More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_29740 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_29740  LSU ribosomal protein L3P  100 
 
 		 219 aa  436  1e-121  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.378005 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2659  50S ribosomal protein L3  88.58 
 
 		 219 aa  390  1e-108  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0587  ribosomal protein L3  81.28 
 
 		 219 aa  361  4e-99  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.295272  normal  0.46094 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0627  ribosomal protein L3  84.04 
 
 		 217 aa  360  7.0000000000000005e-99  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20870  LSU ribosomal protein L3P  76.26 
 
 		 219 aa  344  6e-94  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.235842  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3143  ribosomal protein L3  80.48 
 
 		 220 aa  344  8e-94  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0896196  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2687  50S ribosomal protein L3  77.36 
 
 		 216 aa  343  2e-93  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.740328 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23810  LSU ribosomal protein L3P  77.21 
 
 		 226 aa  340  1e-92  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2975  50S ribosomal protein L3  75.94 
 
 		 216 aa  338  2.9999999999999998e-92  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.454423  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0688  ribosomal protein L3  73.11 
 
 		 219 aa  325  5e-88  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.409644 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17160  50S ribosomal protein L3  71.96 
 
 		 216 aa  323  8.000000000000001e-88  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.283771  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3758  50S ribosomal protein L3  71.36 
 
 		 219 aa  318  3e-86  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.33789  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3905  50S ribosomal protein L3  70.14 
 
 		 223 aa  309  2e-83  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6614  ribosomal protein L3  69.95 
 
 		 216 aa  307  8e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4321  ribosomal protein L3  69.81 
 
 		 216 aa  306  2.0000000000000002e-82  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03980  LSU ribosomal protein L3P  71.84 
 
 		 213 aa  303  1.0000000000000001e-81  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4507  50S ribosomal protein L3  71.84 
 
 		 221 aa  302  3.0000000000000004e-81  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.787031  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0582  50S ribosomal protein L3  67.14 
 
 		 235 aa  299  3e-80  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2646  50S ribosomal protein L3  66.51 
 
 		 216 aa  295  3e-79  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.334348  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6049  50S ribosomal protein L3  65.38 
 
 		 236 aa  295  3e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.185718  normal  0.220559 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0931  ribosomal protein L3  66.67 
 
 		 215 aa  294  9e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.15696  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3435  50S ribosomal protein L3  66.04 
 
 		 218 aa  293  1e-78  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5124  50S ribosomal protein L3  64.68 
 
 		 216 aa  293  1e-78  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1305  50S ribosomal protein L3  67.31 
 
 		 218 aa  288  6e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.207115  normal  0.106977 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10715  50S ribosomal protein L3  68.27 
 
 		 217 aa  287  7e-77  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.249834 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3923  50S ribosomal protein L3  67.31 
 
 		 219 aa  287  8e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4315  50S ribosomal protein L3  66.83 
 
 		 219 aa  285  2.9999999999999996e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00341518 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5049  50S ribosomal protein L3  66.51 
 
 		 218 aa  285  4e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.399218 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0255  50S ribosomal protein L3  63.93 
 
 		 216 aa  284  7e-76  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1086  LSU ribosomal protein L3P  64.76 
 
 		 217 aa  284  8e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.10406 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0562  50S ribosomal protein L3  64.76 
 
 		 218 aa  283  1.0000000000000001e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1123  ribosomal protein L3  66.51 
 
 		 220 aa  283  2.0000000000000002e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1040  50S ribosomal protein L3  65.38 
 
 		 217 aa  282  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1013  50S ribosomal protein L3  65.38 
 
 		 217 aa  282  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1030  50S ribosomal protein L3  65.38 
 
 		 217 aa  282  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1185  50S ribosomal protein L3  67.77 
 
 		 220 aa  280  1e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.108943 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1707  50S ribosomal protein L3  65.38 
 
 		 213 aa  280  1e-74  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00287886  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0306  50S ribosomal protein L3P  64.11 
 
 		 222 aa  278  6e-74  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00207169 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10020  LSU ribosomal protein L3P  53.88 
 
 		 206 aa  224  9e-58  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.000000402835  hitchhiker  0.00000000318342 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4915  50S ribosomal protein L3  51.44 
 
 		 212 aa  218  7.999999999999999e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0274485  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0286  50S ribosomal protein L3  52.2 
 
 		 209 aa  217  8.999999999999998e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0410836  hitchhiker  0.00603059 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0691  50S ribosomal protein L3  53.17 
 
 		 211 aa  217  8.999999999999998e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00208666  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0962  ribosomal protein L3  53.88 
 
 		 206 aa  215  4e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000608869  hitchhiker  0.0000000000269964 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1184  ribosomal protein L3  52.45 
 
 		 209 aa  215  5e-55  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000270125  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2559  50S ribosomal protein L3  52.02 
 
 		 211 aa  211  4.9999999999999996e-54  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.101168  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0847  50S ribosomal protein L3P  52.66 
 
 		 214 aa  211  5.999999999999999e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000479377  decreased coverage  0.0000116579 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2460  50S ribosomal protein L3  50.49 
 
 		 209 aa  209  2e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0891685 
 
 
-
 
NC_002950  PG1938  50S ribosomal protein L3  51.98 
 
 		 205 aa  208  4e-53  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1524  50S ribosomal protein L3  50.24 
 
 		 209 aa  207  8e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.593746  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0215  50S ribosomal protein L3  51.22 
 
 		 209 aa  207  1e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000370606  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05715  50S ribosomal protein L3  50.73 
 
 		 205 aa  206  3e-52  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.499117  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0398  ribosomal protein L3  49.27 
 
 		 213 aa  206  3e-52  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0602  ribosomal protein L3  50 
 
 		 205 aa  205  5e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0458  50S ribosomal protein L3P  54.63 
 
 		 218 aa  204  8e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.310193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0960  50S ribosomal protein L3  53.17 
 
 		 214 aa  204  9e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000067151  hitchhiker  0.000000166028 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3162  50S ribosomal protein L3  50.49 
 
 		 206 aa  204  1e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.596382 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2907  50S ribosomal protein L3  55.12 
 
 		 212 aa  202  2e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01170  50S ribosomal protein L3  50.72 
 
 		 211 aa  202  2e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000794381  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2174  50S ribosomal protein L3  52.2 
 
 		 209 aa  202  2e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000029924  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0320  50S ribosomal protein L3  51.71 
 
 		 209 aa  203  2e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0285067  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4026  50S ribosomal protein L3  50 
 
 		 210 aa  203  2e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000729954 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0715  ribosomal protein L3  50 
 
 		 204 aa  202  3e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3024  50S ribosomal protein L3  49.28 
 
 		 210 aa  202  3e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.371217  hitchhiker  0.00790921 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3667  50S ribosomal protein L3  49.51 
 
 		 211 aa  202  3e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000330884  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1185  50S ribosomal protein L3  49.52 
 
 		 210 aa  202  3e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1161  ribosomal protein L3  50 
 
 		 206 aa  201  6e-51  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000266904  hitchhiker  0.000000567921 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1745  50S ribosomal protein L3  47.8 
 
 		 210 aa  201  6e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000981122  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1292  50S ribosomal protein L3  48.77 
 
 		 212 aa  200  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.0000167398  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001742  LSU ribosomal protein L3p (L3e)  51.71 
 
 		 209 aa  200  9.999999999999999e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000145621  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0842  ribosomal protein L3  51.44 
 
 		 210 aa  200  9.999999999999999e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00730  50S ribosomal protein L3  51.71 
 
 		 209 aa  200  1.9999999999999998e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0111  50S ribosomal protein L3  48.78 
 
 		 211 aa  198  3.9999999999999996e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000151121  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2232  50S ribosomal protein L3  50.25 
 
 		 213 aa  198  5e-50  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.422626 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0225  ribosomal protein L3  49.51 
 
 		 213 aa  198  6e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16240  LSU ribosomal protein L3P  52.43 
 
 		 206 aa  198  6e-50  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0560879  hitchhiker  0.00000737829 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1615  ribosomal protein L3  47.52 
 
 		 205 aa  198  6e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0422  50S ribosomal protein L3  49.76 
 
 		 209 aa  197  9e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000195061  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0323  ribosomal protein L3  50.24 
 
 		 209 aa  197  1.0000000000000001e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000222247  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0105  50S ribosomal protein L3  50.24 
 
 		 210 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000775669  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5195  50S ribosomal protein L3  50.24 
 
 		 210 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000842867  unclonable  2.19314e-25 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0289  50S ribosomal protein L3  46.86 
 
 		 209 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0327  50S ribosomal protein L3  46.89 
 
 		 210 aa  196  2.0000000000000003e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.322183  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0497  50S ribosomal protein L3  46.89 
 
 		 210 aa  196  2.0000000000000003e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.443535  hitchhiker  0.00000000471094 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2714  50S ribosomal protein L3  47.09 
 
 		 209 aa  196  2.0000000000000003e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000231855  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1346  50S ribosomal protein L3  48.78 
 
 		 211 aa  196  2.0000000000000003e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.700686  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2333  50S ribosomal protein L3  44.17 
 
 		 212 aa  196  2.0000000000000003e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000241734  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2903  50S ribosomal protein L3  47.09 
 
 		 212 aa  197  2.0000000000000003e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000477342  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0110  50S ribosomal protein L3  49.76 
 
 		 210 aa  196  3e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000528056  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0110  50S ribosomal protein L3  49.76 
 
 		 210 aa  196  3e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000986131  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0106  50S ribosomal protein L3  49.76 
 
 		 210 aa  196  3e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.6707699999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0104  50S ribosomal protein L3  49.76 
 
 		 210 aa  196  3e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000168091  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0141  50S ribosomal protein L3  49.76 
 
 		 210 aa  196  3e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000551418  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3915  50S ribosomal protein L3  51.22 
 
 		 209 aa  196  3e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  5.44377e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0110  50S ribosomal protein L3  49.76 
 
 		 210 aa  196  3e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000246604  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0283  50S ribosomal protein L3  51.22 
 
 		 209 aa  196  3e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000156273  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0131  50S ribosomal protein L3  49.76 
 
 		 210 aa  196  3e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000141135  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0122  50S ribosomal protein L3  49.76 
 
 		 210 aa  196  3e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.0599700000000001e-61 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0584  50S ribosomal protein L3  51.22 
 
 		 209 aa  196  3e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000000183333  normal  0.0735815 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0759  50S ribosomal protein L3  49.28 
 
 		 245 aa  196  3e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.496484  normal  0.485655 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5787  50S ribosomal protein L3  50.24 
 
 		 220 aa  195  4.0000000000000005e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0786499 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>