More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2975 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_2975  50S ribosomal protein L3  100 
 
 		 216 aa  434  1e-121  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.454423  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2687  50S ribosomal protein L3  97.22 
 
 		 216 aa  426  1e-118  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.740328 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17160  50S ribosomal protein L3  82.87 
 
 		 216 aa  377  1e-104  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.283771  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29740  LSU ribosomal protein L3P  75.94 
 
 		 219 aa  338  2.9999999999999998e-92  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.378005 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2659  50S ribosomal protein L3  76.42 
 
 		 219 aa  337  5.9999999999999996e-92  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23810  LSU ribosomal protein L3P  76.19 
 
 		 226 aa  332  2e-90  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20870  LSU ribosomal protein L3P  74.42 
 
 		 219 aa  332  2e-90  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.235842  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0627  ribosomal protein L3  72.17 
 
 		 217 aa  322  2e-87  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0587  ribosomal protein L3  73.11 
 
 		 219 aa  321  5e-87  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.295272  normal  0.46094 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0688  ribosomal protein L3  70.95 
 
 		 219 aa  315  3e-85  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.409644 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3143  ribosomal protein L3  70.7 
 
 		 220 aa  314  6e-85  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0896196  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3905  50S ribosomal protein L3  68.06 
 
 		 223 aa  311  4.999999999999999e-84  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3758  50S ribosomal protein L3  68.84 
 
 		 219 aa  311  6.999999999999999e-84  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.33789  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4507  50S ribosomal protein L3  70.19 
 
 		 221 aa  309  2e-83  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.787031  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6614  ribosomal protein L3  68.72 
 
 		 216 aa  306  2.0000000000000002e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4321  ribosomal protein L3  67.61 
 
 		 216 aa  302  2.0000000000000002e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0582  50S ribosomal protein L3  66.19 
 
 		 235 aa  300  8.000000000000001e-81  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6049  50S ribosomal protein L3  65.38 
 
 		 236 aa  298  6e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.185718  normal  0.220559 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3435  50S ribosomal protein L3  66.03 
 
 		 218 aa  292  2e-78  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2646  50S ribosomal protein L3  64.15 
 
 		 216 aa  291  4e-78  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.334348  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0931  ribosomal protein L3  64.76 
 
 		 215 aa  291  5e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.15696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4315  50S ribosomal protein L3  66.67 
 
 		 219 aa  291  5e-78  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00341518 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5124  50S ribosomal protein L3  63.85 
 
 		 216 aa  291  6e-78  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03980  LSU ribosomal protein L3P  66.03 
 
 		 213 aa  289  3e-77  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3923  50S ribosomal protein L3  65.7 
 
 		 219 aa  288  5.0000000000000004e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1086  LSU ribosomal protein L3P  62.86 
 
 		 217 aa  285  5e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.10406 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0255  50S ribosomal protein L3  61.11 
 
 		 216 aa  285  5e-76  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1185  50S ribosomal protein L3  68.57 
 
 		 220 aa  283  1.0000000000000001e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.108943 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0562  50S ribosomal protein L3  61.43 
 
 		 218 aa  283  1.0000000000000001e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0306  50S ribosomal protein L3P  63.03 
 
 		 222 aa  281  8.000000000000001e-75  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00207169 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1305  50S ribosomal protein L3  63.81 
 
 		 218 aa  279  3e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.207115  normal  0.106977 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1707  50S ribosomal protein L3  62.09 
 
 		 213 aa  277  8e-74  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00287886  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1013  50S ribosomal protein L3  63.81 
 
 		 217 aa  277  8e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1040  50S ribosomal protein L3  63.81 
 
 		 217 aa  277  8e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1030  50S ribosomal protein L3  63.81 
 
 		 217 aa  277  8e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5049  50S ribosomal protein L3  63.51 
 
 		 218 aa  277  1e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.399218 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10715  50S ribosomal protein L3  62.86 
 
 		 217 aa  275  5e-73  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.249834 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1123  ribosomal protein L3  62.68 
 
 		 220 aa  271  6e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4915  50S ribosomal protein L3  52.4 
 
 		 212 aa  220  9.999999999999999e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0274485  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0960  50S ribosomal protein L3  55.34 
 
 		 214 aa  219  1.9999999999999999e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000067151  hitchhiker  0.000000166028 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10020  LSU ribosomal protein L3P  50.49 
 
 		 206 aa  219  1.9999999999999999e-56  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.000000402835  hitchhiker  0.00000000318342 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2460  50S ribosomal protein L3  51.44 
 
 		 209 aa  213  9.999999999999999e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0891685 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2907  50S ribosomal protein L3  53.85 
 
 		 212 aa  211  7.999999999999999e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0497  50S ribosomal protein L3  49.28 
 
 		 210 aa  211  9e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.443535  hitchhiker  0.00000000471094 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0327  50S ribosomal protein L3  49.28 
 
 		 210 aa  211  9e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.322183  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0458  50S ribosomal protein L3P  53.4 
 
 		 218 aa  211  9e-54  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.310193  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1745  50S ribosomal protein L3  49.28 
 
 		 210 aa  210  1e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000981122  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1184  ribosomal protein L3  50 
 
 		 209 aa  210  2e-53  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000270125  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0691  50S ribosomal protein L3  50 
 
 		 211 aa  209  2e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00208666  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0225  ribosomal protein L3  50.48 
 
 		 213 aa  209  2e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0962  ribosomal protein L3  50.97 
 
 		 206 aa  209  3e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000608869  hitchhiker  0.0000000000269964 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2324  ribosomal protein L3  54.81 
 
 		 214 aa  208  5e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00000658885  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1524  50S ribosomal protein L3  50 
 
 		 209 aa  207  8e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.593746  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0286  50S ribosomal protein L3  49.28 
 
 		 209 aa  207  1e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0410836  hitchhiker  0.00603059 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2174  50S ribosomal protein L3  51.94 
 
 		 209 aa  207  1e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000029924  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0398  ribosomal protein L3  46.63 
 
 		 213 aa  206  2e-52  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0295  ribosomal protein L3  52.63 
 
 		 212 aa  206  2e-52  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000479422  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3667  50S ribosomal protein L3  50.24 
 
 		 211 aa  206  2e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000330884  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3024  50S ribosomal protein L3  48.8 
 
 		 210 aa  205  3e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.371217  hitchhiker  0.00790921 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0405  50S ribosomal protein L3P  52.15 
 
 		 214 aa  206  3e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  unclonable  0.0000000000324929  normal  0.15101 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001742  LSU ribosomal protein L3p (L3e)  51.46 
 
 		 209 aa  205  5e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000145621  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0320  50S ribosomal protein L3  50.97 
 
 		 209 aa  204  7e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0285067  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2559  50S ribosomal protein L3  49.75 
 
 		 211 aa  204  8e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.101168  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0715  ribosomal protein L3  48.06 
 
 		 204 aa  204  1e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0104  50S ribosomal protein L3  50.72 
 
 		 210 aa  202  2e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000119433  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0323  ribosomal protein L3  50.97 
 
 		 209 aa  202  2e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000222247  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05715  50S ribosomal protein L3  48.78 
 
 		 205 aa  202  3e-51  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.499117  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0858  ribosomal protein L3  51.89 
 
 		 216 aa  202  3e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.451508  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3751  50S ribosomal protein L3  50.97 
 
 		 209 aa  202  3e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000000163503  hitchhiker  0.0040389 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5195  50S ribosomal protein L3  51.21 
 
 		 210 aa  202  4e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000842867  unclonable  2.19314e-25 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0105  50S ribosomal protein L3  51.21 
 
 		 210 aa  202  4e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000775669  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0847  50S ribosomal protein L3P  49.51 
 
 		 214 aa  202  5e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000479377  decreased coverage  0.0000116579 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4026  50S ribosomal protein L3  48.57 
 
 		 210 aa  201  5e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000729954 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3338  50S ribosomal protein L3  50 
 
 		 212 aa  201  7e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000254045  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1938  50S ribosomal protein L3  49.75 
 
 		 205 aa  201  8e-51  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4544  50S ribosomal protein L3  51.46 
 
 		 209 aa  201  8e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000354089  hitchhiker  0.00195748 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00730  50S ribosomal protein L3  50.49 
 
 		 209 aa  201  9e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20031  50S ribosomal protein L3  48.53 
 
 		 218 aa  201  9e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03171  50S ribosomal protein L3  50.49 
 
 		 209 aa  200  9.999999999999999e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00105587  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0393  ribosomal protein L3  50.49 
 
 		 209 aa  200  9.999999999999999e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000156822  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03122  hypothetical protein  50.49 
 
 		 209 aa  200  9.999999999999999e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000891003  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3705  50S ribosomal protein L3  50.49 
 
 		 209 aa  200  9.999999999999999e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000030519  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1129  50S ribosomal protein L3  48.04 
 
 		 218 aa  201  9.999999999999999e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1161  ribosomal protein L3  49.51 
 
 		 206 aa  200  9.999999999999999e-51  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000266904  hitchhiker  0.000000567921 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1955  50S ribosomal protein L3  47.09 
 
 		 218 aa  201  9.999999999999999e-51  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2232  50S ribosomal protein L3  50 
 
 		 213 aa  201  9.999999999999999e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.422626 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3615  50S ribosomal protein L3  50.49 
 
 		 209 aa  200  9.999999999999999e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000666979  hitchhiker  0.00609107 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3803  50S ribosomal protein L3  50.49 
 
 		 209 aa  200  9.999999999999999e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000338592  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3514  50S ribosomal protein L3  50.49 
 
 		 209 aa  200  9.999999999999999e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000214725  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4643  50S ribosomal protein L3  50.49 
 
 		 209 aa  200  9.999999999999999e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000124545  normal  0.0362623 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0393  50S ribosomal protein L3  50.49 
 
 		 209 aa  200  9.999999999999999e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000309233  hitchhiker  0.00746366 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1185  50S ribosomal protein L3  47.62 
 
 		 210 aa  201  9.999999999999999e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2966  50S ribosomal protein L3  48.56 
 
 		 227 aa  199  1.9999999999999998e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0816974  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3744  50S ribosomal protein L3  50.97 
 
 		 209 aa  199  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00311101  normal  0.0177476 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3807  50S ribosomal protein L3  50.97 
 
 		 209 aa  199  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000142393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0397  50S ribosomal protein L3  49.27 
 
 		 205 aa  199  1.9999999999999998e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3636  50S ribosomal protein L3  50.97 
 
 		 209 aa  199  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000145749  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2714  50S ribosomal protein L3  48.31 
 
 		 209 aa  199  1.9999999999999998e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000231855  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0111  50S ribosomal protein L3  49.28 
 
 		 211 aa  199  1.9999999999999998e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000151121  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3636  50S ribosomal protein L3  50.97 
 
 		 209 aa  199  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000330914  normal  0.241535 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>