa  313  9.999999999999999e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.15696  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5124  50S ribosomal protein L3  70.81 
 
 		 216 aa  313  1.9999999999999998e-84  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3435  50S ribosomal protein L3  73.58 
 
 		 218 aa  310  7.999999999999999e-84  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0562  50S ribosomal protein L3  69.63 
 
 		 218 aa  310  1e-83  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2687  50S ribosomal protein L3  70.67 
 
 		 216 aa  309  2e-83  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.740328 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2975  50S ribosomal protein L3  70.19 
 
 		 216 aa  309  2e-83  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.454423  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17160  50S ribosomal protein L3  68.72 
 
 		 216 aa  307  8e-83  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.283771  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23810  LSU ribosomal protein L3P  71.09 
 
 		 226 aa  305  3e-82  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29740  LSU ribosomal protein L3P  71.84 
 
 		 219 aa  302  3.0000000000000004e-81  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.378005 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0306  50S ribosomal protein L3P  68.54 
 
 		 222 aa  301  5.000000000000001e-81  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00207169 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1040  50S ribosomal protein L3  72.17 
 
 		 217 aa  301  8.000000000000001e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1013  50S ribosomal protein L3  72.17 
 
 		 217 aa  301  8.000000000000001e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1030  50S ribosomal protein L3  72.17 
 
 		 217 aa  301  8.000000000000001e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0627  ribosomal protein L3  71.36 
 
 		 217 aa  300  1e-80  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1305  50S ribosomal protein L3  71.7 
 
 		 218 aa  300  1e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.207115  normal  0.106977 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2659  50S ribosomal protein L3  70.87 
 
 		 219 aa  299  2e-80  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10715  50S ribosomal protein L3  70.75 
 
 		 217 aa  296  2e-79  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.249834 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0688  ribosomal protein L3  70.53 
 
 		 219 aa  295  4e-79  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.409644 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5049  50S ribosomal protein L3  70.89 
 
 		 218 aa  295  5e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.399218 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20870  LSU ribosomal protein L3P  67.14 
 
 		 219 aa  294  6e-79  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.235842  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1185  50S ribosomal protein L3  72.17 
 
 		 220 aa  293  1e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.108943 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3905  50S ribosomal protein L3  67.31 
 
 		 223 aa  293  2e-78  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3143  ribosomal protein L3  67.77 
 
 		 220 aa  291  7e-78  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0896196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4315  50S ribosomal protein L3  67.94 
 
 		 219 aa  289  2e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00341518 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3923  50S ribosomal protein L3  67.94 
 
 		 219 aa  286  2e-76  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0587  ribosomal protein L3  66.83 
 
 		 219 aa  283  1.0000000000000001e-75  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.295272  normal  0.46094 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1707  50S ribosomal protein L3  61.61 
 
 		 213 aa  258  4e-68  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00287886  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0255  50S ribosomal protein L3  61.65 
 
 		 216 aa  257  1e-67  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4915  50S ribosomal protein L3  54.33 
 
 		 212 aa  227  1e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0274485  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0286  50S ribosomal protein L3  56.04 
 
 		 209 aa  223  2e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0410836  hitchhiker  0.00603059 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1184  ribosomal protein L3  55.88 
 
 		 209 aa  222  3e-57  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000270125  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3667  50S ribosomal protein L3  51.67 
 
 		 211 aa  221  6e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000330884  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10020  LSU ribosomal protein L3P  52.43 
 
 		 206 aa  221  9.999999999999999e-57  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.000000402835  hitchhiker  0.00000000318342 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2460  50S ribosomal protein L3  54.55 
 
 		 209 aa  219  1.9999999999999999e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0891685 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3024  50S ribosomal protein L3  52.63 
 
 		 210 aa  219  3e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.371217  hitchhiker  0.00790921 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1745  50S ribosomal protein L3  53.14 
 
 		 210 aa  218  5e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000981122  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2714  50S ribosomal protein L3  52.66 
 
 		 209 aa  218  6e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000231855  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2399  50S ribosomal protein L3  52.17 
 
 		 209 aa  218  7.999999999999999e-56  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000824684  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1161  ribosomal protein L3  55.67 
 
 		 206 aa  216  2e-55  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000266904  hitchhiker  0.000000567921 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1524  50S ribosomal protein L3  53.85 
 
 		 209 aa  216  2e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.593746  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0691  50S ribosomal protein L3  52.4 
 
 		 211 aa  215  2.9999999999999998e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00208666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2174  50S ribosomal protein L3  54.37 
 
 		 209 aa  214  7e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000029924  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0405  50S ribosomal protein L3P  55.24 
 
 		 214 aa  214  9.999999999999999e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  unclonable  0.0000000000324929  normal  0.15101 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1185  50S ribosomal protein L3  52.63 
 
 		 210 aa  214  9.999999999999999e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0715  ribosomal protein L3  54.9 
 
 		 204 aa  214  9.999999999999999e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0320  50S ribosomal protein L3  53.4 
 
 		 209 aa  214  9.999999999999999e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0285067  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0215  50S ribosomal protein L3  54.59 
 
 		 209 aa  213  1.9999999999999998e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000370606  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00730  50S ribosomal protein L3  53.88 
 
 		 209 aa  213  1.9999999999999998e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4026  50S ribosomal protein L3  52.15 
 
 		 210 aa  213  1.9999999999999998e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000729954 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1292  50S ribosomal protein L3  51.47 
 
 		 212 aa  213  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.0000167398  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001742  LSU ribosomal protein L3p (L3e)  53.88 
 
 		 209 aa  212  2.9999999999999995e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000145621  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0225  ribosomal protein L3  53.05 
 
 		 213 aa  212  2.9999999999999995e-54  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0847  50S ribosomal protein L3P  53.37 
 
 		 214 aa  211  7e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000479377  decreased coverage  0.0000116579 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0295  ribosomal protein L3  53.59 
 
 		 212 aa  209  3e-53  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000479422  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2559  50S ribosomal protein L3  52.26 
 
 		 211 aa  208  4e-53  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.101168  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0962  ribosomal protein L3  53.4 
 
 		 206 aa  208  6e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000608869  hitchhiker  0.0000000000269964 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0960  50S ribosomal protein L3  52.91 
 
 		 214 aa  208  6e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000067151  hitchhiker  0.000000166028 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1346  50S ribosomal protein L3  52.17 
 
 		 211 aa  207  8e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.700686  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0584  50S ribosomal protein L3  52.91 
 
 		 209 aa  206  2e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000000183333  normal  0.0735815 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0283  50S ribosomal protein L3  52.91 
 
 		 209 aa  206  2e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000156273  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2232  50S ribosomal protein L3  51.47 
 
 		 213 aa  206  2e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.422626 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3915  50S ribosomal protein L3  52.91 
 
 		 209 aa  206  2e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  5.44377e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2333  50S ribosomal protein L3  48.58 
 
 		 212 aa  206  2e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000241734  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0323  ribosomal protein L3  52.17 
 
 		 209 aa  206  3e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000222247  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05715  50S ribosomal protein L3  50.74 
 
 		 205 aa  205  5e-52  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.499117  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0405  ribosomal protein L3  51.94 
 
 		 209 aa  204  6e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00399178  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1147  50S ribosomal protein L3  50.99 
 
 		 205 aa  204  7e-52  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000530687  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1867  50S ribosomal protein L3  54.07 
 
 		 207 aa  204  7e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0222976  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2907  50S ribosomal protein L3  53.85 
 
 		 212 aa  204  8e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0111  50S ribosomal protein L3  52.17 
 
 		 211 aa  204  1e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000151121  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3995  ribosomal protein L3  51.94 
 
 		 208 aa  203  1e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1955  50S ribosomal protein L3  48.06 
 
 		 218 aa  203  1e-51  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4544  50S ribosomal protein L3  52.43 
 
 		 209 aa  204  1e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000354089  hitchhiker  0.00195748 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0458  50S ribosomal protein L3P  53.4 
 
 		 218 aa  204  1e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.310193  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1938  50S ribosomal protein L3  51.23 
 
 		 205 aa  203  2e-51  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1067  50S ribosomal protein L3  52.66 
 
 		 211 aa  203  2e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000374639  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20031  50S ribosomal protein L3  48.53 
 
 		 218 aa  202  3e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3751  50S ribosomal protein L3  51.94 
 
 		 209 aa  202  3e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000000163503  hitchhiker  0.0040389 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0398  ribosomal protein L3  48.54 
 
 		 213 aa  202  4e-51  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0867  50S ribosomal protein L3  49.28 
 
 		 210 aa  202  4e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000729631  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1129  50S ribosomal protein L3  48.04 
 
 		 218 aa  202  4e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1615  ribosomal protein L3  46.83 
 
 		 205 aa  201  5e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0422  50S ribosomal protein L3  49.76 
 
 		 209 aa  202  5e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000195061  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0393  ribosomal protein L3  51.46 
 
 		 209 aa  201  6e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000156822  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0249  50S ribosomal protein L3  50.24 
 
 		 212 aa  201  6e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.587373  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03122  hypothetical protein  51.46 
 
 		 209 aa  201  6e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000891003  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3615  50S ribosomal protein L3  51.46 
 
 		 209 aa  201  6e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000666979  hitchhiker  0.00609107 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0393  50S ribosomal protein L3  51.46 
 
 		 209 aa  201  6e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000309233  hitchhiker  0.00746366 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4643  50S ribosomal protein L3  51.46 
 
 		 209 aa  201  6e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000124545  normal  0.0362623 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3705  50S ribosomal protein L3  51.46 
 
 		 209 aa  201  6e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000030519  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>