More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_4315 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_4315  50S ribosomal protein L3  100 
 
 		 219 aa  442  1e-123  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00341518 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3923  50S ribosomal protein L3  97.12 
 
 		 219 aa  412  1e-114  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1185  50S ribosomal protein L3  78.08 
 
 		 220 aa  327  9e-89  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.108943 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0931  ribosomal protein L3  71.23 
 
 		 215 aa  312  1.9999999999999998e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.15696  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6614  ribosomal protein L3  72.04 
 
 		 216 aa  311  3.9999999999999997e-84  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0688  ribosomal protein L3  70.42 
 
 		 219 aa  308  5.9999999999999995e-83  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.409644 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4321  ribosomal protein L3  70.75 
 
 		 216 aa  306  1.0000000000000001e-82  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0562  50S ribosomal protein L3  68.64 
 
 		 218 aa  306  1.0000000000000001e-82  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0306  50S ribosomal protein L3P  69.37 
 
 		 222 aa  304  6e-82  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00207169 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1086  LSU ribosomal protein L3P  67.27 
 
 		 217 aa  303  1.0000000000000001e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.10406 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5124  50S ribosomal protein L3  68.08 
 
 		 216 aa  302  2.0000000000000002e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20870  LSU ribosomal protein L3P  67.45 
 
 		 219 aa  300  1e-80  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.235842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0582  50S ribosomal protein L3  68.87 
 
 		 235 aa  297  8e-80  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17160  50S ribosomal protein L3  66.67 
 
 		 216 aa  297  9e-80  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.283771  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2646  50S ribosomal protein L3  68.08 
 
 		 216 aa  296  2e-79  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.334348  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2975  50S ribosomal protein L3  66.67 
 
 		 216 aa  295  4e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.454423  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2687  50S ribosomal protein L3  66.19 
 
 		 216 aa  295  5e-79  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.740328 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4507  50S ribosomal protein L3  67.92 
 
 		 221 aa  292  3e-78  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.787031  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29740  LSU ribosomal protein L3P  67.3 
 
 		 219 aa  291  7e-78  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.378005 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3758  50S ribosomal protein L3  68.12 
 
 		 219 aa  291  8e-78  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.33789  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6049  50S ribosomal protein L3  66.99 
 
 		 236 aa  289  2e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.185718  normal  0.220559 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1123  ribosomal protein L3  67.14 
 
 		 220 aa  288  4e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3435  50S ribosomal protein L3  66.82 
 
 		 218 aa  286  1e-76  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2659  50S ribosomal protein L3  67.14 
 
 		 219 aa  285  2.9999999999999996e-76  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23810  LSU ribosomal protein L3P  66.82 
 
 		 226 aa  285  4e-76  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3905  50S ribosomal protein L3  63.85 
 
 		 223 aa  283  1.0000000000000001e-75  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03980  LSU ribosomal protein L3P  66.83 
 
 		 213 aa  281  4.0000000000000003e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0587  ribosomal protein L3  65.88 
 
 		 219 aa  278  7e-74  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.295272  normal  0.46094 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1305  50S ribosomal protein L3  66.19 
 
 		 218 aa  276  2e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.207115  normal  0.106977 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3143  ribosomal protein L3  65.87 
 
 		 220 aa  275  4e-73  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0896196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0627  ribosomal protein L3  63.21 
 
 		 217 aa  275  5e-73  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10715  50S ribosomal protein L3  65.24 
 
 		 217 aa  270  1e-71  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.249834 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1013  50S ribosomal protein L3  63.81 
 
 		 217 aa  270  1e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1030  50S ribosomal protein L3  63.81 
 
 		 217 aa  270  1e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1040  50S ribosomal protein L3  63.81 
 
 		 217 aa  270  1e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5049  50S ribosomal protein L3  64.45 
 
 		 218 aa  270  1e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.399218 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1707  50S ribosomal protein L3  57.49 
 
 		 213 aa  248  4e-65  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00287886  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0255  50S ribosomal protein L3  57.56 
 
 		 216 aa  246  3e-64  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1184  ribosomal protein L3  56.1 
 
 		 209 aa  223  2e-57  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000270125  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2907  50S ribosomal protein L3  55.14 
 
 		 212 aa  218  7e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4915  50S ribosomal protein L3  53.08 
 
 		 212 aa  218  7.999999999999999e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0274485  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0847  50S ribosomal protein L3P  52.91 
 
 		 214 aa  215  4e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000479377  decreased coverage  0.0000116579 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3667  50S ribosomal protein L3  50.48 
 
 		 211 aa  214  9.999999999999999e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000330884  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0691  50S ribosomal protein L3  51.2 
 
 		 211 aa  212  3.9999999999999995e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00208666  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10020  LSU ribosomal protein L3P  51.46 
 
 		 206 aa  211  7e-54  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.000000402835  hitchhiker  0.00000000318342 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1161  ribosomal protein L3  53.4 
 
 		 206 aa  207  7e-53  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000266904  hitchhiker  0.000000567921 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0960  50S ribosomal protein L3  50.24 
 
 		 214 aa  207  1e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000067151  hitchhiker  0.000000166028 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0715  ribosomal protein L3  50.97 
 
 		 204 aa  206  2e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1138  50S ribosomal protein L3  46.86 
 
 		 207 aa  205  5e-52  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000858376  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2559  50S ribosomal protein L3  50.75 
 
 		 211 aa  204  7e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.101168  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0286  50S ribosomal protein L3  50.24 
 
 		 209 aa  204  1e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0410836  hitchhiker  0.00603059 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0111  50S ribosomal protein L3  51.2 
 
 		 211 aa  204  1e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000151121  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1938  50S ribosomal protein L3  48.28 
 
 		 205 aa  203  2e-51  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2711  50S ribosomal protein L3  51.44 
 
 		 211 aa  203  2e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000399657  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1745  50S ribosomal protein L3  49.28 
 
 		 210 aa  202  2e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000981122  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2460  50S ribosomal protein L3  49.76 
 
 		 209 aa  202  4e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0891685 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3024  50S ribosomal protein L3  48.56 
 
 		 210 aa  202  5e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.371217  hitchhiker  0.00790921 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1524  50S ribosomal protein L3  49.76 
 
 		 209 aa  202  5e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.593746  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1867  50S ribosomal protein L3  53.59 
 
 		 207 aa  201  5e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0222976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1346  50S ribosomal protein L3  50.71 
 
 		 211 aa  201  8e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.700686  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0458  50S ribosomal protein L3P  50.7 
 
 		 218 aa  201  9e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.310193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1185  50S ribosomal protein L3  50 
 
 		 210 aa  199  1.9999999999999998e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0790  50S ribosomal protein L3  44.76 
 
 		 213 aa  199  1.9999999999999998e-50  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1292  50S ribosomal protein L3  48.53 
 
 		 212 aa  199  3e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.0000167398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4026  50S ribosomal protein L3  49.52 
 
 		 210 aa  199  3.9999999999999996e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000729954 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0104  50S ribosomal protein L3  51.43 
 
 		 210 aa  198  3.9999999999999996e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000119433  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0398  ribosomal protein L3  46.19 
 
 		 213 aa  199  3.9999999999999996e-50  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20031  50S ribosomal protein L3  47.57 
 
 		 218 aa  199  3.9999999999999996e-50  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1129  50S ribosomal protein L3  47.09 
 
 		 218 aa  198  5e-50  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0422  50S ribosomal protein L3  50.24 
 
 		 209 aa  197  1.0000000000000001e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000195061  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2619  50S ribosomal protein L3  49.77 
 
 		 214 aa  196  2.0000000000000003e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0132285  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3995  ribosomal protein L3  48.29 
 
 		 208 aa  196  2.0000000000000003e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0225  ribosomal protein L3  48.37 
 
 		 213 aa  196  2.0000000000000003e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0962  ribosomal protein L3  51.46 
 
 		 206 aa  196  2.0000000000000003e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000608869  hitchhiker  0.0000000000269964 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0867  50S ribosomal protein L3  47.37 
 
 		 210 aa  196  3e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000729631  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2229  50S ribosomal protein L3  47.09 
 
 		 209 aa  196  3e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000790762  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01170  50S ribosomal protein L3  48.31 
 
 		 211 aa  195  5.000000000000001e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000794381  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1067  50S ribosomal protein L3  48.1 
 
 		 211 aa  194  6e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000374639  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5195  50S ribosomal protein L3  51.43 
 
 		 210 aa  194  6e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000842867  unclonable  2.19314e-25 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0105  50S ribosomal protein L3  51.43 
 
 		 210 aa  194  6e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000775669  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0858  ribosomal protein L3  48.36 
 
 		 216 aa  194  9e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.451508  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16781  50S ribosomal protein L3  46.6 
 
 		 219 aa  194  1e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2065  50S ribosomal protein L3  47.26 
 
 		 209 aa  194  1e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.00000000000562685  normal  0.223373 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2174  50S ribosomal protein L3  48.31 
 
 		 209 aa  193  2e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000029924  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0079  50S ribosomal protein L3  50 
 
 		 209 aa  193  2e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.145283 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1955  50S ribosomal protein L3  46.51 
 
 		 218 aa  193  2e-48  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3703  50S ribosomal protein L3  47.32 
 
 		 212 aa  193  2e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1716  50S ribosomal protein L3  47.57 
 
 		 240 aa  192  3e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0849831  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1292  50S ribosomal protein L3  48.57 
 
 		 207 aa  192  3e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000263563  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1394  50S ribosomal protein L3  48.57 
 
 		 207 aa  192  3e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000462367  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0361  50S ribosomal protein L3  47.57 
 
 		 240 aa  192  3e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0289  50S ribosomal protein L3  46.6 
 
 		 209 aa  192  4e-48  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0110  50S ribosomal protein L3  50.48 
 
 		 210 aa  191  5e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000528056  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0110  50S ribosomal protein L3  50.48 
 
 		 210 aa  191  5e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000986131  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0106  50S ribosomal protein L3  50.48 
 
 		 210 aa  191  5e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.6707699999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0104  50S ribosomal protein L3  50.48 
 
 		 210 aa  191  5e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000168091  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0141  50S ribosomal protein L3  50.48 
 
 		 210 aa  191  5e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000551418  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0110  50S ribosomal protein L3  50.48 
 
 		 210 aa  191  5e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000246604  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0122  50S ribosomal protein L3  50.48 
 
 		 210 aa  191  5e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.0599700000000001e-61 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2534  50S ribosomal protein L3  47.09 
 
 		 239 aa  191  5e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.129465  normal  0.91694 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>