More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_3024 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011831  Cagg_3024  50S ribosomal protein L3  100 
 
 		 210 aa  422  1e-117  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.371217  hitchhiker  0.00790921 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4026  50S ribosomal protein L3  70 
 
 		 210 aa  305  3e-82  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000729954 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1185  50S ribosomal protein L3  69.52 
 
 		 210 aa  304  5.0000000000000004e-82  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4915  50S ribosomal protein L3  66.99 
 
 		 212 aa  298  3e-80  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0274485  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0715  ribosomal protein L3  65.22 
 
 		 204 aa  260  1e-68  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0306  50S ribosomal protein L3P  59.81 
 
 		 222 aa  258  4e-68  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00207169 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4321  ribosomal protein L3  57 
 
 		 216 aa  241  6e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0708  50S ribosomal protein L3  54.85 
 
 		 208 aa  239  2e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00455924  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0562  50S ribosomal protein L3  54.81 
 
 		 218 aa  238  5.999999999999999e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1745  50S ribosomal protein L3  54.55 
 
 		 210 aa  232  3e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000981122  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1524  50S ribosomal protein L3  55.77 
 
 		 209 aa  232  3e-60  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.593746  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2907  50S ribosomal protein L3  56.73 
 
 		 212 aa  231  7.000000000000001e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0474  50S ribosomal protein L3  54.85 
 
 		 205 aa  231  8.000000000000001e-60  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00148542  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1184  ribosomal protein L3  52.66 
 
 		 209 aa  230  1e-59  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000270125  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1938  50S ribosomal protein L3  55.88 
 
 		 205 aa  229  2e-59  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1129  50S ribosomal protein L3  54.11 
 
 		 218 aa  229  2e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_417  ribosomal protein L3  54.11 
 
 		 205 aa  229  2e-59  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000036263  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20031  50S ribosomal protein L3  53.62 
 
 		 218 aa  228  3e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0867  50S ribosomal protein L3  55.98 
 
 		 210 aa  227  1e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000729631  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0451  50S ribosomal protein L3  53.62 
 
 		 205 aa  227  1e-58  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000154888  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0376  50S ribosomal protein L3  54.07 
 
 		 218 aa  226  2e-58  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10715  50S ribosomal protein L3  54.55 
 
 		 217 aa  223  2e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.249834 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03980  LSU ribosomal protein L3P  51.2 
 
 		 213 aa  223  2e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5124  50S ribosomal protein L3  53.59 
 
 		 216 aa  223  2e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1955  50S ribosomal protein L3  52.15 
 
 		 218 aa  222  3e-57  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1305  50S ribosomal protein L3  53.59 
 
 		 218 aa  221  4e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.207115  normal  0.106977 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17401  50S ribosomal protein L3  52.68 
 
 		 217 aa  221  6e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3758  50S ribosomal protein L3  53.14 
 
 		 219 aa  220  9.999999999999999e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.33789  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1147  50S ribosomal protein L3  50.49 
 
 		 205 aa  220  9.999999999999999e-57  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000530687  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01170  50S ribosomal protein L3  53.11 
 
 		 211 aa  219  1.9999999999999999e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000794381  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1394  50S ribosomal protein L3  52.71 
 
 		 207 aa  219  1.9999999999999999e-56  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000462367  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1292  50S ribosomal protein L3  52.71 
 
 		 207 aa  219  1.9999999999999999e-56  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000263563  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3703  50S ribosomal protein L3  53.85 
 
 		 212 aa  219  3e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4507  50S ribosomal protein L3  52.63 
 
 		 221 aa  219  3e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.787031  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0249  50S ribosomal protein L3  53.37 
 
 		 212 aa  218  3.9999999999999997e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.587373  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0252  50S ribosomal protein L3  53.37 
 
 		 212 aa  218  3.9999999999999997e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2257  50S ribosomal protein L3  50.74 
 
 		 209 aa  218  3.9999999999999997e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000117498  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0225  ribosomal protein L3  52.86 
 
 		 213 aa  218  3.9999999999999997e-56  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2857  50S ribosomal protein L3  48.8 
 
 		 210 aa  218  5e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.918611  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0286  50S ribosomal protein L3  52.94 
 
 		 209 aa  218  5e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0410836  hitchhiker  0.00603059 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1086  LSU ribosomal protein L3P  50.48 
 
 		 217 aa  218  6e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.10406 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6049  50S ribosomal protein L3  52.71 
 
 		 236 aa  218  6e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.185718  normal  0.220559 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1650  50S ribosomal protein L3  51.71 
 
 		 217 aa  217  8.999999999999998e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2229  50S ribosomal protein L3  50.74 
 
 		 209 aa  217  1e-55  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000790762  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0931  ribosomal protein L3  52.88 
 
 		 215 aa  217  1e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.15696  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17651  50S ribosomal protein L3  51.71 
 
 		 217 aa  217  1e-55  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.884364  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1013  50S ribosomal protein L3  52.15 
 
 		 217 aa  216  1e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1040  50S ribosomal protein L3  52.15 
 
 		 217 aa  216  1e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1030  50S ribosomal protein L3  52.15 
 
 		 217 aa  216  1e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2646  50S ribosomal protein L3  51.67 
 
 		 216 aa  216  2e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.334348  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0691  50S ribosomal protein L3  52.63 
 
 		 211 aa  216  2e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00208666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0397  50S ribosomal protein L3  51.94 
 
 		 205 aa  216  2e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1067  50S ribosomal protein L3  48.33 
 
 		 211 aa  216  2e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000374639  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1161  ribosomal protein L3  50.24 
 
 		 206 aa  216  2e-55  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000266904  hitchhiker  0.000000567921 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17491  50S ribosomal protein L3  50.73 
 
 		 217 aa  216  2.9999999999999998e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2460  50S ribosomal protein L3  52.86 
 
 		 209 aa  216  2.9999999999999998e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0891685 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16781  50S ribosomal protein L3  52.17 
 
 		 219 aa  215  2.9999999999999998e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0790  50S ribosomal protein L3  52.4 
 
 		 213 aa  215  2.9999999999999998e-55  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2711  50S ribosomal protein L3  51.44 
 
 		 211 aa  214  5e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000399657  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3012  50S ribosomal protein L3  51.35 
 
 		 227 aa  215  5e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00913494 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0215  50S ribosomal protein L3  52.63 
 
 		 209 aa  215  5e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000370606  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1867  50S ribosomal protein L3  52.86 
 
 		 207 aa  214  5.9999999999999996e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0222976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10020  LSU ribosomal protein L3P  49.76 
 
 		 206 aa  213  9.999999999999999e-55  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.000000402835  hitchhiker  0.00000000318342 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0626  50S ribosomal protein L3  49.28 
 
 		 210 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000331463  hitchhiker  0.000000000000331617 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5049  50S ribosomal protein L3  52.38 
 
 		 218 aa  213  9.999999999999999e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.399218 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05715  50S ribosomal protein L3  51.44 
 
 		 205 aa  213  9.999999999999999e-55  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.499117  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3905  50S ribosomal protein L3  50.96 
 
 		 223 aa  214  9.999999999999999e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1346  50S ribosomal protein L3  47.62 
 
 		 211 aa  213  1.9999999999999998e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.700686  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0602  ribosomal protein L3  50.96 
 
 		 205 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17160  50S ribosomal protein L3  50.24 
 
 		 216 aa  213  1.9999999999999998e-54  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.283771  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0582  50S ribosomal protein L3  52.91 
 
 		 235 aa  212  1.9999999999999998e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23810  LSU ribosomal protein L3P  50.48 
 
 		 226 aa  213  1.9999999999999998e-54  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23021  50S ribosomal protein L3  51.69 
 
 		 218 aa  213  1.9999999999999998e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2232  50S ribosomal protein L3  52.88 
 
 		 213 aa  212  2.9999999999999995e-54  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.422626 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0422  50S ribosomal protein L3  51.2 
 
 		 209 aa  212  2.9999999999999995e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000195061  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1292  50S ribosomal protein L3  51.69 
 
 		 212 aa  212  3.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.0000167398  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0180  50S ribosomal protein L3  52.22 
 
 		 209 aa  211  5.999999999999999e-54  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00021825  normal  0.996112 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5195  50S ribosomal protein L3  52.63 
 
 		 210 aa  211  5.999999999999999e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000842867  unclonable  2.19314e-25 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6614  ribosomal protein L3  50.72 
 
 		 216 aa  211  5.999999999999999e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0105  50S ribosomal protein L3  52.63 
 
 		 210 aa  211  5.999999999999999e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000775669  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0701  50S ribosomal protein L3  50.48 
 
 		 210 aa  211  7e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000481863  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0587  ribosomal protein L3  49.76 
 
 		 219 aa  210  1e-53  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.295272  normal  0.46094 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5787  50S ribosomal protein L3  51.94 
 
 		 220 aa  210  1e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0786499 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0110  50S ribosomal protein L3  52.15 
 
 		 210 aa  210  2e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000528056  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0110  50S ribosomal protein L3  52.15 
 
 		 210 aa  210  2e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000986131  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0106  50S ribosomal protein L3  52.15 
 
 		 210 aa  210  2e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.6707699999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0104  50S ribosomal protein L3  52.15 
 
 		 210 aa  210  2e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000168091  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2065  50S ribosomal protein L3  46.53 
 
 		 209 aa  209  2e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.00000000000562685  normal  0.223373 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0131  50S ribosomal protein L3  52.15 
 
 		 210 aa  210  2e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000141135  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20870  LSU ribosomal protein L3P  48.8 
 
 		 219 aa  209  2e-53  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.235842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0110  50S ribosomal protein L3  52.15 
 
 		 210 aa  210  2e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000246604  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0141  50S ribosomal protein L3  52.15 
 
 		 210 aa  210  2e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000551418  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1555  ribosomal protein L3  47.34 
 
 		 210 aa  209  2e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00791107  normal  0.982603 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0680  50S ribosomal protein L3  51.26 
 
 		 209 aa  209  2e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.620206  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0122  50S ribosomal protein L3  52.15 
 
 		 210 aa  210  2e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.0599700000000001e-61 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1123  ribosomal protein L3  51.2 
 
 		 220 aa  209  3e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1836  50S ribosomal protein L3  48.76 
 
 		 217 aa  209  3e-53  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00718997  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2903  50S ribosomal protein L3  51.21 
 
 		 212 aa  209  3e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000477342  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1765  50S ribosomal protein L3  49.75 
 
 		 209 aa  209  4e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.0000837732  normal  0.643205 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0079  50S ribosomal protein L3  48.77 
 
 		 209 aa  208  5e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.145283 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>